新型基因修饰、组合物和相关工艺专利检索-专利检索治疗感觉障碍的药物-专利检索网 (2023)

手册的全文。

发明领域

本发明涉及组合物,包括转基因动物和灭活动物,以及使用此类组合物诊断和治疗疾病或病症的方法。

发明背景

细胞外蛋白在多细胞生物的形成、分化和维持等方面发挥着重要作用。许多单个细胞的命运,例如B. 增殖、迁移、分化或与其他细胞的相互作用通常由从其他细胞和/或直接环境接收的信息决定。该信息通常由分泌的多肽(例如促有丝分裂因子、存活因子、细胞毒性因子、分化因子、神经肽和激素)介导,这些多肽又被各种细胞受体或蛋白结合蛋白接收和解释。这些分泌的多肽或信号分子通常通过细胞分泌途径到达它们在细胞外环境中的作用位点。

分泌蛋白具有多种工业用途,包括药物、诊断、生物传感器和生物反应器。大多数当前可用的蛋白质药物如溶栓剂、干扰素、白细胞介素、促红细胞生成素、集落刺激因子和各种其他细胞因子都是分泌性蛋白质。它的受体是膜蛋白,也具有作为治疗剂或诊断剂的潜力。工业界和学术界都在努力识别新的天然分泌蛋白。许多努力都集中在筛选重组哺乳动物 DNA 文库以确定新分泌蛋白的编码序列。文献中描述了筛选方法和技术的示例 [例如,参见 Klein 等人,全氯乙烯美国国家科学院93:7108–7113 (1996);美国专利号5,536,637)]。

膜结合蛋白和受体可以在多细胞生物的形成、分化和维持等方面发挥重要作用。许多单个细胞的命运,例如B. 增殖、迁移、分化或与其他细胞的相互作用通常由从其他细胞和/或直接环境接收的信息决定。该信息通常由分泌的多肽(例如促有丝分裂因子、存活因子、细胞毒性因子、分化因子、神经肽和激素)介导,这些多肽又被各种细胞受体或蛋白结合蛋白接收和解释。此类膜结合蛋白和细胞受体包括但不限于细胞因子受体、受体激酶、受体磷酸酶、参与细胞-细胞相互作用的受体和细胞粘附分子如选择素和整联蛋白。例如,调节细胞生长和分化的信号传递部分受几种细胞蛋白磷酸化的调节。蛋白酪氨酸激酶是催化这一过程的酶,也可以作为生长因子的受体。例子包括成纤维细胞生长因子受体和神经生长因子受体。

膜结合蛋白和受体分子具有多种工业用途,包括作为药物和诊断剂。例如,受体免疫粘附可用作阻断受体-配体相互作用的治疗剂。膜结合蛋白也可用于筛选相关受体/配体相互作用的潜在肽或小分子抑制剂。

工业界和学术界都在努力识别新的天然受体或膜结合蛋白。许多努力都集中在筛选重组哺乳动物 DNA 文库以确定新受体或膜结合蛋白的编码序列。

鉴于分泌蛋白和膜结合蛋白在生物和疾病过程中的重要性,体内研究和表征可以提供有价值的鉴定和发现疗法和/或治疗方法,这些疗法和/或疗法可用于预防、减轻或纠正疾病或病症。在这方面,基因工程小鼠已被证明是对与人类疾病相关的生物过程进行功能分析的宝贵工具,包括免疫学、癌症、神经生物学、心血管生物学、肥胖症等。基因敲除有望通过预测体内高度特异性拮抗剂的活性来模拟药物作用的生物学机制。基因敲除小鼠已被证明可以模拟药物活性;缺乏特定药物靶蛋白的小鼠的表型可能类似于由相应的拮抗剂药物引起的人类临床表型。基因敲除允许发现靶标的作用机制、靶标的主要生理作用以及哺乳动物中靶标抑制可能导致的基于机制的副作用。这种类型的例子包括血管紧张素转换酶 (ACE) 缺陷小鼠 [Esther, C.R. et al.,实验室。投资。,74:953-965 (1996)] 和环氧合酶 1 (COX1) 基因 [Langenbach, R. et al.细胞83:483-492 (1995)]。相反,小鼠中该基因的缺失可能会产生与人类在适当靶标上使用激动剂药物后观察到的相反的表型效应。示例包括去除促红细胞生成素 [Wu, C.S. et al.,细胞,83:59-67 (1996)],导致红细胞生成受损和 GABA (A)-R-β3 失活的突变 [DeLorey, T.M.,J.神经科学,18:8505-8514 (1998)] 其中突变小鼠表现出过度活跃和过度反应。这两种表型都与人类服用促红细胞生成素和苯二氮卓类药物的效果相反。使用小鼠遗传学验证目标的一个显着例子是 ACC2 基因。尽管人类 ACC2 基因在几年前就已确定,但最近通过使用基因敲除小鼠分析 ACC2 功能激发了人们对 ACC2 作为药物开发靶标的兴趣。 ACC2 突变小鼠比它们的野生型同窝小鼠吃得更多,但在它们的脂肪细胞中燃烧更多脂肪并储存更少脂肪,使得这种酶可能成为治疗肥胖症的化学拮抗作用的靶点 [Abu-Elheiga, L. 等人,科学,291:2613-2616 (2001)]。

在本申请中,突变基因的变化导致了与各种疾病或病症相关的表型观察,包括:神经/CNS 病症或病症,例如焦虑症;眼部异常和相关疾病;心血管、内皮或血管生成疾病,包括动脉粥样硬化;异常代谢紊乱,包括糖尿病和血脂异常,与血清胆固醇和甘油三酯水平升高有关;免疫和炎症性疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或病症,如关节炎、骨质疏松症和骨硬化症;或发育疾病,如胚胎致死率。

发明内容

A. 见解

本发明提供了一种分离的核酸分子,其包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的核苷酸序列编码 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO70163、PRO851 或多肽

一方面,分离的核酸分子包含具有至少约80%的核酸序列同一性,或者至少约81%的核酸序列同一性,或者至少约82%的核酸序列同一性,或者至少约82%的核酸序列同一性的核苷酸序列83%核酸序列同一性,或者至少约84%核酸序列同一性,或者至少约85%核酸序列同一性核酸,或者至少约86%核酸序列同一性,或者至少约87%核酸序列同一性,或者至少约 88% 的核酸序列同一性,或者至少约 89% 的核酸序列同一性,或者至少约 90% 的核酸序列同一性,或者至少约 91% 的核酸序列同一性,或者至少约 91% 的核酸序列同一性,或者至少约92%的同一性,或者至少约93%的核酸序列同一性,或者至少约94%的核酸序列同一性,或者至少约95%的核酸序列同一性,或者至少约96%的核酸序列同一性,或者与(a)编码PRO194、PRO220、PRO241、PRO284的DNA分子至少约97%的核酸序列同一性,或者至少约98%的核酸序列同一性,或者至少约99%的核酸序列同一性, PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4、PRO642004如本文所述的信号肽,跨膜蛋白的细胞外结构域,具有或不具有如本文所述的信号肽,或如本文所述的全长氨基酸序列的任何其他明确定义的片段,或(b) (a) 的 DNA 分子。

在其他方面,分离的核酸分子包含具有至少约80%的核酸序列同一性,或者至少约81%的核酸序列同一性,或者至少约82%的核酸序列同一性,或者至少约82%的核酸序列同一性的核苷酸序列83%核酸序列同一性,或者至少约84%核酸序列同一性,或者至少约85%核酸序列同一性核酸,或者至少约86%核酸序列同一性,或者至少约87%核酸序列同一性,或者至少约 88% 的核酸序列同一性,或者至少约 89% 的核酸序列同一性,或者至少约 90% 的核酸序列同一性,或者至少约 91% 的核酸序列同一性,或者至少约 91% 的核酸序列同一性,或者至少约92%的同一性,或者至少约93%的核酸序列同一性,或者至少约94%的核酸序列同一性,或者至少约95%的核酸序列同一性,或者至少约96%的核酸序列同一性,或者至少约 97% 的核酸序列同一性,或者至少约 98% 的核酸序列同一性,或者至少约 99% 的核酸序列同一性,与 (a) 包含全长编码序列 PRO194、PRO220 的 DNA 分子,PRO241,PRO284,PRO331,PRO354,PRO355,PRO533,PRO541,PRO725,PRO937,PRO114,PRO1120,PRO1182,PRO1325,PRO1382,PRO1410,PRO1555,PRO1556,PRO1760,PRO1787,PRO1868,PRO4302,PRO43302,PRO4302,4 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO-PRO1026 或 PRO23370 多肽 cDNA, PRO194, PRO220, PRO241, PRO53, PRO3184, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325 的编码序列, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO10274, PRO16090, PRO19640, PRO19640, PRO2134, PRO10274, PRO16090, PRO19640, PRO2134, PRO10274, PRO16090, PRO19640, PRO21340 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284 , PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO178,PRO43624 PRO43624 , PRO4904,9 PRO40400,9 PRO40400,9 PRO40400,6 PRO90204, PRO90204, PRO90204, PRO90204, PRO90204, PRO90204, PRO16090, PRO85143, PRO1124, PRO13370 或 PRO2 PRO2 编码序列,用于全长氨基酸的任何其他明确定义的片段如本文所述的序列,或(b)(直到)的DNA分子的互补序列。

在另一方面,本发明涉及分离的核酸分子,其包含具有至少约80%核酸序列同一性、或者至少约81%核酸序列同一性、或者至少约82%核酸序列同一性的核苷酸序列,或者至少约 83% 的核酸序列同一性, 或者至少约 84% 的核酸序列同一性, 或者至少约 85% 的核酸序列同一性, 或者至少约 86% 的核酸序列同一性, 或者至少约 87% 的核酸序列同一性核酸序列同一性,或者至少约 88% 核酸序列同一性 核酸序列,或者至少约 89% 核酸序列同一性,或者至少约 90% 核酸序列同一性,或者至少约 91% 核酸序列同一性,或者至少约 92% 的核酸序列同一性,或者至少约 93% 的核酸序列同一性,或者至少约 94% 的核酸序列同一性,或者至少约 95% 的核酸序列同一性,或者至少约 95% 的核酸序列同一性,或者至少约96% 的核酸序列同一性与(a) DNA 分子的序列同一性,或者至少约 97% 的核酸序列同一性,或者至少约 98% 的核酸序列同一性,或者至少约 99% 的核酸序列同一性编码与本文所述保藏于 ATCC 的任何人蛋白质 cDNA 编码的相同成熟多肽,或 (b) (a) 的 DNA 分子的互补序列。

本发明的另一个方面提供了分离的核酸分子,其包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的核苷酸序列. PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。跨膜结构域缺失或跨膜结构域失活或与核苷酸编码序列互补,其中多肽的跨膜结构域如本文所述。因此,描述了 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17870 的可溶性胞外结构域此处考虑 PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO10370、PRO21340、PRO21870、PRO21870、PRO21870

本发明还提供了PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO的片段。 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370,使用 PRO204 多肽的示例片段,PRO204 杂交序列,其PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17870、PRO17870,其可任选地编码包含结合的多肽的多肽反 PRO194、反 PRO220、反 PRO241、反 PRO284、反 PRO331、反 PRO354、反 PRO355、反 PRO533、反 PRO541、反 PRO725、反 PRO937、反 PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗- PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 或作为反义寡核苷酸探针。核酸片段通常至少约 10 个核苷酸长,或者至少约 15 个核苷酸长,或者至少约 20 个核苷酸长,或者至少约 30 个核苷酸长,或者至少约 40 个核苷酸长,或者至少约 40 个核苷酸长,或者至少约 50 个核苷酸长,或者至少约 60 个核苷酸长,或者至少约 70 个核苷酸长,或者至少约 80 个核苷酸长,或者至少约 90 个核苷酸长,或者至少约 100 个核苷酸长,或者至少约 100 个核苷酸长,或者至少约约 110 个核苷酸长,或者至少约 120 个核苷酸长,或者是或至少约 130 个核苷酸长,或者是或至少约 140 个核苷酸长,或者是或至少约 150 个核苷酸长或者是或是至少约 150 个核苷酸长至少约160个核苷酸长,或者是或至少约170个核苷酸长,或者是或至少约180个核苷酸长,或者是或至少约190个核苷酸长,或者是或至少约200个核苷酸长,或者至少约 250 个核苷酸长,或者至少约 300 个核苷酸长,或者至少约 350 个核苷酸长,或者至少约至少约 400 个核苷酸长,或者至少约 400 个核苷酸长,或者在或至少约 450 个核苷酸长,或者至少约 500 个核苷酸长,或者至少约 600 个核苷酸长,或者至少约 700 个核苷酸长,或者至少约 800 个核苷酸长,或者至少约 800 个核苷酸长,或者是或至少约900个核苷酸长,或者是或至少约1000个核苷酸长,其中在上下文中术语“约”是指核苷酸序列的参考长度加上或减去参考长度的10%。观察到新片段PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO186 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 可以从多肽编码序列中常规确定。 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO34.34638, PRO64使用来自已知比对程序的任何数量的已知序列编码多肽的核苷酸序列与其他已知核苷酸序列,并确定哪个, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO43868, PRO43868, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026或 PRO23370 编码新的核苷酸序列。所有这些 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1768、PRO18 B43268、PRO.B43268 PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 核苷酸序列,编码本文中的多肽。还包括 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO438868、PRO43868、PRO4由这些PRO1编码的PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026或PRO23370多肽片段,优选PRO09、PRO3324核苷酸片段,PRO3228核苷酸分子, PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17870、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO40940、PRO604、PRO409、PRO16063、PRO16063含有抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937 的结合位点的 PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽片段, 抗 PRO1014, 抗-PRO1120, 抗-PRO1182, 抗-PRO1325, 抗-PRO1382, 抗-PRO1410, 抗-PRO1555, 抗-PRO1556, 抗-PRO1760, 抗-PRO1787, 抗-PRO1868, 抗-PRO4326, 抗- PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗抗体PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165 , 抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

本发明提供PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO38、PRO43.4准备好。 PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 由上述任何分离的核酸序列编码。

一方面,本发明的特征在于隔离物 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760。 Pro1787,Pro1868,Pro4326,Pro4332,Pro4346,Pro4400,Pro4400,Pro6003,Pro6094,Pro6244,Pro6244,Pro9828,Pro10274,Pro16090,Pro19644,Pro19644,Pro21340,Pro21340,Pro92165,Pro92165,Pro Pro pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Prory8514,氨基酸序列同一性或 PRO23,30 约 81% 氨基酸序列同一性,或者至少约 82% 氨基酸序列同一性,或者至少约 83% 氨基酸序列同一性,或者至少约 84% 氨基酸序列同一性,或者至少约 84% 氨基酸序列同一性,或者至少约 85% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 86% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 87% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 88% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 89% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 90% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 91% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 92% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 93% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 93% 的氨基酸序列同一性,或者至少约94% 的序列同一性,或者至少约 95% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 96% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 97% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 98% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 98% 的氨基酸序列同一性,或者至少约98% 氨基酸序列同一性 与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO10204、PRO10204、PRO10204、PRO10204、1.4如本文所述的氨基酸序列的长度、缺乏如本文所述的信号肽的氨基酸序列、具有或不具有如本文所述的信号肽的跨膜蛋白的细胞外结构域,或任何其他具体定义的蛋白质氨基片段如本文所述的全长酸序列。

另一方面,本发明涉及分离物 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760。 PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026、PRO233 多肽含有至少一个酸性序列同一性或 PRO233%或者至少约 81% 的氨基酸序列同一性, 或者至少约 82% 的氨基酸序列同一性, 或者至少约 83% 的氨基酸序列同一性, 或者至少约 84% 的氨基酸序列同一性, 或者至少约 85% 的氨基酸序列同一性氨基酸序列同一性,或者至少约86%的氨基酸序列同一性,或者至少约87%的同一性,或者至少约88%的氨基酸序列同一性,或者至少约89%的氨基酸序列同一性,或者至少约89%的氨基酸序列同一性,或者至少约90%氨基酸序列同一性,或者至少约91%氨基酸序列同一性,或者至少约92%氨基酸序列同一性,或者至少约93%氨基酸序列同一性,或者至少约94%氨基酸序列同一性,或者至少约95%的氨基酸序列同一性,或者至少约96%的氨基酸序列同一性,或者至少约97%的氨基酸序列同一性,或者至少约98%的氨基酸序列同一性,或者至少约98%的氨基酸序列同一性,和或者,至少约 99% 的氨基酸序列与由一种人类蛋白质 cDNA 编码的氨基酸序列具有同一性,如本文件所述,该 cDNA 保藏在 ATCC。

一方面,本发明涉及 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787。 PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 是氨基酸长度至少为 0 的变体或替代物20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250 260 270 280 290 320 340 350 370 380 400 420 440 460 470 490 500、520、530、540、550、570、580、600 个氨基酸长度或更多。可选 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO183268、PRO443268、PRO4433 , PRO43268, PRO43268, PRO43268 PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, PRO23370 相比保守氨基酸变体具有多于一个的氨基酸取代PRO19,PRO4,282,PRO4,10,282,PRO4,1,282,PRO4,1,2,2,PRO4,1,2,2,PRO4,1,2,2,PRO4,1,PRO220,282,PRO4,1,282, PRO4,1,282,PRO4,1,282,PRO4,1,282,PRO4,1,282,PRO4,1,282,PRO4,1,PRO220,282 Pro331, Pro354, Pro35, Pro541, Pro725, PRO937, PRO1120, PRO1182, PRO1382, PRO1410, PRO1556, PRO1787 , PRO41832, PRO40, PRO624, PRO624, PRO624, PRO624 PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽序列,或者具有或不具有超过 2、5、6、4、7、8、9 或与天然 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、 PRO18687、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO

在具体方面,本发明提供了分离物 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760。 PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026、PRO10274序列如上所述。其生产方法也在本文中描述,该方法包括在有助于表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533 的条件下培养包含载体的宿主细胞,所述载体包含合适的编码核酸分子。合适的。 Pro541,Pro725,Pro937,Pro1014,Pro1120,Pro1182,Pro1325,Pro1382,Pro1410,Pro1555,Pro1555,Pro1556,Pro1760,Pro1787,Pro1868,Pro1868,Pro4326,Pro4326,Pro4332,Pro4332,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4304,Pro4304,Pro4332 PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 O PRO937、PRO1014、PRO131520、PRO1410、PRO1556、PRO1760、PRO4、PRO4、PRO43、PRO43、PRO43、PRO43、PRO9820、PRO9828、PRO16094、PRO16094、PRO16094、PRO16094

本发明的另一个方面提供了分离物 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787。 PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 的培养方法也在本文中有所描述,包含在适合表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533 的条件下包含适当编码核酸分子的载体。 Pro541,Pro725,Pro937,Pro1014,Pro1120,Pro1182,Pro1325,Pro1382,Pro1410,Pro1555,Pro1555,Pro1556,Pro1760,Pro1787,Pro1868,Pro1868,Pro4326,Pro4326,Pro4332,Pro4332,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4306,Pro4304,Pro4304,Pro4332 PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 O PRO937、PRO1014、PRO131520、PRO1410、PRO1556、PRO1760、PRO4、PRO4、PRO43、PRO43、PRO43、PRO43、PRO9820、PRO9828、PRO16094、PRO16094、PRO16094、PRO16094

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO15656、PRO17ativos、PRO43868、PRO43868 PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 如定义 aquí 特别是 el 激动剂,抗 PRO220,抗 PRO2201,抗 PRO220抗-PRO284、抗-PRO331、抗-PRO354、抗-PRO355、抗-PRO533、抗-PRO541、抗-PRO725、抗-PRO937、抗-PRO1014、抗-PRO1120、抗-PRO1182、抗-PRO1325、抗- PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗-PRO6244、抗-PRO9820、抗-PRO9828、抗-PRO10274、抗-PRO16090、抗-PRO19644、抗-PRO21340、抗-PRO92165、抗-PRO85143、抗-PRO1124、抗-PRO1026 或抗-PRO23370 或分子Pequeña。

本发明提供了一种鉴定PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、REV的激动剂或拮抗剂的方法, PRO1760 REV, PRO1787, PRO1868, PRO4326, Pro4332, Pro4346, Pro4400, Pro4400, Pro6003, Pro6003, Pro6094, Pro6244, Pro9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21343, PRO92165, per3, PRO85 per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per35, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, per3, pro., PRO937 , PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO43362, PRO4040, PRO4040, PRO44040, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165 , PRO85143 , PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽与候选分子并监测由 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO5331, PRO3 PRO35, Pro541, Pro725, Pro937, Pro1014, Pro1120, Pro1182, Pro1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO96、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。优选 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43046、PRO433. , PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽是 PRO194, PRO220, PRO1, PRO53, PRO3435, PRO52, PRO1, PRO1, PRO1805 PRO12052、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO90204、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO23374 或 PRO13374

本发明提供了一种物质组合物,包含 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、 PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO333 Anagonist oder PRO33 Polypeptid, Polypeptid oder Antagonist of Pro23 Pro241、Pros284、Pro331、Pro33、Pro354、Pro355、Pro35、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO725、per937、Pro937、PRO725、per1014、per1182、POL1182、POL1182、POL1182、POL11182、POL1182、POL1182、POL1182 , POL1410, POL1410, POL1556, POL1556, POL1556, PRO40, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO404362, PRO. , PRO6, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340,如本文所述的 PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370,或抗 4、抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533 , 抗PRO541, 抗PRO725, 抗PRO937, 抗PRO1014, 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗-PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090 , Anti-PRO19644, Anti-PRO21340, Anti-PRO92165, Anti-PRO85143, Anti-PRO1124, Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370 与载体结合。任选地,载体是药学上可接受的载体。

PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1860, PRO16326,4 PRO33326,4 PRO43326,4 ,PRO4400,PRO6003,PRO6094,PRO6244,PRO9820,PRO9828,PRO10274,PRO16090,PRO19644,PRO21340,PRO92165,PRO85143,PRO1124,PRO1026 -PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325 、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗-PRO6094、Anti-PRO6244、Anti-PRO9820、Anti-PRO9828、Anti-PRO10274、Anti-PRO16090、Anti-PRO19644、Anti-PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-Anticuerpo PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti- PRO23370, zur Vorbereitung eines Medikaments zur Behandlung einer Behandlung, die auf Anti-PRO194-, Anti-PRO220-, Anti-PRO241-, Anti-PRO284-, Anti-PRO331-, Anti-PRO354-Antikörper reagiert, Anti-PRO355, 抗-PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO120、抗PRO182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760 , 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗-PRO16090、Anti-PRO19644、Anti-PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370。

本发明提供包含编码本文所述任何多肽的DNA的载体。还提供了包含任何此类载体的宿主细胞。例如,宿主细胞可以是 CHO 细胞,大肠杆菌, 或酵母。进一步提供了一种产生本文所述任何多肽的方法,包括在适合表达所需多肽的条件下培养宿主细胞,并从细胞培养物中回收所需多肽。

本发明提供包含与异源多肽或氨基酸序列融合的本文所述的任何多肽的嵌合分子。此类嵌合分子的实例包括与表位标签序列或免疫球蛋白的 Fc 区融合的本文所述的任何多肽。

本发明提供了一种抗体,其优选特异性结合上文或下文所述的任何多肽。任选地,所述抗体是单克隆抗体、人源化抗体、抗体片段或单链抗体。

本发明提供了寡核苷酸探针,其可用于分离cDNA和基因组核苷酸序列,测量或检测相关基因的表达,或作为反义探针,该探针可源自上文或下文所述的任何核苷酸序列。优选的探针长度如上所述。

本发明还提供了一种用于鉴定与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的疾病相关的表型的方法. PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polipéptido , understanding方法:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 测量非人类转基因动物的生理特征;和

(c) 将测量的生理特征与同属野生型动物的生理特征进行比较,其中非人转基因动物的生理特征不同于野生型动物的生理特征被鉴定为结果的表型来自非人类转基因动物的基因破坏。一方面,非人转基因动物是哺乳动物。另一方面,哺乳动物是啮齿动物。在另一方面,哺乳动物是大鼠或小鼠。一方面,非人转基因动物是杂合的,用于改变编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因。 PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO23370 多肽。另一方面,与同性野生型同窝仔相比,转基因非人动物表现出的表型至少是以下一种:神经系统疾病;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

在另一方面,神经障碍是在开放场地活动测试期间增加的类似焦虑的反应。在又一方面,神经障碍是在旷野活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,神经障碍是家庭笼活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,神经损伤是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。另一方面,神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。另一方面,神经障碍包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑症、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有恐慌症的恐慌症广场恐惧症、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相障碍、双相 I 型或 II 型障碍,未另行说明的双相情感障碍、循环性精神障碍、重度抑郁症、重度抑郁症、情绪障碍、物质诱发的情绪障碍、认知功能改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或脑外伤相关的认知功能丧失因疾病或伤害导致的伤害、癫痫发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可适用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、表演型、自恋型、强迫型、精神分裂型和分裂型人格障碍。

另一方面,眼睛的异常是视网膜的异常。在另一方面,眼睛的异常与视觉损伤或失明一致。在另一方面,视网膜异常与色素性视网膜炎相容或以视网膜变性或视网膜发育不良为特征。

在另一方面,视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植物新生血管形成、移植排斥、角膜、视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管(红疹)、眼部新生血管、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致视网膜血管继发性萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂症、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

在另一方面,眼睛异常是白内障。在另一方面,白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状旁腺功能减退症或 Conradi 综合症。

在另一方面,发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

在另一方面,心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

另一方面,免疫学病症与系统性红斑狼疮一致;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

在另一方面,骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症、骨质减少或骨硬化症。

另一方面,与同性别的野生型同窝仔相比,转基因非人动物至少表现出以下生理特征之一:在田间试验期间恐惧样反应增加;在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

本发明还提供了源自非人转基因动物的分离细胞,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014 的基因的改变, PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、Pro4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO1264 或 PRO23。一方面,分离的细胞是小鼠细胞。另一方面,小鼠细胞是胚胎干细胞。在另一个方面,细胞分离物来自非人转基因动物,当与同性别的野生型同窝仔相比时,该动物表现出至少一种以下表型:神经障碍;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。本发明还提供了一种用于鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因破坏相关的表型的试剂的方法。 Pro1325、Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026 或 PRO23370 多肽,该方法包括:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的基因的改变, PRO1382 编码, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274- , PRO23370多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物的生理特征;

(c) 将(b)测量的生理特性与同属野生型动物的生理特性进行比较,其中非人转基因动物的生理特性不同于野生型动物的生理特性作为非人类转基因动物基因变化的结果表型;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定测试剂是否调节与非人类转基因动物中的基因突变相关的已鉴定表型。

一方面,与基因改变相关的表型包括神经障碍;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

在另一方面,神经障碍是在开放场地活动测试期间增加的类似焦虑的反应。在又一方面,神经障碍是在旷野活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,神经障碍是家庭笼活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,神经损伤是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。另一方面,神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。另一方面,神经障碍包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑症、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有恐慌症的恐慌症广场恐惧症、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相障碍、双相 I 型或 II 型障碍,未另行说明的双相情感障碍、循环性精神障碍、重度抑郁症、重度抑郁症、情绪障碍、物质诱发的情绪障碍、认知功能改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或脑外伤相关的认知功能丧失因疾病或伤害导致的伤害、癫痫发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

在另一方面,眼睛的异常是视网膜的异常。在另一方面,眼睛的异常与视觉损伤或失明一致。在另一方面,视网膜异常与色素性视网膜炎相容或以视网膜变性或视网膜发育不良为特征。

在另一方面,视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管、角膜移植新生血管、角膜移植排斥、/脉络膜新生血管相关角新生血管(红疹)、眼部新生血管疾病再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄脑桥小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

在另一方面,眼睛异常是白内障。在另一方面,白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状旁腺功能减退症或 Conradi 综合症。 .

在另一方面,发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

在另一方面,心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

另一方面,免疫学病症与系统性红斑狼疮一致;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

在另一方面,骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症、骨质减少或骨硬化症。

另一方面,与同性别的野生型同窝仔相比,转基因非人动物至少表现出以下生理特征之一:在田间试验期间恐惧样反应增加;在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

本发明还提供调节与基因改变相关的表型的试剂。一方面,药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂。 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO432、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6244、PRO9828、PRO10274、PRO85143、PRO1124、PRO92165、PRO8514、PR PRO ENGRAP PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗-PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555 , 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗-PRO9828、Anti-PRO10274、Anti-PRO16090、Anti-PRO19644、Anti-PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370。注入另一方面,拮抗剂为抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗-PRO1026,或反 PRO23370。

本发明还提供了一种用于鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 的基因病症相关的生理特性的药剂的方法。 PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO4828。 PRO1124、PRO1026或PRO23370多肽,包括以下方法:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物表现出的生理特征;

(c) 将 (b) 的测量生理特性与同一物种的野生型动物的生理特性进行比较,确定非人类转基因动物所表现出的与野生型动物所表现出的生理特性不同的生理特性作为与基因突变相关的生理特征;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定与基因改变相关的生理特征是否受到调节。

一方面,与同性别的野生型同窝仔相比,转基因非人动物表现出至少一种以下生理特征:

另一方面,与同性别的野生型同窝仔相比,转基因非人动物至少表现出以下生理特征之一:在田间试验期间恐惧样反应增加;在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

本发明还提供调节与基因改变相关的生理特性的试剂。一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO120、抗PRO182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种用于鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因疾病相关行为的药物的方法. Pro1325、Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026或PRO23370,包括方法:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 观察 (a) 的非人类转基因动物表现出的行为;

(c) 将 (b) 的观察到的行为与同性别的野生型动物的行为进行比较,其中观察到的非人类转基因动物表现出的行为不同于鉴定为的野生型动物表现出的观察到的行为一种与基因破坏有关的行为;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定试剂是否调节与基因改变相关的行为。

一方面,观察到的行为是在开放场地活动测试期间增加的类似恐惧的反应。另一方面,观察到的行为是在开放场地活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,观察到的行为是笼子活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,观察到的行为是在倒置屏幕测试期间改进的运动协调。另一方面,观察到的行为是在倒置屏幕测试期间运动协调受损。另一方面,观察到的行为包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌伴广场恐惧症、恐慌症无广场恐惧症、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相情感障碍、I 型或 II 型双相情感障碍、无双相情感障碍另有说明,循环性障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质诱发的情绪障碍,认知功能改善,认知功能丧失与但不限于阿尔茨海默氏病,中风或外伤性脑损伤,继发于疾病的癫痫发作或受伤,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

本发明还提供调节与改变基因相关的行为的试剂。一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种鉴定改善或调节神经障碍的药剂的方法;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 编码的基因缺陷相关的发育异常, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143 PRO4, PRO85141 其中方法包括

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 对非人类转基因动物施用测试剂;和

(c) 确定测试剂是否改善或调节神经障碍;心血管、内皮或血管生成障碍;眼睛异常;免疫紊乱;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;血脂异常;或与非人类转基因动物的基因破坏相关的发育异常。

在另一方面,神经障碍是在开放场地活动测试期间增加的类似焦虑的反应。在又一方面,神经障碍是在旷野活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,神经障碍是家庭笼活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,神经损伤是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。另一方面,神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。另一方面,神经障碍包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑症、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有恐慌症的恐慌症广场恐惧症、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相障碍、双相 I 型或 II 型障碍,未另行说明的双相情感障碍、循环性精神障碍、重度抑郁症、重度抑郁症、情绪障碍、物质诱发的情绪障碍、认知功能改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或脑外伤相关的认知功能丧失因疾病或伤害导致的伤害、癫痫发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

另一方面,眼睛的异常是视网膜的异常。在另一方面,眼睛的异常与视觉损伤或失明一致。在另一方面,视网膜异常与色素性视网膜炎相容或以视网膜变性或视网膜发育不良为特征。

在另一方面,视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植新生血管形成、角膜移植排斥、视网膜/脉络膜新生血管形成、角新生血管形成(红疹)、眼、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯氏病)、角膜和其他组织移植、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

在另一方面,眼睛异常是白内障。在另一方面,白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状旁腺功能减退症或 Conradi 综合症。 .

在另一方面,发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

在另一方面,心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

另一方面,免疫学病症与系统性红斑狼疮一致;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

在另一方面,骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症、骨质减少或骨硬化症。

另一方面,与同性别的野生型同窝仔相比,转基因非人动物至少表现出以下生理特征之一:在田间试验期间恐惧样反应增加;在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

本发明还提供改善或调节神经障碍的药剂;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与基因破坏相关的发育异常。一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种用于治疗神经障碍的治疗剂;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

本发明还提供了一种用于鉴定调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 表达的试剂的方法。 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。 :

(a) 测试剂与表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的宿主细胞接触, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO212 和多肽

(b) 确定测试试剂是否调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的表达。 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1120 或 PRO302

本发明还提供了一种调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 表达的试剂。 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO23326 或多肽一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种评估治疗剂的方法,该治疗剂能够影响与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 的基因破坏相关的病症。 PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO1124、PRO10326、PRO2多肽的包含方法:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的基因的改变, PRO1382 编码, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274- , PRO23370多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物的生理特征;

(c)将(b)测量的生理特性与同属野生型动物的生理特性进行比较,其中识别出转基因非人动物的生理特性不同于野生型动物的生理特性由于非人类转基因动物的基因破坏;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 评估测试剂对非人类转基因动物中与基因改变相关的已鉴定状况的影响。

一方面,该病症是神经障碍;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

本发明还提供了一种能够影响与基因破坏相关的病症的治疗剂。一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了包含能够影响与基因改变相关的病症的治疗剂的药物组合物。

本发明还提供了一种治疗、预防或减轻神经障碍的方法;心血管、内皮或血管生成障碍;免疫紊乱;肿瘤疾病;与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、编码 PRO1410、 Pro1555、Pro1556、Pro1760、Pro1787、Pro1868、Pro4326、Pro4332、Pro4346、Pro4400、Pro6003、Pro6094 将治疗有效量的治疗剂或激动剂给予需要这种治疗并且可能已经患有该病症或倾向于患有该病症,或其中寻求预防该病症,或其拮抗剂,从而有效地治疗或预防或改善该病症或疾病。

在另一方面,神经障碍是在开放场地活动测试期间增加的类似焦虑的反应。在又一方面,神经障碍是在旷野活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,神经障碍是家庭笼活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,神经损伤是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。另一方面,神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。另一方面,神经障碍包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑症、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有恐慌症的恐慌症广场恐惧症、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相障碍、双相 I 型或 II 型障碍,未另行说明的双相情感障碍、循环性精神障碍、重度抑郁症、重度抑郁症、情绪障碍、物质诱发的情绪障碍、认知功能改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或脑外伤相关的认知功能丧失因疾病或伤害导致的伤害、癫痫发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

另一方面,眼睛的异常是视网膜的异常。在另一方面,眼睛的异常与视觉损伤或失明一致。在另一方面,视网膜异常与色素性视网膜炎相容或以视网膜变性或视网膜发育不良为特征。

在另一方面,视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管、角膜移植新生血管、角膜移植排斥、/脉络膜新生血管相关角新生血管(红疹)、眼部新生血管疾病再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄脑桥小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

在另一方面,眼睛异常是白内障。在另一方面,白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状旁腺功能减退症或 Conradi 综合症。

在另一方面,发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

在另一方面,心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

另一方面,免疫学病症与系统性红斑狼疮一致;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

在另一方面,骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症、骨质减少或骨硬化症。

在另一方面,治疗剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂B. PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026 或 PRO23370 多肽。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种鉴定改善或调节神经障碍的药剂的方法;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 编码的基因缺陷相关的发育异常, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143 PRO4, PRO85141 其中方法包括

(a) 提供非人转基因动物细胞的培养物,培养物中的每个细胞包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014 的基因的破坏, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9 , PRO1124, PRO10260 或;

(b) 对细胞培养物施用测试剂;和

(c) 确定测试剂是否改善或调节神经障碍;心血管、内皮或血管生成障碍;眼睛异常;免疫紊乱;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;血脂异常;或该文化中的发育异常。

在另一方面,神经障碍是在开放场地活动测试期间增加的类似焦虑的反应。在又一方面,神经障碍是在旷野活动测试期间减少的类似焦虑的反应。另一方面,神经障碍是家庭笼活动测试期间的异常昼夜节律。在又一方面,神经损伤是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。另一方面,神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。另一方面,神经障碍包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑症、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有恐慌症的恐慌症广场恐惧症、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑、自闭症、特定恐惧症、物质诱发的焦虑症、急性酒精戒断、强迫症、广场恐惧症、单相障碍、双相 I 型或 II 型障碍,未另行说明的双相情感障碍、循环性精神障碍、重度抑郁症、重度抑郁症、情绪障碍、物质诱发的情绪障碍、认知功能改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或脑外伤相关的认知功能丧失因疾病或伤害导致的伤害、癫痫发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾、脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

另一方面,眼睛的异常是视网膜的异常。在另一方面,眼睛的异常与视觉损伤或失明一致。在另一方面,视网膜异常与色素性视网膜炎相容或以视网膜变性或视网膜发育不良为特征。

在另一方面,视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管、角膜移植新生血管、角膜移植排斥、/脉络膜新生血管相关角新生血管(红疹)、眼部新生血管疾病再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄脑桥小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

在另一方面,眼睛异常是白内障。在另一方面,白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状旁腺功能减退症或 Conradi 综合症。

在另一方面,发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

在另一方面,心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

另一方面,免疫学病症与系统性红斑狼疮一致;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

在另一方面,骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症、骨质减少或骨硬化症。

本发明还提供改善或调节神经障碍的药剂;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与文化基因破坏相关的发育异常。一方面,药剂是与破坏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因相关的表型的激动剂或拮抗剂。 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polipéptido PRO1026或 PRO23370。在另一方面,该药剂是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103245 其他方面或多肽,PRO6激动剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。在另一方面,拮抗剂是抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗-PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗-PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。

本发明还提供了一种用于调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的病症相关的表型的方法. PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polipéptido the method包括将有效量的发现调节表型的药剂或其激动剂或拮抗剂施用于可能已经具有或可能倾向于具有该表型或其中要预防该表型的受试者,有效地调节该表型.

本发明还提供了调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因破坏相关的生理特性的方法B. PRO1410-、PRO1555-、PRO1556-、PRO1760-、PRO1787-、PRO1868-、PRO4326-、PRO4332-、PRO4346-、PRO4400-、PRO6003-、PRO6094-、PRO6244-、PRO9820-、PRO9828、PRO10274、PRO23370多肽包括向可能已经表现出生理特征,或可能倾向于表现出生理特征,或可能要防止生理特征的受试者施用有效量的被鉴定为调节生理特征的试剂的方法或其激动剂或拮抗剂,从而有效地调节生理特性。生理特性。

本发明还提供了一种用于调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 编码的基因破坏相关的行为的方法, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polipéptido the method comprising将有效量的已被发现可调节行为的药剂或其激动剂或拮抗剂给药于可能已经表现出行为或倾向于表现出行为的对象,或其中表现出的行为旨在被阻止的对象,有效地调节行为。

本发明还提供了一种用于调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 表达的方法。 PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO24 或 PRO24 表达细胞, PRO354, PRO354, PRO414,75, PRO34,75 375, PRO453,5 PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO43368, PRO43368, PRO4, PRO604, PRO4306, PRO4304, PRO4304, PRO43304 PRO9820-9, PRO91420-4, PRO91820-4 PRO102794-4、PRO102794-4、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽、有效量的被鉴定为调节此类表达的试剂或其激动剂或拮抗剂,由此有效调节多肽的表达。

本发明还提供了一种用于调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的病症相关的病症的方法. PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polipéptido the method包括将治疗有效量的被鉴定为病症调节剂或激动剂的治疗剂给予可能患有该病症或可能倾向于患有该病症,或该病症将被预防的受试者或其拮抗剂,由此状态得到有效调节。

本发明还提供了一种治疗、预防或减轻神经障碍的方法;心血管、内皮或血管生成障碍;免疫紊乱;肿瘤疾病;与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 编码的基因破坏相关的代谢性骨异常或紊乱或胚胎致死, Pro1555, pro1556, pro1760, pro1787, pro1868, pro4326, pro4332, pro4346, pro4400, pro6003, pro6094 一种向非人转基因动物细胞培养物给药的方法,培养物的每个细胞都包含编码 PRO194 基因的破坏, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937 编码, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO430,264 PRO6003、PRO6094、PRO6244、多肽 PRO92165、PRO130、PRO1243、PRO1243、PRO1243、PRO1243、PRO2 经鉴定可治疗、预防或减轻该病症的药剂或其激动剂或拮抗剂从而治疗、预防或减轻该病症的功效。

B. 其他实施例

在其他实施例中,本发明解决了本申请的以下一组可能的权利要求:

1. 鉴定与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的基因疾病相关的表型的方法, PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO196444,包括程序:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 测量非人类转基因动物的生理特征;和

(c) 将测量的生理特征与同属野生型动物的生理特征进行比较,其中非人转基因动物的生理特征不同于野生型动物的生理特征被鉴定为结果的表型来自非人类转基因动物的基因破坏。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述非人转基因动物对于编码PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182的基因的破坏是杂合的B PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、Pro1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO1124、PRO23370 或 PRO 多肽。

2.根据权利要求1所述的方法,其中与同性别的野生型同窝仔相比,所述转基因非人动物表现出的表型是以下至少一种:神经系统疾病;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是在旷场活动测试期间增加的类似焦虑的反应。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是旷场活动测试期间焦虑样反应降低。

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述神经障碍是在笼活动测试期间的异常昼夜节律。

4.如权利要求3所述的方法,其中所述神经障碍是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述神经障碍为抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述眼部异常是视网膜异常。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述眼部异常与视觉损伤或失明一致。

11.根据权利要求10所述的方法,其中所述视网膜异常与色素性视网膜炎一致。

11.根据权利要求10所述的方法,其中所述视网膜异常的特征在于视网膜变性或视网膜发育不良。

11. 根据权利要求10所述的方法,其中所述视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植新生血管形成、角膜移植排斥反应一致,视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管(红疹)、角新生血管病、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括Graves病)、角膜和其他组织移植、视网膜阻塞移植或动脉闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述眼部异常是白内障。

16.根据权利要求15所述的方法,其中所述白内障与全身性疾病相容,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff综合症、Lowe氏综合症、半乳糖血症、马凡氏综合症、Trismoy 13-15、Alport氏综合症、肌强直性肌营养不良综合症、法布里病、甲状旁腺功能减退症或康拉迪综合征。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

4.根据权利要求3所述的方法,其中所述心血管、内皮或血管生成疾病是动脉疾病例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述免疫性疾病为系统性红斑狼疮;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述骨代谢异常或紊乱为关节炎、骨质疏松症或骨硬化症。

2.根据权利要求1所述的方法,其中所述转基因非人动物与同性别的野生型同窝仔相比表现出至少一种以下生理特征: 在田间试验期间增加的焦虑样反应;在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

22. 来自非人类转基因动物的分离细胞,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , polypéptido PRO1026或 PRO23370。

23. 称义的孤立细胞22什么是小鼠细胞?

24.如权利要求23所述的分离细胞,其中所述小鼠细胞是胚胎干细胞。

23.根据权利要求22所述的细胞分离物,其中所述转基因非人动物相对于同性别的野生型同窝仔畜表现出至少一种以下表型:神经系统疾病;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

26. 鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、 PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO23370多肽,该方法包括:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的基因的改变, PRO1382 编码, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274- , PRO23370多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物的生理特征;

(c) 将(b)测量的生理特性与同属野生型动物的生理特性进行比较,其中非人转基因动物的生理特性不同于野生型动物的生理特性作为非人类转基因动物基因变化的结果表型;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定测试剂是否调节与非人类转基因动物中的基因突变相关的已鉴定表型。

27.根据权利要求26所述的方法,其中与所述基因病症相关的表型包括神经病症;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述神经障碍是在旷野活动测试期间增加的焦虑样反应。

28.如权利要求27所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是旷场活动测试期间焦虑样反应降低。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述神经障碍是笼活动测试期间的异常昼夜节律。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述神经障碍是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。

28.根据权利要求27所述的方法,其中,所述神经障碍是抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述眼部异常是视网膜异常。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述眼部异常与视觉损伤或失明一致。

35.根据权利要求34所述的方法,其中所述视网膜异常与色素性视网膜炎一致。

35.根据权利要求34所述的方法,其中所述视网膜异常的特征在于视网膜变性或视网膜发育不良。

35. 根据权利要求34所述的方法,其中所述视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植新生血管形成、角膜移植排斥反应一致,视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管(红疹)、角新生血管、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜阻塞或移植动脉闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级- Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg 综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述眼部异常是白内障。

40.根据权利要求39所述的方法,其中所述白内障与全身性疾病相容,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff综合症、Lowe氏综合症、半乳糖血症、马凡氏综合症、Trismoy 13-15、Alport氏综合症、肌强直性肌营养不良症、法布里病,甲状旁腺功能减退症或康拉迪综合征。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

28.根据权利要求27所述的方法,其中所述免疫性疾病是系统性红斑狼疮;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

28.如权利要求27所述的方法,其中所述骨代谢异常或紊乱是关节炎、骨质疏松症或骨硬化症。

27.根据权利要求26所述的方法,其中所述非人转基因动物与同性别的野生型同窝仔相比表现出至少一种以下生理特征:在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

46.通过权利要求26的方法鉴定的试剂。

47.根据权利要求46所述的药剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO0, PRO85143。

48. El agente de la reivindicación 47,donde el agonista es un anti-PRO194, anti-PRO220, anti-PRO241, anti-PRO284, anti-PRO331, anti-PRO354, anti-PRO355, anti-PRO533, anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

49. El agente de la reivindicación 47, donde el antagonta es un anti-PRO194、anti-PRO220、anti-PRO241、anti-PRO284、anti-PRO331、anti-PRO354、anti-PRO355、anti-PRO533、anti-PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

50. 一种鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 编码的基因破坏相关的生理特性的试剂的方法PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1020 包含以下方法:或 PRO23370 多肽

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物表现出的生理特征;

(c) 将 (b) 的测量生理特性与同一物种的野生型动物的生理特性进行比较,确定非人类转基因动物所表现出的与野生型动物所表现出的生理特性不同的生理特性作为与基因突变相关的生理特征;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定与基因改变相关的生理特征是否受到调节。

51.如权利要求50所述的方法,其特征在于,与同性别的野生型同窝仔相比,所述转基因非人动物表现出至少一种以下生理特征:在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

52.通过权利要求50的方法鉴定的试剂。

53.根据权利要求52所述的药剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO0, PRO85143。

54. El agente de la reivindicación 53,donde el agonista es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

55. El agente de la reivindicación 53,donde el antagonta es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

56. 一种鉴定调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的基因改变相关的行为的方法,理解方法:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 观察 (a) 的非人类转基因动物表现出的行为;

(c) 将 (b) 的观察到的行为与同性别的野生型动物的行为进行比较,其中观察到的非人类转基因动物表现出的行为不同于鉴定为的野生型动物表现出的观察到的行为一种与基因破坏有关的行为;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 确定试剂是否调节与基因改变相关的行为。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是类似于在现场活动测试期间增加的焦虑的反应。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是在现场活动测试期间减少的类似焦虑的反应。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是在笼活动测试期间的异常昼夜节律。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是在倒置屏幕测试期间改进的运动协调。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是在倒置屏幕测试期间受损的运动协调。

57.根据权利要求56所述的方法,其中所述行为是抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

63.通过权利要求56的方法鉴定的试剂。

64.根据权利要求63所述的药剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO0, PRO85143。

65. El agente de la reivindicación 64, donde el agonista es un anti-PRO194, anti-PRO220, anti-PRO241, anti-PRO284, anti-PRO331, anti-PRO354, anti-PRO355, anti-PRO533, anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

66. El agente de la reivindicación 64, donde el antagonta es un anti-PRO194、anti-PRO220、anti-PRO241、anti-PRO284、anti-PRO331、anti-PRO354、anti-PRO355、anti-PRO533、anti-PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

67. 一种鉴定改善或调节神经障碍的药剂的方法;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 编码的基因缺陷相关的发育异常, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143 PRO4, PRO85141 其中方法包括

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的基因的破坏, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370-多肽;

(b) 对非人类转基因动物施用测试剂;和

(c) 确定测试剂是否改善或调节神经障碍;心血管、内皮或血管生成障碍;眼睛异常;免疫紊乱;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;血脂异常;或非人类转基因动物的发育异常。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述神经障碍是在旷野活动测试期间增加的焦虑样反应。

68.如权利要求67所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是开放场地活动测试期间焦虑样反应降低。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述神经障碍是笼活动测试期间的异常昼夜节律。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述神经障碍是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。

74.根据权利要求73所述的方法,其中所述神经障碍是抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述眼部异常是视网膜异常。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述眼部异常与视觉损伤或失明一致。

75.根据权利要求74所述的方法,其中所述视网膜异常与色素性视网膜炎一致。

75.根据权利要求74所述的方法,其中所述视网膜异常的特征在于视网膜变性或视网膜发育不良。

75. 根据权利要求74所述的方法,其中所述视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植新生血管形成、角膜移植排斥反应一致,视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管(红疹)、角新生血管、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜阻塞或移植动脉闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Kearns-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

68.如权利要求67所述的方法,其中眼部异常是白内障。

80. 如权利要求79所述的方法,其中所述白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff综合症、Lowe综合症、半乳糖血症、马方综合症、Trismoy 13-15、Alport综合症、强直性肌营养不良、法布里病、甲状旁腺功能减退症或康拉迪综合症。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

83.如权利要求67所述的方法,其特征在于,所述免疫病症是系统性红斑狼疮;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

68.如权利要求67所述的方法,其中所述骨代谢异常或紊乱是关节炎、骨质疏松症或骨硬化症。

68.根据权利要求67所述的方法,其中所述非人转基因动物与同性别的野生型同窝仔相比表现出至少一种以下生理特征:在野外活动测试中减少类似焦虑的反应;现场测试期间多动;现场测试期间活动不足;增加现场试验期间的勘探活动;减少现场试验期间的勘探活动;在家庭笼子中进行活动测试时昼夜节律异常,包括走动次数减少;家庭笼子活动测试期间的异常昼夜节律,包括升高的动态计数;增加对新环境的习惯反应;增加对压力引起的体温过高的抵抗力;倒屏测试期间运动协调受损;在尾悬测试期间增加类似抑郁的反应;后悬架测试期间抑郁反应减少;前脉冲抑制试验期间惊吓反应减少;在前脉冲抑制测试期间改善感觉/运动激活/警觉性;减少热板测试中的响应延迟;眼科异常;视网膜色素脱失;水落;心率下降;增加对胰岛素的敏感性;平均空腹血糖水平升高;降低平均血糖水平;平均血清胆固醇水平升高;平均血清甘油三酯水平升高;降低平均血清甘油三酯水平;葡萄糖耐量增加;葡萄糖耐量有限;降低平均血清胰岛素水平;尿酸水平升高;尿酸水平降低;血清磷酸盐水平降低;血清磷酸盐水平升高;胆红素水平升高;尿尿增多;平均血清白蛋白减少;肝病;自然杀伤细胞的平均百分比下降;增加 CD4 细胞的平均百分比; CD4 细胞的平均百分比下降; CD8+ 细胞的平均百分比下降;嗜碱性粒细胞减少;淋巴细胞减少;平均绝对单核细胞计数增加;大红细胞性贫血;红细胞计数减少,血红蛋白减少,血细胞比容减少;平均血小板计数增加;对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应;降低平均血清 IgG2a 对卵清蛋白攻击的反应;增加对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 MCP-1 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应;增加对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 反应;皮肤成纤维细胞增殖增加;脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素增加;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比增加;平均体重增加;增加总组织质量 (TMT);增加瘦体重 (LBM);增加股骨矿物质密度 (BMD);椎骨矿物质密度增加 (BMD);增加 BMC/LBM 比率;骨矿物质密度增加 (BMD);增加骨矿物质含量 (BMC);增加股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积;增加椎骨小梁骨的平均体积、连接的数量和密度;总体脂肪和总脂肪量的平均百分比下降;平均体重下降;平均体长减少;总组织质量 (TMT) 减少;减少瘦体重 (LBM);股骨矿物质密度 (BMD) 降低;椎骨矿物质密度 (BMD) 降低;降低 BMC/LBM 比率;骨密度降低 (BMD);骨矿物质含量 (BMC) 降低;体积骨矿物质密度 (vBMD) 降低;股骨中轴的平均皮质厚度和横截面积减少;平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少;骨营养不良和转移性钙化;减少腹内脂肪;生长迟缓;发育障碍;急性多灶性和肉芽肿性炎症;男性不育症;女性不育症;睾丸退化;男性性腺功能减退症;精子发生缺陷或停滞;睾丸重量减少;炎症和退行性肌病;胰腺腺泡细胞的变化;肾脏增大;肾脏疾病;肌肉疾病;所有器官普遍小型化,发育迟缓;生长迟缓,活力降低;和胚胎致死率。

86.通过权利要求67的方法鉴定的试剂。

87.根据权利要求86所述的药剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO0, PRO85143。

88. El agente de la reivindicación 87,donde el agonista es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

89. El agente de la reivindicación 87,donde el antagonta es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

90.一种通过权利要求67的方法鉴定的治疗剂。

91. 一种鉴定调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4346、PRO6003、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO16090、PRO21340、PRO2165、PRO02、PRO10、PRO10、PRO02、PRO02、PRO02、PRO02

(a) 测试剂与表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的宿主细胞接触, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO212 和多肽

(b) 确定测试试剂是否调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的表达。 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1120 或 PRO302

92.通过权利要求91的方法鉴定的试剂。

93.根据权利要求92所述的药剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556的激动剂或拮抗剂, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO0, PRO85143。

94. El agente de la reivindicación 93,donde el agonista es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

95. El agente de la reivindicación 93, donde el antagonta es un anti-PRO194、anti-PRO220、anti-PRO241、anti-PRO284、anti-PRO331、anti-PRO354、anti-PRO355、anti-PRO533、anti-PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

96. 一种评估治疗剂的方法,该治疗剂能够影响与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、Pro1182、 Pro1325-, Pro1382-, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO PRO1026或PRO23370多肽,该方法包括:

(a) 提供一种非人类转基因动物,其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的基因的改变, PRO1382 编码, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274- , PRO23370多肽;

(b) 测量 (a) 的非人类转基因动物的生理特征;

(c)将(b)测量的生理特性与同属野生型动物的生理特性进行比较,其中识别出转基因非人动物的生理特性不同于野生型动物的生理特性由于非人类转基因动物的基因破坏;

(d) 对 (a) 的非人类转基因动物施用测试剂;和

(e) 评估测试剂对非人类转基因动物中与基因改变相关的已鉴定状况的影响。

97.如权利要求96所述的方法,其中所述病症是神经障碍;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或发育障碍。

98.通过权利要求96的方法鉴定的治疗剂。

99.根据权利要求98所述的治疗剂,其是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555的激动剂或拮抗剂。 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO

100. El terapéutico agent de la reivindicación 99, donde el agonista es un anti-PRO194、anti-PRO220、anti-PRO241、anti-PRO284、anti-PRO331、anti-PRO354、anti-PRO355、anti-PRO533、anti-PRO541 , 抗PRO725, 抗PRO937, 抗PRO1014, 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗抗 PRO1868、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

101. 治疗药物 99,对抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗-PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗抗PRO1868、Anti-PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370。

102. 包含权利要求98的治疗剂的药物组合物。

103. 一种治疗、预防或改善神经障碍的方法;心血管、内皮或血管生成障碍;免疫紊乱;肿瘤疾病;与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 编码的基因破坏相关的代谢性骨异常或紊乱或胚胎致死, Pro1555、Pro1556、Pro1760、Pro1787、Pro1868、Pro4326、Pro4332、Pro4346、Pro4400、Pro6003、Pro6094 将治疗有效量的权利要求 94 的治疗剂给予可能已经患有或倾向于患有该病症的需要这种治疗的患者患有疾病,或其中寻求预防的疾病,或其激动剂或拮抗剂,从而有效地治疗或预防或改善该疾病。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述神经障碍是在旷野活动测试期间增加的焦虑样反应。

104.如权利要求103所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是开放场地活动测试期间焦虑样反应降低。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述神经障碍是笼活动测试期间的异常昼夜节律。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述神经障碍是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述神经障碍是倒置屏幕测试期间的运动协调受损。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述神经障碍是抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述眼部异常是视网膜异常。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述眼部异常与视觉损伤或失明一致。

111.根据权利要求110所述的方法,其中所述视网膜异常与色素性视网膜炎一致。

111.根据权利要求110所述的方法,其中所述视网膜异常的特征在于视网膜变性或视网膜发育不良。

111.根据权利要求110所述的方法,其中所述视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植物新生血管形成、角膜移植物相一致排斥反应、视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管、眼部新生血管疾病、血管再狭窄、动静脉畸形(AVM)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜阻塞或移植动脉闭塞;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级- Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg 综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述眼部异常是白内障。

116.根据权利要求115所述的方法,其中所述白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff综合症、Lowe氏综合症、半乳糖血症、马凡氏综合症、Trismoy 13-15、Alport氏综合症、强直性营养不良综合症、法布里病、甲状旁腺功能减退症,或康拉迪综合症。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

104.根据权利要求103所述的方法,其中所述心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

104. 如权利要求103所述的方法,其中所述免疫病症是系统性红斑狼疮;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

104.如权利要求103所述的方法,其中所述骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症或骨硬化症。

121. 一种鉴定改善或调节神经障碍的药剂的方法;心血管、内皮或血管生成疾病;眼睛异常;免疫系统疾病;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;脂质代谢紊乱;或与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 编码的基因缺陷相关的发育异常, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143 PRO4, PRO85141 其中方法包括

(a) 提供非人转基因动物细胞的培养物,培养物中的每个细胞包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014 的基因的破坏, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9 , PRO1124, PRO10260 或;

(b) 对细胞培养物施用测试剂;和

(c) 确定测试剂是否改善或调节神经障碍;心血管、内皮或血管生成障碍;眼睛异常;免疫紊乱;肿瘤疾病;骨代谢异常或紊乱;血脂异常;或细胞培养发育异常。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述神经障碍是在旷野活动测试期间增加的焦虑样反应。

122.如权利要求121所述的方法,其特征在于,所述神经障碍是旷场活动测试期间焦虑样反应降低。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述神经障碍是笼活动测试期间的异常昼夜节律。

122.如权利要求121所述的方法,其中所述神经障碍是在倒置屏幕测试期间改善的运动协调。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述神经障碍是倒置屏幕测试期间运动协调受损。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述神经障碍是抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏或感觉障碍。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述眼部异常是视网膜异常。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述眼部异常与视觉损伤或失明一致。

129.根据权利要求128所述的方法,其中所述视网膜异常与色素性视网膜炎一致。

129.根据权利要求128所述的方法,其中所述视网膜异常的特征在于视网膜变性或视网膜发育不良。

权利要求128的方法,其中视网膜异常与视网膜发育不良、各种视网膜病包括早产儿视网膜病、晶状体后纤维增生、新生血管性青光眼、年龄相关性黄斑变性、糖尿病性黄斑水肿、角膜新生血管形成、角膜移植新生血管形成、角膜移植排斥反应一致,视网膜/脉络膜新生血管、角新生血管、眼部新生血管疾病血管再狭窄、动静脉畸形(AVMs)、脑膜瘤、血管瘤、血管纤维瘤、甲状腺增生(包括格雷夫斯病)、角膜和其他组织移植、视网膜阻塞或动脉闭塞移植;视网膜变性导致继发性视网膜血管萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂病、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级- Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg 综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述眼部异常是白内障。

134. 如权利要求133所述的方法,其中所述白内障是全身性疾病,例如人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff综合症、Lowe氏综合症、半乳糖血症、马凡氏综合症、Trismoy 13-15、Alport氏综合症、强直性肌营养不良、法布里病、甲状旁腺功能减退症或康拉迪综合症。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述发育异常包括胚胎致死率或存活率降低。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述心血管疾病、内皮疾病或血管生成疾病是动脉疾病,例如糖尿病;视乳头水肿;视神经萎缩;动脉粥样硬化;心绞痛;心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如充血性心力衰竭;高血压;炎性血管炎;雷诺病和雷诺现象;动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;周边血管疾病;癌症,例如血管瘤,例如B. 血管瘤(毛细血管瘤和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤;肿瘤血管生成;外伤,如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、疤痕;缺血再灌注损伤;类风湿关节炎;脑血管疾病;肾脏疾病,如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。

122.根据权利要求121所述的方法,其中所述免疫病症是系统性红斑狼疮;类风湿关节炎;青少年慢性关节炎;脊柱关节病;系统性硬化症(硬皮病);特发性炎症性肌病(皮肌炎,多发性肌炎);干燥综合征;系统性血管炎;结节病;自身免疫性溶血性贫血(免疫性血细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症);自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜,免疫介导的血小板减少症);甲状腺炎(格雷夫氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎);糖尿病;免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,小管间质性肾炎);中枢和周围神经系统的脱髓鞘疾病,例如多发性硬化症、特发性脱髓鞘性多发性神经病或吉兰-巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病;肝胆疾病,如传染性肝炎(甲、乙、丙、丁、戊型肝炎等非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎、硬化性胆管炎;炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病);麸质敏感性肠病和 Whipple 病;自身免疫性或免疫介导的皮肤病,包括起泡性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣;过敏性疾病,如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹;肺部免疫性疾病,如嗜酸性粒细胞性肺炎、特发性肺纤维化和过敏性肺炎;或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。

122.如权利要求121所述的方法,其特征在于,所述骨代谢异常或病症是关节炎、骨质疏松症或骨硬化症。

139.通过索赔程序确定的代理人121.

140.理赔代理人139它是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17601、PRO813267 PRO 的激动剂或拮抗剂, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370。

141. El agente de la reivindicación 140, donde el agonista es un anti-PRO194, anti-PRO220, anti-PRO241, anti-PRO284, anti-PRO331, anti-PRO354, anti-PRO355, anti-PRO533, anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

142. El agente de la reivindicación 140,donde el antagonta es un anti-PRO194,anti-PRO220,anti-PRO241,anti-PRO284,anti-PRO331,anti-PRO354,anti-PRO355,anti-PRO533,anti-PRO541,抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370。

143. 一种通过权利要求的方法鉴定的治疗剂121.

144. 调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 的基因破坏相关的表型的方法, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO196444, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO19644对受试者表型可能已经具有或倾向于具有该表型或其中要预防该表型的受试者,有效量的权利要求46的药剂或其激动剂或拮抗剂,从而有效地调节该表型。

145. 调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 编码的 PRO1382、PRO1410、 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO,该方法包括向受试者给药,其可能已经具有生理特性,或可能趋于表现出生理特性,或可能其中生理特性被阻止,有效量的权利要求52的药剂或其激动剂或拮抗剂,由此生理特性被有效地调节。

146. 一种调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1747、PRO196 可能的行为管理方法已经表现出或倾向于表现出该行为,或者所表现出的行为要被阻止的情况下,有效量的权利要求63的药剂或其激动剂或拮抗剂,从而有效地调节该行为。

147. 一种调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、 PRO1787, Pro1868, Pro4326, Pro432, Pro4346, Pro4400, PRO6003, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO16090, PRO19644, PRO2165, PRO85143 PRO35, Pro1, Pro1, Pro1, Pro1, Pro1, PRO72 PRO1325, PRO1382, PRO15565, PRO15565, PRO1382, PRO15565, PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434326、PRO4400、PRO6003、PRO6044、PRO824、PRO827、PRO624、PRO624 PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽,一种或 2有效调节多肽表达的激动剂或拮抗剂。

148. 调节与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 的基因破坏相关的病症的方法, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644,包括对受试者的给药方法,该条件可能具有或倾向于具有病症或要预防该病症的患者,治疗有效量的权利要求98的治疗剂或其激动剂或拮抗剂,从而有效地调节该病症。

149. 一种治疗、预防或改善神经障碍的方法;心血管、内皮或血管生成障碍;免疫紊乱;肿瘤疾病;与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 编码的基因破坏相关的代谢性骨异常或紊乱或胚胎致死, Pro1555, pro1556, pro1760, pro1787, pro1868, pro4326, pro4332, pro4346, pro4400, pro6003, pro6094 一种向非人转基因动物细胞培养物给药的方法,培养物的每个细胞都包含编码 PRO194 基因的破坏, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937 编码, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO430,264 PRO6003、PRO6094、PRO6244、多肽 PRO92165、PRO130、PRO1243、PRO1243、PRO1243、PRO1243、PRO2 权利要求139的治疗活性剂或其激动剂或拮抗剂,由此有效治疗、预防或减轻病症。

附图的简要说明

飞哥。 1个图1显示了天然序列PRO194 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:1),其中SEQ ID NO:1是本文称为“DNA26844-1394”(UNQ168)的克隆。

飞哥。 2个显示从SEQ ID NO:1所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:2)飞哥。 1个.

飞哥。 3个图1显示了天然序列PRO220 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:3),其中SEQ ID NO:3是本文称为“DNA32298-1132”(UNQ194)的克隆。

飞哥。 4个显示从SEQ ID NO:3所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:4)飞哥。 3个.

飞哥。 5个图1显示了天然序列PRO241 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:5),其中SEQ ID NO:5是本文称为“DNA34392-1170”(UNQ215)的克隆。

飞哥。 6个显示从SEQ ID NO:5所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:6)飞哥。 5个.

飞哥。 7图1显示了天然序列PRO284 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:7),其中SEQ ID NO:7是本文称为“DNA23318-1211”(UNQ247)的克隆。

飞哥。 8个显示从SEQ ID NO:7所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:8)飞哥。 7.

飞哥。 9图1显示了天然序列PRO331 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:9),其中SEQ ID NO:9是本文称为“DNA40981-1234”(UNQ292)的克隆。

飞哥。 10显示从SEQ ID NO:9所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:10)飞哥。 9.

胆小。十一图1显示了天然序列PRO354 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:11),其中SEQ ID NO:11是本文称为“DNA44192-1246”(UNQ311)的克隆。

飞哥。 12显示从SEQ ID NO:11所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:12)胆小。十一.

飞哥。 13图1显示了天然序列PRO355 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:13),其中SEQ ID NO:13是本文称为“DNA39518-1247”(UNQ312)的克隆。

飞哥。 14显示从SEQ ID NO:13所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:14)飞哥。 13.

胆小。十五图1显示了天然序列PRO533 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:15),其中SEQ ID NO:15是本文称为“DNA49435-1219”(UNQ334)的克隆。

胆小。十六显示从SEQ ID NO:15所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:16)胆小。十五.

飞哥。 17图1显示了天然序列PRO541 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:17),其中SEQ ID NO:17是本文称为“DNA45417-1432”(UNQ342)的克隆。

飞哥。 18显示从SEQ ID NO:17所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:18)飞哥。 17.

飞哥。 19图1显示了天然序列PRO725 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:19),其中SEQ ID NO:19是本文称为“DNA52758-1399”(UNQ390)的克隆。

胆小。二十显示从SEQ ID NO:19所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:20)飞哥。 19.

胆小。 21图1显示了天然序列PRO937 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:21),其中SEQ ID NO:21是本文称为“DNA56436-1448”(UNQ474)的克隆。

飞哥。 22显示从SEQ ID NO:21所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:22)胆小。 21.

飞哥。 23图1显示了天然序列PRO1014 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:23),其中SEQ ID NO:23是本文称为“DNA56409-1377”(UNQ497)的克隆。

飞哥。 24显示从SEQ ID NO:23所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:24)飞哥。 23.

飞哥。 25图1显示了天然序列PRO1120 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:25),其中SEQ ID NO:25是本文称为“DNA48606-1479”(UNQ559)的克隆。

飞哥。 26显示从SEQ ID NO:25所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:26)飞哥。 25.

飞哥。 27图1显示了天然序列PRO1182 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:27),其中SEQ ID NO:27是本文称为“DNA59848-1512”(UNQ596)的克隆。

飞哥。 28显示从SEQ ID NO:27所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:28)飞哥。 27.

飞哥。 29图1显示了天然序列PRO1325 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:29),其中SEQ ID NO:29是本文称为“DNA66659-1593”(UNQ685)的克隆。

飞哥。 30显示从SEQ ID NO:29所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:30)飞哥。 29.

飞哥。 31图1显示了天然序列PRO1382 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:31),其中SEQ ID NO:31是本文称为“DNA66526-1616”(UNQ718)的克隆。

飞哥。 32显示从SEQ ID NO:31所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:32)飞哥。 31.

飞哥。 33图1显示了天然序列PRO1410 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:33),其中SEQ ID NO:33是本文称为“DNA68874-1622”(UNQ728)的克隆。

飞哥。 3. 4显示从SEQ ID NO:33所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:34)飞哥。 33.

飞哥。 35图1显示了天然序列PRO1555 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:35),其中SEQ ID NO:35是本文称为“DNA73744-1665”(UNQ763)的克隆。

飞哥。 36显示从SEQ ID NO:35所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:36)飞哥。 35.

飞哥。 37图1显示了天然序列PRO1556 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:37),其中SEQ ID NO:37是本文称为“DNA76529-1666”(UNQ764)的克隆。

飞哥。 38显示从SEQ ID NO:37所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:38)飞哥。 37.

飞哥。 39图1显示了天然序列PRO1760 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:39),其中SEQ ID NO:39是本文称为“DNA76532-1702”(UNQ833)的克隆。

飞哥。 40显示从SEQ ID NO:39所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:40)飞哥。 39.

飞哥。 41图1显示了天然序列PRO1787 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:41),其中SEQ ID NO:41是本文称为“DNA76510-2504”(UNQ849)的克隆。

飞哥。 42显示从SEQ ID NO:41所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:42)飞哥。 41.

飞哥。 43图1显示了天然序列PRO1868 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:43),其中SEQ ID NO:43是本文称为“DNA77624-2515”(UNQ859)的克隆。

飞哥。 44显示从SEQ ID NO:43所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:44)飞哥。 43.

胆小。四五图1显示了天然序列PRO4326 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:45),其中SEQ ID NO:45是本文称为“DNA91779-2571”(UNQ1883)的克隆。

飞哥。 46显示从SEQ ID NO:45所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:46)胆小。四五.

飞哥。 47图1显示了天然序列PRO4332 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:47),其中SEQ ID NO:47是本文称为“DNA100272-2969”(UNQ1887)的克隆。

飞哥。 48岁显示从SEQ ID NO:47所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:48)飞哥。 47.

飞哥。 49图1显示了天然序列PRO4346 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:49),其中SEQ ID NO:49是本文称为“DNA86594-2587”(UNQ1900)的克隆。

胆小。五十显示从SEQ ID NO:49所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:50)飞哥。 49.

飞哥。 51图1显示了天然序列PRO4400 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:51),其中SEQ ID NO:51是本文称为“DNA87974-2609”(UNQ1925)的克隆。

飞哥。 52显示从SEQ ID NO:51所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:52)飞哥。 51.

飞哥。 53图1显示了天然序列PRO6003 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:53),其中SEQ ID NO:53是本文称为“DNA83568-2692”(UNQ2514)的克隆。

飞哥。 54显示从SEQ ID NO:53所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:54)飞哥。 53.

飞哥。 55图1显示了天然序列PRO6094 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:55),其中SEQ ID NO:55是本文称为“DNA96995-2709”(UNQ2542)的克隆。

飞哥。 56显示从SEQ ID NO:55所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:56)飞哥。 55.

飞哥。 57图1显示了天然序列PRO6244 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:57),其中SEQ ID NO:57是本文称为“DNA108743-2722”(UNQ2564)的克隆。

飞哥。 58显示从SEQ ID NO:57所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:58)飞哥。 57.

飞哥。 59图1显示了天然序列PRO9820 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:59),其中SEQ ID NO:59是本文称为“DNA108769-2765”(UNQ3022)的克隆。

飞哥。 60显示从SEQ ID NO:59所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:60)飞哥。 59.

飞哥。 61图1显示了天然序列PRO9828 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:61),其中SEQ ID NO:61是本文称为“DNA142238-2768”(UNQ3027)的克隆。

飞哥。 62显示从SEQ ID NO:61所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:62)飞哥。 61.

飞哥。 63图1显示了天然序列PRO10274 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:63),其中SEQ ID NO:63是本文称为“DNA139686-2823”(UNQ3122)的克隆。

飞哥。 64显示从SEQ ID NO:63所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:64)飞哥。 63.

胆小。六十五图1显示了天然序列PRO16090 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:65),其中SEQ ID NO:65是本文称为“DNA144844-2843”(UNQ5783)的克隆。

飞哥。 66显示从SEQ ID NO:65所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:66)胆小。六十五.

飞哥。 67图1显示了天然序列PRO19644 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:67),其中SEQ ID NO:67是本文称为“DNA139592-2866”(UNQ5825)的克隆。

飞哥。 68显示从SEQ ID NO:67所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:68)飞哥。 67.

飞哥。 69图1显示了天然序列PRO21340 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:69),其中SEQ ID NO:69是本文称为“DNA176775-2957”(UNQ5982)的克隆。

飞哥。 70显示从SEQ ID NO:69所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:70)飞哥。 69.

飞哥。 71图1显示了天然序列PRO92165 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:71),其中SEQ ID NO:71是本文称为“DNA340392”(UNQ17826)的克隆。

飞哥。 72显示从SEQ ID NO:71所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:72)飞哥。 71.

飞哥。 73图12显示了天然序列PRO85143 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:73),其中SEQ ID NO:73是本文称为“DNA340394”(UNQ11831)的克隆。

飞哥。 74显示从SEQ ID NO:73所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:74)飞哥。 73.

飞哥。 75图1显示了天然序列PRO1124 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:75),其中SEQ ID NO:75是本文称为“DNA60629-1481”(UNQ18919)的克隆。

飞哥。 76显示从SEQ ID NO:75所示的编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:76)飞哥。 75.

飞哥。 77图1显示了天然序列PRO1026 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:77),其中SEQ ID NO:77是本文称为“DNA59613-1417”(UNQ511)的克隆。

飞哥。 78显示从SEQ ID NO:77所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:78)飞哥。 77.

飞哥。 79图1显示了天然序列PRO23370 cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO:79),其中SEQ ID NO:79是本文称为“DNA193963”(UNQ8344)的克隆。

飞哥。 80显示从SEQ ID NO:79所示编码序列推导的氨基酸序列(SEQ ID NO:80)飞哥。 79.

优选实施例的详细描述

一、定义

如本文所用且紧跟数字名称的术语“PRO多肽”和“PRO”指各种多肽,其中完整名称(即PRO/数字)指本文所述的序列特异性多肽。如本文所用,术语“PRO/多肽编号”和“PRO/编号”,其中术语“编号”作为实际数字名称提供,涵盖天然序列多肽和多肽变体(其在本文中进一步定义)。 PRO194 PRO220 PRO241 PRO284 PRO331 PRO354 PRO355 PRO533 PRO541 PRO725 PRO937 PRO1014 PRO1120 PRO1182 PRO1325 PRO1382 PRO1410 PRO1555 PRO1556 PRO1760 PRO1787 PRO1868 PRO344434 PRO4343, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026或 PRO23370 可以从多种来源分离,例如从人体组织类型或从其他来源分离。或通过重组或合成方法生产。术语“PRO 多肽”是指本文所述的任何单个 PRO 多肽/PRO 编号。本说明书中提及“PRO多肽”的所有公开内容单独和共同指代每一种多肽。例如,针对或针对或针对抗体的抗体的制造、纯化、衍生、形成、施用、包含的组合物、疾病的治疗等的描述分别指代本发明的每种多肽。术语“PRO 多肽”还包括本文所述的 PRO/Count 多肽的变体。

A"原生序列 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, 4 PRO4338, PRO4338 PRO4338.68、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽”包括具有相同氨基酸序列的相应多肽 PRO2414,2 PRO414,PRO4114,PRO4114 PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO40436, PRO60432, PRO40432 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 天然来源的多肽。PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17360、PRO182434、PRO18248、PRO18248、PRO18268 , , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO98204, PRO98204, PRO98204, PRO982494, PRO982494, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以从自然界分离或重组或合成产生。术语“天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43402 PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽”具体包括特定天然存在的或分泌的截短 PRO19 形式,PRO2、PRO30、PRO412、PRO3554 PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO43268、PRO4326、PRO43302 PRO604、PRO404、PRO304、PRO16064、PRO16094、PRO6 PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370(例如细胞外结构域序列)、野生型变体(例如替代形式)和多肽的剪接等位基因野生型变体本发明提供了天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、 PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43868、PRO4332、PRO4346、PRO604400 PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO21370、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO23370 或成熟多肽的完整天然序列包括附图所示长度的氨基酸序列。起始密码子和终止密码子在图中以粗体显示并加下划线。但是,虽然 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43468、PRO48468、PRO484684附图中描述的PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026或PRO23370均从该甲硫氨酸残留文件开始显示。图中第 1 位氨基酸,可以想象和可能的是,位于图中第 1 位氨基酸上游或下游的其他甲硫氨酸残基可用作 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、 PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326 PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370多肽。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, 或 PRO23370 “细胞外结构域”或“ECD”多肽是指 PRO194、PRO、PRO、PRO241200 的一种形式PRO241200 PRO241200 Per354, Pro354, Pro355, Pro355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO725, Pro725, PRO937, per 1014, Pro937, per1014, per118, PO1182, PRO1182, PRO1182, PRO1325, POL1182, PRO118132 PRO25, PRO1182, PRO118132 PRO25 , POL1410, PO885, POL1555, POL1556, POL1760, PRO1787, PRO1868, per4326 per9828, per 10274, PRO16090, PRO16090, PRO19090, PROs16090, PRO16090, PRO19090, Pro. PRO1124, PRO16090, PRO16090, PRO19090, PROs16090, PRO16090, PRO19090, Pro. PRO1124, PRO10276 或 PRO23 的游离细胞质结构域通常是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO411326、PRO411326、PRO411326、PRO411326、PRO411326 , PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 ECD 多肽将优选具有少于 1% 的跨膜和/或胞质结构域将具有更少并且最好少于这些域的 0.5%。据了解,为 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1868、 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO2333 识别疏水域。跨膜结构域的精确边界可能不同,但最有可能不超过本文最初确定的结构域任一端的 5 个氨基酸。任选地,PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17860、PRO1760、PRO1760 PRO1868 PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 边界和胞外结构域描述可能包含更少的跨膜结构域实施例多肽,有或没有相关的信号肽,以及编码它们的核酸都在本发明的考虑范围之内。

各种PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO23370 中所示的多肽。和/或随附的插图。然而,应注意,信号肽的 C 末端边界可以变化,但很可能在信号肽的 C 末端边界任一侧不超过 5 个氨基酸,如本文最初鉴定的,其中 C-信号肽的末端边界可以根据本领域常用的标准来鉴定此类氨基酸序列元件(例如,Nielsen 等人,保护。英格。10:1-6 (1997) 和 Heinje 等人,酸核。牛肉。14:4683-4690 (1986))。此外,还认识到在一些情况下,信号序列从分泌多肽的切割不完全一致,导致不止一种分泌种类。本发明涵盖其中信号肽在本文鉴定的信号肽C末端边界任一侧不超过约5个氨基酸内被切割的那些成熟多肽,以及编码它们的多核苷酸。

“PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864、PRO346.4、PRO346. .44、PRO346.44、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 策略变体”是指 PRO194、PRO220、PRO3、PRO3、PRO5、 5、PRO3、PRO3、PRO3、PRO3、PRO5、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO14090 , PRO82094 PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 O PRO23370, 优先选择 UN Polipéptido Activo Pro194, Pro220, Pro284, Pro354, PRO53, PRO72, Pro11, Pro11, Pro11, Pro15, PRO11, PRO117, Pro115 , PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO19644, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644 de amino acid secuencia with a native secuencia de longitud1 PRO1455, PRO1455, PRO14582, PRO5 , PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO199, PRO2917424, PRO2927424, PRO2987428, PRO2987428 PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 describe polypeptide secuencia como se aquí, a PRO194, PRO220 , PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO31, PRO1285, PRO155410, PRO155410, PRO1760, PRO1787, PRO18687, PRO18687, PRO4326, PRO4304,6 PRO4326, PRO4304,6 PRO4346,6 PRO43462,6 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 que carecen de la secuencia polypeptidica Señal descrita aquí como dominio PRO194, PRO220, PRO13,4, PRO5,4,3, PRO243,3 PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO15510, PRO15510, PRO1863.3421 PRO1863.341 PRO1863.341 PRO1787 , PRO434326, PRO434326 PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 polipéptido, con o sin el péptido señal, comose description aquí o cualquier otro fragmento de a polypéptido de longitud completa PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO534, PRO3431 PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO15565 , PRO1760, PRO434327, PRO418687, PRO PRO434326, PRO434326 PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 polipeptídica como se describe en este documento ( como las codificadas por ácido Nucleico que representa only one secuencia de codificación complete para un PRO194, PRO220, PRO241, PRO245, PRO345,3 , PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1770, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094,PRO6094,PRO9824, PRO9824 、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370)。 TALES PRO194,PRO220,PRO241,PRO284,PRO331,PRO354,PRO355,PRO533,PRO533,PRO541,PRO725,PRO725,PRO937,PRO114,PRO1120,PRO1182,PRO1325,PRO1325,PRO1382,PRO1410,PRO1410,PRO1555,PRO1555555555555555555555555555555555555, ,pro6244,pro9820,pro9828,pro10274,pro19644,pro21340,pro21340,pro92165,pro1124,pro1126 o pro23370 inpluyen,por ejemplo,pro220,pro3,pro3,pro3,pro1120,pro1120,pro1120,pro1182,pro182,pro182,pro182,pro1382,pro14282,pro PRO1382,PRO1382,PRO1382,PRO1382,PRO1382,Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro10参谋,Pro4326,Pro4332,Pro4346,Pro4400,Pro6003,Pro6094,Pro98204,Pro98204,Pro98204,Pro98204,Pro98247,Pro16090,Pro19644,Pro19644,pro21340,Pro21340,Pro92165,Pro92165,Pro92165,Pro92165,Pro92143,Pro.8555143,Pro Pro Proy35143 aminoácidos en el extremo N o C de la secuencia de aminoácidos nativa de longitud completa。正常,UN PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO4434606、PRO4434606、PRO4434606、PRO1760 , PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 variante polipeptídica tendrá o tendrá al menos aproximadamente 80% de identidad de secuencia de aminoácidos, alternativamente tendrá o tendrá al menos alrededor删除 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97 %、98% 或 99% 的氨基酸同一性,完全天然安全PRO1760 PRO1787 PRO1868 PRO4326 PRO4332 PRO4346 PRO4400 PRO6003 PRO6094 PRO6244 PRO9820 , PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO15555 , PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO404, PRO43046, PRO43046 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 PRO370 que carecen de la secuencia del polypétido señal extracellular, PRO2209 un1o4 PRO229 un370 aqui4 o PRO , PRO241, PRO31, PRO31, PRO22 PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO17687, PRO1, PRO4326, PRO4332, PRO46030, PRO6408036, PRO6404036, PRO6404034 PRO62094、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 政策,有或没有 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO3 PRO34.35、PRO35、PRO .5、 PRO937、PRO1120、PRO182、PRO1325、PRO1410、PRO155、PRO1556、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4400、PRO6003、PRO6244、pro、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370,如它们所述。 Normale, PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO433264, PRO433264, PRO433264, PRO433264 变体Pro4400, Pro6003, Pro6094, Pro6244, Pro9820, Pro9828, Pro10274, Pro16090 经度 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160 170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、 420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600 经度或更多。可选,PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1828、PRO446 变体, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 没有保护 PRO1 保护层。 PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO604326, PRO604324, PRO604324, PRO43044 PRO9820 , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 secuencia polypeptídica,alternate tendrá o no tendrá más 2, 3, 4, 5, 6, 8 与 22 PRO, PRO2104 相比,10 个保守氨基酸PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, Nativos PRO1605, PRO16055 PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4094,6 PRO6409,6 PRO64094,6 PRO64094 ,6 PRO4094,6 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的“氨基酸序列同一性百分比” , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1037, PRO23 中氨基酸残基的百分比本文鉴定的候选多肽序列与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 Specific、Pro1382、PRO1410、PRO1555-中的氨基酸残基相同, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO23370 序列比对和引入缺口后的多肽序列,如有需要,可订购实现最大百分比序列同一性,并且不考虑任何保守取代作为序列同一性的一部分。可以以本领域技术人员已知的多种方式完成用于确定氨基酸序列同一性百分比的比对,例如使用公开可用的软件,例如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign (DNASTAR)。 .本领域的技术人员可以确定用于测量比对的适当参数,包括在待比较序列的全长上实现最大比对所必需的算法。然而,出于本文件的目的,氨基酸序列同一性百分比值是使用 ALIGN-2 序列比较计算机程序生成的,其中 ALIGN-2 程序的完整源代码在下表 1 中提供。 ALIGN-2 序列比较软件由 Genentech, Inc. 创建,下表 1 中显示的源代码与用户文档一起存放在美国版权局 TXU510087。 ALIGN-2 程序可通过加利福尼亚州南旧金山的基因泰克公司公开获得。或者它可以从下面表 1 中提供的源代码编译。必须编译 ALIGN-2 程序以在 UNIX 操作系统上使用,最好是 Digital UNIX V4.0D。所有序列比较参数均由 ALIGN-2 程序设置,不会发生变化。

在 ALIGN-2 用于氨基酸序列比较的情况下,给定氨基酸序列 A 与给定氨基酸序列 B 的氨基酸序列同一性百分比(也可以表示为给定的氨基酸序列与给定氨基酸序列B)具有或包含给定氨基酸序列同一性百分比的序列A计算如下:

分数 X/Y 的 100 倍

其中 X 是 ALIGN-2 序列比对程序在 A 和 B 的比对中归类为相同匹配的氨基酸残基数,其中 Y 是 B 中氨基酸残基的总数 氨基酸序列的长度A不等于氨基酸序列B的长度,从A到B的氨基酸序列同一性百分比将不等于从B到A的氨基酸序列同一性百分比。作为使用该方法计算氨基酸序列同一性百分比的示例,表 2 和表 3 显示了如何计算指定为“比较蛋白”的氨基酸序列与指定为“PRO”的氨基酸序列的百分比氨基酸序列同一性,其中“ PRO”表示假设感兴趣的PRO多肽的氨基酸序列,“比较蛋白”表示与感兴趣的“PRO”多肽进行比较的多肽的氨基酸序列,“X”、“Y”和“Z”每个代表不同的假设氨基酸残基。除非另有明确说明,本文使用的所有百分比氨基酸序列同一性值均使用前一段中所述的 ALIGN-2 计算机程序获得。

“PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864、PRO346.4、PRO346. .44、PRO346.44、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多核苷酸变体”或“PRO194、PRO223、PRO3、PRO241 , PRO937, PRO3, PRO937, PRO937 Pro1014, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1868, PRO4326, PRO4346, PRO4400, PRO6094, PRO9820, PRO1028, PRO 试用版 PRO85143, PRO1124, PRO10376 或 PRO2376指编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO1、PRO1、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326 的核酸分子, PRO4332, Pro4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, , PRO1124, PRO1026 或 PRO23370, 最好在政策中PRO1325, PRO1410, PRO15565, PRO17655, PRO1868, PRO4326, PRO4346, PRO4094, pro PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 oder PRO23, que tiene al menos polypéptido definido aproximadamente el aproximadamente el 80 % de identidad de secuencia de acidouencia con acidouencia secuencia nativa completa PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354 PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1550,8, PRO18766 , PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽序列代表 aqui, una secuencia de longituencia nativa, PRO21, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO11382, PRO11812 , PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1787, PRO4326, PRO4403, PRO6, PRO9820, PRO16090, PRO19644, PRO2165, PRO2165, PRO2165, PRO9243 de una secuencia peptídica señal señal como se description aquí。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1788、PRO343pidodo、PRO343pidodo、PRO3436 , PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO92165, PRO85143, PRO23370, 有或没有本文件的序号12, PRO3, PRO3, PRO5431 , PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO384, PRO3868 PRO4346, PRO4400, PRO9624903, PRO9624903, PRO PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165 , PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 Secuencia 多肽,构成 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO351、PRO35、4、3 PRO35、4、3、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014 的单一文件 de la secuencia de codificación completa , PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, (或多肽)。正常,UN PRO194,PRO220,PRO241,PRO284,PRO331,PRO354,PRO355,PRO533,PRO541,PRO725,PRO937,PRO1014,PRO1120,PRO1182,PRO1325,PRO1382,PRO1410,PRO1555,PRO1556,PRO1760,PRO1787,PRO44308,PRO4 , Pro6094, Pro6244, Pro9820, Pro9828, Pro10274, Pro16090, Pro19644, Pro21340, Pro92165, Pro85143, Pro1124, Pro1。 o tendrá al menos alrededor del 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96 %, 97 %, 98 % or 99 % de identidad de acido Nucleico con a sécuencia de ácido Nucleico que codifica una secuencia de longitud completa PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541 , Pro725、PRO937、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1410、PRO1555、PRO156、PRO1760、PRO1868、PRO4326、PRO4346、PRO6003、PRO6244、PROPRO 2165、PRO PRO0、Pro. Secuencia Polypeptídica como se description en este documento, una secuencia de lontiva nativa完整的 PRO194,PRO220,PRO241,PRO284,PRO331,PRO354,PRO355,PRO533,PRO541,PRO725,PRO937,PRO1014,PRO1120,PRO1182,PRO1325,PRO15825,PRO15825,PRO15825 PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, Secuencia del polypéptido PRO23370 que carece del péptido senal como se4 translate en1 PROdomini, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO10202,1 PRO135, PRO135 ,PRO1382,PRO1410,PRO1555,PRO1556,PRO1760,PRO1787,PRO1868,PRO436,PRO4326 PRO4400,PRO9624403,PRO9624403,PRO9626003,PRO9626003 PRO9828,PRO10274,PRO16090,PRO19644,PRO21340。 la secuencia de señal, como se description aquí o cualquier otro fragmento de PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, 经度完整,Pro1555,Pro1556,Pro1760,Pro1787,Pro1868,Pro4326,Pro4332,Pro4346,Pro4346,Pro4400,Pro6003,Pro6094,Pro6244,Pro6244,Pro9828,Pro9828,Pro1028,Pro10274,Pro1609019044444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 4在此处。 Las variationes no abarcan la secuencia de nucleótidos nativa。

典型的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO4.343 PRO1.3 多核苷酸, PRO4.328, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 的长度为至少约 5 个核苷酸,或者至少约 6 个核苷酸, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、 180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、 410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、 660, 670, 680, 690, 700, 710, 720, 730, 740, 750, 760, 770, 780, 790, 800, 810, 820, 830, 840, 850, 860, 870, 880, 890, 900, 910、920、930、940、950、960、970、980、990 或 1000 个核苷酸长度,在上下文中,术语“大约”是指所引用的核苷酸序列的长度加上或减去该引用长度的 10%。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的“核酸序列同一性百分比 (%)” , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, 本文鉴定的核酸序列编码 PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO11324, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO11364, PRO201作为候选序列中与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的核苷酸相同的核苷酸的百分比, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO186286, PRO24, PRO , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO30 或 PRO1124 输入所需的核酸序列并在必要时对齐它们以实现最大百分比的序列同一性。可以通过本领域技术人员已知的多种方式完成用于确定核酸序列同一性百分比的比对,例如使用公开可用的软件,例如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign (DNASTAR)。然而,出于本文件的目的,百分比核酸序列同一性分数是使用 ALIGN-2 序列比较软件生成的,其中 ALIGN-2 软件的完整源代码在下表 1 中提供。 ALIGN-2 序列比较软件由 Genentech, Inc. 创建,下表 1 中显示的源代码与用户文档一起存放在美国版权局 TXU510087。 ALIGN-2 程序可通过加利福尼亚州南旧金山的基因泰克公司公开获得。或者它可以从下面表 1 中提供的源代码编译。必须编译 ALIGN-2 程序以在 UNIX 操作系统上使用,最好是 Digital UNIX V4.0D。所有序列比较参数均由 ALIGN-2 程序设置,不会发生变化。

在 ALIGN-2 用于核酸序列比较的情况下,给定核酸序列 C 与、与或针对给定核酸序列 D 的核酸序列同一性百分比(可替代地表示为给定核酸序列C与给定的核酸序列D)具有或包含特定百分比的核酸序列同一性,如下计算:

分数 W/Z 的 100 倍

其中 W 是在该程序对 C 和 D 的比对中被 ALIGN-2 序列比对程序评分为相同匹配的核苷酸数,其中 Z 是 D 核酸序列 C 中长度不等于 D 的核苷酸总数核酸序列为 D,从 C 到 D 的核酸序列同一性百分比不对应于 D 到 C 的核酸序列同一性百分比。核酸序列同一性百分比的计算示例如下:表 4 和表 5 显示了百分比称为“比较 DNA”的核酸序列与表示为“PRO-DNA”的核酸序列相比的核酸序列同一性,其中“PRO-DNA”表示编码感兴趣的 PRO 序列的假设核酸,“比较 DNA” "代表与"PRO-DNA"匹配的核酸分子的核苷酸序列-比较感兴趣的核酸分子,"N"、"L"和"V"各自代表假设的不同核苷酸。除非另有明确说明,本文使用的所有百分比核酸序列同一性值均使用上一段中所述的 ALIGN-2 计算机程序获得。

本发明还提供PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO4488386 . PRO4 PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828 , PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO4346, PRO4400, PRO23370 PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO8020、PRO60246、PRO60246、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽以及那些能够编码核苷酸序列的优选严格杂交和洗涤条件的多肽全长 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18268、PRO4 PRO4040,04040,04362,0 PRO6094、PRO8284、PRO8284 B. PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO10260 或 PRO10260 多肽,如本文所述。 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO60904 聚, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以是那些由 PRO194, PRO220, PRO31, PRO32, PRO330, PRO371, Pro725, Pro91204, Pro11037, Pro11037 Pro1182, Pro1325, Pro1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO862404, 变体多核苷酸 PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO27024, PRO27024, PRO17024, PRO815124

当与编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、Pro1325、Pro1382 的核酸相关使用时,术语“全长编码区”编码, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO23370多肽是指编码PRO241,PRO21,PRO21,PRO2420,PRO2420,PRO2420,PRO2420,PRO2420,PRO23370的核苷酸序列PRO2420 PRO31编码PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1756, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO44046.44, PRO4346, PRO44046.44, PRO44046.44 , PRO6007241, PRO6003.949-, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO233 多肽通常展示本发明的起始密码子和终止密码子的间肽,包括附图中的那些)。当与 ATCC 保藏核酸相关使用时,术语“全长编码区”是指 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120、PRO1182、PRO1325 , PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRONAD2 c03 编码多肽的一部分,插入到保藏的载体中ATCC(通常显示在附图中的起始密码子和终止密码子之间并包括在内)。

当用于描述本文所述的各种多肽时,“分离的”是指已经从其天然环境的组分中鉴定和分离和/或回收的多肽。其自然环境的污染物是通常会干扰多肽的诊断或治疗用途的物质,并且可能包括酶、激素和其他蛋白质或非蛋白质溶质。本发明提供多肽被 (1) 纯化到足以使用旋转杯测序仪获得至少 15 个内部或 N 末端氨基酸序列残基的程度,或 (2) 在非还原条件下通过 SDS-PAGE 达到同质性或使用考马斯蓝染色或优选银染的还原条件。分离的多肽包括重组细胞内的原位多肽,作为 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的至少一个组分。 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340,通常不存在但至少在分离清洗步骤中产生的多肽.

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO41868、PRO436 编码的核酸从至少一种污染核酸分子中鉴定并分离的多肽,该污染核酸分子通常与编码该多肽的核酸的天然来源相关联。编码分离的多肽的核酸分子不具有它在自然界中出现的形式或环境。因此,编码分离的多肽的核酸分子与编码天然细胞中发现的特定多肽的核酸分子不同。然而,分离的多肽编码核酸分子包括包含在正常表达多肽的细胞中的多肽编码核酸分子,例如,其中核酸分子位于与天然细胞不同的染色体位置。

术语“控制序列”是指在特定宿主生物体中表达可操作连接的编码序列所需的DNA序列。适用于原核生物的控制序列,例如,包括启动子、可选的操纵子序列和核糖体结合位点。已知真核细胞使用启动子、聚腺苷酸化信号和增强子。

当核酸与另一个核酸序列建立功能关系时,它就是“有效连接”的。例如,当前序列或分泌前导序列的 DNA 被表达为参与多肽分泌的前蛋白时,它与多肽的 DNA 可操作连接;如果启动子或增强子影响序列的转录,则启动子或增强子可操作地连接到编码序列;或者核糖体结合位点在定位以促进翻译时可操作地连接到编码序列。通常,“可操作地连接”是指待连接的 DNA 序列是连续的,并且在分泌前导序列的情况下是连续的并且在阅读框中。然而,增强子不需要是连续的。连接是通过在方便的限制位点连接来完成的。如果不存在此类位点,则根据常规做法使用合成的寡核苷酸衔接子或接头。

杂交反应的“严格性”可由本领域普通技术人员容易地确定,并且通常是取决于探针长度、洗涤温度和盐浓度的经验估计。一般来说,较长的探针需要较高的温度才能进行适当的退火,而较短的探针则需要较低的温度。当互补链存在于低于其解链温度的环境中时,杂交通常取决于变性 DNA 杂交的能力。探针和可杂交序列之间所需的同源性程度越高,可以使用的相对温度就越高。由此可见,较高的相对温度往往会使反应条件更严格,而较低的温度会使它们不那么严格。有关杂交反应严格性的更多详细信息和解释,请参阅 Ausubel 等人,分子生物学的当前协议, Wiley Interscience Publishers, (1995)。

本文定义的“强度条件”或“高度严格条件”可通过以下条件确定:(1)使用低离子强度和高温洗涤,例如0.015M氯化钠/0.0015M柠檬酸钠/0.1%十二烷基硫酸钠在 50°C; (2) 在杂交过程中使用甲酰胺等变性剂,例如 50% (v/v) 甲酰胺与 0.1% 牛血清白蛋白/0.1% Ficoll/0.1% 聚乙烯吡咯烷酮/50mM 磷酸钠缓冲液 pH 6.5,750 mM 氯化钠,75 mM 柠檬酸钠,42°C;或 (3) 50% 甲酰胺、5X SSC(0.75 M NaCl、0.075 M 柠檬酸钠)、50 mM 磷酸钠(pH 6.8)、0.1% 焦磷酸钠、Denhardt 溶液 5X、超声处理的鲑鱼精子 DNA(50 μg/ml), 0.1% SDS 和 10% 硫酸葡聚糖在 42 °C 下,在 42 °C 下在 0.2 x SSC(氯化钠/柠檬酸钠)和 50% 甲酰胺中在 55 °C 下洗涤,然后进行由 0.1X SSC 组成的高严格性洗涤在 55°C 下使用 EDTA。

正如 Sambrook 等人所报告的那样,可以确定“适度严格的条件”。描述,分子克隆:实验室手册, New York: Cold Spring Harbor Press, 1989,并涉及使用不如上述那些严格的洗涤溶液和杂交条件(例如,温度、离子强度和%SDS)。中度严格条件的一个例子是在 37°C 的溶液中过夜孵育,该溶液包含:20% 甲酰胺、5x SSC(150mM NaCl、15mM 柠檬酸三钠)、50mM 磷酸钠(pH 7.6)、5x Denhardt 溶液、10% 硫酸葡聚糖和20 mg/ml 变性、剪切的鲑鱼精子 DNA,然后在约 37-50°C 的 1xSSC 中清洗过滤器。本领域技术人员将认识到如何调节温度、离子强度等。根据需要考虑诸如探头长度等因素。

如本文所用,术语“表位标记的”是指嵌合多肽,其包含PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO21344。标记多肽”。标签多肽具有足够的残基以提供可以针对其产生抗体的表位,但又足够短以至于它不会干扰与其融合的多肽的活性。优选地,标记多肽还足够独特,使得抗体基本上不与其他表位发生交叉反应。合适的标签多肽通常具有至少六个氨基酸残基并且通常具有约8至50个氨基酸残基(优选约10至20个氨基酸残基)。

此处的“活性”或“活性”是指 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 表格, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO196444 保留 PRO, PRO31, PRO3 PRO354, PRO353, PRO53, PRO53, PRO53, PRO53, PRO354 PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 原生或天然、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO40、PRO4362、PRO60940、PRO624.4、PRO9820、PRO108274、PRO108278 , PRO19644, 活性是指由 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、原生或自然的。 PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polypeptide除了能够诱导产生针对具有天然或天然 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 PRO1182、 Pro1325、Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO-PRO23370 多肽和“免疫”活性是指诱导生产的能力针对编码天然或天然 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541 的抗原表位的抗体。 PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO21340、PRO92165、PRO85243

术语“拮抗剂”以其最广义使用[除非另有说明],包括部分或完全阻断、抑制或中和 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、天然 PRO355 的生物活性的任何分子。 、PRO533、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1325、PRO1410、PRO155、PRO1760、PRO1787、PRO4326、PRO432、PRO16090、PRO2164、Pro216 或本文所述的 PRO23370 多肽。类似地,术语“激动剂”以其最广义使用[除非另有说明]并且包括模拟天然PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541的生物活性的任何分子。 , PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO15556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO644, PRO928, PRO92444444444444, PRO9244, PRO924444444, PRO9244444 B. PRO92444444、PRO924444444444444、PRO9244、PRO92444444444444444ES、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽。合适的激动剂或拮抗剂分子特别包括激动剂或拮抗剂抗体或抗体片段、PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、Pro1182 的片段或氨基酸序列变体native B. Pro1325, Pro1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 多肽等小分子,有机PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1868 的激动剂或拮抗剂的鉴定方法, 4 PRO43468、4 PRO43032、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽可以包括接触 PRO23370、PRO24、PRO2194、PRO24、PRO2199、PRO24、PRO2199 PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17860、PRO18670、PRO4326、PRO4332、PRO604、PRO604、PRO48、PRO48、PRO48、PRO151245、PRO8151245 PRO23370 测量激动剂或拮抗剂候选分子的可检测变化的多肽,一种或多种通常与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533 Pros541、Pro541、Pro725、Pro937、Pro937、PRO1014、 PRO1120、PRO1120、PRO1182、PRO1182、POL1382、POL1382、PO1410、POL1325、PRO155、POL1556、POL1760、PRO1787、PRO1868、per4326、PRO4332、PRO60、per604、Pro 219609、PRO1929、PRO 22609、PRO 22609、PRO 22609、PRO , PRO 2609, PRO19220, Pro.PO.2609, PRO19220, Pro.PO.2609, PRO19220, POL26, Pro. Pro. PRO1124, PRO1026 或 PRO23370。

“治疗”或“治疗”或“减轻”是指治疗性治疗和预防性或预防性措施,目的是预防或减缓(减少)所需的病理状况或病症。需要治疗的患者可能已经患有该病症或可能倾向于患有该病症,或者可能是要预防该病症的患者。

“慢性”施用是指以连续模式而不是急性模式施用药剂,以便在延长的时间段内维持初始治疗效果(活性)。 “间歇性”给药是一种不连续不间断的治疗,本质上是周期性的。

用于治疗目的的“哺乳动物”是指任何归类为哺乳动物的动物,包括人类、大鼠或小鼠等啮齿动物、家畜和农场动物,以及动物园、运动或伴侣动物,例如狗、猫、牛、马、羊、猪、山羊、兔子等。优选地,哺乳动物是人。

与一种或多种另外的治疗剂“组合”施用包括以任何顺序同时(同时)和依次施用。

本文所用的“载体”包括药学上可接受的载体、赋形剂或稳定剂,它们在所用剂量和浓度下对它们所接触的细胞或哺乳动物无毒。生理上可接受的载体通常是 pH 缓冲水溶液。生理上可接受的载体的例子包括缓冲液,例如磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸;抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;聚乙烯吡咯烷酮等亲水性高分子;氨基酸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、双糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精; EDTA等螯合剂;糖醇如甘露醇或山梨糖醇;成盐抗衡离子,例如钠;和/或非离子表面活性剂,例如 TWEEN™、聚乙二醇 (PEG) 和 PLURONICS™。

“固相”是指本发明的抗体可以粘附的非水性基质。本文件中讨论的固相示例包括部分或全部由玻璃(例如可控孔径玻璃)、多糖(例如琼脂糖)、聚丙烯酰胺、聚苯乙烯、聚乙烯醇和硅树脂制成的固相。根据上下文,固相可以包括测定板的孔;在其他情况下,它是纯化柱(例如亲和色谱柱)。该术语还包括离散颗粒的不连续固相,如美国专利第 4,275,149 号中所述。

“脂质体”是由不同类型的脂质、磷脂和/或表面活性剂组成的小囊泡,可用于药物的递送(例如 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725) . , PRO937 , PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO15556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO444, PRO9284, PRO9284444444444444444444444444444444444ES PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽或其抗体)给哺乳动物。脂质体成分通常排列成双层结构,类似于生物膜的脂质组装。

“小分子”在本文中被定义为具有低于约500道尔顿的分子量。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1776、PRO1760、PRO13262 , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370, ohne Anti-PRO2940, Anti-PRO24, Anti-PRO24, Anti-PRO24 PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗- PRO9820、Anti-PRO9828、Anti-PRO10274、Anti-PRO16090、Anti-PRO19644、Anti-PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370、PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、 PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434326, PRO43432 , PRO434326, PRO43432 , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 order PRO23370 Vereinsverbund, PRO194, PRO220, PRO241, PRO3, PRO5, PRO3, PRO3, PRO3, PRO5 PRO541, PRO725, PRO1034 PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1415, PRO15, PRO5, PRO5 ,Pro1760,Pro1787,Pro1868,Pro4326,Pro4332,Pro4346,Pro44400,Pro4400,Pro6003,Pro1868,Pro1868,Pro4326,Pro432,Pro4346,Pro4346,Pro44400,Pro4400,Pro4111111111111111111111111414141414155555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555太平洋oder PRO23370 oder PRO23370 oder ein Antagonist der Misma, wie sie beschrieben werden, und das vorliegende Dokument ist eine ausreichende Kandidatur für ein bestimmtes Establecido。 Una „cantidad efectiva“ puede determinarse empíricamente y de manera rutinaria, en relación con el proposito declarado。

El termino "cantidad terapéuticamente eficaz" se refiere a una cantidad de anti-PRO194, anti-PRO220, anti-PRO241, anti-PRO284, anti-PRO331, anti-PRO354, anti-PRO355, anti-PRO533, anti-PRO541, anti -PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868 , 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗-PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 , PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , 多肽 PRO1026 或 PRO23370, un PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1.5565, PRO15565, PRO15565, PRO15565 , PRO1.7876, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 uniligopéptido de PRO104,913, PRO23370 单寡肽PRO2094 PRO354, PRO355 , PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO60420, PRO60403, PRO92403 PRO9828, PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 Organische Molecula de unión u otro farmaco eficaz para “tratar” una enfermedad o trastorno en un sujeto o mamifero。 En el caso del cáncer, la cantidad terapéuticamente eficaz del fármaco puede reducir el número de células cancerosas;减少 el tamaño del 肿瘤; inhibir (es decir, retardar hasta cierto punto y Preferredmente detener) la infiltración de células cancerosas en los órganos periféricos; inhibir (es decir, retardar hasta cierto punto y Preferredmente detener) 肿瘤转移; inhibir, hasta cierto punto, el crecimiento tumoral; y/o aliviar hasta cierto punto uno más de los síntomas asociados con el cáncer。 Konsultieren Sie die Definition von "tratamiento" en el presente documento。 En la medida en que el fármaco pueda prevenir el crecimiento y/o eliminar las células cancerosas existentes, puede ser citostático y/o citotóxico。

术语“心血管、内皮和血管生成障碍”、“心血管、内皮和血管生成功能障碍”、“心血管、内皮或血管生成功能障碍”和“心血管、内皮或血管生成功能障碍”可互换使用,部分指代影响眼镜的全身性疾病,如糖尿病,以及血管本身的疾病,如动脉、毛细血管、静脉和/或淋巴管。这将包括刺激血管生成和/或心血管化的适应症以及抑制血管生成和/或心血管化的适应症。这些疾病包括,例如,动脉疾病如动脉粥样硬化、高血压、炎性血管炎、雷诺氏病和现象、动脉瘤和动脉再狭窄;静脉和淋巴系统疾病,如血栓性静脉炎、淋巴管炎和淋巴水肿;和其他血管疾病,例如外周血管疾病,癌症,例如血管瘤,例如血管瘤。 B. 血管瘤(毛细血管和海绵状血管瘤)、血管球瘤、毛细血管扩张症、细菌性血管瘤病、血管内皮瘤、血管肉瘤、血管外皮细胞瘤、卡波氏肉瘤、淋巴管瘤和淋巴管肉瘤、肿瘤血管生成、外伤如伤口、烧伤和其他受伤组织、植入物固定、瘢痕形成、局部缺血-再灌注损伤、类风湿性关节炎、脑血管病、肾病如急性肾功能衰竭或骨质疏松症。这也包括心绞痛、心肌梗塞如急性心肌梗塞、心脏肥大和心力衰竭如CHF。

如本文所用,“肥大”定义为独立于不涉及肿瘤形成的自然生长的器官或结构的质量增加。器官或组织的肥大是由于单个细胞质量的增加(真正的肥大),构成组织的细胞数量的增加(增生),或两者兼而有之。某些器官,例如心脏,在出生后不久就失去了分裂的能力。因此,“心脏肥大”被定义为在成人中以心肌细胞大小和收缩蛋白含量增加为特征的心脏质量增加而没有伴随的细胞分裂。引发肥大的应激特征(例如,前负荷增加、后负荷增加、心肌梗塞中的肌细胞丢失或原发性收缩衰竭)似乎在决定反应的性质中起主要作用。 .心脏肥大的早期通常在形态学上以肌原纤维和线粒体尺寸的增加以及线粒体和细胞核的增大为特征。虽然肌肉细胞在这个阶段比正常情况下大,但细胞组织在很大程度上得到了保留。在心脏肥大的更晚期阶段,特定细胞器(例如线粒体)的大小或数量优先增加,并且新的收缩元件以不规则的方式添加到细胞的局部区域。经历持续肥大的细胞在细胞组织中表现出更明显的变化,包括显着增大的细胞核和高度分叶的膜取代相邻的肌原纤维和正常 Z 带记录的破坏导致这种疾病的进展,其特征是对心肌的不同程度的结构损伤是特征,无论潜在的心脏病。因此,该术语还包括涉及心脏肥大发展的生理状况,例如血压升高、主动脉瓣狭窄或心肌梗塞。

“心力衰竭”是指心脏功能异常,其中心脏不能以满足组织代谢需求所需的速率泵血。心力衰竭可由多种因素引起,包括缺血性、先天性、风湿性或特发性形式。

“充血性心力衰竭”(CHF) 是一种进行性疾病状态,其中心脏越来越无法产生足够的心输出量(心脏随时间泵出的血液量)以将富含氧气的血液输送到外周组织。随着 CHF 的进展,会发生结构和血液动力学损伤。尽管这些损伤有多种表现,但典型的症状是心室肥大。 CHF 是许多不同心脏病的共同最终结果。

“心肌梗塞”通常由冠状血管的动脉硬化引起,通常伴有冠状动脉血栓形成。它可分为两种主要类型:透壁性梗死,其中心肌坏死影响心室壁的整个厚度,以及心内膜​​下(非透壁性)梗死,其中坏死影响心内膜下、壁内心肌或两者,没有完全延伸。通过心室壁到达心外膜的途径。众所周知,心肌梗塞会引起血液动力学效应的变化以及心脏受损区域和健康区域结构的变化。例如,心肌梗塞会降低心脏的最大心输出量和每搏输出量。与心肌梗塞相关的还有刺激间质中发生的 DNA 合成和增加心脏未受影响区域的胶原蛋白形成。

长期以来,心脏肥大与“高血压”有关,因为与长期高血压相关的心脏压力或紧张增加,例如,由于总外周阻力增加。由于慢性压力超负荷而变得肥大的心室的一个特征是舒张功能受损。福阿德等人,果酱。心脏病上校,4:1500-1506(1984);史密斯等人,果酱。心脏病上校,5:869-874 (1985)。尽管收缩功能正常或超常,但在早期原发性高血压中已注意到左心室舒张时间延长。哈特福德等人,高血压,6:329-338 (1984)。然而,血压读数与心脏肥大之间并没有密切的平行关系。尽管在人类中已有抗高血压治疗后左心室功能改善的报道,但使用利尿剂(氢氯噻嗪)、β-受体阻滞剂(普萘洛尔)或钙通道阻滞剂(地尔硫卓)进行不同治疗的患者表现出左心室功能逆转。肥大而舒张功能没有改善。 Inouye 等人。大豆。 J. Cardiol.,53:1583-7(1984)。

另一种与心脏肥大有关的复杂心脏病是“肥厚性心肌病”。这种情况的特点是形态、功能和临床特征多种多样(Maron 等人,不。包括。 J. 医学,316:780-789(1987);精神和其他不。包括。 J. 医学,320:749-755(1989);路易和爱德华兹,程序心血管疾病,36:275-308(1994); Wigle 等人。交通,92:1680-1692 (1995)),其异质性因其影响所有年龄段的患者这一事实而更加突出。斯皮里托等人。不。包括。 J. 医学,336:775-785 (1997)。肥厚型心肌病的致病因素也多种多样且知之甚少。一般来说,编码肌节蛋白的基因突变与肥厚性心肌病有关。最近的数据表明,肌球蛋白 β 重链突变可能占家族性肥厚性心肌病病例的 30% 至 40%。沃特金斯等人,不。包括。 J. 医学,326:1108-1114(1992);施瓦茨等人。交通,91:532-540(1995);玛丽安和罗伯茨,交通,92:1336-1347(1995);蒂尔费尔德等人。细胞,77:701-712(1994);沃特金塞特等人,Nat. Gen.,11:434-437 (1995)。除β-肌球蛋白重链外,其他基因突变位点包括心肌肌钙蛋白T、拓扑肌球蛋白α、心肌肌球蛋白结合蛋白C、肌球蛋白必需轻链和肌球蛋白调节轻链。参见 Malik 和 Watkins,当前意见 Kardiol.,12:295-302(1997)。

瓣膜上“主动脉瓣狭窄”是一种遗传性血管疾病,其特征是升主动脉变窄,但其他动脉,包括肺动脉,也会受到影响。未经治疗的主动脉瓣狭窄会导致心内压升高,进而导致心肌肥大,最终导致心力衰竭和死亡。本病的发病机制尚不完全清楚,但内侧平滑肌的肥大和可能的增生是本病的突出特征。据报道,弹性蛋白基因的分子变异体参与主动脉瓣狭窄的发展和发病机制。美国专利号 5,650,282,1997 年 7 月 22 日颁发。

“瓣膜功能不全”是由于导致心脏瓣膜功能障碍的心脏病引起的。风湿热等多种疾病可导致瓣膜开口收缩或分离,而其他疾病可导致心内膜炎、心内膜或房室开口内衬膜的炎症以及心脏手术。瓣膜狭窄变窄或瓣膜关闭不当等缺陷会导致血液在心室内汇集或血液回流通过瓣膜。如果不加以纠正,持续的瓣膜狭窄或反流会导致心脏肥大和相关的心肌损伤,最终可能需要更换瓣膜。

术语“免疫系统相关疾病”是指一种疾病,其中哺乳动物的免疫系统成分引起、介导或以其他方式促成哺乳动物的发病。还包括其中免疫应答的刺激或干预对疾病进展具有改善作用的疾病。该术语包括免疫介导的炎性疾病、非免疫介导的炎性疾病、传染病、免疫缺陷病、肿瘤等。

术语“T细胞介导的疾病”是指其中T细胞直接或间接介导或以其他方式促成哺乳动物发病的疾病。 T 细胞介导的疾病可与细胞介导的作用、淋巴因子介导的作用等相关,甚至当 B 细胞受到例如 T 细胞分泌的淋巴因子刺激时的 B 细胞相关作用。

炎症和免疫相关疾病的例子,其中一些是免疫或 T 细胞介导的,包括系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎、幼年慢性关节炎、脊柱关节病、系统性硬化症(硬皮病)、特发性炎症性肌病(皮肌炎、多发性肌炎) 、干燥综合征、系统性血管炎、结节病、自身免疫性溶血性贫血(免疫性红细胞减少症、阵发性睡眠性血红蛋白尿症)、自身免疫性血小板减少症(特发性血小板减少性紫癜、免疫介导性血小板减少症)、甲状腺炎(巴道氏病、桥本氏甲状腺炎、幼年淋巴细胞性甲状腺炎、萎缩性甲状腺炎) ,糖尿病免疫介导的肾脏疾病(肾小球肾炎,肾小管间质性肾炎),中枢和周围神经系统脱髓鞘疾病,如多发性硬化,特发性脱髓鞘性多发性神经病或格林 - 巴利综合征和慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经病,肝胆疾病,如感染性肝炎(甲型、乙型、丙型、丁型、戊型和其他非嗜肝病毒)、慢性活动性自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、肉芽肿性肝炎和硬化性胆管炎、炎症性肠病(溃疡性结肠炎:克罗恩病)、麸质敏感性肠病和惠普氏病综合征。自身免疫或免疫介导的皮肤病,包括水疱性皮肤病、多形性红斑和接触性皮炎、牛皮癣、过敏性疾病如哮喘、过敏性鼻炎、特应性皮炎、食物过敏和荨麻疹,免疫性肺病如嗜酸性粒细胞性肺炎、肺纤维化和过敏性肺炎或移植相关疾病,包括移植排斥和移植物抗宿主病。传染病包括病毒性疾病如艾滋病(HIV感染)、甲、乙、丙、丁、戊型肝炎、疱疹等,细菌感染、真菌感染、原虫感染和寄生虫感染。

如本文所用,“自身免疫性疾病”是起因于并针对人自身组织或器官的疾病或病症,或其共同分离或表现,或由此引起的病症。许多临床和实验室标志物可能存在于许多这些自身免疫和炎症性疾病中,包括但不限于高丙种球蛋白血症、高水平自身抗体、抗原抗体复合物的组织沉积、皮质类固醇治疗或免疫抑制药物的益处以及淋巴细胞。受影响组织中的细胞聚集。不受 B 细胞介导的自身免疫疾病的任何理论的限制,B 细胞被认为通过多种机制途径在人类自身免疫疾病中表现出致病作用,包括自身抗体产生、免疫复合物形成、T 细胞和树突细胞活化。 、细胞因子合成、直接趋化因子释放以及为异位新淋巴生成提供病灶。这些途径中的每一个都可能不同程度地参与自身免疫性疾病的病理学。

“自身免疫性疾病”可以是器官特异性疾病(即免疫反应专门针对器官系统,例如内分泌系统、造血系统、皮肤、心肺系统、胃肠和肝系统、肾系统、甲状腺、耳朵、神经肌肉系统、中枢神经系统等)或可能影响多个器官的全身性疾病(例如系统性红斑狼疮 (SLE)、类风湿性关节炎、多发性肌炎等)。此类优选的疾病包括自身免疫性风湿性疾病(例如类风湿性关节炎、干燥综合征、硬皮病、狼疮例如系统性红斑狼疮和狼疮性肾炎、多发性肌炎/皮肌炎、冷球蛋白血症、抗磷脂抗体综合征和银屑病关节炎)、胃肠道和银屑病疾病。自身免疫。肝脏疾病(例如炎症性肠病(例如溃疡性结肠炎和克罗恩病)、自身免疫性胃炎和恶性贫血、自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、原发性硬化性胆管炎和乳糜泻)、血管炎(例如 ANCA 相关性血管炎、包括 Churg-Strauss 血管炎、韦格纳肉芽肿病和多动脉炎)、自身免疫性神经系统疾病(例如但不限于多发性硬化症、眼阵挛-肌阵挛综合征、重症肌无力、视神经脊髓炎、帕金森病、阿尔茨海默氏病和自身免疫性多发性神经病)肾脏疾病(如肾小球肾炎、Goodpasture 综合征和 Berger 病)、自身免疫性皮肤病(如银屑病、荨麻疹、荨麻疹、寻常型天疱疮、大疱性类天疱疮和皮肤红斑狼疮)、血液病(如血小板减少性紫癜、血栓性血小板减少性紫癜)。 、输血后紫癜和自身免疫性溶血性贫血)、动脉粥样硬化、葡萄膜炎、耳部自身免疫性疾病(如内耳病和听力下降)、白塞氏病、雷诺氏综合征、器官移植和自身免疫性内分泌疾病(如糖尿病自身免疫性疾病) .诸如胰岛素依赖型糖尿病 (IDDM)、艾迪生病和自身免疫性甲状腺疾病(例如糖尿病、格雷夫斯氏病和甲状腺炎)等疾病。这种更优选的疾病包括,例如,类风湿性关节炎、溃疡性结肠炎、ANCA相关血管炎、狼疮、多发性硬化症、干燥综合征、格雷夫斯病、IDDM、恶性贫血、甲状腺炎和肾小球肾炎。

Specific examples of other autoimmune diseases as defined herein, which in some cases encompass those listed above, include, but are not limited to, arthritis (acute and chronic, rheumatoid arthritis including juvenile-onset rheumatoid arthritis and stages such as rheumatoid synovitis, gout or gouty arthritis, acute immunological arthritis, chronic inflammatory arthritis, degenerative arthritis, type II collagen-induced arthritis, infectious arthritis, Lyme arthritis, proliferative arthritis, psoriatic arthritis, Still's disease, vertebral arthritis, osteoarthritis, arthritis chronica progrediente, arthritis deformans, polyarthritis chronica primaria, reactive arthritis, menopausal arthritis, estrogen-depletion arthritis, and ankylosing spondylitis/rheumatoid spondylitis), autoimmune lymphoproliferative disease, inflammatory hyperproliferative skin diseases, psoriasis such as plaque psoriasis, gutatte psoriasis, pustular psoriasis, and psoriasis of the nails, atopy including atopic diseases such as hay fever and Job's syndrome, dermatitis including contact dermatitis, chronic contact dermatitis, exfoliative dermatitis, allergic dermatitis, allergic contact dermatitis, hives, dermatitis herpetiformis, nummular dermatitis, seborrheic dermatitis, non-specific dermatitis, primary irritant contact dermatitis, and atopic dermatitis, x-linked hyper IgM syndrome, allergic intraocular inflammatory diseases, urticaria such as chronic allergic urticaria and chronic idiopathic urticaria, including chronic autoimmune urticaria, myositis, polymyositis/dermatomyositis, juvenile dermatomyositis, toxic epidermal necrolysis, scleroderma (including systemic scleroderma), sclerosis such as systemic sclerosis, multiple sclerosis (MS) such as spino-optical MS, primary progressive MS (PPMS), and relapsing remitting MS (RRMS), progressive systemic sclerosis, atherosclerosis, arteriosclerosis, sclerosis disseminata, ataxic sclerosis, neuromyelitis optica (NMO), inflammatory bowel disease (IBD) (for example, Crohn's disease, autoimmune-mediated gastrointestinal diseases, gastrointestinal inflammation, colitis such as ulcerative colitis, colitis ulcerosa, microscopic colitis, collagenous colitis, colitis polyposa, necrotizing enterocolitis, and transmural colitis, and autoimmune inflammatory bowel disease), bowel inflammation, pyoderma gangrenosum, erythema nodosum, primary sclerosing cholangitis, respiratory distress syndrome, including adult or acute respiratory distress syndrome (ARDS), meningitis, inflammation of all or part of the uvea, iritis, choroiditis, an autoimmune hematological disorder, graft-versus-host disease, angioedema such as hereditary angioedema, cranial nerve damage as in meningitis, herpes gestationis, pemphigoid gestationis, pruritis scroti, autoimmune premature ovarian failure, sudden hearing loss due to an autoimmune condition, IgE-mediated diseases such as anaphylaxis and allergic and atopic rhinitis, encephalitis such as Rasmussen's encephalitis and limbic and/or brainstem encephalitis, uveitis, such as anterior uveitis, acute anterior uveitis, granulomatous uveitis, nongranulomatous uveitis, phacoantigenic uveitis, posterior uveitis, or autoimmune uveitis, glomerulonephritis (GN) with and without nephrotic syndrome such as chronic or acute glomerulonephritis such as primary GN, immune-mediated GN, membranous GN (membranous nephropathy), idiopathic membranous GN or idiopathic membranous nephropathy, membrano- or membranous proliferative GN (MPGN), including Type I and Type II, and rapidly progressive GN (RPGN), proliferative nephritis, autoimmune polyglandular endocrine failure, balanitis including balanitis circumscripta plasmacellularis, balanoposthitis, erythema annulare centrifugum, erythema dyschromicum perstans, eythema multiform, granuloma annulare, lichen nitidus, lichen sclerosus et atrophicus, lichen simplex chronicus, lichen spinulosus, lichen planus, lamellar ichthyosis, epidermolytic hyperkeratosis, premalignant keratosis, pyoderma gangrenosum, allergic conditions and responses, food allergies, drug allergies, insect allergies, rare allergic disorders such as mastocytosis, allergic reaction, eczema including allergic or atopic eczema, asteatotic eczema, dyshidrotic eczema, and vesicular palmoplantar eczema, asthma such as asthma bronchiale, bronchial asthma, and auto-immune asthma, conditions involving infiltration of T cells and chronic inflammatory responses, immune reactions against foreign antigens such as fetal A-B-O blood groups during pregnancy, chronic pulmonary inflammatory disease, autoimmune myocarditis, leukocyte adhesion deficiency, lupus, including lupus nephritis, lupus cerebritis, pediatric lupus, non-renal lupus, extra-renal lupus, discoid lupus and discoid lupus erythematosus, alopecia lupus, SLE, such as cutaneous SLE or subacute cutaneous SLE, neonatal lupus syndrome (NLE), and lupus erythematosus disseminatus, juvenile onset (Type I) diabetes mellitus, including pediatric IDDM, adult onset diabetes mellitus (Type II diabetes), autoimmune diabetes, idiopathic diabetes insipidus, diabetic retinopathy, diabetic nephropathy, diabetic colitis, diabetic large-artery disorder, immune responses associated with acute and delayed hypersensitivity mediated by cytokines and T-lymphocytes, tuberculosis, sarcoidosis, granulomatosis including lymphomatoid granulomatosis, Wegener's granulomatosis, agranulocytosis, vasculitides, including vasculitis, large-vessel vasculitis (including polymyalgia rheumatica and giant-cell (Takayasu's) arteritis), medium-vessel vasculitis (including Kawasaki's disease and polyarteritis nodosa/periarteritis nodosa), microscopic polyarteritis, immunovasculitis, CNS vasculitis, cutaneous vasculitis, hypersensitivity vasculitis, necrotizing vasculitis such as systemic necrotizing vasculitis, and ANCA-associated vasculitis, such as Churg-Strauss vasculitis or syndrome (CSS) and ANCA-associated small-vessel vasculitis, temporal arteritis, aplastic anemia, autoimmune aplastic anemia, Coombs positive anemia, Diamond Blackfan anemia, hemolytic anemia or immune hemolytic anemia including autoimmune hemolytic anemia (AIHA), pernicious anemia (anemia perniciosa), Addison's disease, pure red cell anemia or aplasia (PRCA), Factor VIII deficiency, hemophilia A, autoimmune neutropenia(s), cytopenias such as pancytopenia, leukopenia, diseases involving leukocyte diapedesis, CNS inflammatory disorders, Alzheimer's disease, Parkinson's disease, multiple organ injury syndrome such as those secondary to septicemia, trauma or hemorrhage, antigen-antibody complex-mediated diseases, anti-glomerular basement membrane disease, anti-phospholipid antibody syndrome, motoneuritis, allergic neuritis, Behcet's disease/syndrome, Castleman's syndrome, Goodpasture's syndrome, Reynaud's syndrome, Sjögren's syndrome, Stevens-Johnson syndrome, pemphigoid such as pemphigoid bullous and skin pemphigoid, pemphigus (including pemphigus vulgaris, pemphigus foliaceus, pemphigus mucus-membrane pemphigoid, andpemphigus erythematosus), autoimmune polyendocrinopathies, Reiter's disease or syndrome, thermal injury due to an autoimmune condition, preeclampsia, an immune complex disorder such as immune complex nephritis, antibody-mediated nephritis, neuroinflammatory disorders, polyneuropathies, chronic neuropathy such as IgM polyneuropathies or IgM-mediated neuropathy, thrombocytopenia (as developed by myocardial infarction patients, for example), including thrombotic thrombocytopenic purpura (TTP), post-transfusion purpura (PTP), heparin-induced thrombocytopenia, and autoimmune or immune-mediated thrombocytopenia including, for example, idiopathic thrombocytopenic purpura (ITP) including chronic or acute ITP, scleritis such as idiopathic cerato-scleritis, episcleritis, autoimmune disease of the testis and ovary including autoimmune orchitis and oophoritis, primary hypothyroidism, hypoparathyroidism, autoimmune endocrine diseases including thyroiditis such as autoimmune thyroiditis, Hashimoto's disease, chronic thyroiditis (Hashimoto's thyroiditis), or subacute thyroiditis, autoimmune thyroid disease, idiopathic hypothyroidism, Grave's disease, polyglandular syndromes such as autoimmune polyglandular syndromes, for example, type I (or polyglandular endocrinopathy syndromes), paraneoplastic syndromes, including neurologic paraneoplastic syndromes such as Lambert-Eaton myasthenic syndrome or Eaton-Lambert syndrome, stiff-man or stiff-person syndrome, encephalomyelitis such as allergic encephalomyelitis or encephalomyelitis allergica and experimental allergic encephalomyelitis (EAE), myasthenia gravis such as thymoma-associated myasthenia gravis, cerebellar degeneration, neuromyotonia, opsoclonus or opsoclonus myoclonus syndrome (OMS), and sensory neuropathy, multifocal motor neuropathy, Sheehan's syndrome, autoimmune hepatitis, chronic hepatitis, lupoid hepatitis, giant-cell hepatitis, chronic active hepatitis or autoimmune chronic active hepatitis, pneumonitis such as lymphoid interstitial pneumonitis (LIP), bronchiolitis obliterans (non-transplant) vs NSIP, Guillain-Barré syndrome, Berger's disease (IgA nephropathy), idiopathic IgA nephropathy, linear IgA dermatosis, acute febrile neutrophilic dermatosis, subcorneal pustular dermatosis, transient acantholytic dermatosis, cirrhosis such as primary biliary cirrhosis and pneumonocirrhosis, autoimmune enteropathy syndrome, Celiac or Coeliac disease, celiac sprue (gluten enteropathy), refractory sprue, idiopathic sprue, cryoglobulinemia such as mixed cryoglobulinemia, amylotrophic lateral sclerosis (ALS; Lou Gehrig's disease), coronary artery disease, autoimmune ear disease such as autoimmune inner ear disease (AIED), autoimmune hearing loss, polychondritis such as refractory or relapsed or relapsing polychondritis, pulmonary alveolar proteinosis, Cogan's syndrome/nonsyphilitic interstitial keratitis, Bell's palsy, Sweet's disease/syndrome, rosacea autoimmune, zoster-associated pain, amyloidosis, a non-cancerous lymphocytosis, a primary lymphocytosis, which includes monoclonal B cell lymphocytosis (e.g., benign monoclonal gammopathy and monoclonal gammopathy of undetermined significance, MGUS), peripheral neuropathy, paraneoplastic syndrome, channelopathies such as epilepsy, migraine, arrhythmia, muscular disorders, deafness, blindness, periodic paralysis, and channelopathies of the CNS, autism, inflammatory myopathy, focal or segmental or focal segmental glomerulosclerosis (FSGS), endocrine opthalmopathy, uveoretinitis, chorioretinitis, autoimmune hepatological disorder, fibromyalgia, multiple endocrine failure, Schmidt's syndrome, adrenalitis, gastric atrophy, presenile dementia, demyelinating diseases such as autoimmune demyelinating diseases and chronic inflammatory demyelinating polyneuropathy, Dressler's syndrome, alopecia greata, alopecia totalis, CREST syndrome (calcinosis, Raynaud's phenomenon, esophageal dysmotility, sclerodactyl), and telangiectasia), male and female autoimmune infertility, e.g., due to anti-spermatozoan antibodies, mixed connective tissue disease, Chagas' disease, rheumatic fever, recurrent abortion, farmer's lung, erythema multiforme, post-cardiotomy syndrome, Cushing's syndrome, bird-fancier's lung, allergic granulomatous angiitis, benign lymphocytic angiitis, Alport's syndrome, alveolitis such as allergic alveolitis and fibrosing alveolitis, interstitial lung disease, transfusion reaction, leprosy, malaria, parasitic diseases such as leishmaniasis, kypanosomiasis, schistosomiasis, ascariasis, aspergillosis, Sampter's syndrome, Caplan's syndrome, dengue, endocarditis, endomyocardial fibrosis, diffuse interstitial pulmonary fibrosis, interstitial lung fibrosis, fibrosing mediastinitis, pulmonary fibrosis, idiopathic pulmonary fibrosis, cystic fibrosis, endophthalmitis, erythema elevatum et diutinum, erythroblastosis fetalis, eosinophilic faciitis, Shulman's syndrome, Felty's syndrome, flariasis, cyclitis such as chronic cyclitis, heterochronic cyclitis, iridocyclitis (acute or chronic), or Fuch's cyclitis, Henoch-Schonlein purpura, human immunodeficiency virus (HIV) infection, SCID, acquired immune deficiency syndrome (AIDS), echovirus infection, sepsis (systemic inflammatory response syndrome (SIRS)), endotoxemia, pancreatitis, thyroxicosis, parvovirus infection, rubella virus infection, post-vaccination syndromes, congenital rubella infection, Epstein-Barr virus infection, mumps, Evan's syndrome, autoimmune gonadal failure, Sydenham's chorea, post-streptococcal nephritis, thromboangitis ubiterans, thyrotoxicosis, tabes dorsalis, chorioiditis, giant-cell polymyalgia, chronic hypersensitivity pneumonitis, conjunctivitis, such as vernal catarrh, keratoconjunctivitis sicca, and epidemic keratoconjunctivitis, idiopathic nephritic syndrome, minimal change nephropathy, benign familial and ischemia-reperfusion injury, transplant organ reperfusion, retinal autoimmunity, joint inflammation, bronchitis, chronic obstructive airway/pulmonary disease, silicosis, aphthae, aphthous stomatitis, arteriosclerotic disorders (cerebral vascular insufficiency) such as arteriosclerotic encephalopathy and arteriosclerotic retinopathy, aspermiogenese, autoimmune hemolysis, Boeck's disease, cryoglobulinemia, Dupuytren's contracture, endophthalmia phacoanaphylactica, enteritis allergica, erythema nodo sum lepro sum, idiopathic facial paralysis, chronic fatigue syndrome, febris rheumatica, Hamman-Rich's disease, sensoneural hearing loss, haemoglobinuria paroxysmatica, hypogonadism, ileitis regionalis, leucopenia, mononucleosis infectiosa, traverse myelitis, primary idiopathic myxedema, nephrosis, ophthalmia symphatica, orchitis granulomatosa, pancreatitis, polyradiculitis acuta, pyoderma gangrenosum, Quervain's thyreoiditis, acquired spenic atrophy, non-malignant thymoma, lymphofollicular thymitis, vitiligo, toxic-shock syndrome, food poisoning, conditions involving infiltration of T cells, leukocyte-adhesion deficiency, immune responses associated with acute and delayed hypersensitivity mediated by cytokines and T-lymphocytes, diseases involving leukocyte diapedesis, multiple organ injury syndrome, antigen-antibody complex-mediated diseases, antiglomerular basement membrane disease, autoimmune polyendocrinopathies, oophoritis, primary myxedema, autoimmune atrophic gastritis, sympathetic ophthalmia, rheumatic diseases, mixed connective tissue disease, nephrotic syndrome, insulitis, polyendocrine failure, autoimmune polyglandular syndromes, including polyglandular syndrome type I, adult-onset idiopathic hypoparathyroidism (AOIH), cardiomyopathy such as dilated cardiomyopathy, epidermolisis bullosa acquisita (EBA), hemochromatosis, myocarditis, nephrotic syndrome, primary sclerosing cholangitis, purulent or nonpurulent sinusitis, acute or chronic sinusitis, ethmoid, frontal, maxillary, or sphenoid sinusitis, allergic sinusitis, an eosinophil-related disorder such as eosinophilia, pulmonary infiltration eosinophilia, eosinophilia-myalgia syndrome, Loffler's syndrome, chronic eosinophilic pneumonia, tropical pulmonary eosinophilia, bronchopneumonic aspergillosis, aspergilloma, or granulomas containing eosinophils, anaphylaxis, spondyloarthropathies, seronegative spondyloarthritides, polyendocrine autoimmune disease, sclerosing cholangitis, sclera, episclera, chronic mucocutaneous candidiasis, Bruton's syndrome, transient hypogammaglobulinemia of infancy, Wiskott-Aldrich syndrome, ataxia telangiectasia syndrome, angiectasis, autoimmune disorders associated with collagen disease, rheumatism such as chronic arthrorheumatism, lymphadenitis, reduction in blood pressure response, vascular dysfunction, tissue injury, cardiovascular ischemia, hyperalgesia, renal ischemia, cerebral ischemia, and disease accompanying vascularization, allergic hypersensitivity disorders, glomerulonephritides, reperfusion injury, ischemic re-perfusion disorder, reperfusion injury of myocardial or other tissues, lymphomatous tracheobronchitis, inflammatory dermatoses, dermatoses with acute inflammatory components, multiple organ failure, bullous diseases, renal cortical necrosis, acute purulent meningitis or other central nervous system inflammatory disorders, ocular and orbital inflammatory disorders, granulocyte transfusion-associated syndromes, cytokine-induced toxicity, narcolepsy, acute serious inflammation, chronic intractable inflammation, pyelitis, endarterial hyperplasia, peptic ulcer, valvulitis, and endometriosis.

术语“焦虑相关障碍”是指焦虑、情绪和物质使用障碍,包括但不限于:抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷障碍、睡眠障碍、多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。此类障碍包括轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、伴有广场恐惧症的惊恐障碍、无广场恐惧症的惊恐障碍、创伤后应激障碍、社交恐惧症、社交焦虑症, 自闭症, 特定恐惧症, 物质诱发的焦虑症, 急性酒精戒断症, 强迫症, 广场恐惧症, 单相情感障碍, I 型或 II 型双相情感障碍, 未另行说明的双相情感障碍, 循环性障碍, 抑郁症, 重度抑郁症, 情绪障碍, 物质-诱发的情绪障碍、认知功能的改善、与但不限于阿尔茨海默病、中风或创伤性脑损伤相关的认知功能丧失,导致疾病或损伤的发作,包括但不限于癫痫、学习障碍/残疾,脑瘫。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

术语“脂质代谢紊乱”是指胆固醇和甘油三酯的异常临床化学水平,这些脂质水平升高表明动脉粥样硬化。此外,异常的血脂水平可以指示各种心血管疾病,例如高血压、中风、冠状动脉疾病、糖尿病和/或肥胖症。

术语“眼部异常”是指可能与动脉粥样硬化或各种眼科异常有关的眼部疾病。此类疾病包括但不限于以下:视网膜发育不良、各种视网膜病、再狭窄、视网膜动脉阻塞或闭塞;视网膜变性导致视网膜血管继发性萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂症、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstrom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。白内障也被认为是一种眼部异常,并与全身性疾病有关,例如:或康拉迪综合症。其他眼部发育异常包括:无虹膜、眼前节和发育不全综合征。白内障也可能由于眼内感染或炎症(葡萄膜炎)而发生。

抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗- PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗- PRO92165, Anti-PRO85143, Anti-PRO1124, Anti-PRO1026 or Anti-PRO23370 Anticuerpo, PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO194, PRO34, PRO328, PRO228 PRO355, PRO533, PRO541 , PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434326, PRO434326, PRO434326 PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274 , PRO16090, PRO19644, PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 或 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO3、PRO5、PRO3、PRO3、PRO3 PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO13825、PRO13825 PRO1556、PRO1556、PRO1756、PRO1756 Pro1868,Pro4326,Pro4332,Pro4346,Pro4400,Pro6003,Pro6094,Pro6094,Pro6244,Pro9820,Pro9828,Pro16094,Pro16090,Pro19644,LaMoléculaoréculeCulaorder2 deuniwnica de uniun a pro214144214442142142121340,Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro pro Pro pro Pro pro Pro pro Pro pro Pro pro Pro pro Pro pro pro Pro Crecimiento einer Zelle, speziell eines Tumors, eines Beispiels, einer Zelle Cancersosa, Ihr Meer in vitro oder in vivo.抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗- PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326 , 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗PRO21340, 抗- PRO92165, Anti-PRO85143, Anti-PRO1124, Anti-PRO1026 or Anti-PRO23370 Anticuerpo, PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO194, PRO34, PRO328, PRO228 PRO355, PRO533, PRO541 , PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434326, PRO434326, PRO434326 PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274 , PRO16090, PRO19644, PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 或 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO3、PRO5、PRO3、PRO3、PRO3 PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO13825、PRO13825 PRO1556、PRO1556、PRO1756、PRO1756 PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO101264 上的有机分子crecimiento de células neoplasicas puede determinarse empíricamente y de manera rutinaria。

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124, anti-PRO1026 or anti-PRO23370 anticuerpo, PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO15565, PRO15565, PRO15565 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polypeptide, PRO194 , PRO220, PRO241, PRO284, PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4302、PRO43026、PRO43026、PRO43024、PRO6204、PRO66302 PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 寡聚体或 PRO194、PRO2、PRO3、PRO5、PRO24、PRO5、PRO5、PRO937、PRO1014、PRO1 PRO3、PRO11820、PRO11820 PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO1124, PRO1324, PRO8216 o PRO23370 organisches Molekül der Vereinigung ist eine Cantidad un tumor, por ejemplo, una cell cancerosa, ya sea in vitro o in vivo.抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124, anti-PRO1026 or anti-PRO23370 anticuerpo, PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO15565, PRO15565, PRO15565 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polypeptide, PRO194 , PRO220, PRO241, PRO284, PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4302、PRO43026、PRO43026、PRO43024、PRO6204、PRO66302 PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 Einheits-Oligopépido or PRO194, PRO2, PRO3, PRO5, PRO24 PRO5, PRO5, PRO937, PRO1014, PRO1 PRO3225, PRO11820, PRO1011, PRO1, PRO11820, PRO11820 PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO1124、PRO1324、PRO8216 或 PRO23370 puede determinarse empíricamente y de manera rutinaria。

术语“抗体”以最广义使用,具体包括例如抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533。抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026或抗PRO23370单克隆抗体(包括激动剂、拮抗剂和中和抗体)、抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241 , 抗PRO284, 抗PRO331, 抗PRO354, 抗PRO355, 抗PRO533, 抗PRO541, 抗PRO725, 抗PRO937, 抗PRO1014, 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗-PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094 B. 抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026或抗PRO23370具有多表位特异性的抗体、多克隆抗体、单链抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗-PRO4400、抗 PRO6003、抗 PRO6094、抗 PRO6244、抗 PRO9820、抗 PRO9828、抗 PRO10274、抗 PRO16090、抗 PRO19644、抗 PRO21340 抗体、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗- PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 以及抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗-PRO4326、抗-PRO4332、抗-PRO4346、抗-PRO4400、抗-PRO6003、抗-PRO6094、抗-PRO6244、抗-PRO9820、抗-PRO9828、抗体-PRO10274、抗-PRO16090、抗-PRO19644、抗- PRO21340、Anti-PRO92165、Anti-PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370(见下文),前提是它们具有所需的生物学或免疫学特性。活动。术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中可与抗体互换使用。

“分离的抗体”是已经从其天然环境的组分中鉴定和分离和/或回收的抗体。其自然环境的污染物是会干扰抗体诊断或治疗用途的物质,可能包括酶、激素和其他蛋白质或非蛋白质溶质。本发明提供的抗体 (1) 大于抗体的 95% 重量,如通过 Lowry 方法测定的,最优选大于 99% 重量,(2) 纯化到足以获得至少 15 个残基的程度使用旋转杯测序仪分析 N 末端或内部氨基酸序列,或 (3) 在还原或非还原条件下使用考马斯蓝或优选银染通过 SDS-PAGE 进行同质化。分离的抗体包括重组细胞内的原位抗体,因为抗体自然环境的至少一种成分将不存在。然而,通常,分离的抗体是通过至少一个纯化步骤产生的。

基本的 4 链抗体单元是由两条相同的轻 (L) 链和两条相同的重 (H) 链组成的异四聚体糖蛋白(IgM 抗体由 5 个基本异四聚体单元以及称为 J 链的附加多肽组成,因此包含 10 个抗原结合位点,而分泌型 IgA 抗体可以聚合形成多价组件,其中包含 4 链重复单元中的 2-5 个以及 J 链)。在IgG中,4条链的单位通常在150,000道尔顿左右。每条 L 链通过共价二硫键连接到 H 链,而两条 H 链通过一个或多个二硫键相互连接,具体取决于 H 链同种型。每条 H 和 L 链在内部也有规则的二硫键连锁,链条。每条 H 链在 N 端都有一个可变结构域 (VH)后跟三个恒定域(CH) 对于每个 α 和 γ 链和四个 CHμ 和 ε 同种型的结构域。每条L链在N端都有一个可变域(V大号) 后跟一个常数域 (C大号)的另一端。 v大号与 V 对齐H和c大号与重链的第一个恒定域(CH1).某些氨基酸残基被认为是轻链和重链可变结构域之间的界面。 V的交配H和V大号它们一起形成一个单一的抗原结合位点。有关各类抗体的结构和特性,请参见例如B.基础和临床免疫学,第 8 版,Daniel P. Stites、Abba I. Terr 和 Tristram G. Parslow(编),Appleton & Lange,康涅狄格州诺沃克,1994 年,第 71 页和第 6 章。

任何脊椎动物物种的 L 链都可以根据其恒定域的氨基酸序列归入两种不同类型中的一种,称为 kappa 和 lambda。取决于其重链恒定域的氨基酸序列(CH) 免疫球蛋白可以分配到不同的类别或同种型。免疫球蛋白分为五类:IgA、IgD、IgE、IgG 和 IgM,重链分别指定为 α、δ、ε、γ 和 μ。 γ 和 α 类根据 C 中相对较小的差异进一步分为子类H序列和功能,例如,人类表达以下亚类:IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2。

术语“可变”是指可变结构域的某些区段在抗体之间的序列差异很大的事实。 V 结构域介导抗原结合并定义给定抗体对其特定抗原的特异性。然而,变异性并未均匀分布在可变结构域的 110 个氨基酸区域。相反,V 区由 15 到 30 个氨基酸的称为框架区 (FR) 的相对不变的延伸组成,由称为“高变区”的较短的极端变异区域隔开,每个区域有 9 到 12 个氨基酸长。天然重链和轻链可变结构域各包含四个 FR,​​大部分呈 β-折叠结构,由三个高变区连接,形成连接环,在某些情况下形成主链 β-折叠的一部分。每条链上的高变区由 FRs 紧靠在一起,与另一条链上的高变区一起,有助于形成抗体的抗原结合位点(参见 Kabat 等人,具有免疫学意义的蛋白质序列,第 5 版公共卫生服务,国立卫生研究院,马里兰州贝塞斯达 (1991))。恒定域不直接参与抗体与抗原的结合,但具有多种效应子功能,例如抗体参与抗体依赖性细胞毒性 (ADCC)。

如本文所用,术语“高变区”是指负责抗原结合的抗体的氨基酸残基。高变区通常包括来自“互补决定区”或“CDR”的氨基酸残基(例如,在V中的残基24-34(L1)、50-56(L2)和89-97(L3)周围)大号, 和大约 1-35 (H1), 50-65 (H2), 和 95-102 (H3) 在 VH;卡巴特等人,具有免疫学意义的蛋白质序列,第 5 版 Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991))和/或“超变环”的残差(例如残差 26-32 (L1)、50-52 (L2) 和 91- 96 (L3) 在 v大号, 和 26-32 (H1), 53-55 (H2) 和 96-101 (H3) 在 VH; Chothia 和 LeskJ.摩尔。生物学。196:901-917 (1987))。

如本文所用,术语“单克隆抗体”是指从基本上同质的抗体群体获得的抗体,即构成该群体的个体抗体除了可能以较低量存在的可能的天然突变之外是相同的。单克隆抗体具有高度特异性并针对单个抗原位点。此外,与包含针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂不同,每个单克隆抗体针对抗原上的单个决定簇。单克隆抗体除了具有特异性外,还有一个优点是可以在不被其他抗体污染的情况下合成。 “单克隆”修饰符不应解释为需要通过任何特定方法生产抗体。例如,可用于本发明的单克隆抗体可由Kohler等人首先描述的那些来制备。制备所述杂交瘤方法。自然,256:495 (1975) 或可以在细菌、真核动物或植物细胞中使用重组 DNA 技术产生(参见例如美国专利号 4,816,567)。 “单克隆抗体”也可以使用 Clackson 等人描述的方法从噬菌体抗体库中获得。所描述的技术是孤立的。自然,352:624-628 (1991) 和 Marks 等人。J.摩尔。生物学,222:581-597 (1991),例如。

本文中的单克隆抗体包括“嵌合”抗体,其中部分重链和/或轻链与衍生自特定物种或属于一类或一类抗体的抗体中的相应序列相同或同源。 ) 与来自不同物种或属于不同抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,以及此类抗体的片段,前提是它们表现出所需的生物活性(参见美国专利号 4,816,567 和莫里森等人,全氯乙烯美国国家学院军刀81:6851-6855 (1984))。本文感兴趣的嵌合抗体包括“灵长类化”抗体,其包含源自非人灵长类动物(例如,旧大陆猴、大猿等)的抗原结合可变结构域序列和区域序列、人类常数。

“完整”抗体是具有抗原结合位点和 C大号和至少重链恒定域,CH1个H2年H3. 恒定域可以是天然序列恒定域(例如人天然序列恒定域)或其氨基酸序列变体。优选地,完整抗体具有一种或多种效应子功能。

“抗体片段”包括完整抗体的一部分,优选完整抗体的抗原结合区或可变区。抗体片段的例子包括 Fab、Fab'、F(ab')2个, 和 Fv 片段;双体;线性抗体(参见美国专利号 5,641,870,实施例 2;Zapata 等人,ing. Proteine8(10):1057-1062 [1995];单链抗体分子;以及由抗体片段形成的多特异性抗体。

抗体的木瓜蛋白酶消化产生两个相同的抗原结合片段,称为“Fab”片段和一个残留的“Fc”片段,该名称反映了易于结晶的能力。 Fab 片段由完整的 L 链和 H 链可变区结构域 (VH) 和重链的第一个恒定域 (CH1).每个Fab 片段在抗原结合方面都是单价的,即它有一个抗原结合位点。抗体的胃蛋白酶处理产生单个大的 F(ab')2个片段大致对应于两个二硫键连接的 Fab 片段,显示出二价抗原结合活性,但能够交联抗原。 Fab' 片段与 Fab 片段的不同之处在于它们在 C 的羧基末端包含一些额外的残基H1 个结构域包含来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。 Fab'-SH 是本文对 Fab' 的命名,其中恒定域的半胱氨酸残基带有游离硫醇基团。 F(ab')2个抗体片段最初是作为成对的 Fab' 片段产生的,它们之间有铰链半胱氨酸。抗体片段的其他化学偶联也是已知的。

Fc 片段包括两条二硫键连接的 H 链的羧基末端部分。抗体的效应功能由 Fc 区中的序列决定,该区也是某些细胞类型上发现的 Fc 受体 (FcR) 识别的部分。

“Fv”是包含完整抗原识别和结合位点的最小抗体片段。该片段由非共价紧密结合的重链可变区结构域和轻链可变区的二聚体组成。这两个结构域的折叠产生六个高变环(重链和轻链各有 3 个环),为抗原结合提供氨基酸残基并赋予抗体抗原结合特异性。然而,即使是单个可变结构域(或仅包含三个抗原特异性 CDR 的 Fv 的一半)也具有识别和结合抗原的能力,尽管其亲和力低于整个结合位点。

“单链Fv”,也缩写为“sFv”或“scFv”,是结合V的抗体片段H和V大号连接成一条多肽链的抗体结构域。优选地,sFv多肽还包含一个位于VH和V大号允许 sFv 形成抗原结合所需结构的结构域。有关 sFv 的综述,请参见 Pluckthun,网址为单克隆抗体的药理学,屋宇署。 113,Rosenburg 和 Moore Hrsg.,Springer 出版社,纽约,第 113-1 页。 S. 269–315 (1994); Borrebaeck 1995,见下文。

术语“双抗体”是指通过构建 sFv 片段(见上一段)获得的小抗体片段,在 VH和V大号结构域使得实现V结构域的链间而非链内配对,产生二价片段,即具有两个抗原结合位点的片段。双特异性双抗体是两个“交叉”sFv 片段的异二聚体,其中 VH和V大号两种抗体的结构域存在于不同的多肽链上。双抗体在例如 EP 404 097 中有更详细的描述;文件 WO 93/11161;和霍林格等人,全氯乙烯美国国家学院军刀90:6444-6448(1993)。

“人源化”形式的非人(例如,啮齿动物)抗体是包含源自非人抗体的最少序列的嵌合抗体。人源化抗体主要是人免疫球蛋白(受体抗体),其中受体的高变区残基被非人类物种(供体抗体)如小鼠、大鼠、兔或非人灵长类动物的高变区残基取代,具有所需的抗体特异性、亲和力和容量。在一些情况下,人免疫球蛋白的侧翼区 (FR) 残基被相应的非人残基取代。此外,人源化抗体可包括受体抗体或供体抗体中未发现的残基。进行这些修饰以进一步改进抗体的性能。一般而言,人源化抗体基本上包含至少一个,通常是两个可变域,其中所有或基本上所有的高变环对应于非人免疫球蛋白的那些,并且所有或基本上所有的 FR 是非人免疫球蛋白的那些非人免疫球蛋白,人免疫球蛋白序列。人源化抗体将任选地还包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,通常是人免疫球蛋白的恒定区。有关详细信息,请参阅 Jones 等人,自然321:522-525(1986);里赫曼等人。自然332:323-329(1988);并借出当前操作。结构生物学。2:593-596(1992)。

“物种依赖性抗体”,例如哺乳动物抗人IgE抗体,是对第一哺乳动物物种的抗原具有比对第二哺乳动物物种的该抗原的同系物更强的结合亲和力的抗体。通常,物种依赖性抗体特异性地“结合”到人类抗原(即结合亲和力(Kd)值不超过约 1 × 10−7M,最好不超过约 1 × 10−8最优选不超过约 1×10−9M),但对来自第二非人哺乳动物物种的抗原同系物的结合亲和力比其结合亲和力弱至少约 50 倍、或至少 500 倍、或至少 1000 倍人抗原 物种依赖性抗体可以是以上定义的任何不同类型的抗体,但优选是人源化抗体或人抗体。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO14、PRO186460 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 结合寡肽”是一种寡肽,其优选具有 e410、4、PRO32 PRO2140 的形式,特别是, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, Pro4326, Pro PRO9820, PRO9828, PRO102924, PRO15924, PRO15924, PRO15924 PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370,如本文档所述, PRO1760, PRO1787, PRO1868,6243 unión PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 pueden sintetizarse químicamente utilizando una metodología conocida de síntesis de oligopéptidos o pueden prepararse y purificarse utilizando tecnología 重组。 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1860,40 union with pro3,64640 pro6094、pro6244、pro9820、pro1028、pro16090、pro19644、pro21340、pro92165、pro85143、pro1124,约 6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19, 20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、 45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、 70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、 95、96、97、98、99 或 100 个氨基酸的长度 o más,en los que oligopeptides,它们具有结合能力,优选以特定形式,PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、 Pro533, Pro541, Pro725, Pro937, PRO1014, PRO1120, PRO1325, PRO1382, PRO15510, PRO1551, PRO1760, PRO1787, PRO4326, PRO432, PRO46, PRO46, PRO98, PRO9828, Pro1, PRO21340, PRO92165, PRO PRO192 PRO28,PRO24,20 , PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO187870, PRO187870, PRO6243批次PRO4400, PRO6003, PRO62204,9 PRO62204,9 PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 无需实验即可识别 indebida usando técnicas。 A este respecto, se observed que las técnicas para cribar bibliotecas de oligopéptidos en busca de oligopéptidos que sean capaces de unirse specíficamente a un objetivo polypeptídico son bien conocidas en la técnica (véanse, por ejemplo, las patentes de EE., 5.403.484,65,5) , 5,663,143,PCT 公开号 WO 84/03506 和 WO 84/03564,Geysen 等人。全氯乙烯美国国家科学院,81:3998-4002 (1984); Geysenet 等人,全氯乙烯美国国家科学院,82:178-182(1985); Geysenet 等人,一个合成肽作为抗原,130-149(1986); Geysenet 等人,J.免疫学。打。,102:259-274(1987); Schoofs 等人,J.免疫学,140: 611-616 (1988), Cwirla, S.E. 等。 (1990)全氯乙烯美国国家学院军刀87:6378;洛曼,H.B.等。 (1991)生物化学,30:10832;克拉克森,T.等。 (1991)自然,352: 624; Marks, J.D. 等人。 (1991),J.摩尔。生物学,222:581; Kang, A.S. 等人。 (1991)全氯乙烯美国国家学院军刀88:8363,Smith, G.P. (1991)目前的意见。生物技术.,2:668)。

到“PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO18368, PRO4 分子”不是如本文定义的寡肽或抗体的有机分子,其优选结合特别是PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787 , PRO18687, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 oder PRO23370 wie本文档中描述的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1834、PRO。 4 有机键分子 PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 可以使用已知方法进行化学鉴定和合成,例如 PCT 公开号 8 WO00/00.00.00/39585)。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO155、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO6004、PRO621694、PRO621694 PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 有机结合分子通常小于约 2,000 道尔顿,或者小于约 1,500、500、250 或 200 道尔顿,有机分子能够这样做,优选特异性结合PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 多肽,已知技术。在这方面,应注意用于筛选有机分子文库以寻找能够结合多肽靶标的分子的技术是本领域已知的(参见例如PCT公开号WO00/00823和WO00/39585)。 .

“结合”目标抗原的抗体、寡肽或其他有机分子,例如肿瘤相关多肽靶抗原是以足够的亲和力结合抗原,使得抗体、寡肽或其他有机分子是并且优选地用作诊断和/或治疗剂以靶向表达抗原的细胞或组织与其他蛋白质发生显着的交叉反应。抗体、寡肽或其他有机分子与“非目标”蛋白质的结合水平小于抗体、寡肽或其他有机分子与其特定目标蛋白质结合的水平,如通过激活荧光测定的。细胞分选分析 (FACS) 或放射免疫沉淀 (RIA)。关于抗体、寡肽或其他有机分子与靶分子的结合,术语“特异性结合”或“特异性结合”或“特异于”特定多肽或特定靶多肽上的表位是指结合这与非特异性相互作用有明显不同。例如,可以通过确定分子的结合与对照分子的结合相比来测量特异性结合,对照分子通常是缺乏结合活性的类似结构的分子。例如,特异性结合可以通过与类似于靶标的对照分子竞争来确定,例如B. 未标记目标过多。在这种情况下,当标记靶标与探针的结合被过量的未标记靶标竞争性抑制时,表明特异性结合。如本文所用,术语“特异性结合”或“特异性结合”或“特异于”特定多肽或特定多肽靶标上的表位,例如可以通过具有针对靶标的Kd的分子来显示至少负 10−4M,或者至少约 10−5M,或者至少约 10−6M,或者至少约 10−7M,或者至少约 10−8M,或者至少约 10−9M,或者至少约 10−10M,或者至少约 10−11M,或者至少约 10−12M 或更大。术语“特异性结合”指结合,其中分子结合特定多肽或特定多肽上的表位而不结合基本上任何其他多肽或多肽表位。

“抑制表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的肿瘤细胞生长的抗体、寡肽或其他有机分子” . , PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, 是抗体、寡肽或其他有机分子。生长抑制剂,对表达或过度表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的癌细胞的生长产生可测量的抑制, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO PRO23370。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以是在癌细胞表面表达的跨膜多肽或可以是产生由一个癌细胞。首选生长抑制剂抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗 PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗- PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143 , 抗-PRO1124, 抗-PRO1026 或抗-PRO23370 抗体, 寡肽或有机分子抑制 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725 - , PRO937-, PRO1014-, PRO1120 的生长-, PRO1182-, PRO1325-, PRO1382-, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400 - , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828 , PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370, 肿瘤细胞优选 20% 或表达更多从约 20% 到约 50%,甚至更优选从或大于 50% (例如B.与合适的对照相比约50%至约100%,该对照通常是用测试的抗体、寡肽或其他有机分子处理的非肿瘤细胞。可以在细胞培养物中以约 0.1 至 30 µg/ml 或约 0.5 nM 至 200 nM 的抗体浓度测量生长抑制,在注射后 1-10 天当肿瘤细胞暴露于抗体时测定生长抑制。可以通过多种方式确定体内肿瘤细胞生长的抑制。当施用抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725 时,抗体抑制体内生长。抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO120、抗PRO182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、 [0062] 约100mg/kg体重的约1μg/kg的抗PRO1026或抗PRO23370抗体导致在首次施用抗体后约5天至3个月内肿瘤大小减小或肿瘤细胞增殖,最好在大约 5 到 30 天内。

“细胞凋亡诱导”抗体、寡肽或其他有机分子是一种诱导由膜联蛋白 V 结合、DNA 片段化、细胞收缩、内质网扩张、细胞片段化和/或膜囊泡形成介导的程序性细胞死亡(因此-称为凋亡小体)。细胞通常是过度表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787 的细胞PRO1868-、PRO4326-、PRO4332-、PRO4346-、PRO4400-、PRO6003-、PRO6094-、PRO6244-、PRO9820-、PRO9828-、PRO10274-、PRO16090-、PRO19644-、PRO21340-、PRO92165-、PRO85143-、PRO1124- , PRO1026 或 PRO23370 多肽。优选地,细胞是肿瘤细胞,例如肿瘤细胞。 B. 前列腺、乳腺、卵巢、胃、子宫内膜、肺、肾、结肠、膀胱细胞。有几种方法可用于评估与细胞凋亡相关的细胞事件。例如,磷脂酰丝氨酸 (PS) 易位可以通过膜联蛋白结合来测量; DNA 片段化可以通过 DNA 缩放来评估;和核/染色质浓缩以及 DNA 片段化可以通过亚二倍体细胞的任何增加来判断。优选地,细胞凋亡诱导抗体、寡肽或其他有机分子是导致相对于未处理细胞的膜联蛋白结合诱导约 2-50 倍、优选约 5-50 倍、最优选约 10-50 倍的一种分子膜联蛋白结合试验。

抗体的“效应子功能”是指可归因于抗体的Fc区(天然序列Fc区或氨基酸序列变体Fc区)的那些生物活性,并随抗体的同种型而变化。抗体效应子功能的例子包括: C1q 结合和补体依赖性细胞毒性;与 Fc 受体结合;抗体依赖性细胞介导的细胞毒性 (ADCC);吞噬作用;细胞表面受体(例如 B 细胞受体)的下调;和 B 细胞的激活。

“抗体依赖性细胞介导的细胞毒性”或“ADCC”是指一种细胞毒性形式,其中分泌的 Ig 与在某些杀伤细胞(例如,自然杀伤 (NK) 细胞)、嗜中性粒细胞和巨噬细胞上表达的 Fc 受体 (FcR) 结合) 使这些细胞毒性效应细胞能够特异性结合携带抗原的靶细胞,并随后用细胞毒素杀死靶细胞。抗体“武装”细胞毒性细胞并且对于这种破坏是必不可少的。介导 ADCC 的主要细胞 NK 细胞仅表达 FcγRIII,而单核细胞表达 FcγRI、FcγRII 和 FcγRIII。 FcR 在造血细胞中的表达总结在 Ravetch 和 Kinet 第 464 页的表 3 中。年。免疫学牧师。9:457-92 (1991)。为了确定目标分子的ADCC活性,可以进行体外ADCC测定,例如美国专利号5,500,362或5,821,337中所描述的。用于此类测定的有用效应细胞包括外周血单核细胞 (PBMC) 和自然杀伤 (NK) 细胞。或者或另外,可在体内测定感兴趣分子的ADCC活性,例如在诸如Clynes等人描述的动物模型中。全氯乙烯美国国家科学院95:652-656 (1998)。

“Fc受体”或“FcR”描述了结合抗体Fc区的受体。优选的FcR是天然序列人FcR。此外,优选的 FcR 是结合 IgG 抗体(γ 受体)的 FcR,包括 FcγRI、FcγRII 和 FcγRIII 亚类的受体,包括这些受体的等位变体和可变剪接形式。 FcγRII 受体包括 FcγRIIA(一种“激活受体”)和 FcγRIIB(一种“抑制受体”),它们具有相似的氨基酸序列,主要区别在于它们的细胞质结构域。 FcγRIIA 受体激活剂在其细胞质结构域中包含基于免疫受体酪氨酸的激活基序 (ITAM)。抑制性受体 FcγRIIB 在其细胞质结构域中包含基于免疫受体酪氨酸的抑制基序 (ITIM)。 (见 Daëron 的评论 M.,年。免疫学牧师。15:203-234(1997))。 FvR 在 Ravetch 和 Kinet 上进行检查,年。免疫学牧师。9:457-492(1991);凯普莱等人,免疫方法4:25-34(1994);和德哈斯等人,劳工 J.clin。药品。126:330-41 (1995)。其他 FcR,包括那些将在未来确定的 FcR,在本文件中被归类在术语“FcR”下。该术语还包括负责将母体 IgG 传递给胎儿的新生儿受体 FcRn(Guyer 等人,J.免疫学。117:587 (1976) 和 Kim 等人,J.免疫学。24:249(1994))。

“人效应细胞”是表达一种或多种FcR并执行效应功能的白细胞。优选地,细胞至少表达FcγRIII并发挥ADCC效应子功能。介导 ADCC 的人类白细胞的例子包括外周血单核细胞 (PBMC)、自然杀伤 (NK) 细胞、单核细胞、细胞毒性 T 细胞和中性粒细胞;首选PBMC和NK细胞。效应细胞可以从天然来源分离,例如B. 来自血液。

“补体依赖性细胞毒性”或“CDC”是指靶细胞在补体存在下的裂解。经典补体途径的激活由补体系统的第一个组分 (C1q) 与与其同源抗原结合的抗体(适当子类)的结合启动。例如,CDC 测定,如 Gazzano-Santoro 等人所述。描述,J.免疫学。方法202:163(1996 年)。

术语“癌症”和“癌症”是指或描述哺乳动物中通常以不受调节的细胞生长为特征的生理状况。癌症的例子包括但不限于癌、淋巴瘤、母细胞瘤、肉瘤和白血病。此类癌症的更具体实例包括鳞状细胞癌、肺癌(包括小细胞肺癌、非小细胞肺癌、肺腺癌和肺鳞状细胞癌)、腹膜癌、肝细胞癌、胃癌或胃癌(包括胃肠癌) ).癌)、胰腺癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、肝癌、膀胱癌、肝细胞癌、乳腺癌、结肠癌、结肠癌、子宫内膜癌或子宫癌、唾液腺癌、肾癌或肾癌、肝癌、前列腺癌癌症、外阴癌、甲状腺癌、肝癌和各种类型的头部和宫颈癌以及 B 细胞淋巴瘤(包括滤泡性/低级别非霍奇金淋巴瘤 (NHL);NHL;中度/滤泡性 NHL;中度弥漫性 NHL;高级免疫母细胞性 NHL;高级别淋巴细胞 NHL;高级别小细胞 NHL;巨块型 NHL;套细胞淋巴瘤;AIDS 相关淋巴瘤;和华氏巨球蛋白血症);慢性淋巴细胞白血病 (CLL);急性淋巴细胞白血病 (ALL);毛细胞白血病;慢性粒细胞白血病;和移植后淋巴增生性疾病(PTLD)。优选地,癌症包括表达IGF受体的肿瘤,更优选乳腺癌、肺癌、结肠癌或前列腺癌,最优选乳腺癌或前列腺癌。

“化疗药物”是一种可用于治疗癌症的化合物。化学治疗剂的实例包括烷化剂,例如噻替派和 CYTOXAN® 环磷酰胺;烷基磺酸盐,例如白消安、亚普消、匹泊消;氮丙啶类,例如苯并多巴、碳醌、meturedopa和uredopa;亚乙基亚胺和甲基三聚氰胺,包括六甲糖胺、三亚乙基三聚氰胺、三亚乙基磷酰胺、三亚乙基硫代磷酰胺和三羟甲基三聚氰胺; acetogenins(尤其是 bullatacin 和 bullatacinone);喜树碱(包括合成类似物拓扑替康);苔藓抑素;卡利他汀; CC-1065(包括其合成类似物 adozelesin、carzelesin 和 bizelesin);隐藻素(特别是隐藻素 1 和隐藻素 8);海兔毒素; duocarmycin(包括合成类似物 KW-2189 和 CB1-TM1);刺五加素;胰抑素;肉毒杆菌素;海绵抑素;氮芥,例如苯丁酸氮芥、氯马嗪、松磷酰胺、雌莫司汀、异环磷酰胺、氮芥、盐酸氮芥、美法仑、novembiquin、苯内酯、泼尼莫司汀、曲磷酰胺、尿嘧啶芥;卡莫司汀、氯脲佐菌素、氟莫司汀、洛莫司汀、尼莫司汀、雷尼司汀等硝脲类;抗生素例如烯二胺抗生素(例如加利车霉素,特别是加利车霉素γII和加利车霉素ωII(参见例如Agnew, International Chem. Ed. English,33:183-186(1994));动力霉素,einschließlich 动力霉素 A;双膦酸盐,如 Clodronat;艾斯培霉素; sowie Neocarzinostatin-Chromophor und verwandte Antibiotikum-Endiin-Chromoprotein-Chromophore), 阿克拉霉素, 放线菌素, Autramycin, Azaserin, Bleomycine, Cactinomycin, Carabicin, Cadomycin, Carzinophyllin, Chromomycine, Dactinomycin, 柔红霉素, Detorubicin- 5-ox-Diazozo -norleucin , ADRIAMYCIN® Doxorubicin (einschließlich Morpholino-Doxorubicin, Cyanomorpholino-Doxorubicin, 2-Pyrrolino-Doxorubicin und Desoxidoxorubicin), Epirubicin, Esorubicin, Idarubicin, Marcelomycin, Mitomycine wie Mitomycin C, Mycophenolsäure, Nogalamycin, Olivomycine, Peplomycin, Potfiromycin, Puromycin B .Chelamycin、Rhodorubicin、Streptongrin、Streptozocin、Tubercidin、Ubenimex、Zinostatin、Zorubicin;抗代谢药物如甲氨蝶呤和 5-氟尿嘧啶 (5-FU); Folsäure-Analoga wie Denopterin、Methotrexat、Pteropterin、Trimetrexat; Purinanaloga wie Fludarabin、6-Mercaptopurin、Thiomiprin、Thioguanin;嘧啶类似物 wie Ancitabin、Azacitidin、6-Azauridin、Carmofur、Cytarabin、Didesoxyuridin、Doxifluidin、Enocitabin、Floxuridin;雄激素 wie Callusteron、Dromostanolonpropionat、Epitiostanol、Mepitiostan、Testolacton;抗Nebennierenmittel wie Aminoglutethimid、Mitotan、Trilostan; Folsäure-Auffüller wie Frolinsäure;加速器;醛磷酰胺糖苷; Aminolävulinsäure;恩尿嘧啶;安吖啶;贝斯塔布西尔;双生蒽;依地沙;综合;地美秋水仙;地亚醌;艾福米汀;醋酸椭圆素; ein Epothilon;乙醇胺;硝酸镓;羟基原料;香菇多糖;乐奈宁;美登木素、美登素和安丝霉素;米托瓜松;米托蒽醌;莫匹丹莫;硝酸甘油;喷司他丁;怪物;吡柔比星;洛克蒽醌;鬼臼; 2-乙基酰肼;丙卡巴肼; PSK® Polysaccharidkomplex (JHS Natural Products, Eugene, Oregon);雷佐生;根瘤菌素;四唑呋喃;螺锗; Tenuazonsäure;三氮唑; 2,2',2''-三氯三乙胺;单端孢霉烯(insbesondere T-2-Toxin、Verracurin A、Roridin A 和 Anguidin);聚氨酯;长春花苷;达卡巴嗪;甘露莫司汀;米托布罗尼特;米托内醇;溴溴索;胞嘧啶;阿拉伯糖苷(“Ara-C”);环磷酰胺;噻替哌; Taxoide、zum Beispiel TAXOL® Paclitaxel (Bristol-Myers Squibb Oncology, Princeton, N.J.)、Cremophor ABRAXANE™-freie albumintechnisch hergestelte Nanopartikelformulierung von Paclitaxel (American Pharmaceutical Partners, Schauberg, Illinois) 和 TAXOTERE® Doxetaxel (Rhône-Poulenc Rorer)。 , 安东尼乌斯, 法兰克赖希);苯丁酸氮芥;吉西他滨 GEMZAR®; 6-硫鸟嘌呤;巯基嘌呤;甲氨蝶呤; Platinanaloga wie 顺铂和卡铂;长春花碱;铂金;依托泊苷 (VP-16);异环磷酰胺;米托蒽醌;长春新碱; NAVELBINE 长春瑞宾;诺凡创;替尼泊苷;依达曲沙;道诺霉素;氨蝶呤;希罗达;伊班膦酸钠; CPT-11; RFS 2000-拓扑异构酶抑制剂;二氟甲基鸟氨酸 (DMFO);维甲酸 wie Retinsäure;卡培他滨; und pharmazeutisch annehmbare Salze, Säuren 或 Derivate von beliebigen der vorstehenden。

该定义还包括调节或抑制激素对肿瘤的作用的抗激素药物,例如抗雌激素和选择性雌激素受体调节剂(SERM),包括例如他莫昔芬(包括 NOLVADEX®他莫昔芬)、雷洛昔芬、屈洛昔芬、羟基他莫昔芬、三苯氧胺、酮苯氧胺、LY117018、奥那司酮和托瑞米芬 FARESTON;芳香酶抑制剂,可抑制调节肾上腺中雌激素产生的芳香酶,例如 4(5)-咪唑、氨鲁米特、醋酸甲地孕酮 MEGASE、AROMASIN® 依西美坦、福美斯坦、法屈唑、RIVISOR® vorozole、FEMARA® letrozole 和 ARIMIDEX ® 阿那曲唑;和抗雄激素药,例如氟他胺、尼鲁米特、比卡鲁胺、亮丙瑞林和戈舍瑞林;和曲沙他滨(一种 1,3-二氧戊环核苷胞嘧啶类似物);反义寡核苷酸,特别是那些抑制异常细胞增殖信号通路中基因表达的寡核苷酸,例如 PKC-α、Ralf 和 H-Ras;核酶,例如 VEGF 表达抑制剂(例如 ANGIOZYME® 核酶)和 HER2 表达抑制剂;疫苗,例如基因治疗疫苗,例如B. ALLOVECTIN®疫苗、LEUVECTIN®疫苗和VAXID®疫苗; PROLEUKIN® rIL-2; LURTOTECAN® 拓扑异构酶 1 抑制剂; ABARELIX® rmRH;以及任何前述物质的药学上可接受的盐、酸或衍生物。

术语“细胞增殖性病症”和“增殖性病症”是指与某种程度的异常细胞增殖相关的病症。在本发明的一方面,细胞增殖性病症是癌症。

如本文所用,“肿瘤”是指肿瘤细胞的总生长和增殖,无论是恶性的还是良性的,以及所有癌前和癌细胞和组织。

“诱导细胞死亡”的抗体、寡肽或其他有机分子是使活细胞无法存活的分子。电芯为PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17687、PRO426。 7表示B。 -, PRO1124-, PRO23370 多肽, PRO 是过表达 PRO2094 的细胞, 优选 PRO2094, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1786, PRO1786, PRO1760 PRO4326、PRO4332、PRO4030、PRO0946、PRO80、PRO8209、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 与相同组织类型的正常细胞相比。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以是在癌细胞表面表达的跨膜多肽或可以是产生由一个癌细胞。优选地,细胞是癌细胞,例如乳腺、卵巢、胃、子宫内膜、唾液腺、肺、肾、结肠、甲状腺、胰腺或膀胱细胞。可以在没有补体和免疫效应细胞的情况下确定体外细胞死亡,以区分由抗体依赖性细胞介导的细胞毒性 (ADCC) 或补体依赖性细胞毒性 (CDC) 诱导的细胞死亡。因此,可以使用热灭活(即没有补体)和没有免疫效应细胞的血清进行细胞死亡测定。为了确定抗体、寡肽或其他有机分子是否能够通过掺入碘化丙锭 (PI)、台盼蓝(参见 Moore 等人,Zytotechnologies公司17:1-11 (1995)) 或 7AAD 相对于未处理的细胞。优选的细胞死亡诱导抗体、寡肽或其他有机分子是在 BT474 细胞 PI 摄取测定中诱导 PI 摄取的那些。

如本文所用,术语“免疫粘附”是指将异源蛋白的结合特异性(“粘附”)与免疫球蛋白恒定域的效应子功能相结合的抗体样分子。在结构上,免疫粘附涉及具有所需结合特异性的氨基酸序列与抗体的抗原识别和结合位点(即“异源”)不同的氨基酸序列与免疫球蛋白恒定域序列的融合。免疫粘附分子的粘附部分通常是连续的氨基酸序列,包括至少一个受体或配体结合位点。免疫粘附中的免疫球蛋白恒定域序列可以从任何免疫球蛋白获得,例如IgG-1、IgG-2、IgG-3或IgG-4亚型、IgA(包括IgA-1和IgA-2)、IgE、IgD或IgM。

如本文所用,术语“标记”是指直接或间接与抗体缀合以产生“标记的”抗体的可检测化合物或组合物。标记本身可以是可检测的(例如放射性同位素标记或荧光标记),或者在酶标记的情况下,它可以催化可检测化合物或底物成分的化学变化。

“复制抑制剂”是抑制或阻止细胞复制、功能和/或生长,或杀死细胞的试剂,无论机制如何,例如通过细胞凋亡、血管抑制、细胞分裂、杀肿瘤剂、抑制有丝分裂。 ,阻断细胞周期进程,阻止细胞生长,与肿瘤结合,充当细胞介质等。此类药剂包括化学治疗剂、细胞毒性剂、细胞因子、生长抑制剂或抗激素剂,例如抗雌激素化合物例如他莫昔芬,一种抗孕酮,例如奥那司酮(参见 EP 616 812);或抗雄激素药物如氟他胺,如芳香酶抑制剂或激素药物如雄激素。

如本文所用,术语“细胞毒剂”是指抑制或阻止细胞功能和/或引起细胞破坏的物质。该术语旨在包括放射性同位素(例如 At211, 我131, 我125, Y90后, 参考186, 参考188, 史密斯153, 毕212, 聚酰胺32和放射性同位素),化学治疗剂,例如甲氨蝶呤、阿霉素、长春花生物碱(长春新碱、长春花碱、依托泊苷)、多柔比星、美法仑、丝裂霉素 C、苯丁酸氮芥、柔红霉素或其他嵌入剂、酶及其片段如溶核酶,抗生素和毒素,例如小分子毒素或酶促活性酶。细菌、真菌、植物或动物来源的毒素,包括其片段和/或变体,以及下文所述的各种抗肿瘤剂或抗癌剂。其他细胞毒剂如下所述。杀肿瘤剂导致肿瘤细胞的破坏。

与本文的拮抗剂联合使用的用于特定肿瘤类型的本文优选的细胞毒剂如下:

1. 前列腺癌:雄激素、多西紫杉醇、紫杉醇、雌莫司汀、多柔比星、米托蒽醌、针对 ErbB2 结构域的抗体,例如 2C4(WO 01/00245;ATCC 杂交瘤 HB-12697),它结合 ErbB2 胞外结构域中的一个区域(一个或多个ErbB2 的约残基 22 至约残基 584(含))、AVASTIN™ 抗血管内皮生长因子(VEGF)、TARCEVA™ OSI-774(厄洛替尼)(Genenetech 和 OSI Pharmaceuticals)或其他表皮生长因子受体的区域中有更多残基酪氨酸激酶抑制剂 (EGFR TKI)。

2. Magenkrebs:5-氟尿嘧啶 (5FU)、Capecitabin XELODA™、甲氨蝶呤、依托泊苷、顺铂/卡铂、紫杉醇、多西紫杉醇、吉西他滨、多柔比星和 CPT-11(喜树碱-11;伊立替康,美国商标:CAMPTOSAR®)。

3.胰腺癌:吉西他滨、5FU、卡培他滨XELODA™、CPT-11、多西紫杉醇、紫杉醇、顺铂、卡铂、特罗凯™、厄洛替尼和其他EGFR TKIs。

4. 结肠癌:5FU、XELODA™ Capecitabine、CPT-11、Oxaliplatin、AVASTIN™ Anti-VEGF、TARCEVA™ Erlotinib 和其他 EGFR TKIs 和 ERBITUX™(以前称为 IMC-C225)、嵌合人:鼠单克隆抗体结合 EGFR并阻断 EGF 启动受体激活和向肿瘤发出信号的能力。

5. 肾癌:IL-2、干扰素 α、AVASTIN™ 抗 VEGF、MEGACE™(醋酸甲地孕酮)孕激素、长春碱、特罗凯™厄洛替尼和其他 EGFR TKI。

如本文所用,“生长抑制剂”是指抑制细胞生长的化合物或组合物,特别是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533-、PRO541-、PRO725-、PRO937-、 PRO1014-、PRO1120-、PRO1182-、PRO1325-、PRO1382-、PRO1410-、PRO1555-、PRO1556-、PRO1760-、PRO1787-、PRO1868-、PRO4326-、PRO4332-、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820 , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 在体外或体内表达癌细胞。因此,生长抑制剂可以是增加 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182-、PRO1325-、PRO1382-、PRO1410 的百分比的一种-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340 、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 表达 S 期细胞阻滞(在 S 期以外的位点),例如诱导 G1 停滞和 M 期停滞的药物。经典的 M 期阻滞剂包括长春花(长春新碱)和长春碱)、紫杉烷类和拓扑异构酶 II 抑制剂,例如多柔比星、表柔比星、柔红霉素、依托泊苷和博来霉素。阻滞 G1 的药物也延伸至阻滞 S 期,例如,DNA 烷化剂,如他莫昔芬、泼尼松、达卡巴嗪、氮芥、顺铂、甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶和 ara-C。有关详细信息,请参阅癌症的分子基础,Mendelsohn 和 Israel,编辑,第 1 章,题为“细胞周期调节、致癌基因和抗癌药物”,作者 Murakami 等人。 (WB Saunders: Philadelphia, 1995),尤其是 p. 13. 紫杉烷(紫杉醇和多西紫杉醇)是抗癌药物,均来自紫杉树。多西紫杉醇(TAXOTERE®,Rhone-Poulenc Rorer)源自欧洲紫杉树,是紫杉醇(TAXOL®,Bristol-Myers Squibb)的半合成类似物。紫杉醇和多西紫杉醇可促进微管蛋白二聚体组装成微管,并通过防止解聚来稳定微管,从而抑制细胞有丝分裂。

“多柔比星”是一种蒽环类抗生素。阿霉素的完整化学名称是 (8S-cis)-10-[(3-amino-2,3,6-trideoxy-α-L-lyxo-hexapyranosyl)oxy]-7,8,9,10-tetrahydro- 6,8,1-三羟基-8-(羟基乙酰基)-1-甲氧基-5,12-萘二酮。

术语“细胞因子”是从细胞群中释放并作为另一个细胞的细胞间介质的蛋白质的通用术语。这种细胞因子的例子是淋巴因子、单核因子和传统的多肽激素。细胞因子包括生长激素,如人生长激素、人N-甲硫氨酰生长激素和牛生长激素;甲状旁腺激素;甲状腺素;胰岛素;胰岛素原;松弛素;松弛素原;糖蛋白激素,如促卵泡激素(FSH)、促甲状腺激素(TSH)和促黄体激素(LH);肝脏生长因子;成纤维细胞生长因子;催乳素;胎盘催乳素;肿瘤坏死因子-α和-β;苗勒管抑制剂;小鼠促性腺激素相关肽;抑制素;激活素;血管内皮生长因子;整合素;促血小板生成素 (TPO); NGF-β等神经生长因子;血小板生长因子;转化生长因子 (TGF),例如 TGF-α 和 TGF-β;胰岛素样生长因子-I 和-II;促红细胞生成素 (EPO);骨诱导因子;干扰素,例如干扰素-α、-β和-γ;集落刺激因子 (CSF),例如巨噬细胞 CSF (M-CSF);粒细胞-巨噬细胞-CSF (GM-CSF);和粒细胞脑脊液(G-CSF);白细胞介素 (IL),例如 IL-1、IL-1a、IL-2、IL-3、IL-4、IL-5、IL-6、IL-7、IL-8、IL-9、IL-11,白细胞介素-12; TNF-α或TNF-β等肿瘤坏死因子;和其他多肽因子,包括 LIF 和 Kit Ligand (KL)。如本文所用,术语“细胞因子”包括来自天然来源或来自重组细胞培养物的蛋白质和天然序列细胞因子的生物活性等同物。

术语“包装说明书”是指通常包含在药品商业包装中的使用说明,其中包含有关这些药品的适应症、用途、剂量、给药、禁忌症和/或警告的信息。

术语“基因”指(a)包含至少一个本文所述的DNA序列的基因; (b) 编码由本文所述的 DNA 序列编码的氨基酸序列的任何 DNA 序列和/或; (c) 与本文所述编码序列互补序列杂交的任何 DNA 序列。优选地,该术语包括编码区和非编码区,并且优选地包括正常基因表达所必需的所有序列。

术语“基因打靶”是指当基因组DNA片段被引入哺乳动物细胞并且该片段被定位并与内源同源序列重组时发生的一种同源重组。同源重组基因打靶使用重组 DNA 技术,用专门设计的外源 DNA 替换特定的基因组序列。

术语“同源重组”是指两个DNA分子或染色单体之间在同源核苷酸序列位点的DNA片段交换。

术语“靶基因”(或者称为“靶基因序列”或“靶DNA序列”)是指任何核酸分子、多核苷酸或将通过同源重组修饰的基因。靶序列包括完整基因、外显子或内含子、调节序列或基因之间的任何区域。靶基因可包含个体基因组DNA中的特定基因或基因座的一部分。

“中断”PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1786、PRO44262、PRO44262 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 发生在具有内源同源序列的基因组 DNA 片段定位和重组时野生型基因或其部分,或野生型基因中的突变,或当破坏是野生型基因的功能失活时。或者,可以使用基因捕获载体通过非特异性插入失活来产生序列中断(即,包含并表达随机插入的转基因的非人类转基因动物;参见,例如,2002 年 8 月 20 日颁发的美国专利号 6,436,707 ).这些序列中断或修饰可能涉及插入、错义、移码、缺失或 DNA 序列替换或交换,或其任何组合。插入包括全长基因的插入,其可以是动物、植物、真菌、昆虫、原核生物或病毒来源的。例如,一种疾病可以通过部分或完全抑制正常基因产物的产生或增加正常基因产物的活性来改变正常基因产物。优选地,中断是空中断,其中没有 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO3.30, 或 PRO1 母语表达。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382编码的全长多肽。 PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644,具有野生型小鼠中存在的表达水平。内源性 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340 或编码内源性 PRO2094 的多肽的至少一部分的表达完全降低, PRO2. PRO2194 , PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO4304, PRO463326 , PRO640403, PRO640403 PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO196444, 哺乳动物的单细胞、选定细胞或所有细胞。

术语“敲除”是指 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1034;如果 PRO124 功能基因结果,天然基因或其部分的缺失;或天然基因的突变。

术语“敲入”是指用编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354 编码的 PRO355 特异性人类之一的人类 cDNA 替换小鼠直系同源物(或其他小鼠基因)。 -, PRO533-, PRO541-, PRO725-, PRO937-, PRO1014-, PRO1120-, PRO1182-, PRO1325-, PRO1382-, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 编码基因或其变体(即破坏导致天然小鼠基因被替换为天然的人类基因)。

术语“构建体”或“靶向构建体”是指用于转移至靶组织、细胞系或动物的人工组装的DNA片段。通常,靶向构建体将包括特别感兴趣的基因或核酸序列、标记基因和适当的控制序列。如本文所述,定向结构包括 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO18687、 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1370、PRO1124 或 PRO1124。关于“PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1830368,6 PRO04 PRO040368-、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 靶向构建体”包含与 PRO194、PRO22、PRO22 的至少一部分同源的 DNA 序列, PRO31.4, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO43362, PRO4040,6 PRO4024, PRO4040,6 PRO4024 , PRO64040 , PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 并且可以在 PRO241,351 PRO241,351 PRO241,351, PRO194, PRO, PRO35, PRO2541, PRO1424,1 PRO1424,1 , PRO1120 生成 PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO6003, PRO6094, PRO92165, PRO85143,2 PRO312143,2 PRO10143,2 PRO115143,2 PRO115143 宿主细胞4

术语“转基因细胞”是指在其基因组中包含PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410的细胞。 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO全部或部分被基因选择法替代。

术语“转基因动物”是指在其基因组中包含已通过本文所述或本领域已知的方法破坏或以其他方式修饰或突变的特定基因的动物。优选地,非人转基因动物是哺乳动物。更优选地,哺乳动物是啮齿动物例如大鼠或小鼠。此外,“转基因动物”可以是杂合动物(即一个缺陷等位基因和一个野生型等位基因)或纯合动物(即两个缺陷等位基因)。胚胎属于动物的定义。提供动物包括在子宫内提供胚胎或胎儿,无论是通过交配还是其他方式,无论胚胎是否足月。

如本文所用,术语“选择标记”和“位置选择标记”是指编码产物的基因,该产物仅允许携带该基因的细胞在某些条件下存活和/或生长。例如,对引入的新霉素(NeoR) 对化合物 G418 具有抗性。不携带 Neo 的细胞R基因标记被 G418 杀死。其他阳性选择标记是已知的或在技术人员的技能范围内。

本文所用的术语“调节”或“调节”指PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO541、PRO725、PRO937、 Pro1014,Pro1120,Pro1182,Pro1325,Pro1382,Pro1410,Pro1555,Pro1556,Pro1556,Pro1760,Pro1787,Pro1787,Pro4326,Pro4326,Pro4332,Pro4332,Pro446,Pro4400 PRO236 或 PRO237 功能或者与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、Pro1120、Pro1182、Pro1325、Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO178687、PRO1555、PRO178687、PRO1410、PRO1555、PRO178687、PRO1410 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9 PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 基因。

本文所用的术语“改善”或“改善”是指病症、疾病、病症或表型(包括异常或症状)的减少、减少或消除。

术语“异常”是指任何疾病、病症、病症或表型,其中 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、 PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO196444,包括病理情况和行为观察。

表格1

/*

*

* C-C 从 12 增加到 15

* Z 是 EQ 的平均值

* B 是 ND 的平均值

* 停止匹配是_M;停止-停止 = 0;匹配 J(通配符)= 0

*/

#定义

_M −8

/* 停止匹配的值 */

和T

_tag[26][26] = {

/* ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTU VWXYZ */

/* A */

{ 2, 0,−2, 0, 0,−4, 1,−1,−1, 0,−1,−2,−1, 0,_M, 1, 0,−2, 1, 1, 0 , 0,−6, 0,−3, 0},

/*乙*/

{ 0, 3,−4, 3, 2,−5, 0, 1,−2, 0, 0,−3,−2, 2,_M,−1, 1, 0, 0, 0, 0,− 2,−5, 0,−3, 1},

/* C */

{−2,−4,15,−5,−5,−4,−3,−3,−2,0,−5,−6,−5,−4,_M,−3,−5,− 4, 0,−2, 0,−2,−8, 0, 0,−5},

/* D */

{ 0, 3,−5, 4, 3,−6, 1, 1,−2, 0, 0,−4,−3, 2,_M,−1, 2,−1, 0, 0, 0, −2, −7, 0, −4, 2},

/*米*/

{ 0, 2,−5, 3, 4,−5, 0, 1,−2, 0, 0,−3,−2, 1,_M,−1, 2,−1, 0, 0, 0, −2, −7, 0, −4, 3},

/*F*/

{−4,−5,−4,−6,−5, 9,−5,−2, 1, 0,−5, 2, 0,−4,_M,−5,−5,−4,− 3,−3, 0,−1, 0, 0, 7,−5},

/*G*/

{ 1, 0,−3, 1, 0,−5, 5,−2,−3, 0,−2,−4,−3, 0,_M,−1,−1,−3, 1, 0 , 0,−1,−7, 0,−5, 0},

/*H*/

{−1, 1,−3, 1, 1,−2,−2, 6,−2, 0, 0,−2,−2, 2,_M, 0, 3, 2,−1,−1, 0,−2,−3, 0, 0, 2},

/* 我 */

{−1,−2,−2,−2,−2, 1,−3,−2, 5, 0,−2, 2, 2,−2,_M,−2,−2,−2,− 1, 0, 0, 4, -5, 0, -1, -2},

/*J*/

{ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,_M, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 , 0},

/*K*/

{−1, 0,−5, 0, 0,−5,−2, 0,−2, 0, 5,−3, 0, 1,_M,−1, 1, 3, 0, 0, 0, −2, −3, 0, −4, 0},

/*长*/

{−2,−3,−6,−4,−3, 2,−4,−2, 2, 0,−3, 6, 4,−3,_M,−3,−2,−3,− 3,−1, 0, 2,−2, 0,−1,−2},

/*M*/

{−1,−2,−5,−3,−2, 0,−3,−2, 2, 0, 0, 4, 6,−2,_M,−2,−1, 0,−2, −1, 0, 2, −4, 0, −2, −1},

/* 注释 */

{ 0, 2,−4, 2, 1,−4, 0, 2,−2, 0, 1,−3,−2, 2,_M,−1, 1, 0, 1, 0, 0,− 2,−4, 0,−2, 1},

/*哦*/

{_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,0,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M,_M ,_METRO},

/* PAG */

{ 1,−1,−3,−1,−1,−5,−1, 0,−2, 0,−1,−3,−2,−1,_M, 6, 0, 0, 1, 0, 0, -1, -6, 0, -5, 0},

/* P */

{ 0, 1,−5, 2, 2,−5,−1, 3,−2, 0, 1,−2,−1, 1,_M, 0, 4, 1,−1,−1, 0 ,−2,−5, 0,−4, 3},

/*R*/

{−2, 0,−4,−1,−1,−4,−3, 2,−2, 0, 3,−3, 0, 0,_M, 0, 1, 6, 0,−1, 0,−2, 2, 0,−4, 0},

/* 小号 */

{ 1, 0, 0, 0, 0,−3, 1,−1,−1, 0, 0,−3,−2, 1,_M, 1,−1, 0, 2, 1, 0,− 1,−2, 0,−3, 0},

/*T*/

{ 1, 0,−2, 0, 0,−3, 0,−1, 0, 0, 0,−1,−1, 0,_M, 0,−1,−1, 1, 3, 0, 0,−5, 0,−3, 0},

/* T */

{ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,_M, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 , 0},

/*V*/

{ 0,−2,−2,−2,−2,−1,−1,−2, 4, 0,−2, 2, 2,−2,_M,−1,−2,−2,− 1, 0, 0, 4, -6, 0, -2, -2},

/*W*/

{−6,−5,−8,−7,−7, 0,−7,−3,−5, 0,−3,−2,−4,−4,_M,−6,−5, 2 ,−2,−5, 0,−6,17, 0, 0,−6},

/* X */

{ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,_M, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 , 0},

/* J */

{−3,−3, 0,−4,−4, 7,−5, 0,−1, 0,−4,−1,−2,−2,_M,−5,−4,−4, −3, −3, 0, −2, 0, 0,10, −4},

/*Z*/

{ 0, 1,−5, 2, 3,−5, 0, 2,−2, 0, 0,−2,−1, 1,_M, 0, 3, 0, 0, 0, 0,−2 ,−6, 0,−4, 4}

};

/*

#include <stdio.h>

#include <ctype.h>

#定义

MAXJMP

十六

/* 诊断中的最大跳跃 */

#定义

最大间隙

24

/* 不再惩罚较大的间隙 */

#定义

JMPS

1024

/* 路由中的最大跳数 */

#定义

MX

4个

/* 如果自上次 jmp 以来至少有 MX−1 个碱基,则保存 */

#定义

DMAT

3个

/* 匹配碱基的值 */

#定义

SIGD

/* 碱基不匹配的惩罚 */

#定义

DINS0

8个

/* 间隙惩罚 */

#定义

星期二 1

1个

/* 基本惩罚 */

#定义

PINS0

8个

/* 间隙惩罚 */

#定义

引脚 1

4个

/* 休息惩罚 */

结构跳转 {

库尔兹

n[MAXJMP];

/* jmp 的大小(延迟为负值)*/

未签名的库尔兹

x[MAXJMP];

/* jmp在序列x中的基数 */

};

/* 将 seq 限制为 2{circle over ( )}16 −1 */

诊断结构{

和T

分数;

/* 最后一跳得分 */

拉戈

补偿;

/* 相对于前一个块的偏移量 */

库尔兹

魔鬼;

/* 当前 jmp 索引 */

jmp结构

J.P;

/* 跳转列表 */

};

结构路径{

和T

sp;

/* 前导空格数 */

库尔兹

n[JMPS];/* jmp(gap) 的大小 */

和T

x[JMPS];/* jmp loc (空格前的最后一个元素) */

};

字符

*直到;

/* 输出文件名 */

字符

*名称[2];

/* 顺序名称:getseqs() */

字符

*前卫;

/* 错误信息的程序名 */

字符

*序列[2];

/* 序列:获取序列 ( ) */

和T

dmax;

/* 更好的诊断:nw( ) */

和T

dmax0;

/*最终诊断*/

和T

广告;

/* 设置 if dna: main() */

和T

端缝;

/* 指定尾随空格是否应该被惩罚 */

和T

原因原因;

/* 序列中的总间隙 */

和T

len0, len1;

/* 顺序镜头 */

和T

ngapx,ngapy;

/* 孔的总大小 */

和T

克莱因;

/* 最大点数:nw( ) */

和T

*xbm;

/* 匹配位图 */

拉戈

补偿;

/* jmp 文件中的当前偏移量 */

结构

诊断

*dx;

/* 有斜杠 */

结构

离开

[2];

/* 保留流的路径 */

字符

*calloc(), *malloc(), *index(), *strcpy();

字符

*getseq(), *g_calloc();

/* Needleman 愿望注册程序

*

* 使用:progs archivo1 archivo2

* 其中 File1 和 File2 是两个 DNA 序列或两个蛋白质。

* ‍序列可能区分大小写并包含歧义

* 任何以“;”、“>”或“<”开头的行都将被忽略

* 最大文件长度为 65535(受限于 jmp 结构中的 unsigned short x)

* ⅓ 或更多 ACGTU 元素的序列被认为是 DNA

* ‍输出在文件“align.out”中

*

* 该程序可以在 /tmp 中创建一个 tmp 文件以包含跟踪信息。

* 在 BSD 4.3 下在 vax 8650 上开发的原始版本

*/

#include "nw.h"

#include “day.h”

静止的

_val_db[26] = {

1,14,2,13,0,0,4,11,0,0,12,0,3,15,0,0,0,5,6,8,8,7,9,0,10, 0

};

静止的

_pbval[26] = {

1, 2|(1<<('D'-'A'))|(1<<('N'-'A')), 4, 8, 16, 32, 64,

128, 256, 0xFFFFFFF, 1<<10, 1<<11, 1<<12, 1<<13, 1<<14,

1<<15, 1<<16, 1<<17, 1<<18, 1<<19, 1<<20, 1<<21, 1<<22,

1<<23, 1<<24, 1<<25|(1<<('E'-'A'))|(1<<('Q'-'A'))

};

主要(AC,关闭)

校长

和T

加州;

字符

*在......之外[ ];

{

编=关闭[0];

和(交流!= 3){

fprintf(stderr,“uso: %s archivo1 archivo2\n”, prog);

fprintf(stderr, "其中 file1 和 file2 是两个 DNA 序列或两个蛋白质。\n");

fprintf(stderr,"序列可以是大写或小写\n");

fprintf(stderr, "忽略所有以 ';' 或 '<' 开头的行\n");

fprintf(stderr,"输出在文件\"align.out\"\n");

退出(1);

}

xname[0] = off[1];

xname[1] = off[2];

seqx[0] = getseq(nombrex[0], &len0);

seqx[1] = getseq(nombrex[1], &len1);

xbm = (adn)? _dbval : _pbval;

尾随空格 = 0;

/* 1 惩罚后续的间隙 */

ofile = "align.outside";

/* 输出文件 */

nw( );

/* 填充数组,获取可能的 jmps */

readjmps();

/* 获取当前的 jmps */

按( );

/* 打印统计,对齐 */

清理(​​0);

/* 取消链接 tmp 文件 */}

/* 执行对齐,返回最佳分数:main()

* adn: values in Fitch and Smith, PNAS, 80, 1382-1386, 1983

* 每:PAM 250 值

* 如果分数相等,我们更喜欢差异而不是我们更喜欢的每个差距

* 一种新的伤害来延长持续的伤害并且更喜欢 seqx 中的伤害

* 到字符串 y 中的一个空格。

*/

现在( )

西北

{

字符

*px, *py;

/* seqs 和 ptrs */

和T

*德莱,*德莱;

/* 注意延迟 */

和T

ndelx, delx;

/* 关注delx */

和T

*tmp;

/* 交换 row0, row1 */

和T

马尔;

/* 每种类型的分数 */

和T

实际0,实际1;

/* 插入惩罚 */

记录

ID;

/* 对角线索引 */

记录

ij;

/* jmp-索引 */

记录

*第 0 列,*第 1 列;

/* 当前分数,最后一行 */

记录

xx,机管局;

/* 流索引 */

dx = (struct diag *)g_calloc(“para obtener diags”, len0+len1+1, sizeof(struct diag));

ndely = (int *)g_calloc(“para obtener ndely”, len1+1, sizeof(int));

dely = (int *)g_calloc("获取延迟", len1+1, sizeof(int));

col0 = (int *)g_calloc("获取 col0", len1+1, sizeof(int));

col1 = (int *)g_calloc("获取 col1", len1+1, sizeof(int));

ins0 = (adn)? DINS0 : 引脚 0;

ins1 = (adn)? DINS1:引脚1;

smax = –100000;

如果(尾随空格){

对于 (col0[0] = retraso[0] = −ins0, yy = 1; yy <= len1; yy++) {

col0[yy] = delay[yy] = col0[yy−1] − ins1;

ndely[yy] = yy;

}

col0[0] = 0;

/* Waterman Bull 数学生物学 84 */

}

其余的部分

段(yy = 1;yy <= len1;yy++)

延迟[aa] = -ins0;

/* 填充匹配数组

*/

para (px = seqx[0], xx = 1; xx <= len0; px++, xx++) {

/* 初始化列中的第一个条目

*/

如果(尾随空格){

如果(xx == 1)

col1[0] = delx = −(ins0+ins1);

其余的部分

col1[0] = delx = col0[0] - ins1;

ndelx = xx;

}

其余的部分 {

columna1[0] = 0;

delx = -ins0;

ndelx = 0;

}

...西北

para (py = seqx[1], yy = 1; yy <= len1; py++, yy++) {

mis = col0[aa−1];

si (adn)

mis += (xbm[*px−‘A’]&xbm[*py−‘A’])? DMAT:管理信息系统;

其余的部分

我的 += _day[*px−‘A’][*py−‘A’];

/* 更新 x seq 中 del 的惩罚;

*更喜欢longong envelope new

* 加权尾随空格时忽略 MAXGAP

*/

如果(尾随空格 || ndely[aa] < MAXGAP){

如果 (col0[aa] − ins0 >= delay[aa]) {

延迟[yy] = col0[yy] − (ins0+ins1);

ndely[yy] = 1;

} 其余的部分 {

延迟[aa] -= ins1;

ndely[yy]++;

}

} 其余的部分 {

如果 (col0[aa] − (ins0+ins1) >= delay[aa]) {

延迟[yy] = col0[yy] − (ins0+ins1);

ndely[yy] = 1;

} 其余的部分

ndely[yy]++;

}

/* 更新 del in & seq 的惩罚;

*更喜欢longong envelope new

*/

如果(尾随空格 || ndelx < MAXGAP){

如果 (col1[yy−1] − ins0 >= delx) {

delx = col1[yy−1] − (ins0+ins1);

ndelx = 1;

} 其余的部分 {

delx −= ins1;

ndelx++;

}

} 其余的部分 {

si (col1[yy−1] − (ins0+ins1) >= delx) {

delx = col1[yy−1] − (ins0+ins1);

ndelx = 1;

} 其余的部分

ndelx++;

}

/* 选择最高分数;我们喜欢

* 关于 dely 的每个 del 和 delx 的错误

*/

...西北

id = xx - yy + len1 - 1;

if (my >= delx && my >= delay[yy])

col1[aa] = 主要;

else if (delx >= retraso[yy]) {

col1[aa] = delx;

ij = dx[id].ijmp;

如果 (dx[id].jp.n[0] && (!dna || (ndelx >= MAXJMP

&& xx > dx[id].jp.x[ij]+MX) || mis > dx[id].puntuación+DINS0)) {

dx[id].ijmp++;

到 (++ij >= MAXJMP) {

描述(id);

ij = dx[id].ijmp = 0;

dx[id].offset = 偏移量;

offset += (struct jmp) 的大小 + (offset) 的大小;

}

}

dx[id].jp.n[ij] = ndelx;

dx[id].jp.x[ij] = xx;

dx[id].score = delx;

}

其余的部分 {

col1[yy] = 延迟[yy];

ij = dx[id].ijmp;

如果 (dx[id].jp.n[0] && (!dna || (ndely[yy] >= MAXJMP

&& xx > dx[id].jp.x[ij]+MX) || mis > dx[id].puntuación+DINS0)) {

dx[id].ijmp++;

到 (++ij >= MAXJMP) {

描述(id);

ij = dx[id].ijmp = 0;

dx[id].offset = 偏移量;

offset += (struct jmp) 的大小 + (offset) 的大小;

}

}

dx[id].jp.n[ij] = −ndely[yy];

dx[id].jp.x[ij] = xx;

dx[id].score = 延迟[yy];

}

si (xx == len0 && yy < len1) {

/* 最后一列

*/

是(尾随空格)

col1[aa] −= ins0+ins1*(len1−aa);

如果 (Spalte1[yy] > smax) {

smáx = col1[yy];

dmax = id;

}

}

}

如果(尾随空格 && xx < len0)

col1[yy−1] −= ins0+ins1*(len0−xx);

si (col1[yy−1] > smax) {

smáx = col1[yy−1];

dmax = id;

}

tmp = col0; col0 = col1; col1 = tmp;

}

(void) frei ((char *) ndely);

(void) frei ((char *)dely);

(void) 免费 ((char *) col0);

(void) 免费 ((char *) col1);

}

/*

*

* print()——仅在该模块外可见的例程

*

* 静止的:

* getmat( ) -- 跟踪最佳路径,计算匹配:print( )

* pr_align( ) -- 打印数组 p[ ] 中描述的对齐方式: print( )

* dumpblock( ) -- 转储带有数字和星号的行块:pr_align( )

* nums( ) -- 输出一系列数字:dumpblock( )

* putline() -- 打印一行 (name, [num], seq, [num]): dumpblock()

* stars( ) - -设置一系列星星:dumpblock( )

* stripname( ) -- 从 seqname 中删除所有路径和前缀

*/

#include "nw.h"

#定义SPC

3个

#definir P_LINE

256

/* 最大输出行 */

#definiir P_SPC

3个

/* 名称或数字与序列之间的空格 */

外部的

_标签[26][26];

和T

军队;

/* 设置输出行的长度 */

档案

*效果;

/* 输出文件 */

按( )

{

和T

lx,ly,第一个空格,最后一个空格;

/* 覆盖 */

如果((fx = fopen(存档,“w”))== 0){

fprintf(stderr, "%s: %s 无法写入\n", prog, ofile);

清理(​​1);

}

fprintf(fx, "<第一个序列: %s (length = %d)\n", xname[0], len0);

fprintf(fx, "<second stream: %s (length = %d)\n", xname[1], len1);

bin = 60;

lx = len0;

ly = len1;

第一个间隔 = 最后一个间隔 = 0;

ja (dmax < len1 - 1) {

/* x 处的前导空格 */

pp[0].spc = 第一个空间 = len1 − dmax − 1;

ly −= pp[0].spc;

}

si 否 (dmax > len1 − 1) {

/* y 的领导差距 */

pp[1].spc = 第一个空间 = dmax − (len1 − 1);

lx −= pp[1].spc;

}

si (dmax0 < len0 - 1) {

/* x 中的最后一个间隙 */

最后一个间隔 = len0 − dmax0 −1;

lx −= 最后一个区域;

}

else if (dmax0 > len0 − 1) { /* y 中的最后一个间隙 */

最后一个区域 = dmax0 − (len0 − 1);

ly −= 最后一个范围;

}

getmat(lx, ly, 第一个空格, 最后一个空格);

pr_linear(); ,

/*

* 跟踪最佳路径,计算匹配项

*/

静止的

getmat(lx,ly,第一个范围,最后一个范围)

我有垫子

和T

lx, ly;

/* “核心”(减去尾随空格)*/

和T

第一个空格,最后一个空格;

/* 开始Ende Overlay */

{

和T

nm, i0, i1, 大小 0, 大小 1;

字符

柳属[32];

双倍的

厘;

记录

n0, n1;

注册商标

*p0, *p1;

/* 获取整体匹配,得分

*/

i0 = i1 = usted0 = usted1 = 0;

p0 = seqx[0] + pp[1].spc;

p1 = seqx[1] + pp[0].spc;

n0 = pp[1].spc + 1;

n1 = pp[0].spc + 1;

纳米 = 0;

而 (*p0 && *p1) {

如果(大小 0){

p1++;

n1++;

tu0--;

}

如果不是(size1){

p0++;

n0++;

tu1--;

}

其余的部分 {

si (xbm[*p0−‘A’]&xbm[*p1−‘A’])

纳米++;

如果 (n0++ == pp[0].x[i0])

size0 = pp[0].n[i0++];

si (n1++ == pp[1].x[i1])

Größe1 = pp[1].n[i]++];

p0++;

p1++;

}

}

/* PCT-同源性:

*如果尾随空格被惩罚,基地是最短的序列

*否则,移除悬垂部分并使用较短的芯

*/

是(尾随空格)

lx = (len0 < len1)? len0 : len1;

其余的部分

lx = (lx <ly)? lx: ly;

pct = 100*(双)nm/(双)lx;

fprintf(fx, “\n”);

fprintf(fx, "<%d 在 %d 的重叠部分与 %s 匹配:%.2f 相似度百分比\n",

纳米,(纳米==1)? „“:„es“,lx,pct);

fprintf(fx, "<第一个序列中的空间: %d", spacex);

...拿个垫子

如果(差距){

(vacío) sprintf(outx, "(%d %s%s)",

ngapx,(adn)? “基础”:“休息”,(ngapx == 1)? “”:“S”);

fprintf(fx,“%s”, salidax);

fprintf(fx, “, 第二个序列中的空格: %d”, gapy);

如果(差距){

(vacío) sprintf(outx, "(%d %s%s)",

为什么,(广告)? '基数':'余数',(基数== 1)? “”:“嘘”);

fprintf(fx,“%s”, salidax);

}

si (adn)

fprintf(fx,

"\n<分数:%d(匹配 = %d,不匹配 = %d,差距惩罚 = %d + 每个碱基 %d)\n",

smmax, DMAT, DMIS, DINS0, DINS1);

其余的部分

fprintf(fx,

"\n<Result: %d (Dayhoff PAM 250 matrix, gap penalty = %d + %d per residual)\n",

smax, PINS0, PINS1);

是(尾随空格)

fprintf(fx,

“<最后的差距受到惩罚。左空格:%d %s%s,右空格:%d %s%s\n",

第一个洞,(DNA)? “基”:“余数”,(第一个差距== 1)? ““ : “是的”,

最后一个缺口,(DNA)? "base": "remainder", (last space == 1)? “”:“S”);

其余的部分

fprintf(fx, "<未惩罚的尾随空格\n");

}

静止的

新墨西哥;

/* 内核中的匹配——检查 */

静止的

lmax;

/* 删除的文件名长度 */

静止的

ij[2];

/* 路由的 jmp 索引 */

静止的

数控[2];

/* 当前行开头的数字 */

静止的

在 2];

/* 当前元素编号——用于间隙 */

静止的

你[2];

静电碳

*ps[2];

/* 指向当前元素的指针 */

静电碳

*在 2] 之后;

/* 指向下一个输出字符槽的指针 */

静电碳

来自[2][P_LINE];

/* 输出行 */

静电碳

星星[P_LINE];

/* 由星号 ( ) 设置 */

/*

* 返回 pp[ ] 中描述的结构的路径对齐。

*/

静止的

pr_linear()

pr_linear

{

和T

nn;

/* 字符个数 */

和T

更远;

记录

我;

para (I = 0, lmax = 0; I < 2; I++) {

nn = tirname(namex[i]);

si (nn > lmax)

lmáx = nn;

nc[i] = 1;

尼 [哟] = 1;

图[i] = ij[i] = 0;

ps[i] = seqx[i];

po[i] = aus[i];

}

对于 (nn = nm = 0, plus = 1; plus; ) {

...pr_align

对于(我=加= 0;我<2;我++){

/*

* 我们有更多这样的序列吗?

*/

si (!*ps[i])

继续前进;

更多++;

si (pp[i].spc) {

/* 前导空格 */

*po[i]++ = ' ';

pp[i].spc--;

}

否则如果(杜[我]){

/* 在一个孔 */

*po[i]++ = '-';

你[我]--;

}

其余的部分 {

/* 我们设置一个 seq 元素

*/

*po[i] = *ps[i];

如果(更小(*ps[i]))

*ps[i] = 上级(*ps[i]);

po[i]++;

ps[i]++;

/*

* 我们是否处于此序列的下一个间隙?

*/

si ( ni [ i ] == pp [ i ] . x [ ij [ i ]] ) {

/*

* 我们需要合并所有的差距

* 在此刻

*/

Größe[i] = pp[i].n[ij[i]++];

während (ni[i] == pp[i].x[ij[i]])

Größe[i] += pp[i].n[ij[i]++];

}

ni[i]++;

}

}

如果(++nn == olen || !if && nn){

转储块();

段(I = 0;I < 2;I++)

po[i] = aus[i];

n = 0;

}

}

}

/*

* 打印一行,包括数字、星号:pr_align( )

*/

静止的

垃圾块 ()

垃圾收集器

{

注册我;

段(I = 0;I < 2;I++)

*po[i]--=‘\0’;

... 垃圾收集器

(void) putc('\n', fx);

对于 (i = 0; i < 2; i++) {

if (*out[j] && (*out[i] != ‘ ’ || *(po[i]) != ‘ ’)) {

如果(我==0)

数字(一);

如果(我== 0 && *输出[1])

斯特恩( );

设置线(一);

如果(我== 0 && *输出[1])

fprintf(fx, 星星);

如果(我== 1)

数字(一);

}

}

}

/*

* 获取数字行:dumpblock()

*/

静止的

六号)

支付

和T

九;

/* out[ ] 顺序队列中的索引 */

{

字符

nline[P_LINE];

记录

她, j;

注册商标

*pn, *px, *py;

para (pn = nline, I = 0; I < lmax+P_SPC; I++, pn++)

*pn = ' ';

对于 (I = nc[ix], py = out[ix]; *py; py++, pn++) {

是的(*py == ' ' || *py == '-')

*pn = ' ';

其余的部分 {

si (I%10 == 0 || (I == 1 && nc[ix] != 1)) {

j = (i < 0)? -我:我;

para (px = pn; j; j /= 10, px--)

*px = j%10 + '0';

如果(我 < 0)

*px = '-';

}

其余的部分

*pn = ' ';

哟++;

}

}

*pn = '\0';

nc[ix] = 哟;

para (pn = nline; *pn; pn++)

(void) putc(*pn, fx);

(void) putc('\n', fx);

}

/*

* 插入一行 (name, [num], seq, [num]): dumpblock()

*/

静止的

设定线 (ix)

放线

和T

九;

{

...设置线

和T

我;

注册商标

*像素;

para (px = nombrex[ix], I = 0; *px && *px != ‘:’; px++, I++)

(void) putc(*px, fx);

para (; I < lmax+P_SPC; I++)

(void) putc(' ', fx);

/* 这些从 1 开始计数:

* ni[ ] 是当前元素(共 1 个)

* nc[ ] 是当前行开头的数字

*/

für (px = out[ix]; *px; px++)

(leer) putc(*px&0x7F, fx);

(void) putc('\n', fx);

}

/*

* 设置一系列星号(序列总是在 out[0]、out[1] 中):dumpblock( )

*/

静止的

斯特恩( )

斯特恩

{

和T

我;

注册商标

*p0, *p1, cx, *px;

如果 (!*out[0] || (*out[0] == ' ' && *(po[0]) == ' ') ||

!*来自[1] || (*out[1] == ' ' && *(po[1]) == ' '))

反手;

px = 船尾;

para (I = lmax+P_SPC; I; I--)

*px++ = ' ';

对于 (p0 = 输出[0], p1 = 输出[1]; *p0 && *p1; p0++, p1++) {

如果 (isalpha(*p0) && isalpha(*p1)) {

si (xbm[*p0−‘A’]&xbm[*p1−‘A’]) {

cx = '*';

纳米++;

}

相反是 (!dna && _day[*p0−'A'][*p1−'A'] > 0)

cx = '.';

其余的部分

cx = ' ';

}

其余的部分

cx = ' ';

*px++ = cx;

}

*px++ = '\n';

*px = '\0';

}

/*

* 从 pn 中移除路径或前缀,返回 len: pr_align( )

*/

静止的

条带名称 (pn)

条带名称

字符

*产品编号;

/* 文件名(可以是路径)*/

{

注册商标

*px, *py;

π = 0;

对于 (px = pn; *px; px++)

si (*px == '/')

pi = px + 1;

si (pi)

(leer) strcpy(pn, py);

返回(strlen(pn));

}

/*

* cleanup() -- 删除所有 tmp 文件

* getseq( ) -- 从流中读取,设置 dna、len、maxlen

* g_calloc() -- 带有错误日志的 calloc()

* readjmps()——必要时从 tmp 文件中获取好的 jmps

* writejmps()——将一个完整的 jmps 数组写入一个 tmp 文件:nw()

*/

#include "nw.h"

#include <sys/archivo.h>

字符

*jnombre = „/tmp/homgXXXXXX“;

/* jmps 的 tmp 文件 */

档案

*缩略词;

和T

索伯();

/* 清理 tmp 文件 */

拉戈

查找();

/*

* 吹的时候删除每个tmp文件

*/

干净的(我)

索伯

和T

我;

{

你(fj)

(空)解除绑定(jname);

退出(我);

}

/*

* 读取,return.ptr 到 seq,设置 dna,len,maxlen

* 跳过以 ';'、'<' 或 '>' 开头的行

* 大写或小写的seq

*/

字符

*

getseq(文件,长度)

getq

字符

*档案;

/* 文件名 */

和T

*长度;

/* 序列长度 */

{

字符

行[1024], *pseq;

注册商标

*px, *py;

和T

natgc, 特伦;

档案

*计划生育;

如果((fp = fopen(文件,“r”))== 0){

fprintf(stderr, "%s: %s\n 无法读取", prog, 文件);

退出(1);

}

tlen = natgc = 0;

while (fgets(linea, 1024, fp)) {

如果 (*line == ';' || *line == '<' || *line == '>')

继续前进;

for (px = line; *px != '\n'; px++)

如果(优于(*px)||低于(*px))

氧气++;

}

如果 ((pseq = malloc((unsigned)(complete+6))) == 0) {

fprintf(stderr, "%s: malloc( ) 无法为 %s\n 获取 %d 字节", prog, tlen+6, file);

退出(1);

}

pseq[0] = pseq[1] = pseq[2] = pseq[3] = ‘\0’;

...堡垒之夜

py = pseq + 4;

*len = 氧气;

倒带(fp);

while (fgets(linea, 1024, fp)) {

如果 (*line == ';' || *line == '<' || *line == '>')

继续前进;

for (px = linea; *px != ‘\n’; px++) {

如果(优于(*px))

*py++ = *像素;

如果(更低(*px))

*py++ = 上级(*px);

si(index("ATGCU", *(py−1)))

natgc++;

}

}

*py++ = '\0';

*py = '\0';

(leer) fclose(fp);

dna = natgc > (氧气/3);

返回(pseq+4);

}

字符

*

g_calloc(消息,nx,sz)

g_calloc

字符

*消息;

/* 程序,例程调用 */

和T

nx, sch;

/* 元素的个数和大小 */

{

字符

*px, *calloc();

如果((px = calloc((无符号)nx,(无符号)sz))== 0){

如果(*消息){

fprintf(stderr, "%s: g_calloc() %s 失败 (n= %d, sz= %d)\n", prog, msg, nx, sz);

退出(1);

}

}

返回(像素);

}

/*

* 从 dx[] 或 tmp 文件获取最后的 jmps,设置 pp[],重置 dmax:main()

*/

读入()

重新跳转

{

和T

fd = -1;

和T

你,i0,i1;

记录

哟,j,xx;

你(fj){

(空)fclose(fj);

如果 ((fd = abrir(jname, O_RDONLY, 0)) < 0) {

fprintf(stderr, "%s: 无法打开( ) %s\n", prog, jname);

清理(​​1);

}

}

para (I = i0 = i1 = 0, dmax0 = dmax, xx = len0; ; I++) {

而 (1) {

para (j = dx[dmax].ijmp; j >= 0 && dx[dmax].jp.x[j] >= xx; j--)

;

...学习jmps

si (j < 0 && dx[dmax].offset && fj) {

(Vacío) lseek(fd, dx[dmax].offset, 0);

(void) read(fd, (char *)&dx[dmax].jp, sizeof(struct jmp));

(void) read(fd, (char *)&dx[dmax].offset, sizeof(dx[dmax].offset));

dx[dmax].ijmp = MAXJMP−1; }

其余的部分

连裤裤;

}

如果(我 >= JMPS){

fprintf(stderr, "%s: 对齐间隔太多\n", prog);

清理(​​1);

}

si (j >= 0) {

tamaño = dx[dmax].jp.n[j];

xx = dx[dmax].jp.x[j];

dmax += 你;

如果(你 < 0){

/* 放在第二个流中 */

pp[1].n[i1] = −sin;

xx += 你;

/* id = xx - yy + len1 - 1

*/

pp[1].x[i1] = xx − dmáx + len1 − 1;

普尔塔++;

ngapy −= 你;

/* 忽略末端间隙的 MAXGAP */

你 = (-你 < MAXGAP || Endlücken)? - 即:MAXGAP;

i1++;

}

else if (size > 0) { /* 第一个序列中的空格 */

pp[0].n[i0] = 二;

pp[0].x[i0] = xx;

布雷查克斯++;

ngapx += 你;

/* 忽略末端间隙的 MAXGAP */

你 =(你 < MAXGAP || 端隙)?杜:最大间隙;

i0++;

}

}

其余的部分

连裤裤;

}

/* jmps 的逆序 */

para (j = 0, i0--; j < i0; j++, i0--) {

我 = pp[0].n[j]; pp[0].n[j] = pp[0].n[i0]; pp[0].n[i0] = I;

我 = pp[0].x[j]; pp[0].x[j] = pp[0].x[i0]; pp[0].x[i0] = 哟;

}

Paar (j = 0, i1--; j < i1; j++, i1--) {

我 = pp[1].n[j]; pp[1].n[j] = pp[1].n[i1]; pp[1].n[i1] = I;

我 = pp[1].x[j]; pp[1].x[j] = pp[1].x[i1]; pp[1].x[i1] = 哟;

}

si (fd >= 0)

(空白)关闭(fd);

你(fj){

(空)解除绑定(jname);

fj = 0;

偏移量 = 0;

}

}

/*

* 写入上面的完整 jmp 结构偏移量(如果有的话):nw()

*/

描述(ix)

writejmps

和T

九;

{

字符

*mktemp();

si (!fj) {

如果 (mktemp(jnombre) < 0) {

fprintf(stderr, „%s: no se puede mktemp( ) %s\n“, prog, jname);

清理(​​1);

}

如果 ((fj = fopen(jnombre, “w”)) == 0) {

fprintf(stderr, "%s: 无法写入 %s\n", prog, jname);

退出(1);

}

}

(void) fwrite((char *)&dx[ix].jp, sizeof(struct jmp), 1, fj);

(void) fwrite((char *)&dx[ix].offset, sizeof(dx[ix].offset), 1, fj);

}

塔布拉 2

PROFI

XXXXXXXXXXXX

(长度 = 15 个氨基酸)

比较

XXXXXYYYYYYY

(长度 = 12 个氨基酸)

蛋白质

%氨基酸序列同一性=(两条多肽序列之间相同的氨基酸残基数,通过ALIGN-2确定)除以(PRO多肽的氨基酸残基总数)=5除以15=33.3%

塔布拉 3

PROFI

XXXXXXXX

(长度 = 10 个氨基酸)

比较

XXXXXYYYYYZZYZ

(长度 = 15 个氨基酸)

蛋白质

%氨基酸序列同一性=(两条多肽序列之间相同的氨基酸残基数,通过ALIGN-2确定)除以(PRO多肽的氨基酸残基总数)=5除以10=50%

塔布拉 4

专业DNA

NNNNNNNNNNNN

(长度 = 14 个核苷酸)

比较

NNNNNNLLLLLLLLLL

(长度 = 16 个核苷酸)

自动驾驶网络

%核酸序列同一性=(通过ALIGN-2确定的两条核酸序列之间相同的核苷酸数)除以(PRO DNA核酸序列中的核苷酸总数)=6除以14=42.9%

表 5

专业DNA

NNNNNNNNNNNN

(长度 = 12 个核苷酸)

DNA比对

NNNNLLLVV

(长度 = 9 个核苷酸)

%核酸序列同一性=(通过ALIGN-2确定的两条核酸序列之间相同的核苷酸数)除以(PRO DNA核酸序列中的核苷酸总数)=4除以12=33.3%

II.本发明的组合物和方法

A.总长度PRO440、PRO440、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370

本发明提供新鉴定和分离的核苷酸序列,其编码在本申请中鉴定为PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382的多肽。 PRO1410 PRO1555 PRO1556 PRO1760 PRO1787 PRO1868 PRO4326 PRO4332 PRO4346 PRO4400 PRO6003 PRO6094 PRO6244 PRO9820 PRO9828 PRO10274 PRO16090 PRO1964 PRO10274 PRO16090 PRO1964 PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760 , PRO18687, PRO 多肽 PRO4326, PRO4032, PRO4032, PRO409 PRO6844, PRO998290, PRO998241, PRO998244, PRO998240, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 已在实施例中进一步鉴定和分离。在下面。需要注意的是,在不同的表达轮次中产生的蛋白质可能会被赋予不同的 PRO 编号,但 UNQ 编号对于任何给定的 DNA 和编码的蛋白质都是唯一的,并且不会改变。然而,为了简单起见,在本说明书中,由本文描述的全长天然核酸分子编码的蛋白质,以及包括在上述PRO定义中的任何额外的天然同源物和变体,被称为“ PRO/number”与其来源或制备方法无关。

几个 cDNA 克隆已保藏在 ATCC 中,如下面的实施例所述。通过使用本领域常规方法对保藏的克隆进行测序,本领域技术人员可以容易地确定这些克隆的实际核苷酸序列。可以使用常规知识从核苷酸序列确定预测的氨基酸序列。适用于 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18044946、PRO1783、PRO18044946、PRO36 PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 编码本文所述的多肽和核酸,申请人已经鉴定了被认为是当时可获得的序列信息最佳可鉴定的阅读框。

B PRO194...PRO220...PRO241...PRO284...PRO331...PRO354...PRO355...PRO533...PRO541...PRO725...PRO937...PRO1014...PRO1120 ... PRO1182... PRO1325... PRO1382... PRO1410... PRO1555... PRO1556... PRO1760... PRO1787... PRO18268... PRO4333 多肽变体 PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370

除了完整的原生序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868 B PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO21340、PRO92165、PRO2033、PRO19 多肽,本文涵盖, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO43362, PRO44040, PRO44040, PRO624变种可备PRO16078,PRO16078,PRO1607 PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864-3、PRO609可以通过在 PRO194、PRO220、PRO41、PRO5、PRO2、PRO2、33、Pro355、Pro533、PRO194、PRO220、PRO41、PRO5、PRO2、PRO2、33、 Pro541、Pro725、Pro937、Pro1014、Pro1120、Pro1182、Pro1325、Pro1382、Pro1410、Pro1555、Pro1556、Pro1760、Pro187、Pro1868、Pro4326、Pro4326。 PRO23370 DNA 和/或通过合成所需的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO93725、PRO1004、PRO112、PRO112、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、 PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820202020。 B. PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽。本领域技术人员将认识到,氨基酸变化可以改变 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的翻译后过程B. PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644等锚定性能。

全长天然序列变异 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO18787、PRO43326 , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO, PRO354, PRO355, PRO533, PRO2541, PRO1, PRO1, PRO1,821,71 PRO13822,71 PRO1322 Pro1410,Pro1555,Pro1556,Pro1760,Pro1787,Pro1868,Pro1868,Pro4326,Pro4332,Pro4332,Pro4306,Pro06904,Pro06904,Pro0904,Pro0904,Pro0904,Pro0904,Pro0904,Pro0904,Pro0904,Pro09044,Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro Pro pro Pro此处描述的 PRO1026 或 PRO23370 可以使用任何已建立的保守和非保守突变技术和指南来制备。例如,在美国专利号 5,364,934 中。变异可以是一个或多个编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 的密码子的替换、删除或插入编码,PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43268的氨基酸序列变化PRO43326, PRO43326, PRO43326 , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO1124, PRO1026, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO21340, PRO92165、PRO85143、PRO213、PRO 多肽天然序列 1、PRO10、PRO20 PRO23370、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO15556、PRO17556、PRO17556、PRO17556 PRO1787、PRO9182682、PRO9182682、PRO、PRO0946 多肽 PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。任选地,变异通过用 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120 的一个或多个结构域中的任何其他氨基酸取代至少一个氨基酸而发生, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO PRO1026 或 PRO2337。通过比较 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、 PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820202020。 , PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽与已知同源蛋白质分子的多肽,并最大限度地减少在高同源性区域中氨基酸序列变化的数量。氨基酸置换可以由一个氨基酸置换为具有相似结构和/或化学性质的另一种氨基酸引起,例如用丝氨酸置换亮氨酸,即保守氨基酸置换。插入或缺失可任选地在约1至5个氨基酸的范围内。可通过在序列中系统地进行氨基酸插入、缺失或取代并分析所得变体的完整或成熟天然序列所表现出的活性来确定允许的变异。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864.0、PRO404034本文提供了 PRO4034.04、PRO4034.04、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽片段。此类片段可能在 N 端或 C 端被截断,或者与例如全长天然蛋白质相比可能缺少内部残基。某些片段缺少对 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的所需生物活性不是必需的氨基酸残基。 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PROTATO240、PRO20240。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18604、PRO143、PRO34604片段, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以使用多种标准技术之一制造。可以化学合成所需的肽片段。另一种方法是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43868 生成 eg.868通过酶消化,例如在由特定氨基酸残基定义的位点切割蛋白质,或用适当的限制酶消化 DNA 并分离所需片段。另一种合适的技术包括通过聚合酶链式反应 (PCR) 分离和扩增编码所需多肽片段的 DNA 片段。定义 DNA 片段所需末端的寡核苷酸用于 PCR 的 5' 和 3' 引物。最好是PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO43403,6 PRO6034 PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽片段与天然 PRO20294、PRO20284 PRO331、PRO354、PRO355、PRO5413 共享至少一种生物学和/或免疫学活性, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO40402, PRO404302, PRO404302, PRO404302, PRO404302 PRO4040, PRO4040 B. PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644 , PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 在此描述。

感兴趣的保守取代显示在表 6 的“首选取代”标题下。如果此类取代导致生物活性发生变化,则优选引入表6中作为示例性取代或如下所述的与氨基酸类别有关的更实质性的变化,并选择产品。

塔布拉 6

原来的

复制

特权

残留物

替换

替换

道路)

你好;里昂;当局

Arg ®)

李斯;谷歌;作为

赖氨酸

阿森 (N)

谷歌;是;天冬氨酸、赖氨酸;阿根廷

谷氨酰胺

天冬氨酸 (D)

胶水;作为

胶水

Ci⟩©)

或许;为了

谷氨酰胺(q)

阿森;胶水

如果

胶水)

麻辣烫;谷氨酰胺

天冬氨酸

甘氨酸 (G)

他的 H)

阿森;谷歌;李斯;阿根廷

阿根廷

在我身上)

狮子;卡尔;从;这;

亮氨酸

zb;正亮氨酸

莱昂(链接)

亮氨酸;和;峡谷;

缺点

见面;翅膀信仰

赖氨酸 (K)

参数;谷歌;作为

阿根廷

熟悉(男)

狮子;相信;当局

亮氨酸

铁 (F)

色氨酸;狮子;海浪;岛;这;轮胎

酪氨酸

专业(P)

苏氨酸

苏氨酸

苏氨酸 (T)

瓦尔;六

色氨酸 (W)

看过;呸

酪氨酸

金牛座(Y)

色氨酸; zB;苏氨酸;系列

zB

塔尔 (V)

岛;光滑的;周一;例如;

亮氨酸

翼;正亮氨酸

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1866787 PRO1866787 , PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370, 它们在多肽选择的选择上存在显着差异通过维持 (a) 多肽在取代区域的主链结构,例如片层或螺旋构象,(b) 分子在目标位点的电荷或疏水性,或 A) 大多数侧链。天然残基根据共同的侧链特性分为几组:

氨基酸可以根据其侧链特性的相似性进行分组(见 A.L. Lehninger,in Biochemistry,第 2 版,第 73-75 页,Worth Publishers,纽约(1975 年)):

(1)非极性:Ala(A)、Val(V)、Leu(L)、Ile(I)、Pro(P)、Phe(F)、Trp(W)、Met(M)

(2)极性辛卡加:Gly(G)、Ser(S)、Thr(T)、Cys(C)、Tyr(Y)、Asn(N)、Gln(Q)

(3)酸:天冬氨酸(D)、谷氨酸(E)

(4) 基础:赖氨酸(K)、精氨酸(R)、组氨酸(H)

或者,天然残基可以根据共同的侧链特性分为几类:

(1)疏水性:Norleucin、Met、Ala、Val、Leu、Ile;

(Video) 【有声书】《申论金题精练》(上):国家公务员录用考试轻松学系列

(2)中性亲水性:Cys、Ser、Thr、Asn、Gln;

(3)酸类:天冬氨酸、谷氨酸;

(4)基本的:组氨酸、赖氨酸、精氨酸;

(5) 影响链取向的残基:Gly、Pro;

(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。

非保守替换涉及将其中一类的成员换成另一类。这些取代的残基也可以被引入保守取代位点,或者更优选地,引入剩余的(非保守的)位点。

可以使用本领域已知的方法进行变化,例如B. 寡核苷酸介导的(定点)诱变、丙氨酸扫描和 PCR 诱变。定点诱变 [Carter 等人,酸核研究,13:4331 (1986);佐勒等人,酸核研究,10:6487 (1987)],盒式诱变 [Wells 等人,将军,34:315 (1985)],限制性选择诱变 [Wells 等人,跨哲学 R. Soc.伦敦将317:415 (1986)] 或其他已知技术可在克隆的 DNA 上进行以产生生产。 Pro1382、Pro1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274 变体。

氨基酸扫描分析也可用于鉴定沿连续序列的一个或多个氨基酸。优选的筛选氨基酸是相对较小的中性氨基酸。这样的氨基酸包括丙氨酸、甘氨酸、丝氨酸和半胱氨酸。丙氨酸通常是该组中首选的侦察氨基酸,因为它去除了 β 碳以外的侧链,并且不太可能改变变体的主链构象 [Cunningham 和 Wells,科学,244:1081-1085 (1989)]。丙氨酸通常也是首选,因为它是最常见的氨基酸。此外,它常见于掩埋和裸露的地方 [Creighton,蛋白质, (WH Freeman & Co., N. Y.);乔西亚,J.摩尔。生物学,150:1(1976 年)]。如果丙氨酸取代不能产生足够量的变体,则可以使用等排氨基酸。

C、PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43346的修改, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17412、PRO17412、PRO624410 的共价修饰、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽均包括在本发明的范围内。一类共价修饰涉及 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556, PRO1760 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO247, PRO92165, PRO85143, PRO247, PRO4219 PRO, PRO ,具有 2219 PRO4.4、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1866 的选定残基PRO4326, PRO4326, PRO4326, PRO6044, PRO6044, PRO44030, PRO6042, PRO44030 , PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO103240 od​​er Polypeptid PRO103243, PRO151243, PRO103240 od​​er Polypeptid PRO103243, PRO103243, PRO34, PRO34, PRO34, PRO2520 PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4326, PRO4326, PRO4326, PRO60204, PRO60204, PRO60204, PRO60204 PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124 或 Wasserunlösliches 多肽、PRO10326 或 PRO1024 表面用于抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗 PRO16090、抗 PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370,反之亦然。常用的交联剂包括,例如,1,1-双(重氮乙酰基)-2-苯乙烷、戊二醛、N-羟基琥珀酰亚胺酯,例如与 4-叠氮基水杨酸的酯、同型双功能亚氨基酯,包括二琥珀酰亚胺酯,例如 3,3' -二硫代双(琥珀酰亚胺基丙酸酯)、双功能马来酰亚胺如双-N-马来酰亚胺-1,8-辛烷和试剂如3-[(对叠氮基苯基)二硫代]丙酰亚胺酸甲酯。

其他修饰包括谷氨酰胺酰和天冬氨酰残基分别脱酰胺为相应的谷氨酰和天冬氨酰残基、脯氨酸和赖氨酸的羟基化、丝氨酰或苏氨酰残基的羟基磷酸化、赖氨酸、精氨酸和组氨酸的 α-氨基甲基化。链[t。 E克赖顿,蛋白质:结构和分子特性, W.H. Freeman & Co., San Francisco, pp. 79-86 (1983)],N-末端胺的乙酰化和任何 C-末端羧基的酰胺化。

PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO17642 PRO18, PRO1860 -、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽涉及改变天然糖基化模式或多肽的天然糖基化模式.就本文件而言,“改变天然糖基化模式”是指去除天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、 PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PROV。 (通过去除潜在的糖基化位点或通过化学和/或酶促方法去除糖基化)和/或通过添加一个或多个未在天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355 中发现的糖基化位点, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182 存在, PRO1325-, PRO1382-, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO19644-, PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽。此外,表达包括天然蛋白质糖基化的质变,暗示存在的各种碳水化合物单元的类型和比例发生变化。

将糖基化位点添加到 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1767、PRO14387 PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026或PRO23370多肽可通过改变氨基酸序列获得。例如,可以通过添加或取代天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937 中的一个或多个丝氨酸或苏氨酸残基来进行改变。 , PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820202020。 B. PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370(用于 O-连接的糖基化位点)。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO62934、PRO62934、PRO460934 , PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370,氨基酸序列可以任选地通过 DNA 水平的变化进行修饰,特别是通过编码 PRO194、PRO220 的 DNA 突变, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO114, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434, PRO43094-PRO64, PRO63094-B. - , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 碱基生成翻译成所需氨基酸的密码子。

另一种测量 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 到增加。 PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23 are such polycytic椭圆形多核偶联技术描述于例如 1987 年 9 月 11 日公开的 WO 87/05330 以及 Aplin 和 Wriston 中。关键 CRC。生物化学牧师,p。259–306 (1981)。

消除 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17360、PRO1747326、PRO1747326、PRO17473626 中的微量碳水化合物, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, 或 PRO23370 多肽突变可以通过密码子编码氨基酸残基来实现糖基化。化学去糖基化技术是本领域已知的并且例如由Hakimuddin等人描述。描述,弧。生物化学传记,259:52 (1987) 和 Edge 等人,肛门。生化,118:131(1981)。如 Thotakura 等人所述,可以使用多种内切和外切糖苷酶将碳水化合物部分酶促切割成多肽。描述,Metanfetamina-Enzimol.,138:350(1987)。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO17867、PRO1 PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332 , PRO4346, PRO4400, PRO6004, PRO862404, PRO862404, PRO862404, PRO862404, PRO862404, PRO862404 , PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, or PRO23370 polypeptide to one of a variety of non-proteinaceous polymers, B . 聚乙二醇 (PEG)、聚丙二醇或聚氧化烯,美国专利号编号4,640,835; 4.496.689; 4.301.144; 4.670.417; 4.791.192 或 4.179.337。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 也可以被修饰以形成包含 PRO194, PRO220, PRO181, PRO231. 的嵌合分子。 2、PRO231包括PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO43026、PRO4302、PRO244302、PRO244302、PRO244302、PRO244302 , PRO824.9, PRO824.9 B. PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽与另一个异源多肽或异源氨基酸序列融合。

嵌合分子包含 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1838、PRO4332 的融合物、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 可以选择性地加入提供抗标记多肽的多肽。表位标记通常位于 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的氨基或羧基末端具有 PRO194、PRO220、PRO241、PRO35、PRO284、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43268、PRO32636、6 PRO4036 的表位6 PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23 可以使用针对多肽的多肽 370 标签进行检测。此外,还提供表位标签 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17868、PRO17868 -, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274-, PRO16090-, PRO19644-, PRO21340-, PRO92165-, PRO85143-, PRO1124-,可以通过亲和力轻松纯化的 PRO1026 或 PRO23370 抗体与表位标签结合。许多标记多肽和它们各自的抗体是本领域众所周知的。示例包括多组氨酸 (poly-his) 或多组氨酸-甘氨酸 (poly-his-gly) 标签;流感 HA 标签多肽及其抗体 12CA5 [Field 等人,无关紧要的细胞。生物学。8:2159-2165 (1988)]; c-myc 标签和 8F9、3C7、6E10、G4、B7 和 9E10 抗体 [Evan 等人,分子和细胞生物学,5:3610-3616 (1985)];以及单纯疱疹病毒糖蛋白 D (gD) 标签及其抗体 [Paborsky 等人,蛋白质工程,3(6):547-553 (1990)]。其他标签多肽包括旗肽 [Hopp 等人,生物技术,6:1204-1210 (1988)]; das KT3-表位-肽 [Martin 等人,科学,255:192-194 (1992)]; α-微管蛋白表位肽 [Skinner 等人,J.生物学。化学,266:15163-15166 (1991)];和 T7 基因 10 蛋白肽标签 [Lutz-Freyermuth 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀87:6393-6397(1990)]。

嵌合分子可包含 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787 的融合物。特定免疫球蛋白区域或特定免疫球蛋白区域的 PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370对于二价形式的嵌合分子(也称为“免疫粘附素”),这种融合可以是 IgG 分子的 Fc 区。 Ig 融合优选涉及替代 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、Pro1382 的可溶性形式(跨膜域删除或失活) B. PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO 多肽代替 Ig 分子内的至少一个可变区。在本发明特别优选的方面,免疫球蛋白融合体包括IgG1分子的铰链、CH2和CH3或铰链、CH1、CH2和CH3区。还参见 1995 年 6 月 27 日颁发的关于制备免疫球蛋白融合物的美国专利号 5,428,130。

D、PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43346.2的制备, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽

以下说明主要针对PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787的生产, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, 核酸转化核酸载体PRO2或PRO4多肽载体, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO443306,PRO32306,2,PRO264 , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370。当然,预期可以使用本领域熟知的替代方法来产生 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 以产生 PRO1325、 PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026 或 PRO23370 多肽。例如 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO114、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO132.68、PRO4 序列PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 或其部分可通过直接肽合成技术制备 [参见 z, Stewart 等人阿尔。坚硬的-相肽合成B. W. H. 弗里曼公司,旧金山,加利福尼亚州 (1969);梅里菲尔德,果酱。化学学会,85:2149-2154 (1963)]。可以使用手动技术或通过自动化进行体外蛋白质合成。可以根据制造商的说明,例如使用 Applied Biosystems (Foster City, California) 肽合成仪进行自动合成。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43468 多肽的不同部分, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以单独化学合成并组合以产生完整的化学或酶促过程。 -长度 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO148PRO.483. 4.PRO PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽。

1.分离编码PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO18,683 , PRO4 PRO433 编码 B. PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274-, PRO16090-, PRO19644-, PRO21340-, PRO92165-, PRO85143-, PRO1124-, PRO1026- 或PRO23370 多肽

DNA 编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1786、PRO432268、PRO43268、PRO4 PRO43268 PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽可能源自从疑似含有 PRO2091、PRO24、PRO2 的组织制备的 cDNA 文库PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO43326、PRO433204、PRO42464 mRNA 或并以可检测的水平表达。因此人们、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090 - 、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370例子。 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410 - , PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1866,4 PRO43432 , PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, 编码 PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 的基因也可以从基因组文库或通过已知的合成方法(例如自动化核酸合成)。

可以用探针筛选文库(例如针对 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的抗体PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO92165, PRO85143, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 oder mindestens ein PRO20370 Polypeptid oder mindestens ein Polypeptid PRO20370 PRO20370 ) designed to identify感兴趣的基因或其编码的蛋白质。可以使用标准方法,例如,用选定的探针筛选基因组或 cDNA 文库。 B. Sambrook 等人的那些。被描述分子克隆:实验室手册(新约克:冷泉港实验室出版社,1989 年)。船的一个普通替代品是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1760 编码, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370, 同上迪芬巴赫等人,PCR 引物:实验室手册(冷泉港实验室出版社,1995)]。

以下示例描述了筛选 cDNA 文库的技术。选作探针的寡核苷酸序列必须足够长且足够独特,以尽量减少假阳性结果。寡核苷酸优选被标记,以便在与待筛选的文库中的DNA杂交后可以被检测到。标记方法是本领域众所周知的,包括使用放射性标记,例如32P-标记的 ATP、生物素化或酶标记。 Sambrook 等人,同上,提供了杂交条件,包括中度严格性和高度严格性。

可以将在此类文库筛选方法中鉴定的序列与其他已知序列进行比较和匹配,这些序列在公共数据库(例如 GenBank 或其他专有序列数据库)中保藏和可用。分子限定区域内或整个序列的序列同一性(在氨基酸或核苷酸水平)可以使用本领域已知的方法和如本文所述的方法来确定。

具有蛋白质编码序列的核酸可以通过使用本文首先描述的推导的氨基酸序列筛选选定的基因组或 cDNA 文库来获得,并且如果需要,使用标准引物延伸方法,如 Sambrook 等人,见上文中描述的检测 mRNA -前体和处理可能未被逆转录成 cDNA 的中间体。

2. 宿主细胞的选择和转化

用本文所述的表达或克隆载体转化宿主细胞,转染或适当转化以诱导启动子、选择转化体或扩增编码所需序列的基因。培养条件例如培养基、温度、pH等可以由本领域普通技术人员选择而无需过度实验。一般而言,可在以下位置找到最大化细胞培养生产力的实用原则、协议和技术哺乳动物细胞生物技术:实用方法, M. Butler, eds. (IRL Press, 1991) and Sambrook and Sp., supra.

真核细胞转染和原核细胞转化的方法是本领域技术人员已知的,例如CaCl2个, 氧化钙4个, 由脂质体和电穿孔介导。根据所使用的宿主细胞,使用适合于此类细胞的标准技术进行转化。如 Sambrook 等人,同上所述,使用氯化钙进行钙处理或电穿孔通常用于原核生物。感染根癌农杆菌如 Shaw 等人所述,它用于转化某些植物细胞。描述,将军,23:315 (1983) 和 WO 89/05859,1989 年 6 月 29 日出版。对于缺乏这种细胞壁的哺乳动物细胞,Graham 和 van der Eb 的磷酸钙沉淀法,病毒学,52:456-457 (1978)。美国专利号 4,399,216 中描述了哺乳动物细胞-宿主系统转染的一般方面。酵母转化通常根据 Van Solingen 等人的方法进行。J.巴克特,130:946 (1977) 和 Hsiao 等人,全氯乙烯美国国家科学院. (欧洲联盟), 76:3829 (1979)。然而,也可以使用将 DNA 引入细胞的其他方法,例如核显微注射、电穿孔、细菌原生质体与完整细胞的融合,或聚阳离子,例如例如聚凝胺、聚鸟氨酸。有关转化哺乳动物细胞的各种技术,请参见 Keown 等人,酶学方法,185:527-537 (1990) von Mansour 等人,自然,336:348-352(1988)。

适用于克隆或表达本文载体中的DNA的宿主细胞包括原核、酵母或高等真核细胞。合适的原核生物包括真细菌,例如革兰氏阴性或革兰氏阳性生物,例如肠杆菌科,例如肠杆菌科。 B.但不限于此大肠杆菌.一些大肠杆菌菌株是公开的,例如大肠杆菌CEPA K12 MM294 (ATCC 31.446);大肠杆菌X1776 (ATCC 31.537);大肠杆菌菌株 W3110 (ATCC 27.325) 和 K5772 (ATCC 53.635)。其他合适的原核宿主细胞包括肠杆菌科,例如大肠杆菌, 运动。,大肠杆菌、肠杆菌、欧文氏杆菌、克雷伯氏菌、变形杆菌、沙门氏菌、p。 B. 鼠伤寒沙门氏菌、沙雷氏菌, 运动。,枯木屑, j志贺氏菌, 也巴齐连如果枯草芽孢杆菌j地衣芽孢杆菌(运动。,地衣芽孢杆菌41P,在 DD 266.710 中公开,1989 年 4 月 12 日出版),假单胞菌属如果铜绿假单胞菌, j链霉菌属.这些例子是说明性的而不是限制性的。菌株W3110是特别优选的宿主或亲代宿主,因为它是重组DNA产物发酵的常用宿主菌株。优选地,宿主细胞分泌最少量的蛋白水解酶。例如,可以操纵 W3110 菌株以引起编码宿主内源性蛋白质的基因发生基因突变,此类宿主的例子包括大肠杆菌W3110菌株1A2,具有完整的tonA基因型;大肠杆菌具有完整基因型tonA ptr3的W3110菌株9E4;大肠杆菌W3110 菌株 27C7 (ATCC 55.244) 具有全基因型 tonA ptr3phoA E15 (argF-lac) 169 degP ompT kanR;大肠杆菌W3110 菌株 37D6 具有全基因型 tonA ptr3phoA E15 (argF-lac)169 degP ompT rbs7 ilvG kanR;大肠杆菌W3110菌株40B4,即具有非卡那霉素抗性degP缺失突变的菌株37D6;和一个大肠杆菌1990 年 8 月 7 日授权的美国专利号 4,946,783 中描述了一种含有突变体周质蛋白酶的菌株。或者,体外克隆方法是合适的,例如 PCR 或其他酸性聚合酶反应。

除原核生物外,丝状真菌或酵母等真核微生物也是 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120-、PRO1182-、PRO1325- 的合适克隆或表达宿主, PRO1382-, PRO1410-, PRO1555-, PRO1556-, PRO1760-, PRO1787-, PRO1868-, PRO4326-, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090 , PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 或 PRO1026 或 PRO23370 编码载体。酿酒酵母是一种常用的低等真核宿主微生物。包括其他人粟酒裂殖酵母(海滩和护士,自然,290:140 [1981]; EP 139,383,1985 年 5 月 2 日出版);克鲁维酵母属宿主(美国专利号 4,943,529;Fleer 等人,生物技术,9:968-975 (1991)) 例如什么牛奶(MW98-8C、CBS683、CBS4574;Louvencourt 等人,J. 细菌学,154(2):737-742 [1983],太脆弱(ATCC 12.424),保加利亚克氏菌(ATCC 16.045),K. wickeramii(ATCC 24.178),州长(ATCC 56.500),果蝇(ATCC 36,906;Van den Berg 等人,生物技术,8:135(1990 年)),K. 耐热, jK. marxianus;千年(EP 402,226);牧羊人无花果(EP 183.070;Sreekrishna 等人,J. 基础微生物学,28:265-278 [1988]);念珠菌;里氏木霉(EP 244.234);粗糙脉孢菌(秋天等人,全氯乙烯美国国家学院军刀76:5259-5263 [1979]);神经鞘菌属如果西万氏菌(1990 年 10 月 31 日公布的 EP 394,538);和丝状真菌如脉孢菌属、青霉属、Tolypocladium(WO 91/00357,1991 年 1 月 10 日公布)和洒水器像主人A. nidulans(平衡等,生物化学传记。决议共同体,112:284-289 [1983];蒂尔伯内特等人,将军,26:205–221 [1983];耶尔顿等人,全氯乙烯美国国家学院军刀81:1470-1474 [1984]) 和到。尼日尔(凯利和海因斯,EMBÓ J.,4:475-479 [1985])。嗜甲基酵母在本文中是有用的并且包括但不限于能够在甲醇中生长的选自以下属的酵母:汉逊酵母、念珠菌、Kloeckera、毕赤酵母、酵母菌、球拟酵母, j红酵母属.可以在 C. Anthony 中找到代表该酵母类别的特定物种列表,甲基营养生物的生物化学,269(1982)。

用于表达 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, 合适的宿主细胞-、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽来源于多细胞生物。无脊椎动物细胞的例子包括昆虫细胞,例如果蝇S2J斜纹夜蛾Sf9 以及植物细胞。有用的哺乳动物宿主细胞系的例子包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞和COS细胞。更具体的例子包括SV40转化的猴肾CV1系(COS-7,ATCC CRL 1651);人胚肾系(293 或 293 细胞亚克隆用于悬浮培养,Graham 等人,J. Gen Virol.,36:59(1977 年));中国仓鼠卵巢细胞/-DHFR。全氯乙烯美国国家学院军刀77:4216(1980 年));小鼠支持细胞(TM4、Mather、生物学。复制。,23:243-251(1980));人肺细胞(W138,ATCC CCL 75);人肝细胞(Hep G2,HB 8065);和小鼠乳腺肿瘤(MMT 060562,ATCC CCL51)。选择合适的宿主细胞被认为在本领域的技术范围内。

3. 可复制载体的选择和使用

编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的核酸(例如,cDNA 或基因组 DNA)编码,PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO13243、PRO13、243、PRO13243 DNA 扩增)或用于表达。有几种载体是公开可用的。例如,载体可以是质粒、粘粒、病毒颗粒或噬菌体的形式。可以通过多种方法将合适的核酸序列插入载体中。通常,使用本领域已知的技术将DNA插入适当的限制性核酸内切酶位点。载体成分通常包括但不限于一个或多个信号序列、复制起点、一个或多个标记基因、增强子元件、启动子和转录终止序列。使用本领域技术人员已知的标准连接技术构建含有一种或多种这些成分的合适载体。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 不仅可以直接重组生产,还可以作为与异源多肽的融合多肽,在成熟蛋白质或多肽的 N 末端具有特定切割位点的信号序列或其他多肽。通常,信号序列可以是矢量的一个组成部分,也可以是 PRO194-、PRO220-、PRO241-、PRO284-、PRO331-、PRO354-、PRO355-、PRO533-、PRO541-、PRO725-、PRO937- 的一部分, PRO1014- , PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, DNA编码PRO6003-, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO16274, PRO16278 , PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 插入到向量中。信号序列可以是选自例如碱性磷酸酶、青霉素酶、lpp或热稳定肠毒素II前导序列的原核信号序列。例如,对于酵母分泌,信号序列可能是酵母转化酶前导序列、α-因子前导序列(包括酵母菌属j克鲁维酵母属α 因子前导序列,后者描述于美国专利第 5,010,182 号)或酸性磷酸酶前导序列,白色念珠菌葡糖淀粉酶前导序列(EP 362,179,1990 年 4 月 4 日公开),或 WO 90/13646 中描述的信号,1990 年 11 月 15 日公开,来自相同或相关物种,以及病毒分泌前导序列。

表达载体和克隆载体均包含使载体能够在一个或多个选定宿主细胞中复制的核酸序列。此类序列对于多种细菌、酵母和病毒而言是众所周知的。 pBR322 复制起点质粒适用于大多数革兰氏阴性菌,2µ 质粒起点适用于酵母,几种病毒起点(SV40、多瘤病毒、腺病毒、VSV 或 BPV)适用于将载体克隆到哺乳动物细胞中。

表达和克隆载体通常含有选择基因,也称为选择标记。典型的选择基因编码的蛋白质 (a) 赋予对抗生素或其他毒素的抗性,例如氨苄青霉素、新霉素、甲氨蝶呤或四环素,(b) 补充营养缺陷型,或 (c) 提供复杂的关键营养素,例如,编码 D-丙氨酸消旋酶的基因巴齐伦。

哺乳动物细胞合适的选择标记的一个例子是那些能够识别能够表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725-、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的细胞的标记, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400 -, 核酸编码 PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274-, PRO160964-, PRO160964-, PRO160964- , PRO21340-, PRO92165-, PRO85143-, PRO1124-, PRO1026- 或 PRO23370- 例如 DHFR 或胸苷激酶。当使用野生型 DHFR 时,合适的宿主细胞是 DHFR 活性缺陷的 CHO 细胞系,如 Urlaub 等人所述制备和繁殖。描述,全氯乙烯美国国家学院军刀77:4216 (1980)。适用于酵母的选择基因是存在于酵母质粒 YRp7 上的 trp1 基因 [Stinchcomb 等人,自然,282:39(1979); Kingmanet 等人,将军,7:141 (1979); Tschemperet 等人。将军,10:157 (1980)]。 trp1 基因为缺乏在色氨酸中生长能力的酵母突变菌株提供选择标记,例如酵母。 B. ATCC No. 44076 或 PEP4-1 [琼斯,遗传,85:12(1977)]。

表达和克隆载体通常包含可与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 连接的启动子。 PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820 B. PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124 , PRO1026 或 PRO23370,编码指导 mRNA 合成的核酸序列。被多种潜在宿主细胞识别的启动子是众所周知的。适用于原核宿主的启动子包括 β-内酰胺酶和乳糖启动子系统 [Chang 等人,自然,275:615(1978 年);哥德尔等人,自然,281:544 (1979)],碱性磷酸酶,色氨酸 (trp)-启动子系统 [Goeddel,核酸水库,8:4057 (1980); EP 36,776] 和杂交启动子,例如 tac 启动子 [deBoer 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀80:21-25 (1983)]。用于细菌系统的启动子还将包含可操作连接到编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 的 DNA 的 Shine-Dalgamo (S.D.) 序列. Pro1325、Pro1382、Pro1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO 或 PRO23370 多肽。

适用于酵母宿主的启动子序列的例子包括 3-磷酸甘油酸激酶启动子 [Hitzeman 等人,J.生物学。化学,255:2073 (1980)] 或其他糖酵解酶 [Hess 等人,副词酶记录,7:149(1968 年);荷兰,生物化学,17:4900 (1978)],包括烯醇酶、甘油醛-3-磷酸-脱氢酶、己糖激酶、丙酮酸-脱羧酶、磷酸果糖激酶、葡萄糖-6-磷酸-异构酶、3-磷酸甘油酸变位酶、丙酮酸-激酶、丙酮酸-异构酶、磷酸葡萄糖-异构酶和葡萄糖激酶。

其他酵母启动子是诱导型启动子,具有生长条件控制转录的额外好处,包括乙醇脱氢酶 2、异细胞色素 C、酸性磷酸酶、与氮代谢相关的降解酶、金属硫蛋白、甘油醛-3-磷酸脱氢酶和酶的启动子区域负责麦芽糖和半乳糖的利用。适用于酵母表达的载体和启动子在 EP 73,657 中有进一步描述。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18638、PRO344、443 PRO 例如,PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 的转录受病毒基因组表达的启动子控制,如多瘤病毒、禽痘病毒( UK 2,4,211.,504,211 on July 5, 1989),腺病毒(如腺病毒 2)、牛乳头瘤病毒、禽肉瘤病毒、巨细胞病毒、逆转录病毒、乙型肝炎病毒和猿猴病毒 40 (SV40),来自异源哺乳动物启动子,例如肌动蛋白启动子或免疫球蛋白启动子,以及热休克启动子,前提是这些启动子与宿主细胞系统相容。

包含 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1557、PRO1760、PRO17687、PRO1767、PRO1767通过插入高等真核增强子序列载体编码 PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽。 .增强子是 DNA 的顺式作用元件,通常约 10 至 300 bp,作用于启动子以增加其转录。现在已知许多来自哺乳动物基因(球蛋白、弹性蛋白酶、白蛋白、甲胎蛋白和胰岛素)的增强子序列。然而,通常使用来自真核细胞病毒的增强子。示例包括复制起点后期的 SV40 增强子 (bp 100-270)、巨细胞病毒早期启动子增强子、复制起点后期的多瘤增强子和腺病毒增强子。增强子可在PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382的5'或3'位置拼接到向量中但最好位于启动子的 5' 位点。

真核宿主细胞(酵母、真菌、昆虫、植物、动物、人或其他多细胞生物的有核细胞)中使用的表达载体也包含终止转录和稳定 mRNA 所必需的序列。此类序列通常可从真核或病毒 DNA 或 cDNA 的 5' 和偶尔 3' 非翻译区获得。这些区域包含在 mRNA 编码的非翻译部分中转录为多聚腺苷酸片段的核苷酸片段. PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。

还有其他方法、载体和宿主细胞用于适应 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 的合成geeignet sind , PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polypeptides in recombinant vertebrate细胞培养在 Gething 等人。描述,自然,293:620-625(1981); Mantei 等人,自然,281:40-46(1979); EP 117.060;死亡 EP 117.058。

4. 基因扩增/表达检测

基因扩增和/或表达可以直接在样品中测量,例如通过常规的 Southern 印迹、Northern 印迹来量化 mRNA 转录 [Thomas,全氯乙烯美国国家学院军刀77:5201-5205 (1980)]、斑点印迹(DNA 分析)或原位杂交,使用基于本文提供的序列的适当标记的探针。或者,可以使用能够识别特定双链体(包括 DNA 双链体、RNA 双链体和 DNA-RNA 杂交双链体或 DNA-蛋白质双链体)的抗体。抗体又可以被标记并且在双链体结合到表面的地方进行测定,使得在表面上形成双链体之后可以检测到结合到双链体的抗体的存在。

或者,可以通过免疫学方法测量基因表达,例如B. 细胞或组织切片的免疫组织化学染色和细胞培养物或体液的测定,以直接量化基因产物的表达。用于免疫组织化学染色和/或样品流体测试的抗体可以是单克隆抗体或多克隆抗体,并且可以在任何哺乳动物中产生。方便地,可以针对 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、 PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO92165, PRO85143, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO32 PRO1124本文提供的针对具有 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、 PRO1556、PRO1760、PRO17、PRO1868 融合外来序列、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO25143、PRO1374 PRO23370

5. 多肽纯化

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO134、PRO134、PRO132的模具PRO13268-、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽可以从培养基或宿主细胞裂解物中分离。一旦结合到膜上,它就可以用合适的洗涤剂溶液(例如 Triton-X 100)或通过酶促裂解从膜上分离。参与表达PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1767、PRO4322的细胞PRO4332-、PRO4346-、PRO4400-、PRO6003-、PRO6094-、PRO6244-、PRO9820-、PRO9828-、PRO10274-、PRO16090-、PRO19644-、PRO21340-、PRO92165-、PRO85143-、PRO1124-、PRO1026-或PRO23370多肽可以通过各种物理或化学方法破坏,例如冻融。循环、超声处理、机械破碎或细胞裂解剂。

可能需要清洁 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO432666 , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 重组细胞蛋白多肽或多肽。以下方法是合适的纯化方法的例子:通过在阴离子交换柱上的分馏;乙醇沉淀;反相高效液相色谱;在二氧化硅或阳离子交换树脂如 DEAE 上进行层析;色谱聚焦;安全数据表;硫酸铵沉淀;使用例如Sephadex G-75的凝胶过滤; Protein A Sepharose 柱,用于去除 IgG 等污染物;和金属螯合物柱,用于结合表位标记形式的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 或多肽 可以使用多种方法来纯化蛋白质,并且此类方法是本领域已知的并且例如描述于 Deutscher,酶学方法,182 (1990);领域蛋白质纯化:原理与实践, 斯普林格出版社,纽约 (1982)。选择的纯化步骤取决于,例如,使用的生产工艺类型和 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1120、PRO1182。 PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026 或 PRO23370 多肽。

E. PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO431868、PRO431866 , PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370

编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO18687 的核苷酸序列(或其互补序列)编码 PRO4326, PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 具有多肽分子的各种分子生物学应用。作为杂交探针,用于染色体和基因作图,以及反义 RNA 和 DNA 的产生。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864.0、PRO404034 PRO4034.04 PRO4034.04-、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 核酸也用于生产 PRO194、PRO220、PRO2841、PRO220、PRO2841、 pro328,pro413,pro413,pro5 pro725,pro937,pro1014,pro1120,pro1120,pro1182,pro1325,pro1382,pro1410,pro1555,pro1555,pro1556,pro1760,pro1787,pro1787,pro1868,pro1868,pro1868,pro4326,Pro4326,Pro4326,Pro4326,Pro4326,Pro4326,Pro4326,pro4326,pro4332,pro432,Pro1832,Pro1787,Pro101 prorerser参见, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 通过本文件中描述的重组技术。

全长天然序列 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、 AS 探针可用于从 PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO233702 PRO04 基因或其部分中分离, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1826, PRO43326, PRO43326, PRO4400, PRO666044 自然编码0隔离或PRO66044 (例如,其他现有的 PRO1 cDNA-94 变体、PRO220、PRO220、PRO220 PRO284、PRO331、PRO354、Pro355、Pro533、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1556、PRO1787、PRO43268、PRO6003、PRO624 PRO98, PRO624, PRO624, PRO609, PRO433268, PRO43268, Pro. NAW, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO1616344, PRO1616340 PRO85143、PRO102744、PRO102744、PRO1020 其他类型所需的序列同一性或与天然 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO15510 , PRO1556, PRO1760, PRO1787 , PRO811860, PRO811860, 本文档中描述的序列 PRO1026 或 PRO23370。任选地,探针的长度为约20至约50个碱基。杂交探针可来源于天然全长核苷酸序列的至少部分新区域,如果这些区域无需过度实验即可确定,或来源于基因组序列,包括天然序列 PRO194、PRO220 的启动子、增强子元件和内含子, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4343,943, PRO4326, PRO4343,943, PRO4 ,4 PRO498204,4 PRO498204,1 PRO498204、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。例如,检测方法将涉及隔离 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的编码区域, PRO1760 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340 合成约40个碱基的选定探针。杂交探针可以用多种标记物标记,包括放射性核苷酸,例如32o35S,或酶标记物,如碱性磷酸酶,通过亲和素/生物素偶联系统偶联到探针上。与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787 相同序列的标记探头是 B. PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO21370、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO21370、PRO9211245 - 可以使用筛选。人类 cDNA、基因组 DNA 或 mRNA,以确定探针与哪些文库成员杂交。在下面的实施例中更详细地描述了杂交技术。

本申请中描述的任何EST序列可以类似地用作使用本文描述的方法的探针。

来自 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO404.464 的其他有用片段.464、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 包括包含核酸序列(单链 RNA 或 DNA)的反义或有义寡核苷酸 PRO2 PRO199 目标PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326 PRO4340、PRO4340、PRO64264 PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO2 m PRO284、PRO331、PRO5、PRO5、PRO53、PRO53、PRO1419、PRO53 PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4030、PRO0946、PRO0946、PRO6244、PRO 98、PRO.、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 DNA 序列(反义)。根据本发明的有义或反义寡核苷酸包含 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 等编码区的片段片段通常包含至少约 14 个约 14 至 30 个核苷酸的脱核苷酸。例如,Stein 和 Cohen 证明了基于编码给定蛋白质的 cDNA 序列衍生反义或正义寡核苷酸的能力(癌症研究中心48:2659, 1988) 和 van der Krol 等人。 (生物技术6:958, 1988)。

有义或反义寡核苷酸与靶核酸序列的结合导致双链体的形成,其通过多种方式之一阻断靶序列的转录或翻译,包括增加双链体的降解、转录或翻译的过早终止或其他方式。因此,反义寡核苷酸可用于控制 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556 的表达堵塞。 PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1370.1 PRO1124反义或有义寡核苷酸还包括具有修饰的糖磷酸二酯主链(或其他糖键,例如WO 91/06629中描述的那些)的寡核苷酸,并且其中此类糖键对内源性核酸酶具有抗性。这种具有强糖键的寡核苷酸在体内是稳定的(即,能够抵抗酶促降解)但保留序列特异性以结合靶核苷酸序列。

有义或反义寡核苷酸的其他实例包括与有机部分共价连接的那些寡核苷酸,例如WO 90/10048中描述的那些以及增加寡核苷酸对靶核酸序列例如聚-(L-赖氨酸)的亲和力的其他部分。此外,嵌入剂,例如玫瑰树碱,和烷化剂或金属络合物可以连接到有义或反义寡核苷酸上以修饰反义或有义寡核苷酸对靶核苷酸序列的结合特异性。

可以通过任何基因转移方法将有义或反义寡核苷酸引入含有靶核酸序列的细胞中,包括例如 CaPO4个通过电穿孔或使用基因转移载体(如 Epstein-Barr 病毒)介导的 DNA 转染。在优选的方法中,将有义或反义寡核苷酸插入合适的逆转录病毒载体中。含有靶核酸序列的细胞在体内或离体与重组逆转录病毒载体接触。合适的逆转录病毒载体包括但不基于衍生自鼠类逆转录病毒 M-MuLV、N2(衍生自 M-MuLV 的逆转录病毒)的载体或指定为 DCT5A、DCT5B 和 DCT5C 的双拷贝载体(参见 WO 90/13641)。有限的。

如WO 91/04753中所述,也可以通过与配体结合分子形成缀合物将有义或反义寡核苷酸引入含有靶核苷酸序列的细胞中。合适的配体结合分子包括但不限于细胞表面受体、生长因子、其他细胞因子或结合细胞表面受体的其他配体。优选地,配体结合分子的缀合基本上不干扰配体结合分子结合其相应分子或受体或阻断有义或反义寡核苷酸或其缀合形式进入细胞的能力。

或者,如WO 90/10448中所述,可通过形成寡核苷酸-脂质复合物将有义或反义寡核苷酸引入含有靶核酸序列的细胞中。有义或反义寡核苷酸-脂质复合物优先在细胞内被内源性脂肪酶切割。

反义或有义 RNA 或 DNA 分子通常至少约 5 个碱基长、约 10 个碱基长、约 15 个碱基长、约 20 个碱基长、约 25 个碱基长、约 30 个碱基长、约 35 个碱基长、约 40 个碱基长长约45个碱基长约50个碱基长约55个碱基长约60个碱基长约65个碱基长约70个碱基长约75个碱基长约80个碱基长约85个碱基长约90个碱基长,约95个碱基长,约100个碱基长或更多。

探针也可用于 PCR 技术以生成一组序列识别 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1120 B. Pro1182 , Pro1325, Pro1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370。

编码的核苷酸序列, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽也可用于生成杂交探针以构建 PRO2、PRO2、PRO24、PRO28、PRO241、 PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760 PRO1787 PRO1868 PRO43026 PRO4302 PRO4302 PRO4302 PRO4302 PRO69 PRO60202 PRO6244 PRO9820 PRO9828 PRO10274 PRO16090 PRO19644 PRO21340 PRO92165 PRO85143 PRO230760干扰。可以使用已知技术,例如,将本文提供的核苷酸序列定位到染色体和染色体的特定区域。 B. 原位杂交,针对已知染色体标记的连锁分析和文库杂交筛选。

PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO4 PRO4 6617610, PRO47 6617617, PRO47 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 编码与另一种蛋白质结合的蛋白质(例如 PRO2, PRO194, 2, PRO4, PRO241 PRO331 PRO354 PRO355 PRO533 PRO541 PRO725 PRO937 PRO1014 PRO1120 PRO1182 PRO1325 PRO1382 PRO1410 PRO1555 PRO1556 PRO1760 PRO1787 PRO1868 PRO4326 PRO60302 PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 is a receiver), PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO3, PRO3554 , PRO3, PRO7325, PRO104, PRO1120, PRO1182, PRO13825, PRO1513825, PRO141560, PRO151560, PRO1513825 , PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO644, PRO928, PRO92444444444444, PRO9244, PRO924444444, PRO9244444 , PRO92444444, PRO924444444444444, PRO9244, PRO92444444444444444ES, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可用于测定以鉴定参与结合相互作用的其他蛋白质或分子。这样的方法可以鉴定受体/配体结合相互作用的抑制剂。参与此类结合相互作用的蛋白质也可用于选择结合相互作用的肽或小分子抑制剂或激动剂。还有接收器 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO683 PRO、PRO444 PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 可用于分离相关配体。可以开发筛选分析以发现调节 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、天然 Mimic PRO1410 生物活性的先导化合物, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094) 用于 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO0.Pro.2 PRO2, PRO1382 , PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434326, PRO43432, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO PRO1026 或 PRO23370。此类筛选分析包括能够以高通量筛选化学库的分析,使它们特别适用于识别小分子候选药物。考虑的小分子包括合成的有机或无机化合物。可以以多种形式进行测定,包括蛋白质-蛋白质结合测定、生化检测测定、免疫测定和基于细胞的测定,这些在本领域中被充分表征。

核酸编码 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1738, PRO4, PRO223, PRO1738, PRO4, PRO223 PRO4362 编码 PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽或其修饰的霉菌也可用于产生转基因或敲除动物。反过来可用于开发和选择治疗有用的试剂。转基因动物(例如小鼠或大鼠)是具有含有转基因细胞的动物,其中转基因在产前阶段被引入动物或动物的祖先,例如例如胚胎 转基因是整合到细胞基因组中的 DNA,转基因动物从中发育而来。本发明提供了编码PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17687、PRO4726的cDNA编码, PRO4332-, PRO4346-, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274-, PRO16090-, PRO19644-, PRO21340-, PRO92165-, PRO85143-, PRO1124-, PRO1026 - 或PRO23370 可用于克隆 DNA 的多肽, PRO43362, PRO4040, PRO4040, PRO44040, PRO44044 多肽 PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 被用于根据已建立的技术和动物产生的转基因序列编码 DNA 的 PRO194 表达细胞, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4340, PRO6434, PRO6 , PRO604, PRO404, PRO404, PRO820 PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽可以使用本领域已知的任何技术将目标基因转基因引入动物以产生转基因动物的建立者系。此类技术包括但不限于原核显微注射(美国专利号 4,873,191、4,736,866 和 4,870,009);逆转录病毒介导的基因转移到种系中(Van der Putten 等人,全氯乙烯美国国家科学院82:6148-6152(1985));胚胎干细胞中的靶向基因(Thompson 等人,细胞,56:313-321(1989));使用基因捕获载体进行非特异性插入失活(美国专利号 6,436,707);胚胎电穿孔 (Lo,无关紧要的细胞。生物学。3:1803-1814 (1983));和精子介导的基因转移(Lavitrano 等人,细胞,57:717-723(1989));通常,特定细胞受到 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787 的攻击. PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23 特定组织增强。转基因动物含有一份转基因编码的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 编码, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO1124, PRO23320, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO23326 编码 PRO204,PRO24,PRO22 的 DNA 表达增加的作用, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO604040 , PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO153240, PRO153240 o polipéptido PRO153243, PRO153243 Dichos animales pueden usarse 作为 Reagenzien 的试验动物,被认为可以提供针对与例如病理状况相关的保护他们的过度表达。根据本发明的这个方面,用试剂治疗动物并且与携带转基因的未治疗动物相比疾病状态的发生率降低将指示对疾病状态的潜在治疗干预。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17.PRO7633 PRO17.PRO43, Pro4332, PRO4400, PRO6003, Pro6094, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO21340, PRO92165, PRO1124, PRO23370 SE PUEDE Usar Para Construir Un11, PRO10, Pro., Pro533, Pro541, Pro9127, Pro1102, Pro1102, Pro1102, Pro1102 , Pro1325, PRO1410, PRO155, PRO1760, PRO1787, PRO4326, PRO432, PRO602400, PRO98, PRO982, PRO9828, PRO10, PRO9828, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 “敲除”编码改变的动物 PRO194 或,pro220,pro241,pro284,pro331,pro354,pro5355,pro541,pro725,pro725,pro1047,pro1047,pro138252,pro138252,pro138252,pro138252 clos pro pro pro1410 ,, tros1555,po15555,po15556,pro136,pro176,pro176,pro176,pro176,pro46,pro46,pro46,pro46,pro46,pro pro pro pro in PRO6003、PRO6244、PRO6244、Pro6244、Pro9820、Pro9828、PRO9828、PRO 10274、PRO 216090、PRO21644、PRO8340、Pro Pro.Pro.、Pro Pro.Pro.、Pro Pro.Pro.、PRO 2165、PRO 8340、PRO 2965 , PRO 834, PRO 834, PRO 834, PRO 834, PRO 834, PRO 80, PRO. 编码 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, Pro937,Pro1014,Pro1120,Pro1182,Pro13825,Pro14025,Pro1325 Pro1555,Pro1556,Pro17870。,Pro17870。 PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 polipéptidos y ADN genómico alterado que codifica PRO194, PRO220, PRO241 , Pro284, Pro354, Pro53, Pro541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1325, PRO1410, PRO175055, PRO1787, PRO43268,将 PRO44、PRO60、PRO60、PRO60、PRO60、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23 引入到含有胚胎 Animal370 的细胞中。 Preferiblemente,动物 noqueado es un mamifero。 Más Preferredmente, el Mamífero es un roedor tal como rata o un ratón。以ADNc编码为例 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO17860, PRO17860, PRO17860, PRO17860, PRO17860 2.47860 , Pro4346, Pro6003, PRO6094, Pro6244, Pro9828, Pro10274, PRO16090, PRO19644, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO23370 Que Codifican ADN Genómico Pro1, Pro2 Pro1 Pro541, PRO725, PRO937, PRO1120, PRO1182, PRO1382, PRO1410, PRO1556, PRO1787 , PRO1868, PRO4326, PRO602400, Pro9820, PRO9828, PRO982, PRO602400 PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 según tecnicas establecidas.部分 DNA 基因组编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO18670、PRO18670、PRO486 , PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 puede ser eliminado o reemplazado con otro gen gen que codifica un marcador seleccionable que puede使用 para controlar la 集成。 Normalmente, se incluyen en el varias kilobases de ADN flanqueante inalterado (tanto en los extremos 5' como 3') [véase, por ejemplo, Thomas y Capecchi,细胞,51:503 (1987) 对同源重组载体的描述]。将载体引入胚胎干细胞系(例如,通过电穿孔)并选择其中引入的 DNA 与内源 DNA 同源重组的细胞[参见,例如B.李等人,细胞,69:915 (1992)]。然后将选定的细胞注射到动物(例如小鼠或大鼠)的囊胚中以形成聚集嵌合体[参见,例如B布拉德利,在畸胎癌和胚胎干细胞:实用方法, EJ Robertson, ed. (IRL, Oxford, 1987), pp. 113-152]。然后可以将嵌合胚胎植入合适的假孕雌性寄养动物中,并使胚胎足月以产生“基因敲除”动物。在其生殖细胞中含有同源重组DNA的后代可以通过标准技术鉴定并用于繁殖动物,其中动物的所有细胞都含有同源重组DNA。例如,基因敲除动物的特征在于它们能够抵御某些病理状况以及由于缺乏编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541 的基因而导致病理状况的发展, charakterisiert werden , PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO15556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO444, PRO9284, PRO9284444444444444444444444444444444444ES Polipéptido PRO21340, PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。

此外,基因敲除小鼠在发现药物靶点的基因功能和药物效用以及确定与特定靶点相关的潜在副作用方面可以提供非常丰富的信息。基因功能和生理学在小鼠和人类之间非常保守,因为它们都是哺乳动物并且包含相似数量的基因,因此它们在物种之间高度保守。例如,最近有充分的证据表明,小鼠 16 号染色体上 98% 的基因具有人类直系同源基因(Mural 等人,科学296:1661-71 (2002))。

尽管胚胎干 (ES) 细胞中的基因选择使得能够构建在许多与人类疾病有关的基因中具有无效突变的小鼠,但并非所有遗传疾病都归因于无效突变。可以通过建立破坏小鼠基因座并引入突变人类对应物的基因替换(敲入)方法来设计有价值的人类疾病小鼠模型。随后,可以进行针对人类蛋白质的体内药物研究(Kitamoto 等人,生物化学和生物物理研究一起,222:742-47 (1996))。

核酸编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO17864、PRO403、PRO403、PRO1760 .003、PRO.PRO.00-、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO124、PRO1026 或 PRO23370 多肽也可用于基因治疗。在基因治疗应用中,将基因引入细胞以实现治疗有效基因产物的体内合成,例如替换缺陷基因。 “基因疗法”既包括常规基因疗法,其中通过单次治疗实现持久效果,也包括基因治疗剂的施用,其涉及单次或重复施用治疗有效的DNA或mRNA。反义 RNA 和 DNA 可用作治疗剂以在体内阻断某些基因的表达。先前已经表明,短反义寡核苷酸可以被导入细胞,尽管由于它们通过细胞膜的摄取受限而导致细胞内浓度较低,但它们在细胞中充当抑制剂。 (Zamecnik 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀83:4143-4146 [1986])。可以修饰寡核苷酸以提高它们的摄取,例如用不带电的基团取代带负电的磷酸二酯基团。

有多种技术可用于将核酸引入活细胞。技术因核酸是转移到体外生长的细胞中还是转移到体内预期宿主的细胞中而异。适用于在体外将核酸转移到哺乳动物细胞中的技术包括使用脂质体、电穿孔、显微注射、细胞融合、DEAE-葡聚糖、磷酸钙沉淀法等。目前优选的体内基因转移技术包括用病毒载体(通常是逆转录病毒)转染和脂质体介导的病毒外壳蛋白转染(Dzau 等人,生物技术趋势11, 205-210 [1993])。在某些情况下,希望为核酸源提供靶向靶细胞的试剂,例如靶细胞或细胞表面膜蛋白特异的抗体、细胞靶上受体的配体等。当脂质体是例如,结合与内吞作用相关的细胞表面膜蛋白的蛋白质可用于指导和/或促进摄取,例如衣壳蛋白或特定细胞类型的相同比喻的片段,针对循环中内化的蛋白质的抗体,靶向细胞内定位并增加细胞内半衰期的蛋白质。受体介导的内吞作用技术例如由 Wu 等人提出。描述,J.生物学。化学262, 4429-4432 (1987); y Wagner 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀87, 3410-3414 (1990)。有关基因标记和基因治疗方案的概述,请参阅 Anderson 等人,科学256, 808-813 (1992)。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34本文所述的 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 序列也可用作蛋白质电泳和分离核酸目的的分子量标记重组表达这些标记。

核酸分子编码 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO18642, PRO,43-43- PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽或其描述的片段可用于本文件中的染色体鉴定。在这方面,存在鉴定新染色体标记的持续需要,因为基于当前序列数据目前可用的染色体标记试剂相对较少。每个 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO4303324、PRO1787、PRO4303324、PRO1787、PRO4303324、PRO1787 , PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 本发明的核酸分子可用作染色体标记。

PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4344 肽段本发明的核酸也可用于组织分型的诊断目的PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO434326, PRO434326, PRO434326 Los polipéptidos PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 of the present invention may in einem Gewebe unterschiedlich exprimiert 相互比较,最好是在患病组织中。组织与相同组织类型的正常组织相比。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1864-3、PRO609 PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 核酸分子可用于生成用于 PCR、Northern 分析、Southern 分析和蛋白质分析的探针。

PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18638、PRO344、443 PRO4343、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 也可用作治疗剂。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 可以根据已知的用于制备可药用组合物的方法配制,其中 PRO194、PRO220、PRO241 , Pro284, Pro331, Pro355, Pro533, Pro541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1182, PRO1325, PRO1410, PRO155, PRO1760, PRO1868, per434326, pro , PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO851242, PRO153244, PRO15324, PRO153244与药学上可接受的载体混合。通过将所需纯度水平的活性成分与可选的生理学可接受的载体、赋形剂或稳定剂混合,制备治疗制剂以供储存。雷明顿制药科学第 16 版,Osol,A.Ed. (1980)),以冻干制剂或水溶液的形式存在。可接受的载体、赋形剂或稳定剂在使用的剂量和浓度下对接受者无毒,包括磷酸盐、柠檬酸盐和其他有机酸等缓冲剂;抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(小于约 10 个残基)多肽;蛋白质,如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物如聚乙烯吡咯烷酮,氨基酸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、双糖和其他碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精; EDTA等螯合剂;糖醇如甘露醇或山梨糖醇;成盐抗衡离子,例如钠;和/或非离子表面活性剂,例如 TWEEN™、PLURONICS™ 或 PEG。

用于体内给药的制剂必须是无菌的。这很容易通过在冻干和重构之前或之后通过无菌过滤膜过滤来实现。

本文的治疗组合物通常放置在具有无菌入口的容器中,例如具有可被皮下注射针刺穿的塞子的静脉内溶液袋或小瓶。

给药途径根据已知方法,例如通过静脉内、腹膜内、脑内、肌内、眼内、动脉内或病灶内途径注射或输注,局部给药或缓释系统。

本发明药物组合物的所需剂量和药物浓度可根据预期的特定用途而变化。适当剂量或给药途径的确定在普通医师的技能范围内。动物实验为确定人类治疗的有效剂量提供了可靠的信息。有效剂量的种间缩放可以根据 Mordenti, J. 和 Chappell, W. 中概述的原则进行。毒代动力学和新药开发中的“在毒代动力学中使用种间缩放”,Yacobi 等人,编辑,Pergamon Press,纽约 1989 年,第 42-96 页。

用于体内给药 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO18787., 正常量多肽或其激动剂或拮抗剂的剂量范围可以是每天约 10 ng/kg 至 100 mg/kg 哺乳动物体重或更多,优选约 1 μg/kg/天至 10 mg/kg/天,这取决于给药途径。有关具体剂量和给药方法的建议可在文献中找到;参见,例如,美国专利号 4,657,760; 5,206,344;或 5.225.212。预计不同的制剂将对不同的治疗化合物和不同的病症有效,例如,靶向一个器官或组织可能需要与另一个器官或组织不同的给药。

管理 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO4334368、6 PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 具有所需疾病的疾病或特征释放 PRO194,41,PRO230,PRO , PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO436, PRO4326 PRO4400, PRO6003, PRO6094,962048,98 PRO6094,98 PRO6094 PRO10274 , PRO16090, PRO19644, PRO92165, PRO1, PRO1120, PRO1182, PRO1382, PRO155, PRO1760, PRO1787, POLOPE6, PRO4332, PRO4040, PRO433, PRO433, PRO178, PRO1787, Pro. PRO9828, PRO10274, PRO19034, PRO146034, PRO146034被认为是 PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。重组蛋白的缓释微囊化已成功地与人生长激素 (rhGH)、干扰素 (rhIFN-)、白细胞介素 2 和 MN rgp120 一起进行。约翰逊等人。晚上。和。,2: 795–799 (1996);贾苏达,生物医学 El r.,27:1221-1223 (1993);霍拉等人,生物技术,8:755-758(1990); Cleland,“使用聚丙交酯和聚乙交酯微球系统设计和生产独特的免疫疫苗”,载于疫苗设计:亚单位和辅助方法, Powell 和 Newman 编(全会出版社:纽约,1995 年),第 439-462 页; WO 97/03692、WO 96/40072、WO 96/07399;和美国专利。第 5,654,010 号。

由于聚乳酸-羟基乙酸 (PLGA) 聚合物具有生物相容性和广泛的生物可降解特性,因此已开发出这些蛋白质的缓释制剂。 PLGA的分解产物乳酸和乙醇酸在人体内可迅速排出体外。此外,这种聚合物的可降解性可以根据分子量和组成进行调整,从几个月到几年不等。 Lewis,“从丙交酯/乙交酯聚合物中控制释放生物活性剂”,载于:M. Chasin 和 R. Langer(编辑),作为药物递送系统的生物可降解聚合物(Marcel Dekker:纽约,1990),S. 1-41。

本发明包括筛选化合物以鉴定产生 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、模拟 PRO1556 的化合物的方法. PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO370 (防止PRO28的PRO2,9,9,9) PRO28多肽、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO18268、PRO4068、PRO43368、PRO9027.多肽B 1 PRO9828、1 PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370(拮抗剂)。模拟 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO60326 的激动剂, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽在用非人转基因动物观察到基于阴性类型的现象的那些情况下在治疗上特别有价值其基因组包含编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、 PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PROT 拮抗剂影响 PRO2、PRO219、4、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、 PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO18626, PRO4386 prevent , PRO4332-, PRO46003-, PRO44003- -, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340 、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽在基于敲除转基因非人动物的观察结果观察到治疗阳性多肽呈阳性的那些情况下将具有特别的治疗价值。拮抗剂候选药物筛选试验旨在鉴定表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、结合或复合的化合物PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。本文鉴定的基因或以其他方式干扰所编码的多肽与其他细胞蛋白的相互作用。此类筛选分析包括能够以高通量筛选化学库的分析,使它们特别适用于识别小分子候选药物。

可以以多种形式进行测定,包括蛋白质-蛋白质结合测定、生化筛选测定、免疫测定和基于细胞的测定,这些在本领域中被充分表征。

所有针对拮抗剂的研究都是常见的,因为它们涉及将候选药物暴露于 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、 PRO1555 需要 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。在足以允许这两种组分相互作用的条件和时间下鉴定本文鉴定的核酸。

在结合测定中,相互作用是结合,形成的复合物可以在反应混合物中分离或检测。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 , PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 由本文鉴定的基因编码的多肽或候选药物被共价或非固定化在固相上共价键。非共价结合通常通过用 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410 的溶液洗涤固体表面来实现涂层。 PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。或者,固定化抗体,例如B. PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO17687, PRO1556 , PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO1964, 用于固定在坚固的表面上。通过将可用可检测标记物标记的非固定化成分添加到固定化成分,例如,进行测定。 B. 包含固定组件的涂层表面。反应结束后,去除未反应的成分,例如通过洗涤,并检测附着在固体表面的复合物。如果最初未固定的成分带有可检测的标记,则在表面检测到固定的标记表明发生了络合。如果最初未固定的组分不携带标记,则可以检测复合物的形成,例如,通过使用特异性结合固定化复合物的标记抗体。

当候选化合物与特定的 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 相互作用时,PRO1555、PRO1556、PRO1760 与 B 结合。通过众所周知的检测蛋白质-蛋白质相互作用的方法。此类测定包括传统方法,例如交联、免疫共沉淀和通过色谱梯度或色谱柱进行的共纯化。此外,可以使用 Fields 等人开发的基于酵母的遗传系统来监测蛋白质-蛋白质相互作用。 (田野和宋,自然(伦敦),340:245-246(1989 年);佩罗特等人,全氯乙烯美国国家学院军刀88:9578-9582 (1991)),据 Chevray 和 Nathans 报道,全氯乙烯美国国家学院军刀89:5789-5793 (1991)。许多转录激活因子如B. 酵母 GAL4,由两个物理上独立的模块域组成,其中一个用作 DNA 结合域,另一个用作转录激活域。上述出版物中描述的酵母表达系统(通常称为“双杂交系统”)利用了这一特性并使用了两种杂交蛋白,其中一种将靶蛋白融合到 GAL4 DNA 结合域。另一个候选激活蛋白与激活域融合。 GAL1-lacZ 报告基因在 GAL4 激活启动子控制下的表达取决于通过蛋白质-蛋白质相互作用恢复 GAL4 活性。用 β-半乳糖苷酶的显色底物检测含有相互作用多肽的菌落。用于使用双杂交技术鉴定两种特定蛋白质之间的蛋白质-蛋白质相互作用的完整试剂盒 (MATCHMAKER™) 可从 Clontech 购买。该系统还可以扩展到绘制涉及特定蛋白质相互作用的蛋白质结构域,以及识别对这些相互作用至关重要的氨基酸残基。

破坏编码基因相互作用的化合物PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026, PRO23 intracellular本文鉴定的PRO23或PRO23细胞内组分可按如下测定:通常,在促进两种产物的相互作用和结合成为可能的条件下和一段时间内制备含有基因产物和细胞内或细胞外组分的反应混合物。为了测试候选化合物抑制结合的能力,反应在测试化合物不存在和存在的情况下进行。此外,可以将安慰剂添加到第三反应混合物中作为阳性对照。如上所述监测测试化合物与存在于混合物中的细胞内或细胞外组分之间的结合(复合物形成)。在对照反应中而不是在含有测试化合物的反应混合物中形成复合物表明测试化合物干扰了测试化合物与其反应物的相互作用。

用于分析拮抗剂 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1784、PRO24、 PRO-、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽可以与特定细胞的活性一起添加到细胞中研究它以及化合物在 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、Pro937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1382、PRO1410 存在的情况下产生感兴趣的活性的能力抑制, Pro1555, Pro1760, PRO1868, PRO4326, PRO4346, PRO6003, Pro6094, Pro9820, Pro10, Pro10, Pro9820, PRO982, PRO982, PRO98, PRO98, PRO98, PRO98, PRO98, PRO98, PRO98, PRO98, PRO928 PRO21340, PRO 拮抗剂PRO19644、PRO324、PRO324、PRO19、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO.84、PRO1787、PRO446.8 , PRO4400, PRO6003, PRO68204, PRO68204, PRO68204, PRO68204, PRO68204 PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370。或者,可以通过 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、 PRO1786。 PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO92165, PRO23 PRO190 membrangebundener Polypeptid, PRO318 PRO204 und ein potenzieller PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO40432, PRO6 PRO40432,0040432,0040432,0040444,PRO8244,PRO8244,PRO8244,PRO8244,PRO8244 ,PRO8244,PRO8244,PRO8244,PRO8244 PRO10274,PRO16090,PRO19644,PRO21340,PRO92165,PRO85143,PRO1124,PRO1026 或 PRO23370 多肽受体或重组受体在适合竞争性抑制测定的条件下。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO434、PRO34、PRO34 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1024、PRO1026 或 PRO23370 多肽可以标记,例如通过放射性标记,使得 PRO194、PRO4120、PRO2120、PRO2120 的数目PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO18687, PRO18787 PRO21340, PRO92165, PRO1182, PRO1325, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO18687, PRO18787 PRO21340, PRO92165, PRO1182, PRO1322 PRO3620, PRO3620 或 PRO10720 受体结合可用于确定潜在拮抗剂的效力。编码受体的基因可以通过本领域技术人员已知的许多方法来鉴定,例如B. 配体筛选和 FACS 分类。科利根等人,当前日志 inm.,1(2):第 5 章(1991 年)。优选地,使用表达克隆,其中从针对PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1182、PRO1325、 PRO1382, PRO1410 响应, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19640, PRO21640.从该 RNA 创建的文库被分成池,用于转染 COS 细胞或其他不表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 响应的细胞。 PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO1026、PRO23370、PRO2、载玻片上生长的多肽PRO2 PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556或暴露于多肽PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO3.1 , PRO35.4 , PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1836, PRO43,440,PRO6 PRO6003-, PRO6094-, PRO6244- PRO9820-、-、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽可以通过多种方式标记,包括碘化或包含特定蛋白激酶位点的识别位点。固定和孵育后,对载玻片进行放射自显影分析。识别阳性池并使用子池和重新筛选的迭代过程制作和重新转染,最终产生编码推定受体的单个克隆。

作为识别受体的替代方法,标记为 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、 PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO10370 Photons can be extracted from膜细胞或受体分子,PRO10370表达。交联材料通过 PAGE 分离并暴露在 X 射线胶片上。可以切除含有受体的标记复合物,分离成肽片段并进行蛋白质微量测序。从微量测序获得的氨基酸序列将用于设计一组简并寡核苷酸探针以筛选 cDNA 文库以鉴定编码推定受体的基因。

另一种评估 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、 PRO1787 PRO1868 PRO4326 PRO4332 PRO4346 PRO4400 PRO6003 PRO6094 PRO6244 PRO9820 PRO9828 PRO10274 PRO16090 PRO19644 PRO21340 PRO92165 PRO85143 PRO1124 PRO1026 PRO22 PRO4 , PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO43362、PRO4040、PRO64040、PRO640240、PRO640240、PRO48040、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370所以首先你要删除 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO17687- PRO,18687 PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 - 由于所产生的 PRO19 表型缺失或破坏而引起的感兴趣基因PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO43368, PRO4, PRO3, PRO4403, PRO4, PRO3, PRO4403 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。随后,可以评估 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 拮抗剂的有效性., PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO92165, PRO85143, PRO1124 PRO376 产生 PRO3, PRO24, PRO24 或 PRO24 多肽, PRO3 PRO31,.4 PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4302, PRO4302, PRO4302, PRO3, PRO4302, PRO9604940, PRO96049402 PRO9828, PRO10274 , PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 到野生型小鼠。预计有效的拮抗剂会模仿最初在基因敲除动物中观察到的表型效应。激动剂对 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO186、 PRO4326, PRO432, PRO4400, PRO6003, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO16090, PRO19644, PRO2165, PRO241, PRO284, per333.5Pro5 Pro114 , PRO1410, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO4326, PRO44040, PRO44040 PRO6244, PRO9828, PRO16090, PRO1964, PRO2165、PRO2165 B. PRO23370 激动剂用于非人转基因小鼠以改善已知的阴性基因敲除表型。所以首先你要删除 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO17687- PRO,18687 PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 - 由于所产生的 PRO19 表型缺失或破坏而引起的感兴趣基因PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO43368, PRO4, PRO3, PRO4403, PRO4, PRO3, PRO4403 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。随后,可以评估 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的激动剂的有效性. , Pro1787, Pro1868, Pro4326, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6244, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO21340, PRO92165, 每, PROTRE ANTERED, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO13,7 PRO74, PRO5, PRO1014、PRO1120、PRO1120、PRO3182、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO43022、PRO43026、PRO43026、PRO43026、PRO53026、PRO PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO102 非人转基因。预期有效的激动剂会改善最初在基因敲除动物中观察到的负面表型效应。

在拮抗剂的另一种测定中,表达受体的哺乳动物细胞或膜制剂将用 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182 和 PRO1325 标记,待孵化。 B. Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO多肽存在候选化合物。然后可以测量该化合物增强或阻断这种相互作用的能力。

潜在拮抗剂的更具体的例子包括与免疫球蛋白结合的寡核苷酸融合物 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO196444,特别是抗体,包括但不限于多克隆抗体、单克隆抗体和片段 B. 单链抗体、抗独特型抗体和此类抗体或片段的嵌合或人源化形式,以及人类抗体和抗体片段。或者,潜在的拮抗剂可以是密切相关的蛋白质,例如 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382 的突变形式。 , Pro1410 , PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO34,5313, PRO3313 PRO354, PRO355 PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326 PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-4, PRO41828-4 PRO10274-4-PRO102796-、PRO21340、PRO92165、PRO103240 或 PRO103240 或 PRO103240 多肽

其他可能的 PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO408,8,60, PRO408,60, PRO1787 60 PRO403 PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽拮抗剂是使用反义技术制备的反义 DNA 或 RNA 结构,例如反义 RNA 或 DNA 分子通过与靶 mRNA 杂交并阻止蛋白质翻译,直接阻断 mRNA 的翻译。反义技术可用于通过三螺旋形成或反义 DNA 或 RNA 来控制基因表达,这两种方法都基于多核苷酸与 DNA 或 RNA 的结合。例如,编码PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、成熟的PRO1410、PRO1555、 PRO15565、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340。用于设计长度约为 10 至 40 个碱基对的反义 RNA 寡核苷酸。 DNA 寡核苷酸被设计为与参与转录的基因区域互补(三螺旋;参见 Lee 等人,酸核研究,6:3073 (1979);库尼等人,科学,241:456(1988);德瓦内等人,科学,251:1360 (1991)),从而阻止 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 的转录和生产wird , PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO103240 o polipéptido PRO103243, PRO151243, PRO151243 El oligonucleótido de ARN反义在体内与 mRNA 杂交并阻断 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555 中 mRNA 分子的翻译, PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、反义冈野、神经化学,56:560(1991);寡脱氧核苷酸作为基因表达的反义抑制剂(CRC 出版社:博卡拉顿,佛罗里达州,1988 年)。也可以将上述寡核苷酸施用于细胞以允许反义RNA或DNA在体内表达以诱导PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937的产生,以抑制PRO1014 . PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO1120、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO1120、PRO1787、PRO1868、PRO1124起始站点,例如B.靶基因核苷酸序列的约-10和+10位之间。

潜在的拮抗剂包括与 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120 的活性位点、受体或生长因子结合位点或其他相关结合位点结合的小分子, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, Pro1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO1024, PRO1024, PRO1031, PRO2214, PRO221, PRO221, PRO221, PRO220, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4, PRO460326-2,PRO620-4,9 PRO6 PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO103240 或 PRO103243、PRO151243、PRO151243 多肽实例包括非肽、小分子,但优选限于小分子、小分子或肽样分子、可溶性肽和合成非肽肽有机或无机化合物。

核酶是酶促 RNA 分子,可以催化 RNA 的特异性裂解。核酶通过与互补靶 RNA 进行序列特异性杂交,然后进行核酸内切裂解来发挥作用。可以使用已知技术鉴定潜在RNA靶标内的特定核酶切割位点。有关详细信息,请参阅例如 Rossi,目前的生物学,4:469-471 (1994) 和 PCT 公开号 WO 97/33551 (1997 年 9 月 18 日公开)。

用于抑制转录的三链核酸分子必须是单链的,由脱氧核苷酸组成。这些寡核苷酸的碱基组成旨在通过 Hoogsteen 的碱基配对规则促进三股螺旋的形成,这通常需要双链体的一条链中有大量的嘌呤或嘧啶。进一步的细节参见,例如,PCT 公开号 WO 97/33551,同上。

这些小分子可以通过一种或多种以上讨论的检测分析和/或通过本领域技术人员熟知的任何其他检测技术来鉴定。

本文描述的分子的诊断和治疗用途也可以基于下面描述和描述的阳性功能测试结果。

F. 抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、 Anticuerpos Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370

本发明提供抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026或抗PRO23370可在本文中用作治疗剂和/或诊断剂的抗体。抗体的例子包括多克隆抗体、单克隆抗体、人源化抗体、双特异性抗体和异源偶联抗体。

1. 多克隆抗体

优选通过相关抗原和佐剂的多次皮下(sc)或腹膜内(ip)注射在动物中产生多克隆抗体。将相关抗原(尤其是使用合成肽时)与在待免疫物种中具有免疫原性的蛋白质结合可能是有用的。例如,可以使用双功能或衍生剂,例如B. 马来酰亚胺基苯甲酰磺基琥珀酰亚胺酯(通过匙孔壁残基、半胱氨酸结合)、N-羟基琥珀酰亚胺(通过赖氨酸残基)、戊二醛、琥珀酸酐、SOCl2个, 或 R1个N=C=NR,其中 R 和 R1个它们是不同的烷基。

通过将例如 100 µg 或 5 µg 蛋白质或偶联物(分别用于兔子或小鼠)与 3 体积的弗氏完全佐剂组合并在多个部位皮内注射溶液,使动物针对抗原、免疫原性偶联物或衍生物进行免疫. .一个月后,通过在多个部位皮下注射,用弗氏完全佐剂中原始量的 1/5 至 1/10 的肽或缀合物加强动物。 7 到 14 天后,对动物进行采血并测试血清的抗体滴度。刺激动物直到滴度停滞。缀合物也可以在重组细胞培养物中制成蛋白质融合物。此外,诸如明矾的结合剂适合用于增强免疫应答。

2. 单克隆抗体

可以使用 Kohler 等人首先描述的方法生产单克隆抗体。所述杂交瘤方法产生。自然,256:495 (1975),或可通过重组 DNA 技术制备(美国专利号 4,816,567)。

在杂交瘤方法中,小鼠或其他合适的宿主动物,例如仓鼠,如上所述被免疫以引发产生或能够产生特异性结合用于免疫的蛋白质的抗体的淋巴细胞。或者,可以在体外免疫淋巴细胞。免疫后,分离淋巴细胞,然后使用适当的融合剂(如聚乙二醇)与骨髓瘤细胞系融合,形成杂交瘤细胞(Goding,单克隆抗体:原理与实践, 页数。 59-103(学术出版社,1986 年))。

将由此产生的杂交瘤细胞接种并培养在合适的培养基中,该培养基优选含有一种或多种抑制未融合亲代骨髓瘤细胞(也称为融合伙伴)生长或存活的物质。例如,如果亲代骨髓瘤细胞缺乏次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶(HGPRT 或 HPRT),杂交瘤的选择性培养基通常含有次黄嘌呤、氨基蝶呤和胸苷(HAT 培养基),这些物质会阻止 HGPRT 的生长。

优选的融合配偶体骨髓瘤细胞是那些能有效融合、支持所选抗体产生细胞稳定、高水平产生抗体,并且对选择未融合亲本细胞的选择性培养基敏感的细胞。优选的骨髓瘤细胞系是小鼠骨髓瘤细胞系,例如源自小鼠肿瘤 MOPC-21 和 MPC-11 的细胞系,可从美国加利福尼亚州圣地亚哥的索尔克研究所细胞分布中心获得,以及 SP-2 和衍生物,例如Ag8-653 细胞,可从美国弗吉尼亚州马纳萨斯的美国典型培养物保藏中心获得。人骨髓瘤和小鼠-人异源骨髓瘤细胞系也已被描述用于生产人单克隆抗体(Kozbor,J.免疫学,133:3001 (1984); y Brodeur 等人,单克隆抗体生产技术及应用, S. 101-1 51-63(Marcel Dekker, Inc.,纽约,1987 年)。

分析杂交瘤细胞在其中生长的培养基是否产生针对抗原的单克隆抗体。优选地,由杂交瘤细胞产生的单克隆抗体的结合特异性通过免疫沉淀或通过体外结合测定例如放射免疫测定(RIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA)来测定。

单克隆抗体的结合亲和力可以例如通过Munson等人中描述的方法来确定。所述的Scatchard测定法可以确定。肛门。生化,107:220(1980 年)。

一旦鉴定出产生具有所需特异性、亲和力和/或活性的抗体的杂交瘤细胞,就可以通过有限稀释法对克隆进行亚克隆,并通过标准方法(Goding,单克隆抗体:原理与实践,第 59-103 页(学术出版社,1986 年))。适合此目的的培养基包括,例如,D-MEM 或 RPMI 1640 培养基。此外,杂交瘤细胞可以在动物体内作为腹水瘤生长,例如动物。将细胞注射到小鼠体内。

通过标准抗体纯化方法例如亲和层析(例如使用蛋白A或蛋白G Sepharose)或离子交换层析,将亚克隆分泌的单克隆抗体从培养基、腹水或血清中适当分离。 、羟基磷灰石层析、凝胶电泳、透析等

编码单克隆抗体的 DNA 很容易使用标准技术分离和测序(例如,使用能够特异性结合编码鼠抗体重链和轻链的基因的寡核苷酸探针)。杂交瘤细胞是此类 DNA 的优选来源。分离后,可以将 DNA 放入表达载体中,然后将其转染到宿主细胞中大肠杆菌其他不产生抗体蛋白的细胞、猴COS细胞、中国仓鼠卵巢(CHO)细胞或骨髓瘤细胞获得重组宿主细胞中单克隆抗体的合成。在细菌中重组表达抗体编码 DNA 的综述包括 Skerra 等人,目前对免疫学的看法,5:256-262 (1993) 和 Pluckthun,免疫学。牧师130:151-188 (1992)。

单克隆抗体或抗体片段可以从使用 McCafferty 等人描述的方法生成的抗体噬菌体文库中分离出来。生成了描述的技术。自然,348: 552–554 (1990)。克拉克森等人,自然,352:624-628 (1991) 和 Marks 等人。J.摩尔。生物学,222:581-597 (1991) 描述了使用噬菌体文库分离鼠或人抗体。随后的出版物描述了通过链改组生产高亲和力(nM 范围)人抗体(Marks 等人,生物技术,10:779-783 (1992)),以及组合感染和体内重组作为构建超大型噬菌体文库的策略(Waterhouse 等人,不。酸。牛肉。21:2265-2266 (1993))。因此,这些技术是用于单克隆抗体分离的常规单克隆抗体杂交瘤技术的可行替代方案。

编码抗体的 DNA 可以被修饰以产生嵌合或融合抗体多肽,例如通过替换人轻链和重链恒定域(CHy C大号) 同源鼠序列的序列(美国专利号 4,816,567;和 Morrison 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀81:6851 (1984))或通过将免疫球蛋白编码序列与非免疫球蛋白(异源)多肽的全部或部分编码序列融合。非免疫球蛋白多肽序列可以取代抗体的恒定结构域或取代抗体的抗原结合位点的可变结构域以产生包含对抗原具有特异性的抗原结合位点的嵌合二价抗体。和对另一种抗原具有特异性的另一种抗原结合位点。

3. 人类和人源化抗体

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗 PRO4400、抗 PRO6003、抗 PRO6094、抗 PRO6244、抗 PRO9820、抗 PRO9828、抗 PRO10274、抗 PRO16090、抗 PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 Die-PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体本发明还可包括人源化抗体或人抗体。非人(例如,鼠)抗体的人源化形式是嵌合免疫球蛋白、免疫球蛋白链或其片段(例如 Fv、Fab、Fab'、F(ab')2个或其他抗原结合抗体子序列),其中包含源自非人免疫球蛋白的最小序列。人源化抗体包括人免疫球蛋白(受体抗体),其中受体的互补决定区 (CDR) 的残基被非人类物种(供体抗体)的 CDR 残基所取代,例如小鼠、大鼠或兔具有特异性、亲和力和能力。在一些情况下,人免疫球蛋白的 Fv 构架残基被相应的非人残基取代。人源化抗体还可以包括在受体抗体、导入的框架或 CDR 序列中未发现的残基。通常,人源化抗体包含基本上所有的至少一个,通常是两个可变结构域,其中所有或基本上所有 CDR 区对应于非人免疫球蛋白的那些,并且所有或基本上所有 FR 区对应于人的免疫球蛋白 - 共有序列。最佳地,人源化抗体还包含免疫球蛋白恒定区(Fc)的至少一部分,通常是人免疫球蛋白的恒定区[Jones等人,自然,321:522-525(1986);里赫曼等人。自然,332:323-329(1988);并借出当前操作。结构生物学,2:593-596(1992)]。

将非人抗体人源化的方法是本领域众所周知的。通常,人源化抗体具有一个或多个从非人类来源引入的氨基酸残基。这些非人类氨基酸残基通常被称为“输入”残基,它们通常取自“输入”可变域。人源化基本上可以根据 Winter 等人的方法进行 [Jones 等人,自然,321:522-525(1986);里赫曼等人。自然,332:323-327(1988); Verhoeyen 等人,科学,239:1534-1536 (1988)],其中啮齿动物 CDR 或 CDR 序列替换了人类抗体的相应序列。因此,此类“人源化”抗体是嵌合抗体(美国专利号 4,816,567),其中基本上少于一个完整的人类可变结构域已被来自非人类物种的相应序列替换。实际上,人源化抗体通常是人抗体,其中一些 CDR 残基和可能一些 FR 残基被啮齿动物抗体中类似位点的残基取代。

选择用于生产人源化抗体的人可变域(轻链和重链)非常重要,以降低抗原性和 HAMA(人抗小鼠抗体)反应,当抗体用于人的治疗用途时故意的。根据所谓的“最佳拟合”方法,针对已知人类可变域序列的整个文库分析啮齿动物抗体的可变域序列。鉴定出最接近啮齿动物的人 V 结构域序列,并且其中包含的人框架区 (FR) 被接受用于人源化抗体(Sims 等人,J.免疫学。151:2296 (1993); Chothia 等人。J.摩尔。生物学,196:901(1987 年))。另一种方法使用源自所有人类抗体的共有序列的特定构架区以对抗重链或轻链的特定子集。相同的框架可用于几种不同的人源化抗体(Carter 等人,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:4285 (1992);Presta 等人,J.免疫学。151:2623 (1993))。

同样重要的是,抗体要人源化,同时保持对抗原的高结合亲和力和其他有益的生物学特性。为实现这一目标,根据优选方法,人源化抗体是通过亲本序列分析过程和使用亲本和人源化序列的三维模型的各种概念性人源化产品产生的。三维免疫球蛋白模型通常可用并且为本领域技术人员所熟悉。计算机程序可用于可视化和显示所选候选免疫球蛋白序列的可能三维构象结构。检查这些筛选可以分析残基在候选免疫球蛋白序列功能中的可能作用,即分析影响候选免疫球蛋白结合其抗原的能力的残基。以这种方式,可以从受体和输入序列中选择 FR 残基并组合以实现所需的抗体特性,例如增加对靶抗原的亲和力。一般而言,高变区残基直接且显着地参与影响抗原结合。

Anti-PRO194、Anti-PRO220、Anti-PRO241、Anti-PRO284、Anti-PRO331、Anti-PRO354、Anti-PRO355、Anti-PRO533、Anti-PRO541、Anti-PRO725、Anti-PRO937、Anti-PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗考虑-可以产生 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。例如,人源化抗体可以是抗体片段,例如Fab,任选与一种或多种细胞毒剂偶联以产生免疫偶联物。或者,人源化抗体可以是完整的抗体,例如完整的 IgG1 抗体。

作为人源化的替代方案,可以产生人抗体。例如,现在可以生产转基因动物(例如,小鼠),在免疫后,这些动物能够在不产生内源性免疫球蛋白的情况下产生完整的人类抗体库。例如,已经描述了抗体重链结合区 (JH) 在嵌合和种系突变小鼠中导致内源性抗体产生的完全抑制。将人种系免疫球蛋白基因阵列转移到这种种系突变小鼠中导致在抗原攻击后产生人抗体。参见例如 Jakobovits 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀90:2551 (1993); Jakobovits 等人,自然,362:255-258(1993); Brüggemann 等人,免疫年。7:33 (1993);美国专利号 5,545,806、5,569,825、5,591,669(均授予 GenPharm); 5,545,807;和 WO 97/17852。

或者,噬菌体展示技术(McCafferty 等人,自然348:552-553 [1990]) 从未免疫供体的免疫球蛋白可变结构域 (V) 基因库中体外生成人抗体和抗体片段。根据这种技术,抗体 V 结构域基因被克隆到来自丝状噬菌体(例如 M13 或 fd)的主要或次要外壳蛋白基因中,并在抗体-噬菌体颗粒的表面上展示为功能性抗体片段。因为丝状颗粒含有噬菌体基因组的单链 DNA 拷贝,基于抗体功能特性的选择也将导致选择编码表现出这些特性的抗体的基因。因此,噬菌体模仿了 B 细胞的某些特性。噬菌体展示可以以多种形式进行,例如,Johnson, Kevin S 和 Chiswell, David J. 对此进行了讨论。结构生物学的当前观点3:564-571 (1993)。多种来源的 V 基因片段可用于噬菌体展示。克拉克森等人,自然,352:624-628 (1991) 从源自免疫小鼠脾脏的小型 V 基因随机组合文库中分离出一组不同的抗恶唑酮抗体。可以构建来自未免疫的人类供体的 V 基因库,并分离针对多种抗原(包括自身抗原)的抗体,基本上遵循 Marks 等人描述的方法。遵循所描述的技术。J.摩尔。生物学。222:581-597 (1991), o Griffith 等人,EMBÓ J.12:725-734 (1993)。另见美国专利号 5,565,332 和 5,573,905。

如上所述,活化的 B 细胞也可以在体外产生人抗体(参见美国专利号 5,567,610 和 5,229,275)。

4. 抗体片段

在某些情况下,使用抗体片段而不是完整抗体具有优势。较小尺寸的碎片允许快速移除并且可以导致更好地接近实体瘤。

已经开发了几种生产抗体片段的技术。传统上,这些片段是通过完整抗体的蛋白水解消化获得的(参见,例如,Morimoto 等人,生化与生物物理方法杂志24:107-117(1992);和布伦南等人,科学,229:81(1985 年))。然而,这些片段现在可以通过重组宿主细胞直接产生。可以表达和分泌Fab、Fv和ScFv抗体片段大肠杆菌, 允许轻松准备大量这些片段。抗体片段可以从上面讨论的抗体噬菌体文库中分离出来。或者,可以直接从中获得 Fab'-SH 片段大肠杆菌并化学耦合到 F(ab')。2个片段(Carter 等人,生物技术10:163-167(1992))。根据另一种方法,F(ab′)2个片段可以直接从重组宿主细胞培养物中分离出来。 Fab 和 F(ab′)2个美国专利号 5,869,046 中描述了一种体内半衰期延长的片段,其包含与表位残基结合的拯救受体。用于制备抗体片段的其他技术对于本领域技术人员而言将是显而易见的。选择的抗体是单链 Fv 片段 (scFv)。参见WO 93/16185;美国专利号 5,571,894;和美国专利号 5,587,458。 Fv 和 sFv 是唯一具有完整结合位点但缺乏恒定区的物种;因此,它们适用于体内使用期间的低非特异性结合。可以对 sFv 融合蛋白进行工程改造,使效应蛋白融合到 sFv 的氨基或羧基末端。看抗体工程, ed. Borrebaeck, 同上。抗体片段也可以是“线性抗体”,例如例如,如美国专利号 5,641,870 中所述。此类线性抗体片段可以是单特异性或双特异性的。

5.双特异性抗体

双特异性抗体是对至少两个不同表位具有结合特异性的抗体。示例性双特异性抗体可以结合 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760 的两个不同表位。 PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23,如本文所述。其他类似抗体可结合 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO43268 位点与另一种蛋白质的结合位点。或者,Anti-PRO194、Anti-PRO220、Anti-PRO241、Anti-PRO284、Anti-PRO331、Anti-PRO354、Anti-PRO355、Anti-PRO533、Anti-PRO541、Anti-PRO725、Anti-PRO937、Anti-PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 臂可以与结合白细胞上触发分子的臂组合,例如B. T 细胞受体分子(如 CD3)或 IgG(FcγR)的 Fc 受体,如 FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)和 FcγRIII(CD16),以调节 PRO194、PRO220 中的细胞防御机制 目的和定位PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4330,6, PRO4430,6, 单元, PRO4430,6 PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370。双特异性抗体还可用于在表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、Express PRO1555、 PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO92165、PRO85143 PRO1、PRO07、PRO20 肽。 PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760-、PRO1787-、PRO1868-、PRO4326-、PRO4336 -, PRO4400-, PRO6003-, PRO6094-, PRO6244-, PRO9820-, PRO9828-, PRO10274-, PRO16090-, PRO19644-, PRO21340-, PRO92165-, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 绑定臂和绑定到的臂细胞毒剂(例如肥皂草素、抗干扰素-α、长春花生物碱、蓖麻毒素 A 链、甲氨蝶呤或放射性同位素半抗原)。双特异性抗体可以制备为完整抗体或抗体片段(例如 F(ab')2个双特异性抗体)。

WO 96/16673 描述了一种抗 ErbB2/抗 FcγRIII 双特异性抗体,美国专利号 5,837,234 描述了一种抗 ErbB2/抗 FcγRI 双特异性抗体。在 WO98/02463 中显示了一种双特异性抗 ErbB2/Fcα 抗体。美国专利号 5,821,337 教导了一种抗 ErbB2/抗 CD3 双特异性抗体。

产生双特异性抗体的方法是本领域已知的。传统的全长双特异性抗体的生产是基于两对免疫球蛋白轻链和重链的共表达,两条链具有不同的特异性(Millstein et al.,自然305:537-539(1983))。由于免疫球蛋白重链和轻链的随机多样性,这些杂交瘤(四链体)产生了 10 种不同抗体分子的潜在混合物,其中只有一种具有正确的双特异性结构。通常通过亲和层析步骤纯化正确的分子非常麻烦,而且产品收率很低。 WO 93/08829 和 Traunecker 等人描述了类似的方法。描述。EMBÓ J.10:3655-3659(1991)。

根据另一种方法,将具有所需结合特异性(抗体-抗原结合位点)的抗体可变域融合到免疫球蛋白恒定域的序列。优选地,融合是与包含至少部分铰链的Ig重链恒定域融合,CH2年H3个地区。优选的是,包含轻链结合所必需的位点的第一重链恒定区(CHI)存在于至少一个融合物中。将编码免疫球蛋白重链和(如果需要)免疫球蛋白轻链融合物的 DNA 插入单独的表达载体中,并共转染到合适的宿主细胞中。当用于构建的三个多肽链的不等比例提供所需双特异性抗体的最佳产量时,这在调整三个多肽片段的相互比例方面提供了更大的灵活性。然而,当以相等比率表达至少两条多肽链导致高产率或当该比率不显着影响性能时,可以将两条或所有三个多肽链的编码序列插入单个表达载体中。所需的字符串组合。

本发明提供了双特异性抗体,其由在一个臂上具有第一结合特异性的杂交免疫球蛋白重链和在另一臂上的杂交免疫球蛋白重链-轻链对(提供第二结合特异性)组成。已发现这种不对称结构有助于将所需的双特异性化合物与不需要的免疫球蛋白链组合分离,因为免疫球蛋白轻链仅存在于双特异性分子的一半中,提供了一种简单的分离方式。这种方法在 WO 94/04690 中有所描述。有关双特异性抗体生成的更多详细信息,请参见例如 Suresh 等人,酶学方法121:210(1986 年)。

根据美国专利号 5,731,168 中描述的另一种方法,可以修饰一对抗体分子之间的界面以使从重组细胞培养物中回收的异二聚体的百分比最大化。首选接口至少涉及 C 的一部分H3 域。在此过程中,第一个抗体分子界面上的一个或多个小氨基酸侧链被较大的侧链(例如酪氨酸或色氨酸)取代。通过用较小的氨基酸侧链(例如丙氨酸或苏氨酸)替换大氨基酸侧链,在第二抗体分子的界面处产生与大侧链相同或相似大小的补偿性“空隙”。这提供了一种机制来增加异二聚体的产量,而不是其他不需要的终产物,如同二聚体。

双特异性抗体包括交联或“异源偶联”抗体。例如,杂合物中的一种抗体可以与抗生物素蛋白偶联,另一种与生物素偶联。这些抗体已被建议,例如,将免疫系统细胞靶向不需要的细胞(美国专利号 4,676,980)和治疗 HIV 感染(WO 91/00360、WO 92/200373 和 EP 03089)。可以使用任何合适的交联技术制备异源偶联抗体。合适的交联剂是本领域公知的并且在美国专利No.4,676,980中与多种交联技术一起被描述。

文献中也描述了从抗体片段产生双特异性抗体的技术。例如,双特异性抗体可以通过化学连接产生。布伦南等。科学229:81 (1985) 描述了一种方法,其中完整抗体被蛋白水解切割以产生 F(ab')。2个片段 这些片段在二硫醇络合剂亚砷酸钠存在下被还原,以稳定邻位二硫醇并防止分子间二硫化物形成。然后将生成的 Fab' 片段转化为硫代硝基苯甲酸酯 (TNB) 衍生物。接下来,一种 Fab'-TNB 衍生物通过用巯基乙胺还原转化回 Fab'-硫醇,并与等摩尔量的另一种 Fab'-TNB 衍生物混合以形成双特异性抗体。产生的双特异性抗体可用作选择性固定化酶的试剂。

最近的进展促进了 Fab'-SH 片段的直接回收大肠杆菌, 它可以化学偶联形成双特异性抗体。沙拉比等人,成人 J. 医学。175:217-225 (1992) 描述了完全人源化双特异性 F(ab') 抗体的生产。2个分子。每个 Fab' 片段都是单独分泌的大肠杆菌并在体外进行靶向化学偶联,形成双特异性抗体。这样产生的双特异性抗体能够与过表达 ErbB2 受体的细胞和正常人 T 细胞结合,并引发针对人乳腺肿瘤靶点的人细胞毒性淋巴细胞裂解活性。还描述了直接从重组细胞培养物中产生和分离双特异性抗体片段的各种技术。例如,已经使用亮氨酸拉链制备了双特异性抗体。 Kostelny 等人,J.免疫学。148(5):1547-1553 (1992)。来自 Fos 和 Jun 蛋白的亮氨酸拉链肽通过基因融合连接到两种不同抗体的 Fab' 部分。抗体同二聚体在铰链区被还原形成单体,然后再氧化形成抗体异二聚体。该方法也可用于生产抗体同型二聚体。霍林格等人。描述了“双体”技术,全氯乙烯美国国家学院军刀90:6444-6448 (1993) 提供了另一种产生双特异性抗体片段的机制。这些片段包括一个 VH与 V 有关大号通过太短的链接器,不允许在同一链中的两个域之间配对。因此,VH和V大号片段的结构域被迫与互补的 V 配对大号和VH另一个片段的结构域,产生两个抗原结合位点。还报道了使用单链 Fv (sFv) 二聚体制备双特异性抗体片段的另一种策略。参见 Gruber 等人,J.免疫学,152:5368 (1994)。

考虑了具有多于二价的抗体。例如,可以产生三特异性抗体。图特等人,J.免疫学。147:60(1991)。

6. 异源偶联抗体

异源偶联抗体也在本发明的范围内。异源偶联抗体由两个共价连接的抗体组成。此类抗体已被提出,例如,将免疫系统细胞靶向不需要的细胞 [美国专利号 4,676,980] 和治疗 HIV 感染 [WO 91/00360; WO 92/200373; EP 03089]。预期可使用合成蛋白质化学中已知的方法,包括涉及交联剂的方法,在体外产生抗体。例如,可以使用二硫键交换反应或通过形成硫醚键来构建免疫毒素。用于该目的的合适试剂的实例包括亚氨基硫醇盐和4-巯基丁亚胺酸甲酯以及例如在美国专利No.4,676,980中描述的那些。

7. 多价抗体

多价抗体可以比二价抗体更快地被表达抗体结合的抗原的细胞内化(和/或分解代谢)。本发明的抗体可以是具有三个或更多个抗原结合位点的多价抗体(IgM类除外)(例如,四价抗体),其可以通过编码链抗体多肽的核酸的重组表达容易地产生。多价抗体可包括二聚化结构域和三个或更多抗原结合位点。优选的二聚化结构域包含(或由其组成)Fc区或铰链区。在这种情况下,抗体包含 Fc 区和 Fc 区氨基末端的三个或更多抗原结合位点。本文优选的多价抗体包含(或由以下组成)三个至约八个,但优选四个抗原结合位点。多价抗体包含至少一条多肽链(并且优选两条多肽链),其中多肽链包含两个或更多个可变结构域。例如,多肽链可包含VD1-(X1)。北方-VD2-(X2)北方-Fc,其中VD1为第一可变域,VD2为第二可变域,Fc为Fc区的多肽链,X1和X2代表氨基酸或多肽,n为0或1。例如,多肽Ia链可包含:VH CH1柔性接头VH CH1 Fc区链;或 VH-CH1-VH-CH1-Fc 区链。本文的多价抗体优选还包含至少两个(优选四个)轻链可变结构域多肽。例如,本文的多价抗体可包含约两个至约八个轻链可变结构域多肽。本文考虑的轻链可变结构域多肽包含轻链可变结构域和任选地进一步包含CL结构域。

8.技术效果器功能

可能需要在效应子功能方面修饰本发明的抗体,例如以增强抗体的抗原依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)和/或补体依赖性细胞毒性(CDC)。这可以通过将一个或多个氨基酸取代引入抗体的 Fc 区来实现。或者或另外,可将半胱氨酸残基引入Fc区,从而允许在该区域形成链间二硫键。如此产生的同源二聚体抗体可能表现出增强的内化能力和/或增强的补体介导的细胞杀伤和抗体依赖性细胞毒性(ADCC)。参见 Caron 等人,J.Exp.Med。176:1191-1195 (1992) 和 Shopes, B.J.免疫学。148:2918-2922 (1992)。如 Wolff 等人所述,还可以使用异双功能交联剂制备具有增强抗肿瘤活性的同源二聚体抗体。描述,癌症研究53:2560-2565 (1993)。或者,可以构建具有双 Fc 区的抗体,因此可能具有增强的 ADCC 和补体裂解能力。见史蒂文森等人,反对-癌症药物设计3:219-230 (1989)。为了增加抗体的血清半衰期,可以将拯救受体结合表位掺入抗体(特别是抗体片段)中,例如美国专利号 5,739,277 中所述。如本文所用,术语“补救受体结合表位”是指来自 IgG 分子(例如,IgG1个, 免疫球蛋白2个, 免疫球蛋白3个o IgG4个), 它负责增加 IgG 分子的体内血清半衰期。

9. 免疫偶联物

本发明还涉及包含抗体的免疫偶联物,所述抗体与细胞毒剂例如化学治疗剂、生长抑制剂、毒素(例如细菌、真菌、植物或动物来源的酶活性毒素或其片段)反应或偶联放射性同位素(即放射性共轭物)。

先前已经描述了可用于产生此类免疫缀合物的化学治疗剂。可以使用的酶促活性毒素及其片段包括白喉 A 链、白喉毒素非结合活性片段、外毒素 A 链(来自铜绿假单胞菌), 蓖麻毒蛋白 A 链,相思豆毒蛋白 A 链,modecin A 链,α-八叠球菌蛋白,油桐蛋白质、地安蛋白、美洲商陆蛋白质(PAPI、PAPII 和 PAP-S),苦瓜抑制剂、Curcin、Crotin、皂草抑制剂、Gelonin、Mitogelin、Restrictocin、Fenomycin、Enomycin 和 Trichothecenes。大量放射性核素可用于生产放射性偶联抗体。包括例子212双,131我,131在,90后和和186关于。使用多种双功能蛋白偶联剂制备抗体-细胞毒剂偶联物,例如 N-琥珀酰亚胺-3-(2-吡啶二硫醇)丙酸酯 (SPDP)、亚氨基硫戊烷 (IT)、亚氨基酯的双功能衍生物(例如二甲基己二酰亚胺盐酸盐)、活性酯(如辛二酸二琥珀酰亚胺酯)、醛类(如戊二醛)、双叠氮基化合物(如双(对叠氮基苯甲酰基)己二胺)、双重氮衍生物(如双(对重氮苯甲酰基)乙二胺)、二异氰酸酯(如2,6-甲苯二异氰酸酯)和双活性氟化合物(如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,如 Vitetta 等人所述的蓖麻毒素免疫毒素。描述的是生产的。科学,238:1098(1987)。 Carbon-14-labeled 1-isothiocyanatenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaacetic acid (MX-DTPA) 是用于将放射性核苷酸与抗体结合的示例性螯合剂。参见 WO94/11026。

本文还考虑了抗体和一种或多种小分子毒素的缀合物,例如加利车霉素、美登木素生物碱、单端孢霉烯和 CC1065,以及这些毒素的表现出毒素活性的衍生物。

单宁和单宁

La invención proporciona Anti-PRO194、Anti-PRO220、Anti-PRO241、Anti-PRO284、Anti-PRO331、Anti-PRO354、Anti-PRO355、Anti-PRO533、Anti-PRO541、Anti-PRO725、Anti-PRO937、Anti-PRO1014 , 抗PRO1120, 抗PRO1182, 抗PRO1325, 抗PRO1382, 抗PRO1410, 抗PRO1555, 抗PRO1556, 抗PRO1760, 抗PRO1787, 抗PRO1868, 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗-PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗Anticuerpo PRO85143、anti-PRO1124、anti-PRO1026 或 anti-PRO23370(全长或片段)与一个或多个 matansinoid 分子连接。

美登木素生物碱是通过抑制微管蛋白聚合起作用的有丝分裂抑制剂。美登素首先从东非灌木中分离出来锯齿蟹(美国专利号 3,896,111)。后来发现某些微生物也产生美登木素生物碱,例如美登醇和 C-3 美登醇酯(美国专利号 4,151,042)。合成美登醇及其衍生物和类似物描述于例如美国专利号 4,137,230 ; 4,248,870; 4,256,746; 4,260,608; 4,265,814; 4,294,757; 4,307,016; 4,308,268; 4,308,269; 4,309,428; 4,313,946; 4,315,929; 4,317,821; 4,322,348; 4,331,598; 4,361,650; 4,364,866; 4,424,219; 4,450,254; 4,362,663;和 4,371,533,其公开内容通过引用明确并入本文。

美登木素抗体偶联物

为了提高其治疗指数,美登素和美登木素生物碱已与特异性结合肿瘤细胞抗原的抗体结合。含有美登木素生物碱的免疫偶联物及其治疗用途描述于例如美国专利号 5,208,020、5,416,064 和欧洲专利 EP 0 425 235 B1 中,其公开内容通过引用明确并入本文。刘等人。全氯乙烯美国国家学院军刀93:8618-8623 (1996) 描述了包含称为 DM1 的美登木素生物碱的免疫偶联物,其连接到针对人结直肠癌的 C242 单克隆抗体。发现该偶联物对培养的结肠癌细胞具有高度细胞毒性,并在体内肿瘤生长试验中显示出抗肿瘤活性。查里等人,癌症研究52:127-131 (1992) 描述了免疫偶联物,其中美登木素生物碱通过二硫化物接头偶联至鼠 A7 抗体,其结合人结肠癌细胞系中的抗原,或另一种鼠 TA 单克隆抗体。 1,与 HER-2/neu 致癌基因结合。 TA细胞毒性。在表达 3×10 的人乳腺癌细胞系 SK-BR-3 上体外测试了 1-美登素偶联物5个每个细胞的 HER-2 表面抗原。药物偶联物达到了与游离美登奈德药物相似的细胞毒性水平,可以通过增加每个抗体分子的美登木素生物碱分子的数量来增加。 A7-美登木素生物碱偶联物在小鼠中表现出低全身细胞毒性。

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370 Konjugationen von Anticuerpo-Maitansinoide (Immunkonjugationen)

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 在抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗 PRO19644、抗 PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 Un promedio de 3-4 moléculas de maitansinoide conjugadas por molécula de anticuerpo ha demostrado eficacia para mejorar la citotoxicidad de las células diana sin afectar negativamente la función la solubilidad del anticuerpo, anque se esperaria que incluso una molécula de toxina/anticito mejoidore con respekt al uso de anticuerpo desnudo。 Los maitansinoides son bien conocidos en la técnica y pueden sintetizarse mediante técnicas conocidas o aislarse de fuentes naturales。 Los Maitansinoides adecuados se beschrieben, por ejemplo, en las patentes de EE.UU.编号5.208.020 y en las demás patentes y publicaciones distintas de las patentes mencionadas anteriormente。 Los Maitansinoides Preferredos Son Maitansinol y Análogos de Maitansinol Modificados en el anillo aromático o en otras posiciones de la molécula de maitansinol, Tales como diversos ésteres de maitansinol。

本领域已知有许多连接基团可用于制备抗体-美登木素生物碱偶联物,包括例如美国专利号 5,208,020 或欧洲专利 0 425 235 B1 和 Chari 等人中描述的那些。被描述癌症研究52:127-131 (1992)。连接基团包括二硫化物基团、硫醚基团、酸不稳定基团、光不稳定基团、肽酶不稳定基团或酯酶不稳定基团,如上述专利中所述,优选二硫化物和硫醚基团。

可以使用多种双功能蛋白偶联剂制备抗体-美登木素偶联物,例如 N-琥珀酰亚胺 3-(2-吡啶二硫代)丙酸酯 (SPDP)、琥珀酰亚胺 4-(N-马来酰亚胺甲基)环己烷-1-羧酸酯、亚氨基硫杂环戊烷 (IT) ,双功能亚胺酯衍生物(如己二酰亚胺盐酸盐),活性酯(如辛二酸二琥珀酰亚胺酯),醛类(如戊二醛),双叠氮基化合物(如双(对叠氮基苯甲酰基)己二胺),双重氮衍生物(如双-(p -重氮苯甲酰基)乙二胺)、二异氰酸酯(如甲苯-2,6-二异氰酸酯)和双活性氟化合物(如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。特别优选的偶联剂包括 N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP) (Carlsson et al.,生化j173:723-737 [1978]) 和 N-琥珀酰亚胺基 4-(2-吡啶硫基)戊酸酯 (SPP) 以提供二硫键。

根据连接的类型,接头可以在不同位置连接至美登木素生物碱分子。例如,可以使用常规偶联技术通过与羟基反应形成酯键。该反应可发生在具有羟基的C-3位、经羟甲基修饰的C-14位、经羟基修饰的C-15位和具有羟基的C-20位。该键在美登醇或美登醇类似物的 C-3 位形成。

加利车霉素

另一种感兴趣的免疫缀合物包括抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗- PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026、或与一种或多种加利车霉素分子缀合的抗 PRO23370 抗体。加利车霉素抗生素家族能够在亚皮摩尔浓度下产生双链 DNA 断裂。对于加利车霉素家族缀合物的制备,参见美国专利号 5,712,374、5,714,586、5,739,116、5,767,285、5,770,701、5,770,710、5,773,001、5,877,296(均授予 American Cyanamid Company)。可以使用的加利车霉素的结构类似物包括?一、但不限于1个1个, A2个1个, A3个1个, N-乙酰基-γ1个1个, PSAG y θ1个1个(欣曼等人,癌症研究53:3336-3342 (1993), Lode y col.,癌症研究58:2925-2928 (1998) 和上述美国氰胺的美国专利)。另一种可以与抗体偶联的抗肿瘤药物是 QFA,它是一种抗叶酸剂。加利车霉素和 QFA 都具有细胞内作用位点,不易穿过质膜。因此,细胞通过抗体介导的内化吸收这些药物会大大增加它们的细胞毒性作用。

其他细胞毒性药物

与抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗-PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332 ,防PRO4346,防PRO4400,防PRO6003,防PRO6094,防PRO6244,防PRO9820,防PRO9828,防PRO10274,防PRO16090,防PRO19644,防PRO21340,防松防本发明的 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体包括 BCNU、链脲佐菌素、长春新碱和 5-氟尿嘧啶,这些药物家族统称为 LL-E33288-复合物,描述于美国专利专利号 5,053,394、5,770,710 和埃斯培霉素(美国专利号 5,877,296)。

可以使用的酶促活性毒素及其片段包括白喉 A 链、白喉毒素非结合活性片段、外毒素 A 链(来自铜绿假单胞菌), 蓖麻毒蛋白 A 链,相思豆毒蛋白 A 链,modecin A 链,α-八叠球菌蛋白,油桐蛋白质、地安蛋白、美洲商陆蛋白质(PAPI、PAPII 和 PAP-S),苦瓜抑制剂、Curcin、Crotin、皂草抑制剂、Gelonin、Mitogelin、Restrictocin、Fenomycin、Enomycin 和 Trichothecenes。参见,例如,1993 年 10 月 28 日公布的 WO 93/21232。

本发明还提供了在抗体和具有核酸溶解活性的化合物(例如核糖核酸酶或DNA核酸内切酶如脱氧核糖核酸酶;DNase)之间形成的免疫缀合物。

为了选择性地破坏肿瘤,抗体可以包含高放射性原子。多种放射性同位素可用于制备放射性偶联物:抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗- PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868 , 抗PRO4326, 抗PRO4332, 抗PRO4346, 抗PRO4400, 抗PRO6003, 抗PRO6094, 抗PRO6244, 抗PRO9820, 抗PRO9828, 抗PRO10274, 抗PRO16090, 抗PRO19644, 抗- PRO21340、抗 PRO92165、抗 PRO85143、抗 PRO124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体。例子在211, 我131, 我125, Y90后, 参考186, 参考188, 史密斯153, 毕212, 聚酰胺32, 铅212和 Lu 的放射性同位素。当用于诊断时,偶联物可包含用于闪烁扫描研究的放射性原子,例如 tc99米或者我123,或用于核磁共振成像 (NMR)(又名磁共振成像,mri)的自旋标签,例如 iodine-123、iodine-131、indium-111、fluorine-19、carbon-13、nitrogen-15、氧-17 、钆、锰或铁。

可以以已知方式将放射性标记或其他标记掺入缀合物中。例如,肽可以生物合成或可以使用适当的氨基酸前体通过化学氨基酸合成来合成,例如含有氟-19代替氢。像 tc 这样的标签99米或者我123, 参考186, 参考188并在111它可以通过肽中的半胱氨酸残基连接。钇 90 可以通过赖氨酸残基连接。 IODOGEN 方法(Fraker 等人 (1978) Biochem. Biophys. Res. Commun. 80:49-57 可用于掺入碘 123。“免疫闪烁扫描中的单克隆抗体”(Chatal,CRC Press 1989)描述了其他程序细节 。

可以使用多种双功能蛋白偶联剂制备抗体-细胞毒剂偶联物,例如 N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate (SPDP)、succinimidyl-4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1-carboxylate、亚氨基硫杂环戊烷(IT)、双功能亚胺酯衍生物(如己二酰亚胺盐酸盐)、活性酯(如辛二酸二琥珀酰亚胺酯)、醛类(如戊二醛)、双叠氮基化合物(如双(对叠氮基苯甲酰基)己二胺)、衍生物双重氮化合物(如如双(对重氮苯甲酰基)乙二胺)、二异氰酸酯(如甲苯-2,6-二异氰酸酯)和双活性氟化合物(如1,5-二氟-2,4-二硝基苯)。例如,如 Vitetta 等人所述的蓖麻毒素免疫毒素。描述的是生产的。科学238:1098(1987)。 Carbon-14-labeled 1-isothiocyanatenzyl-3-methyldiethylenetriaminepentaacetic acid (MX-DTPA) 是用于将放射性核苷酸与抗体结合的示例性螯合剂。参见 WO94/11026。接头可以是促进细胞毒性药物释放到细胞中的“可裂解接头”。例如,酸不稳定接头、肽酶敏感接头、光不稳定接头、二甲基接头或含二硫化物的接头(Chari 等人,癌症研究52:127-131(1992);美国专利号 5,208,020)。

或者,融合蛋白包含抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗-PRO1014、抗-PRO1120、抗-PRO1182、抗-PRO1325、抗-PRO1382、抗-PRO1410、抗-PRO1555、抗-PRO1556、抗-PRO1760、抗-PRO1787、抗-PRO1868、抗-PRO4326、抗- PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026或抗PRO23370抗体和细胞毒剂可以通过例如重组技术或肽合成来产生。 DNA的长度可包括编码缀合物的两个部分的相应区域,所述两个部分相邻或被编码不破坏缀合物所需特性的接头肽的区域隔开。

本发明提供抗体可以与“受体”(例如链霉亲和素)缀合以用于先前的肿瘤选择,其中将抗体-受体缀合物施用于患者,随后使用使用从循环中去除未结合的缀合物一种洗涤剂。然后施用与细胞毒剂(例如放射性核苷酸)缀合的“配体”(例如抗生物素蛋白)。

10. 免疫脂质体

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗Die-PRO1124-、抗PRO1026-或抗PRO23370本文所述的抗体也可以配制成免疫脂质体。 “脂质体”是由各种类型的脂质、磷脂和/或表面活性剂组成的小囊泡,可用于将药物递送至哺乳动物。脂质体成分通常排列成双层结构,类似于生物膜的脂质组装。含有抗体的脂质体通过本领域已知的方法制备,如 Epstein 等人所述。描述,全氯乙烯美国国家学院军刀82:3688 (1985);万杰等人,全氯乙烯美国国家学院军刀77:4030(1980);美国专利号 4,485,045 和 4,544,545;和 WO 97/38731,1997 年 10 月 23 日公开。美国专利第 5,013,556 号中描述了具有改进循环时间的脂质体。

特别有用的脂质体可以通过反相蒸发法用包含磷脂酰胆碱、胆固醇和PEG衍生的磷脂酰乙醇胺(PEG-PE)的脂质组合物产生。脂质体通过确定孔径的过滤器挤出,以产生具有所需直径的脂质体。如 Martin 等人所述,本发明抗体的 Fab' 片段可与脂质体缀合。描述,J.生物学。化学257:286-288 (1982) 关于二硫化物交换反应。任选地,化疗剂包含在脂质体中。参见 Gabizon 等人,J. Nationale Krebsinstitut。81(19):1484 (1989)。

11. 药物抗体组合物

特异性结合PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO4326322 PRO84 -PRO43的抗体, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽,以及本文所鉴定的其他分子,通过上述筛选试验进行鉴定。它可以以药物组合物的形式给药,用于治疗各种疾病。

如果 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO184448、PRO0、PRO4 PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 多肽在细胞内,全抗体作为抑制剂,优选内化抗体。然而,脂质转染或脂质体也可用于将抗体或抗体片段递送到细胞中。当使用抗体片段时,优先选择特异性结合靶蛋白结合域的较小抑制片段。例如,基于抗体的可变区序列,可以设计保留结合靶蛋白序列能力的肽分子。这些肽可以化学合成和/或通过重组 DNA 技术生产。参见,例如,Marasco 等人,全氯乙烯美国国家学院军刀90:7889-7893 (1993)。本文的制剂还可以根据所治疗的特定适应症的需要包含多于一种的活性成分,优选那些具有不会对彼此产生不利影响的互补作用的活性成分。或者或另外,组合物可包含增强其功能的试剂,例如细胞毒剂、细胞因子、化学治疗剂或抗生长剂。这样的分子适当地以对预期目的有效的量组合存在。

活性物质也可以封装在微胶囊中,例如通过凝聚技术或通过界面聚合生产,例如羟甲基纤维素或明胶微胶囊或聚(甲基丙烯酸甲酯)微胶囊,在胶体药物递送系统(例如脂质体、白蛋白微球、微乳液、纳米颗粒和纳米胶囊)或粗乳液中。这些技术在 Remington 的制药科学, 多于。

用于体内给药的制剂必须是无菌的。这很容易通过无菌过滤膜过滤来实现。

可制成缓释制剂。持续释放制剂的合适例子包括含有抗体的固体疏水聚合物的半透性基质,该基质是成形制品的形式,例如B. 薄膜或微胶囊。缓释基质的例子包括聚酯、水凝胶(例如聚(2-羟乙基甲基丙烯酸酯)或聚(乙烯醇))、聚丙交酯(美国专利 L-谷氨酸、不可降解的乙烯-乙酸乙烯酯、可降解的乳酸-乙醇酸共聚物如 LUPRON DEPOT TM(由乳酸-乙醇酸和醋酸亮丙瑞林的共聚物组成的可注射微球)和聚-D-(-)-3-羟基丁酸,而聚合物如乙酸乙烯酯乙烯基和乳酸乙醇酸允许释放分子超过 100 天,某些水凝胶蛋白释放的时间更短。如果封装的抗体在体内保留很长时间,暴露在 37 °C 的水分中会导致它们变性或聚集,从而导致损失生物活性和免疫原性的可能变化。稳定化的合理策略可能因所涉及的机制而异。例如,如果聚集的机制被证明是通过硫代二硫化物交换形成分子间 S-S 键,则可以通过修饰巯基残基来实现稳定化,冻结- 从酸溶液中干燥,控制水分含量,使用适当的添加剂,并设计特定的聚合物基体。作曲

G. 抗 PRO194、抗 PRO220、抗 PRO241、抗 PRO284、抗 PRO331、抗 PRO354、抗 PRO355、抗 PRO533、抗 PRO541、抗 PRO725、抗 PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗Anticuerpos PRO85143、Anti-PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗PRO1124、抗PRO1026或抗PRO23370抗体本发明对神经系统疾病具有多种治疗和/或诊断用途;心血管、内皮或血管生成疾病;免疫系统疾病;肿瘤疾病;胚胎发育或致死率紊乱,或代谢异常。例如抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗 PRO1124、抗 PRO1026 或抗 PRO23370 抗体可用于 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325 的诊断分析. Pro1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO1868、PRO4326、PRO4332、PRO4346、PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO,例如通过检测其表达(以及某些情况下的差异表达)在特定细胞、组织或血清中。可以使用本领域已知的各种诊断测定技术,例如竞争性结合测定、直接或间接夹心测定以及在异相或均相中进行的免疫沉淀测定[Zola,单克隆抗体:技术手册, CRC Press, Inc. (1987) pp. 147-158]。诊断分析中使用的抗体可以用可检测部分标记。可检测实体必须能够直接或间接产生可检测信号。例如,可检测实体可以是放射性同位素,例如3个H,14C,32如果,35所以125I,荧光素或化学发光化合物,如异硫氰酸荧光素、罗丹明或荧光素,或酶,如碱性磷酸酶、β-半乳糖苷酶或辣根过氧化物酶。可以使用本领域已知的用于将抗体与可检测实体缀合的任何方法,包括 Hunter 等人描述的那些。描述的程序。自然,144:945(1962 年);大卫等人,生物化学,13:1014 (1974);疼痛等人,J.免疫学。打。,40:219(1981);和尼格伦,J.组织化学。和细胞化学,30:407(1982)。

抗PRO194、抗PRO220、抗PRO241、抗PRO284、抗PRO331、抗PRO354、抗PRO355、抗PRO533、抗PRO541、抗PRO725、抗PRO937、抗PRO1014、抗PRO1120、抗PRO1182、抗PRO1325、抗PRO1382、抗PRO1410、抗PRO1555、抗PRO1556、抗PRO1760、抗PRO1787、抗PRO1868、抗PRO4326、抗PRO4332、抗PRO4346、抗PRO4400、抗PRO6003、抗PRO6094、抗PRO6244、抗PRO9820、抗PRO9828、抗PRO10274、抗PRO16090、抗PRO19644、抗PRO21340、抗PRO92165、抗PRO85143、抗丢失 Anticuerpos PRO1124、Anti-PRO1026 或 Anti-PRO23370 werden zur Reinigung von PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、verwendet。 PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 or PRO23370 polypeptides aus rekombinanter cultivo celular o fuentes naturales。 En este process, los anticuerpos contra PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1846327 PRO184632 , PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370 se inmovilizan en un soporte adecuado o una resina de filtro Sephadex papel, utilizando métodos bien conocidos en la técnica。 Luego, el anticuerpo inmovilizado se pone en contacto con una muestra que contiene PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO14510, PRO1 PRO PRO1556, PRO1760 , PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 o PRO23370, y luego se purifica el POLIPEPTIDO, y luego se purifica el polypéptido lavado con un solvente adecuado que eliminará sustancialmente todo el material de la muestra außer PRO194, PRO220, PRO241, PRO284, PRO331, PRO354, PRO355, PRO533, PRO541, PRO725, PRO937, PRO1014, PRO11820 , PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO191344, PRO21344, PRO191344 unido al anticuerpo inmovilizado。 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO155565 PRO1555, PRO1555, PRO1555 PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO103260, PRO103260, PRO103260, PRO103260, PRO103264

以下实施例仅用于说明目的,并不旨在以任何方式限制本发明的范围。

本文引用的所有专利和参考书目均​​通过引用整体并入本文。

例子

除非另有说明,否则根据制造商的说明使用实施例中提到的市售试剂。这些细胞的来源,在以下实施例和整个说明书中由 ATCC 登录号标识,是美国典型培养物保藏中心,弗吉尼亚州马纳萨斯。

示例 1

检测细胞外结构域同源性以鉴定新多肽和编码它们的 cDNA

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括公共数据库(例如 Dayhoff、GenBank)和专有数据库(例如 LIFESEQ™、Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)。使用 BLAST 或 BLAST-2 软件进行搜索(Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996))将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高的比较,不编码已知蛋白质,被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)组装成共识 DNA 序列. . .

使用此细胞外域同源性筛选,相对于使用 Phrap 识别的其他 EST 序列组装了共有 DNA 序列。此外,获得的 DNA 共有序列经常(但不总是)通过使用 BLAST 或 BLAST-2 和 Phrap 的重复循环来扩展,以使用上面讨论的 EST 序列来源尽可能地扩展共有序列。

基于如上所述获得的共有序列,合成寡核苷酸并用于通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库,并将它们用作探针以生成 PRO-分离物多肽编码序列的全长克隆.正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议, 与 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

示例 2

通过淀粉酶检测分离 cDNA 克隆

1. 寡聚 dT 引物 cDNA 文库的制备

使用来自 Invitrogen, San Diego, California (Fast Track 2) 的试剂和方案从感兴趣的人体组织中分离出 mRNA。该 RNA 用于使用马里兰州盖瑟斯堡 Life Technologies(Super Script Plasmid System)的试剂和方案在 pRK5D 载体中生成 oligo-dT-primed cDNA 文库。在这个过程中,双链 cDNA 被分选到大于 1000 bp,SalI/NotI 连接的 cDNA 被克隆到 XhoI/NotI 切割载体中。 pRK5D 是一种克隆载体,具有一个 sp6 转录起始位点,后跟一个位于 XhoI/NotI cDNA 克隆位点之前的 SfiI 限制酶位点。

2. 随机引物 cDNA 文库制备

生成二级 cDNA 文库以优先代表初级 cDNA 克隆的 5' 端。 Sp6 RNA 是从初级文库(如上所述)生成的,该 RNA 用于使用 Life Technologies 试剂和方案(Super Script Plasmid System,如上所述)在 pSST-AMY.0 载体中随机生成先前生成的 cDNA 文库,以产生 )。在这个过程中,双链 cDNA 被分选到 500-1000 bp,直接连接到 NotI,用 SfiI 消化并克隆到 SfiI/NotI 消化的载体中。 pSST-AMY.0是一个克隆载体,在cDNA克隆位点之前有一个酵母醇脱氢酶启动子和小鼠淀粉酶序列(没有分泌信号的成熟序列),后面是淀粉酶终止子,酵母醇脱氢酶,克隆后网站。因此,克隆到该载体中并与淀粉酶序列框内融合的 cDNA 将导致淀粉酶从适当转染的酵母菌落中分泌。

3. 转型与认可

将上述第 2 段中描述的文库中的 DNA 在冰上冷藏,并向其中添加电感受态 DH10B 细菌(Life Technologies,20 毫升)。然后按照制造商的建议对细菌和载体的混合物进行电穿孔。随后,加入SOC培养基(Life Technologies,1ml)并将混合物在37℃孵育30分钟。然后将转化体接种到 20 个含有氨苄青霉素的标准 150mm LB 平板上并孵育 16 小时 (37°C)。使用标准方案,例如,从平板上刮下阳性菌落并从细菌沉淀中分离 DNA。 CsCl 梯度。然后在以下酵母方案中运行纯化的 DNA。

酵母方法分为三类:(1)用质粒/cDNA 组合载体转化酵母; (2) 产淀粉酶酵母克隆的检测与分离; (3) 直接从酵母菌落中对插入片段进行 PCR 扩增,并纯化用于测序和后续分析的 DNA。

使用的酵母菌株是 HD56-5A (ATCC-90785)。该菌株具有以下基因型:MAT alpha、ura3-52、leu2-3、leu2-112、his3-11、his3-15、MAL+, 联合会+, 加仑+.优选地,可以使用具有缺陷的翻译后途径的酵母突变体。此类突变体可能在 sec71、sec72、sec62 处具有易位缺陷等位基因,最优选截短的 sec71。或者,破坏这些基因正常功能的拮抗剂(包括反义核苷酸和/或配体)可能靶向参与该翻译后信号通路的其他蛋白质(例如,SEC61p、SEC72p、SEC62p、SEC63p、TDJ1p 或 SSA1p-4 - p)或这些蛋白质的络合也可优先与表达淀粉酶的酵母结合使用。

转化是根据 Gietz 等人进行的。描述的协议执行,酸核。牛肉。,20:1425 (1992)。然后将转化的细胞从琼脂接种到 YEPD 复合培养基肉汤 (100 ml) 中,并在 30°C 下培养过夜。 YEPD 肉汤的制备如 Kaiser 等人所述。描述制造。酵母遗传学方法,冷泉港出版社,冷泉港,纽约,p。 207(1994)。然后将过夜培养物稀释至大约 2×106个细胞/ml(约 OD600= 0.1) 在新鲜的 YEPD 肉汤 (500 mL) 中并以 1 × 107细胞/ml(约 OD60=0,4-0,5)。

然后通过将细胞转移到 Sorval GS3 转子中的 GS3 转子烧瓶中以 5000 rpm 5 分钟收获细胞并准备​​转化,弃去上清液,重悬于无菌水中并在 Beckman GS 中以 3500 rpm rpm 重新引入 50 个 Falcon 管中-6KR离心机。弃去上清液,然后用 LiAc/TE(10 ml,10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA pH 7.5,100 mM Li2个OOCCH3个) 并重新悬浮在 LiAc/TE (2.5 mL) 中。

通过将制备的细胞 (100 µl) 与新鲜变性的单链鲑鱼睾丸 DNA (Lofstrand Labs, Gaithersburg, MD) 混合并将 DNA(1 µg,体积 <10 µl)转化到微量离心管中来进行转化。将混合物短暂涡旋,然后加入 40% PEG/TE(600 µL、40% 聚乙二醇 4000、mM Tris-HCl、1mM EDTA、100mM Li2个OOCCH3个, pH 值 7.5)。轻轻混合该混合物并在 30°C 下振荡孵育 30 分钟。然后将细胞在 42°C 下热休克 15 分钟,并将反应管在微量离心机中以 12,000 rpm 离心 5-10 秒,倾析并悬浮于 TE(500 μL,10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA)中,重新悬浮pH 7.5),然后再次离心。然后将细胞在 TE (1 ml) 中稀释,并将等分试样 (200 µl) 铺展到先前在 150 mm 生长板 (VWR) 中制备的选择性培养基上。

或者,代替多个小反应,转化是使用单个大规模反应进行的,其中试剂的量相应地按比例缩放。

使用的选择性培养基是不含尿嘧啶的合成葡萄糖完全琼脂 (SCD-Ura),如 Kaiser 等人所述制备。描述,酵母遗传学方法,冷泉港出版社,冷泉港,纽约,p。 208-210 (1994)。转化体在 30°C 下生长 2-3 天。

通过在选择性培养基中加入红色淀粉来检测分泌淀粉酶的菌落。根据 Biely 等人的方法测量淀粉。描述了将红色染料 (Reactive Red-120, Sigma) 偶联的方法。肛门。生化,172:176-179 (1988)。将偶联淀粉以 0.15% (w/v) 的终浓度接种到 SCD-Ura 琼脂平板中,并用磷酸钾缓冲至 pH 7.0(50-100 mM 终浓度)。

挑取阳性菌落并将其接种到新鲜的选择性培养基(在 150 毫米培养皿中)以获得分离良好且可识别的单菌落。通过将红色淀粉直接掺入缓冲的 SCD-Ura 琼脂中来检测分离良好的淀粉酶分泌阳性单菌落。阳性菌落由它们降解淀粉的能力决定,在直接可视化的阳性菌落周围产生清晰的光晕。

4. 通过 PCR 扩增分离 DNA

当分离出阳性菌落时,用牙签挑出一部分并在 96 孔板中用无菌水 (30 µl) 稀释。此时,将阳性菌落冷冻并储存以供进一步分析或立即扩增。将等分试样的细胞 (5 µl) 用作 PCR 反应的模板,体积为 25 µl,其中包含: 0.5 µl Klentaq (Clontech, Palo Alto, CA); 4.0 µl 10mM dNTP (Perkin Elmer-Cetus); 2.5 µl Kentaq 缓冲液(Clontech); 0.25 µl 直接寡核苷酸 1; 0.25 µl 反向寡核苷酸 2; 12.5 升蒸馏水。正向寡核苷酸 1 的序列是:

(SEC-ID-Nr.: 81)

5'-TGTAAAACGACGGCCAGTTAAATAGACCTGCAATTATTAATCT公司-3'

反向寡核苷酸2的序列是:

(序列号:82)

5'-CAGGAAACAGCTATGACCACCTGCACACCTGCAAATCCAT-3'

然后如下进行PCR:

A。

变性

92 毕业,

5分钟

B.

3个周期:

变性

92 毕业,

30秒

侦察员

59 毕业,

30秒

更新

72 研究生,

60秒

C。

3个周期:

变性

92 毕业,

30秒

侦察员

57 毕业,

30秒

更新

72 研究生,

60秒

D.

25 个周期:

变性

92 毕业,

30秒

侦察员

55 毕业,

30秒

更新

72 研究生,

60秒

米。

抓住

4℃

寡核苷酸的下划线区域分别与 ADH 启动子区域和淀粉酶区域杂交,并在不存在插入片段时扩增载体 pSST-AMY.0 的 307 bp 区域。通常,这些寡核苷酸 5' 端的前 18 个核苷酸包含测序引物的连接位点。因此,空载体的 PCR 反应总产物为 343 bp。然而,与信号序列融合的cDNA 产生了明显更长的核苷酸序列。

在 PCR 之后,如 Sambrook 等人所述,在 1% 琼脂糖凝胶上通过琼脂糖凝胶电泳分析反应的等分试样(5 微升),如 Sambrook 等人,同上。在用 Qiaquick 96 PCR 纯化柱(Qiagen Inc.,Chatsworth,CA)纯化后,通过 DNA 测序进一步分析产生大于 400 bp 的单一强 PCR 产物的克隆。

示例 3

使用信号算法分析分离 cDNA 克隆

通过将基因泰克公司(加利福尼亚州南旧金山)开发的专有信号序列搜索算法应用于 EST 并汇集和组装来自公众(例如 GenBank)的 EST 片段,鉴定了几种编码多肽的核酸序列。和/或专有数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Inc., Palo Alto, CA)。信号序列算法根据所考虑的序列或序列片段 5' 端第一个和任选第二个甲硫氨酸 (ATG) 密码子周围的 DNA 核苷酸的特征计算分泌信号值。第一个 ATG 之后的核苷酸必须编码至少 35 个没有终止密码子的独特氨基酸。如果第一个 ATG 具有所需的氨基酸,则不检查第二个。如果都不符合要求,则不评估候选序列。为了确定 EST 序列是否包含真实的信号序列,使用已知与分泌信号相关联的一组七个传感器(评分参数)对 ATG 密码子周围的 DNA 和相应的氨基酸序列进行评分。该算法的使用导致鉴定了许多编码多肽的核酸序列。

使用上述实施例 1-3 中描述的技术,许多全长 cDNA 克隆编码 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、B. PRO1382、 PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO19644, PRO19644, PRO19644, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO19644, PRO19644, PRO19644 和 PRO164美国典型培养物保藏中心,10801 University Blvd., Manassas, Virginia,根据布达佩斯条约的条款。 20110-2209,美国 (ATCC),如下表 7 所示。另外,编码PRO92165多肽的DNA340392序列从GenBank登录号:AB028714中鉴定;编码PRO85143多肽的DNA340394序列从GenBank登录号:AF329488中鉴定;编码PRO23370多肽的DNA193963序列从GenBank登录号:L08177中鉴定。

七号塔布拉

材料

ATCC 部门编号

存款日期

ADN26844-1394

209926

2. 1998年6月

ADN32298-1132

209257

16. 1997 年 9 月

ADN34392-1170

209526

1997 年 12 月 10 日

ADN23318-1211

209787

1998年4月21日

ADN40981-1234

209439

7. 1997 年 11 月

ADN44192-1246

209531

1997 年 12 月 10 日

ADN39518-1247

209529

1997 年 12 月 10 日

ADN49435-1219

209480

1997年11月21日

ADN45417-1432

209910

27. 1998 年 5 月

ADN52758-1399

209773

14. 1998 年 4 月

ADN56436-1448

209902

27. 1998 年 5 月

ADN56409-1377

209882

1998 年 5 月 20 日

ADN48606-1479

203040

1998 年 7 月 1 日

ADN59848-1512

203088

4. 1998年8月

ADN66659-1593

203269

22. 1998 年 9 月

ADN66526-1616

203246

9. 1998 年 9 月

ADN68874-1622

203277

22. 1998 年 9 月

ADN73744-1665

203322

6. 1998年10月

ADN76529-1666

203315

6. 1998年10月

ADN76532-1702

203473

17. 1998 年 11 月

ADN76510-2504

203477

17. 1998 年 11 月

ADN77624-2515

203553

1998 年 12 月 22 日

ADN91779-2571

203844

1999 年 3 月 16 日

ADN100272-2969

PTA-2299

2000 年 7 月 25 日

ADN86594-2587

203894

1999 年 3 月 30 日

ADN87974-2609

203963

27. 1999 年 4 月

ADN83568-2692

PTA-386

1999 年 7 月 20 日

ADN96995-2709

PTA-475

3. 1999年8月

ADN108743-2722

PTA-508

10. 1999 年 8 月

ADN108769-2765

PTA-861

19. 1999 年 10 月

ADN142238-2768

PTA-819

5、1999年10月

ADN139686-2823

PTA-1264

2000 年 2 月 2 日

ADN144844-2843

PTA-1536

2000 年 3 月 21 日

ADN139592-2866

PTA-1587

2000 年 3 月 28 日

ADN176775-2957

PTA-2303

2000 年 7 月 25 日

ADN60629-1481

209979

16. 1998 年 6 月

ADN59613-1417

203007

23. 1998 年 6 月

这些保藏是根据国际承认用于专利程序的微生物保藏的布达佩斯条约和相关条例(布达佩斯条约)的规定进行的。这确保了从储存之日起 30 年内维持有活力的沉积培养物。 ATCC 将根据《布达佩斯条约》的条款并根据 Genentech, Inc. 和 ATCC 之间的协议提供储存库,该协议确保在相关美国专利发布后,公众可以不受限制地和持续地获得储存库中培养物的后代或在向公众公开美国或外国专利申请时,以先到者为准,并确保美国专利和商标专员根据 35 USC § 授权的人可以获得后代。 122 和专员的相关规定(包括 37 CFR §1.14,具体参考 8860G 638)。

本申请的受让人已同意,如果保藏材料的培养物在适当条件下生长时死亡或丢失或毁坏,则该材料将在收到通知后立即用其他相同材料替换。保藏材料的可用性不应被解释为在违反任何政府授权根据其专利法授予的任何权利的情况下实施本发明的许可。

例子 4

分离编码人PRO194多肽的cDNA克隆[UNQ168]

如上文实施例1所述,使用Phrap组装相对于其他EST序列的共有DNA序列。这个共有序列在这里是 DNA19464。基于 DNA19464 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于 PRO194 分离的全长编码序列的克隆。基于 DNA19464 序列合成 PCR 引物(正向和反向)。此外,从 DNA19464 的共有序列构建了合成寡核苷酸杂交探针。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO194 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肺组织 (LIB25) 中分离出来的。

如上所述分离的克隆的DNA测序提供了PRO194的全长DNA序列[本文称为DNA26844-1394](SEQ ID NO:1)和推导的PRO194蛋白质序列。

DNA26844-1394的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 1个(序列号:1)。克隆 DNA26844-1394 包含一个单一的开放阅读框,在第 81-83 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 873-875 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 1个).预测的多肽前体长度为 264 个氨基酸(飞哥。 2个).显示的全长 PRO194 蛋白飞哥。 2个它的估计分子量约为 29,665 道尔顿,pI 约为 9.34。显示的全长 PRO194 序列分析飞哥。 2个(SEQ ID NO:2)证明存在几个重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 2个.克隆 DNA26844-1394 于 1998 年 6 月 2 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 209926。

全长 PRO194 多肽的氨基酸序列分析表明它与任何已知的人类蛋白质没有显着的序列相似性。然而,对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)的分析显示氨基酸序列 PRO194 与 Dayhoff、HUMORFT 的以下序列之间存在一些同源性1、CET07F105、ATFCA912、F64934、YDJX_ECOLI、ATAF00065719F29G20.19、H70002、S76980、H64934 和 S76385。

例 5

编码人 PRO220 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ194]

如上文实施例1所述,相对于其他鉴定的EST序列组装共有DNA序列,共有序列在本文中称为DNA28749。基于 DNA28749 的共有序列,合成寡核苷酸以通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库,并使用它们作为探针来分离 PRO220 全长编码序列的克隆。

合成了一对 PCR 引物(正向和反向):

(序列号:83)

正向 PCR 引物 5'-TCACCTGGAGCCTTTATTGGCC-3'

(序列号:84)

5'-ATACCAGCTATAACCAGGCTGCG-3' 反向 PCR 接收器

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA28749 构建合成寡核苷酸杂交探针:

杂交探针

(序列号:85)

5'-CAACAGTAAGGTGGTTTGATGCTCTCCAATCTAGAGATTCTGATGA

TTGGG-3'。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO220 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肺组织中分离出来的。如上所述对分离的克隆进行 DNA 测序,提供了 PRO220 的全长 DNA 序列 [本文指定为 DNA32298-1132 和推导的 PRO220 蛋白质序列]。

DNA32298-1132的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 3个(序列号:3)。克隆 DNA32298-1132 包含一个单一的开放阅读框,在第 480-482 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 2604-2606 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 3个).预测的多肽前体长度为 708 个氨基酸(飞哥。 4个;序列号:4)。克隆 DNA32298-1132 于 1997 年 9 月 16 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 ATCC 209257。

PRO220的全长氨基酸序列分析表明,它与富含亮氨酸重复蛋白超家族成员具有同源性,包括富含亮氨酸重复蛋白和神经元富含亮氨酸重复蛋白1。

例 6

分离编码人PRO241多肽的cDNA克隆[UNQ215]

如上文实施例1所述,相对于其他EST序列组装共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 DNA30876。基于 DNA30876 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于 PRO241 分离的全长编码序列的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5'-GGAAATGAGTGCAAACCCTC-3'

(序列号:86)

反向PCR引物

5'-TCCCAAGCTGAACACTCATTCTGC-3'

(序列号:87)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA30876 构建合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针

(序列号:88)

5'-GGGTGACGGTGTTCATATCAGAATTGCAGAAGCAAACTGACCTCA

GTT-3'

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO241 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肾组织 (LIB29) 中分离出来的。

如上所述分离的克隆的DNA测序提供了PRO241的全长DNA序列[本文称为DNA34392-1170](SEQ ID NO:5)和推导的PRO241蛋白质序列。

DNA34392-1170的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 5个(序列号:5)。克隆 DNA34392-1170 包含一个单一的开放阅读框,在第 234-236 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 1371-1373 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 5个).预测的多肽前体长度为 379 个氨基酸(飞哥。 6个).显示的全长 PRO241 蛋白飞哥。 6个它的估计分子量约为 43,302 道尔顿,pI 约为 7.30。克隆 DNA34392-1170 于 1997 年 12 月 10 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 ATCC 209526。

全长 PRO241 多肽的氨基酸序列分析表明它与各种双糖蛋白聚糖蛋白具有显着的同源性,表明 PRO241 是一种新型双糖链蛋白同源多肽。

例 7

编码人 PRO284 [UNQ247] 多肽的 cDNA 克隆的分离

在实施例2中描述的淀粉酶筛选中分离出两个cDNA序列,并且这些cDNA序列在本文中称为DNA12982和DNA15886。然后将 DNA12982 和 DNA15886 序列合并并比对,产生共有核苷酸序列,在本文中称为 DNA18832。

基于 DNA18832 的共有序列,生成寡核苷酸探针并用于筛选如上文实施例 2 第 1 段所述制备的人胎盘文库 (LIB89)。克隆载体是 pRK5B(pRK5B 是 pRK5D 的前体,不包含 SfiI 位点;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991)),cDNA 边界小于 2800 bp。

合成 PCR 引物(正向和反向):

正向 PCR 引物 1 (18832.est.f)

5′-TCGTACAGTTACGCTCTCCC-3′

(SEQ-ID-NR: 89)

正向 PCR 引物 2 (18832.f)

5'-CTTGAGGAGCGTCAGAAGCG-3'

(序列号:90)

反向 PCR 引物 (18832.r)

5′-ATAACGAATGAAGCCCTCGTG-3′

(序列号:91)

此外,从具有以下核苷酸序列的 18832 DNA 序列构建了合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针 (18832.p)

(序列号:92)

5'-GCTAATATCTGTAAGACGGCAGCTACAGCAGGCATCATTG-3'

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO284 基因的克隆。

鉴定出一个全长克隆,它包含一个单一的开放阅读框,在第 167-169 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 1022-1024 位核苷酸处的终止密码子处终止(飞哥。 7;序列号:7)。预测的多肽前体长度为 285 个氨基酸,计算分子量约为 32,190 道尔顿,估计​​ pI 约为 9.03。显示的全长 PRO284 序列分析飞哥。 8个(SEQ ID NO:8)显示存在以下内容:从约氨基酸 1 到约氨基酸 24 的信号肽,从约氨基酸 76 到约氨基酸 96 和从约氨基酸 171 到约氨基酸的跨膜结构域195,以及约氨基酸 153 至约氨基酸 156 的潜在 N-糖基化位点。克隆 UNQ247 (DNA23318-1211) 于 1998 年 4 月 21 日保藏在 ATCC 并指定为 ATCC 登录号。 209787。

全长 PRO284 多肽的氨基酸序列分析表明它与任何已知蛋白质没有任何显着的序列相似性。然而,对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)的分析显示氨基酸序列 PRO284 与以下序列 Dayhoff、JQ0124、CELE04A4 之间存在一定程度的同源性5、AB0064511、AF0301621、IM23_YEAST、S71194、NIA_CUCMA、IM17_YEAST、150479 和 HUMZFHP1.

例 8

分离编码人PRO331多肽的cDNA克隆[UNQ292]

如上文实施例1所述,使用Phrap组装相对于其他EST序列的共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 DNA36685。基于 DNA36685 共有序列和 Incyte EST 序列号。合成了 2,228,990 个寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库,以及 2) 用作探针以分离 PRO331 全长编码序列的克隆。

合成了用于测定 PRO331 的正向和反向 PCR 引物:

直接PCR引物

5'-GCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTG-3'

(序列号:93)

反向PCR引物

5'-CCCCATGTGTCCATGACTGTTCCC-3'

(序列号:94)

此外,构建了具有以下核苷酸序列的用于测定PRO331的合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针

(序列号:95)

5'-TACTGCCTCATGACCTCTTCACCTCCCTTGCATCTTAGAGCG

G-3′

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO331 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿大脑 (PRO331) 中分离出来的。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO331 的全长 DNA 序列 [本文称为 DNA40981-1234;序列号:9;看飞哥。 9] 和来自 PRO331 的蛋白质序列(cf飞哥。 10; SEC-ID-Nr.: 10).

完整的核苷酸序列如图所示飞哥。 9, 于 1997 年 11 月 7 日存放于 ATCC,ATCC 登录号为 . 209439。

全长 PRO331 多肽的氨基酸序列分析表明它的部分与 LIG-1 蛋白具有显着的同源性,表明 PRO331 可能是一种新型的 LIG-1 相关蛋白。

例 9

编码人 PRO354 [UNQ311] 多肽的 cDNA 克隆的分离

搜索了一个表达序列标签 (EST) DNA 数据库(LIFESEQ™,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,California)并鉴定了几个 EST 序列,这些序列与抑制剂 inter-alpha -Trypsin 的重链具有一定程度的同源性,并且每个序列都具有其他的。 .然后比对这些同源的 EST 序列并获得共有序列。然后使用重复的 BLAST 和 Phrap 循环扩展获得的共有 DNA 序列,以使用从公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ™,Incyte Pharmaceuticals)获得的同源 EST 序列尽可能地扩展共有序列,加利福尼亚州帕洛阿尔托)。延伸的剪接序列在本文中称为 DNA39633。以前的搜索是使用 BLAST 或 BLAST2 软件进行的(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被合并并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。 ).

基于 DNA39633 的共有序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于 PRO354 分离的全长编码序列的克隆。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议, 与 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

PCR引物合成如下:

正向 PCR 引物 1 (39633.f1)

5'-GTGGGAACCAAACTCCGGCAGACC-3'

(序列号:96)

正向 PCR 引物 2 (39633.f2)

5'-CACATCGAGCGTCTCTG-3'

(序列号:97)

反向 PCR 引物 (39633.r1)

5′-AGCCGCTCCTTCTCGGTTCATCG-3′

(序列号:98)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA39633 构建合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针

(SEQ-ID-NR: 99)

5'-TGGAAGGACCACTTGATATCAGTCACTCCAGACAGCATCAGGGATGG

G-3′

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO354 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肾组织 (LIB227) 中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的DNA测序提供了PRO354的全长DNA序列[本文称为DNA44192-1246](SEQ ID NO:11)和推导的PRO354蛋白质序列。

DNA44192-1246的完整核苷酸序列如图所示胆小。十一(序列号:11)。克隆 DNA44192-1246 包含一个单一的开放阅读框,在第 72-74 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 2154-2156 位核苷酸处的终止密码子处结束(胆小。十一).预测的多肽前体长度为 694 个氨基酸(飞哥。 12;序列号:12)。显示的全长 PRO354 蛋白飞哥。 12它的估计分子量约为 77,400 道尔顿,pI 约为 9.54。克隆 DNA44192-1246 于 1997 年 12 月 10 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 ATCC 209531。

全长 PRO354 多肽的氨基酸序列分析表明它与 inter-alpha 胰蛋白酶抑制剂重链蛋白具有显着同源性,表明 PRO354 可能是一种新型胰蛋白酶抑制剂重链蛋白同源物。

例 10

编码人 PRO355 [UNQ312] 多肽的 cDNA 克隆的分离

如上文实施例1所述,使用BLAST和Phrap组装相对于其他EST序列的共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 DNA35702。基于 DNA35702 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于 PRO355 分离的全长编码序列的克隆。

如下合成正向和反向PCR引物:

直接PCR引物

5'-GGCTTCTGCTGTTGCTCTTCTCCG-3'

(SEQ-ID-NR: 100)

直接PCR引物

5'-GTACACTGTGACCAGTCAGC-3'

(序列号:101)

直接PCR引物

5'-ATCATCACAGATTCCCGAGC-3'

(序列号:102)

反向PCR引物

5'-TTCAATCTCCTCACCTTCCACCGC-3'

(序列号:103)

反向PCR引物

5'-ATAGCTGTGTCTGCGTCTGCTCG-3'

(序列号:104)

此外,从 DNA35702 共有序列构建了合成寡核苷酸杂交探针,其具有以下核苷酸序列:

杂交探针

(序列号:105)

5'-CGCGGCACTGATCCCCACAGGTGATGGGCAGAATCTGTTTACGAAAG

ACG-3′

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用先前鉴定的 PCR 引物对之一通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用寡核苷酸探针使用阳性文库分离编码 PRO355 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎肝组织中分离出来的。

如上所述对分离的克隆进行 DNA 测序,提供了 PRO355 的全长 DNA 序列 [本文称为 DNA39518-1247] (SEQ ID NO: 13) 和推导的 PRO355 蛋白质序列。

DNA39518-1247的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 13(序列号:13)。克隆 DNA39518-1247 包含一个单一的开放阅读框,在第 22-24 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 1342-1344 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 13).预测的多肽前体长度为 440 个氨基酸(飞哥。 14;序列号:14)。显示的全长 PRO355 蛋白飞哥。 14它的估计分子量约为 48,240 道尔顿,pI 约为 4.93。此外,感兴趣的区域包括信号肽、细胞外结构域中的 Ig 重复、潜在的 N-糖基化位点和潜在的跨膜结构域,如图所示飞哥。 14.克隆 DNA39518-1247 于 1997 年 12 月 10 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 ATCC 209529。

全长 PRO355 多肽的氨基酸序列分析表明其部分与 CRTAM 蛋白具有显着同源性,表明 PRO355 可能是 CRTAM 蛋白。

例 11

分离编码人PRO533多肽的cDNA克隆[UNQ334]

EST 序列登录号 AF007268,一种鼠成纤维细胞生长因子 (FGF-15),用于搜索多个公共 EST 数据库(例如 GenBank、Dayhoff 等)。使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480(1996 年);作为 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译的比较。搜索返回了 GenBank EST AA220994 的匹配项,它被确定为 Stratagene NT2 神经祖细胞 937230。

基于 Genbank EST AA220994 序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成编码序列分离长度的全长克隆。正向和反向 PCR 引物的长度范围为 20-30 个核苷酸(通常约为 24 个),旨在提供长度为 100-1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp(通常为 50 左右)。为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,根据 Ausubel 等人的方法,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议, 与 PCR 引物对。然后使用寡核苷酸探针和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码感兴趣基因的克隆。

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用下面确定的 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO533 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿视网膜中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如 Invitrogen,San Diego,CA;Clontech 等)通过标准方法构建的。用 SalI 进行半激酶处理的衔接子,用 NotI 切割,通过凝胶电泳确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是 pRK5D 的前体,不包含 SfiI 位点;参见 Holmes等人,等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

一个 cDNA 克隆被完全测序。 PRO533的全长核苷酸序列如图所示胆小。十五(序列号:15)。克隆 DNA49435-1219 包含一个单一的开放阅读框,在第 459-461 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点(胆小。十五;序列号:15)。预测的多肽前体长度为 216 个氨基酸(胆小。十六;序列号:16)。克隆 DNA49435-1219 于 1997 年 11 月 21 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 ATCC 209480。

基于全长序列的 BLAST-2 和 FastA 序列比对分析,PRO533 显示出与成纤维细胞生长因子 (53%) 的氨基酸序列同一性。

上述程序中使用的寡核苷酸序列如下:

FGF15.继续:

(序列号:106)

5'-ATCCGCCCAGATGGCTACAATGTGTA-3';

FGF15.探针:

(序列号:107)

5'-GCCTCCCGGTCTCCCTGAGCAGTGCCAAACACGCGGCAGTGTA-3';

FGF15.向后:

(序列号:108)

5'-CCAGTCCGGTGACAAGCCCAAA-3'。

例 12

分离编码人PRO541多肽的cDNA克隆[UNQ342]

相对于如上文实施例1中所述的多种EST序列获得共有序列,所获得的共有序列在本文中称为DNA42259。基于 DNA42259 的共有序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成 PRO541 的全长编码序列克隆以进行分离。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5'-GGACAGAATTTGGGAGCACACTGG-3'

(序列号:109)

直接PCR引物

5'-CCAAGAGTATACTGTCTCCG-3'

(序列号:110)

反向PCR引物

5'-AGCACAGATTTTCTCTCAGCCCCC-3'

(序列号:111)

反向PCR引物

5'-AACCACTCCAGCATGTACTGCTGC-3'

(序列号:112)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA42259 构建合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针

(序列号:113)

5'-CCATTCAGGTGTTCTGGCCCTGTATGTACACATTATACAGGTCGT

GTG-3′

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用先前鉴定的 PCR 引物对之一通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO541 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肾组织 (LIB227) 中分离出来的。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO541 的全长 DNA 序列 [本文称为 UNQ342 (DNA45417-1432)] (SEQ ID NO: 17) 和推导的 PRO541 蛋白质序列。

UNQ342 (DNA45417-1432)的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 17(序列号:17)。克隆 UNQ342 (DNA45417-1432) 包含一个单一的开放阅读框,在第 469-471 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 1969-1971 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 17).预测的多肽前体长度为 500 个氨基酸(飞哥。 18).显示的全长 PRO541 蛋白飞哥。 18它的估计分子量约为 56,888 道尔顿,pI 约为 8.53。显示的全长 PRO541 序列分析飞哥。 18(SEQ ID NO:18)显示存在以下内容:从大约氨基酸 1 到大约氨基酸 20 的信号肽,与细胞外蛋白 SCP/Tpx-1/Ag5/PR- 共享同源性的氨基酸序列块. 1/Sc7 从氨基酸 165 到氨基酸 186、氨基酸 196 到氨基酸 218、氨基酸 134 到氨基酸 146、氨基酸 96 到氨基酸 108 和氨基酸 58 到大约氨基酸 77 和潜在的 N-糖基化位点从约第 28 位氨基酸到约第 31 位氨基酸。克隆 UNQ342 (DNA45417-1432) 于 1998 年 5 月 27 日保藏在 ATCC,并指定为 ATCC 登录号。 209910。

全长 PRO541 多肽的氨基酸序列分析表明它与胰蛋白酶抑制剂蛋白具有显着的序列相似性,表明 PRO541 可能是一种新型胰蛋白酶抑制剂。更具体地说,对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)的分析显示 PRO541 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列 D45027 之间存在显着同源性1、AB0096091、JC5308、CRS3_HORSE、TPX1_HUMAN、HELO_HELHO、GEN14351、A281121、CET05A10P_W11485 的 4。

例 13

分离编码人 PRO725 多肽的 cDNA 克隆 ​​[UNQ390]

如上文实施例1所述,获得关于多种EST序列的共有序列。基于观察到的该共有序列与包含在 Incyte EST 克隆#4242090 中的 EST 序列之间的同源性,购买了 Incyte EST 克隆#4242090 并获得其插入片段并测序。

在上文实施例2中描述的淀粉酶筛选中分离的cDNA序列在本文中称为DNA43301。然后将 DNA43301 的序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有的 EST DNA 数据库(LIFESEQ™, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)以确定现有的同源性. .使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被合并并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。 ).所得共有序列在本文中称为 DNA45458。基于 DNA45458 的共有序列,生成寡核苷酸探针并用于筛选如上文实施例 2 第 1 段所述制备的人胎儿脑文库 (LIB153)。克隆载体是 pRK5B(pRK5B 是 pRK5D 的前体,不包含 SfiI 位点;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991)),cDNA 边界小于 2800 bp。

合成 PCR 引物(正向和反向):

正向 PCR 引物 (45458.f1)

5'-CCAAACTCCACCCAGTGAGTGAGC-3'

(SEC-ID-Nr.: 114)

反向 PCR 引物 (45458.r1)

5'-TGGGAAATCAGGAATGGTGTTCTCC-3'

(序列号:115)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA45458 构建合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针 (45458.p1)

(序列号:116)

5'-CTTGTTTCACCATGGGCTAACTTTGCTGCTAGGGAGTTCAAGCCAT

GCC-3'

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO725 基因的克隆。

鉴定出一个全长克隆(此处标识为 DNA52758-1399),它包含一个开放阅读框,在第 161-163 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并终止于第 455-457 位核苷酸处的终止密码子(飞哥。 19;序列号:19)。预测的多肽前体长度为 98 个氨基酸,计算分子量约为 11,081 道尔顿,估计​​ pI 约为 6.68 (胆小。二十;序列号:20)。显示的全长 PRO725 序列分析胆小。二十(SEQ ID NO:20)显示存在以下:从约氨基酸 1 到约氨基酸 20 的信号肽,从约氨基酸 72 到约氨基酸 75 的潜在 N-糖基化位点,以及酪氨酸激酶磷酸化从大约第 63 位氨基酸到大约第 70 位氨基酸的位点 克隆 DNA52758-1399 于 1998 年 4 月 14 日保藏在 ATCC,指定的 ATCC 登录号为209773。

全长 PRO725 多肽的氨基酸序列分析表明它与任何已知蛋白质没有任何显着的序列相似性。然而,对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)的分析显示氨基酸序列 PRO725 与以下序列 Dayhoff、POL_BLVAU、PSSP_RAT、CELC36C5 之间存在一定程度的同源性7、AF0192341、148862、P_R12498、P_P10125、P_R26861、A64527 和 P_W20495。

例 14

分离编码人PRO937多肽的cDNA克隆[UNQ474]

来自 Swiss-Prot 的公共蛋白质数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号,如果存在)用于搜索表达序列标签 (EST) 数据库。 EST 数据库包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有的 EST DNA 数据库(LIFESEQ™,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,California)。使用 BLAST 或 BLAST2 软件进行搜索(Altshul 等人,酶学方法266:460-480 (1996))将 ECD 蛋白序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被合并并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。 ).

使用上述分析将共有 DNA 序列鉴定为编码可能分泌的蛋白质。该序列在本文中称为 DNA49651.init。此外,然后使用重复的 BLAST 和 Phrap 循环扩展 DNA46951.init 序列,以使用上面讨论的 EST 序列来源尽可能地扩展序列。扩展的组装序列在本文中称为“DNA49651”。

基于 DNA49651 的共有序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于分离 PRO937 的全长编码序列的克隆。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议, 与 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

正向 PCR 引物 (49651.f1)

5'-CTCCGTGGTAAACCCCACAGCCC-3';

(SEC-ID-Nr.: 117)

j

反向 PCR 引物 (49651.r1)。

5'- TCACATCGATGGGATCCATGACCG -3'。

(序列号:118)

此外,从具有以下核苷酸序列的 DNA48651 序列构建合成寡核苷酸杂交探针:

杂交探针 (49651.p1)

(序列号:119)

5'-GGTCTCGTGACTGTGAAGCCATGTTACAACTACTGCTCAAACATCAT

GAG-3'。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO937 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎儿肾组织 (LIB227) 中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO937 的全长 DNA 序列 [本文称为 UNQ474 (DNA56436-1448)] (SEQ ID NO:21) 和推导的 PRO937 蛋白质序列。

UNQ474 (DNA56436-1448)的完整核苷酸序列如图所示胆小。 21(序列号:21)。它包含一个单一的开放阅读框,在第 499-501 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并终止于第 2167-2169 位核苷酸处的终止密码子(胆小。 21,序列号:21)。预测的多肽前体长度为 556 个氨基酸,计算分子量约为 62,412 道尔顿,估计​​ pI 约为 6.62。显示的全长 PRO937 序列分析飞哥。 22(SEQ ID NO:22)证明存在以下特征:大约在氨基酸 1-22 处的信号肽; ATP/GTP 结合位点(P 环)基序 A 位于约氨基酸 515-523 处;大约在氨基酸 514-517 处的潜在 N-糖基化位点;和 glipican 同源位点大约在氨基酸 54-74、106-156、238-279、309-345、423-459 和 468-505。

克隆 UNQ474 (DNA56436-1448) 于 1998 年 5 月 27 日保藏在 ATCC 并指定了 ATCC 登录号。 209902。

全长 PRO937 多肽的氨基酸序列分析表明它与磷脂酰肌醇蛋白聚糖具有显着的序列相似性,表明 PRO937 可能是一种新型磷脂酰肌醇蛋白聚糖。更具体地说,对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)的分析显示 PRO937 氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在显着同源性:GPCK_MOUSE、GPC2_RAT、GPC5_HUMAN、GPC3_HUMAN、P_R30168、CEC03H122、GEN13820、HS119E231、HDAC_DROME与AF0176371.

例 15

编码人 PRO1014 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ497]

如上文实施例1所述,使用Phrap相对于其他EST序列组装DNA共有序列,所得共有序列在本文中称为DNA49811。基于观察到的 DNA49811 序列和 Incyte EST 克隆 #2612207 之间的同源性,Incyte EST 克隆#2612207。获得2612207及其插入片段并测序,获得的序列如图所示飞哥。 23(序列号:23)。

DNA 测序提供了 PRO1014 的全长 DNA 序列 [本文称为 UNQ497 (DNA56409-1377)] (SEQ ID NO:23) 和推导的 PRO1014 蛋白质序列。

UNQ497 (DNA56409-1377)的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 23(序列号:23)。克隆 UNQ497 (DNA56409-1377) 包含一个单一的开放阅读框,在第 66-68 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 966-968 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 23).预测的多肽前体长度为 300 个氨基酸(飞哥。 24;序列号:24)。显示的全长 PRO1014 蛋白飞哥。 24它的估计分子量约为 33,655 道尔顿,pI 约为 9.31。克隆UNQ497(DNA56409-1377)于1998年5月20日保藏于ATCC,保藏号为209882。至于序列,可以理解保藏的克隆含有正确的序列,本文提供的序列基于已知序列。测序技术。

全长 PRO1014 多肽的氨基酸序列分析表明它的某些部分与还原酶具有序列同一性,表明 PRO1014 可能是还原酶家族的新成员。

进一步分析SEQ ID NO:24的氨基酸序列,推定的信号肽位于SEQ ID NO:24的大约1-19位氨基酸处。cAMP-和cGMP-依赖性蛋白激酶磷酸化位点位于大约1-19位氨基酸处。 SEQ ID NO:24的30-33和58-61。短链醇脱氢酶家族蛋白大约位于SEQ ID NO:24的氨基酸165-202、37-49、112-122和210-219。给定本文提供的序列,可以常规确定这些结构域和本文提供的所有其他氨基酸的相应核苷酸。

例 16

编码人 PRO1120 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ559]

如上文实施例1所述,使用Phrap组装相对于其他EST序列的共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 consensus0352。然后使用重复的 BLAST 和 Phrap 循环扩展 consensus0352 序列,以使用上面讨论的 EST 序列来源尽可能地扩展共有序列。扩展的共有序列在本文中称为 DNA34365。基于 DNA34365 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于 PRO1120 分离的全长编码序列的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接 PCR 引物:

5'-GAAGCCGGCTGTTCTGAATC-3',

(序列号:120)

5'-GGCCAGCTATCTCCGCAG-3',

(SEC-ID-Nr.: 121)

5'-AAGGGCCTGCAAGAGAAG-3',

(序列号:122)

5'-CACTGGGACAACTGTGGG-3',

(SEC-ID-Nr.: 123)

5'-CAGAGGCAACGTGGAGAG-3',

(SEC-ID-Nr.: 124)

j

5'-AAGTATTGTCATACAGTGTTC-3';

(序列号:125)

反向 PCR 引物:

5'-TAGTATCTTGGGCACGAGGTTGGAG-3',

(SEC-ID-Nr.: 126)

j

5'-TCATACCAACTGCTGGTCATTGGC-3'。

(SEC-ID-Nr.: 127)

此外,从具有以下核苷酸序列的 DNA34365 的共有序列构建合成寡核苷酸杂交探针:

杂交探针:

(序列号:128)

5'-CTCAAGCTGCTGGACACGGAGCGGCCGGTGAATCGGTTTCACTTG-

3'。

为了筛选多个文库以寻找全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用寡核苷酸探针和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO1120 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎肾组织中分离出来的。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO1120 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA48606-1479 [飞哥。 25, SEQ ID NO:25];以及推导的 PRO1120 蛋白质序列。

PRO1120的完整编码序列如图所示飞哥。 25(序列号:25)。克隆 DNA48606-1479 包含一个单一的开放阅读框,在第 608-610 位核苷酸处具有明显的翻译起始位点,在第 3209-3211 位核苷酸处具有明显的终止密码子。预测的多肽前体长度为 867 个氨基酸。显示的全长 PRO1120 蛋白飞哥。 26(SEQ ID NO:26)具有约100,156道尔顿的估计分子量和约9.44的pI。 PRO1120 多肽的其他特征包括大约氨基酸 1-17 处的信号肽;大约氨基酸 86-98 处的硫酸酯酶特征;在大约氨基酸87-106、133-146、216-229、291-320和365-375处与硫酸酯酶同源的区域;和潜在的 N-糖基化位点在大约氨基酸 65-68、112-115、132-135、149-152、171-174、198-201、241-245、561-564、608-611、717-720、 754 -757 和 764-767。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 26(SEQ ID NO:26)显示出 PRO1120 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的显着同源性:CELK09C41、GL6S_HUMANO、G65169、NCU894921、BCU448521、E64903、P_R51355、STS_HUMAN、GA6S_HUMAN 和 IDS_MOUSE。克隆 DNA48606-1479 于 1998 年 7 月 1 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 203040。

例 17

编码人 PRO182 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ596]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法能够从 Incyte 数据库中识别单个 EST 簇序列,在本文中称为 146647。然后将该 EST 簇序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括 EST 数据库(例如 GenBank)和专有的 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)以识别现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 计算机程序进行同源性搜索(Altshul 等人,Methods in Enzymology 266:460-480 (1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。由此产生的共有序列在此处称为 DNA56033。

鉴于在 DNA56033 共有序列和因塞特 EST 克隆 # 中编码的 EST 序列之间观察到的序列同源性。 2595195,克隆 2595195 购自 Incyte EST,获得 cDNA 插入片段并测序。发现该插入片段编码全长蛋白质。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 27在本文中称为 DNA59848-1512。

克隆 DNA59848-1512 包含一个单一的开放阅读框,在第 67-69 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 880-882 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 27;序列号:27)。预测的多肽前体长度为 271 个氨基酸(飞哥。 28;序列号:28)。显示的全长 PRO1182 蛋白飞哥。 28它的估计分子量约为 28,665 道尔顿,pI 约为 5.33。显示的全长 PRO1182 序列分析飞哥。 28(SEQ ID NO:28)显示存在以下内容:从约氨基酸 1 到约氨基酸 25 的信号肽,与从约氨基酸 247 到约氨基酸的 C 型凝集素结构域蛋白具有同源性的氨基酸块256,以及与 C1q 结构域蛋白同源的氨基酸序列块,从大约氨基酸 44 到大约氨基酸 77。克隆 DNA59848-1512 于 1998 年 8 月 4 日保藏在 ATCC 中,ATCC 登录号为203088。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 28(SEQ ID NO:28)显示 PRO1182 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在显着同源性:PSPD_BOVIN、CL43_BOVIN、CONG_BOVIN、P_W18780、P_R45005、P_R53257 和 CELEGAP7。1.

例 18

编码人 PRO1325 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ685]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别 EST 库序列,指定为 Incyte EST 库序列号。 139524. 然后对照各种表达序列标签 (EST) 数据库检查这个汇集的 EST 序列,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(Lifeseq®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)与确定现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。由此产生的共有序列在此处称为 DNA56115。

鉴于 DNA56115 序列与因塞特 EST 克隆 no. 中发现的 EST 序列之间的序列同源性。 3744079,Incyte EST 克隆号。 3744079 和 cDNA 插入片段已获得并测序。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 29在本文中称为 DNA66659-1593。

克隆 DNA66659-1593 包含一个单一的开放阅读框,在第 51-53 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 2547-2549 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 29;序列号:29)。预测的多肽前体长度为 832 个氨基酸(飞哥。 30).显示的全长 PRO1325 蛋白飞哥。 30它的估计分子量约为 94,454 道尔顿,pI 约为 6.94。显示的全长 PRO1325 序列分析飞哥。 30(SEQ ID NO:30)显示存在以下内容:约氨基酸 1 至约氨基酸 18 的信号肽,约氨基酸 292 至约氨基酸 317 的跨膜结构域,约氨基酸 451 至约氨基酸470,从约氨基酸501到约氨基酸520,从约氨基酸607到约氨基酸627,从约氨基酸751到约氨基酸770,亮氨酸拉链模式序列从约氨基酸497到约氨基酸518 ,和潜在的N-糖基化位点从约氨基酸27到约氨基酸30,从约氨基酸54到约氨基酸57,从约氨基酸60到约氨基酸63,从约氨基酸位置123到约氨基酸位置126,从约氨基酸位置141到约氨基酸位置144,从约氨基酸位置165到约氨基酸位置168,从约氨基酸位置364到约氨基酸位置367,从约氨基酸位置476到约氨基酸位置479,从大约氨基酸位置496到大约氨基酸位置499,从大约氨基酸位置572到大约氨基酸位置575,从大约氨基酸位置从氨基酸位置603到大约氨基酸位置606,和从大约第 699 位氨基酸到大约第 702 位氨基酸。克隆 DNA66659-1593 于 1998 年 9 月 22 日保藏在 ATCC,并指定了 ATCC 登录号。 203269。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 30(SEQ ID NO:30)显示出 PRO1325 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的显着同源性:CELR04E51、CELZK7215、CELC30l5、CELC30l6、CELC30升2、CEY37H2C1、CELC30升7、CELT07H87 和 E64006。

例 19

分离编码人PRO1382多肽的cDNA克隆[UNQ718]

使用上述实施例 1 中描述的程序,Incyte EST no. 2719 被确定为感兴趣的序列,其 BLAST 得分为 70 或更高,不编码已知蛋白质。 EST编号的核苷酸序列。 2719 在本文中称为“DNA42842”。基于 DNA42842 的序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以分离 PRO1382 的全长编码序列的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

ACGGGCTCACCATGGGCTCCG公司

(42842.f1; SEC-ID-Nr.: 129)

反向PCR引物

AGGAAGAGGAGCCCTTGGAGTCCG

(42842.r1; SEC-ID-Nr.: 130)

此外,从 DNA42842 共有序列构建了合成寡核苷酸杂交探针,其具有以下核苷酸序列:

Hybridisierungssonde CGTGCTGGAGGGCAAGTGTCTGGTGGTGTGCGACTCGAAC(42842.p1;SEQ ID NO:131)。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO1382 基因的克隆。用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人乳腺癌中分离出来的。

如上所述对分离的克隆进行 DNA 测序,提供了 PRO1382 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA66526-1616 [飞哥。 31,SEQ ID NO:31];和来自 PRO1382 的蛋白质序列。

PRO1382的完整编码序列如图所示飞哥。 31(序列号:31)。克隆

DNA66526-1616 包含一个单一的开放阅读框,在核苷酸位置 337-339 有一个明显的翻译起始位点,在核苷酸位置 940-942 有一个明显的终止密码子。预测的多肽前体长度为 201 个氨基酸。显示的全长 PRO1382 蛋白飞哥。 32(SEQ ID NO:32)具有约21,808道尔顿的估计分子量和约9.04的pI。其他特征包括大约在氨基酸 1-27 处的信号肽;大约在氨基酸 29-32 和 88-91 处的潜在 N-糖基化位点;和大约在氨基酸 92-126、159-178 和 191-200 处与 C1q 蛋白同源的区域。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 32(SEQ ID NO:32)显示出 PRO1382 的氨基酸序列与 Dayhoff 序列号之间的显着同源性。 CERL_RAT。还证明了 PRO1382 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的同源性:CERB_HUMAN、S769751、A41752、HUMC1QB21、A57131、CALA_HUMAN、ACR3_MOUSE 和 COLE_LEPMA。

克隆 DNA66526-1616 于 1998 年 9 月 9 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 203246。

例 20

编码人 PRO1410 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ728]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别 EST 库序列,指定为 Incyte EST 库序列号。 98502。然后对照各种表达序列标签 (EST) 数据库检查这个汇集的 EST 序列,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)与确定现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。由此产生的共有序列在此处称为 DNA56451。

鉴于 DNA56451 序列与在 Incyte EST 克隆中发现的 EST 序列之间的序列同源性。 1257046,克隆 125046 购自 Incyte EST,获得 cDNA 插入片段并测序。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 33在本文中称为 DNA68874-1622。

克隆 DNA68874-1622 包含一个单一的开放阅读框,在第 152-154 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 866-868 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 33;序列号:33)。预测的多肽前体长度为 238 个氨基酸(飞哥。 3. 4).显示的全长 PRO1410 蛋白飞哥。 3. 4它的估计分子量约为 25,262 道尔顿,pI 约为 6.44。显示的全长 PRO1410 序列分析飞哥。 3. 4(SEQ ID NO:34)显示存在以下内容:从约氨基酸 1 到约氨基酸 20 的信号肽,从约氨基酸 194 到约氨基酸 220 的跨膜结构域,和潜在的 N-糖基化位点来自大约第 132 位氨基酸到大约第 135 位氨基酸。克隆 DNA68874-1622 于 1998 年 9 月 22 日保藏在 ATCC 中,ATCC 登录号为203277。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 3. 4(SEQ ID NO:34)显示 PRO1410 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在显着同源性:148652、P_R76466、HSMHC3W36A2、EPB4_HUMANO、P_R14256、EPA8_MOUSE、P_R77285、P_W13569、AF0005601年ASF_HELAN。

例 21

编码人 PRO1555 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ763]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法能够从 LIFESEQ® 数据库中识别 EST 库序列,指定 EST 库编号。 521,在本文中也称为“DNA10316”。然后将该 EST 库序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库(包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和 LIFESEQ® 数据库)进行比较,以确定现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。所得共有序列在本文中称为“DNA56374”。

鉴于 DNA56374 序列与 Incyte EST no. 中公开的 EST 序列之间的序列同源性。 2855769,EST 号。 2855769 和 cDNA 插入片段已获得并测序。美国东部时间没有。 2855769 来源于由女性乳腺脂肪组织构建的文库。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 35在本文中称为 DNA73744-1665。

全长显示的克隆飞哥。 35包含一个单一的开放阅读框,在第 90 到 92 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并终止于第 828 到 830 位核苷酸处的终止密码子(飞哥。 35;序列号:35)。预测的多肽前体(飞哥。 36, SEQ ID NO: 36) 的长度为 246 个氨基酸。 PRO1555 的计算分子量约为 26,261 道尔顿,估计​​ p1 约为 5.65。其他特征包括:大约在氨基酸 1-31 处的信号肽;大约氨基酸 11-31 和 195-217 处的跨膜结构域;大约在氨基酸 111-114 处的潜在 N-糖基化位点;潜在的酪蛋白激酶 II 磷酸化位点大约在氨基酸 2-5、98-101 和 191-194;以及大约在氨基酸 146-151 和 192-197 处的潜在 N-豆蔻酰化位点。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 36(SEQ ID NO:36)显示 PRO1555 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在一些同源性:YKA4_CAEEL、AB0145411、HVSX995182、SSU630191、GEN14286、MMU682671、XP2_XENLA、ICP4_HSV11、P_W40200和AE0013601.

克隆 DNA73744-1665 于 1998 年 10 月 6 日保藏在 ATCC 并指定了 ATCC 登录号。 203322。

例 22

编码人 PRO1556 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ764]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从数据库中识别 EST 库序列,指定为 EST 库#103158,在本文中也称为“DNA10398”。然后将该 EST 池序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库(包括公共 EST 数据库(例如,GenBank)和 LIFESEQ® 数据库)进行比较,以识别现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。所得共有序列在本文中称为 DNA56417。

鉴于 DNA56417 序列与 Incyte EST 编号之间的序列同源性。 959332,EST 号。 959332 和 cDNA 插入片段已获得并测序。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 37并在本文中称为 DNA76529-1666。

全长显示的克隆飞哥。 37包含一个单一的开放阅读框,在第 85 位到第 87 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 892 位到第 894 位核苷酸的终止密码子处结束(飞哥。 37;序列号:37)。预测的多肽前体(飞哥。 38, SEQ ID NO: 38) 的长度为 269 个氨基酸。 PRO1556 的计算分子量约为 28,004 道尔顿,估计​​ pI 约为 5.80。附加特征包括:在大约氨基酸 1-24 处的信号肽序列;跨膜结构域在大约氨基酸 11-25 和 226-243 处;在大约氨基酸 182-185 处的潜在 N-糖基化位点,在大约氨基酸 70-73 处的潜在 cAMP 和 cGMP 依赖性蛋白激酶磷酸化位点;和大约在氨基酸 29-34、35-39、117-122、121-126、125-130、154-159、166-171、241-246、246-251、247-252、 249 -254、250-255、251-256、252-257、253-258、254-259、255-260、256-261、257-262 和 259-264。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 38(SEQ ID NO:38)显示出 PRO1556 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的一些同源性:T8F54、R23B_MOUSE、CANS_HUMAN、P_W41640、DSU510911、TP2B_CHICK、DVU206601、S43296、P_R23962 和 BRN1_HUMAN。

克隆 DNA76529-1666 于 1998 年 10 月 6 日保藏在 ATCC 并指定了 ATCC 登录号。 203315。

例 23

编码人 PRO1760 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ833]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别 EST pool 序列。然后将该汇集的 EST 序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)以识别同源性。一种或多种 EST 来源于前列腺肿瘤文库。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。所得共有序列在本文中称为 DNA58798。

鉴于 DNA58798 序列与 Incyte EST 3358745 之间的序列同源性,购买了包含该 EST 的克隆,并获得了 cDNA 插入片段并进行了测序。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 39在本文中称为 DNA76532-1702。

全长显示的克隆飞哥。 39包含一个单一的开放阅读框,在第 60-62 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并以第 624-626 位核苷酸处的终止密码子结束(飞哥。 39;序列号:39)。预测的多肽前体(飞哥。 40, SEQ ID NO: 40) 的长度为 188 个氨基酸。原因在进一步给出飞哥。 40. PRO1760 的计算分子量约为 21,042 道尔顿,估计​​ pI 约为 5.36。克隆 DNA76532-1702 于 1998 年 11 月 17 日保藏在 ATCC 并指定了 ATCC 登录号。 203473。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 40(SEQ ID NO:40)显示 PRO1760 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:CELT07F122、T22J1816、ATF1C123、LEVADURA APE3、P_W22471、SAU569081、SCPA_STRPY、ATAC00423817、SAPURCLUS2 年 AF0414689.

例 24

编码人 PRO1787 [UNQ849] 多肽的 cDNA 克隆的分离

使用 Phrap 相对于其他 EST 序列组装共有 DNA 序列以形成如上文实施例 1 中所述的阵列。该共有序列在本文中称为“DNA45123”。根据汇编中鉴定的 DNA45123 与 Incyte EST 3618549 的同源性以及本文提供的其他证据和信息,购买并测序了包含该 EST 的克隆。克隆的 DNA 测序提供了 PRO1787 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA76510-2504)和 PRO1787 的推导蛋白质序列。

DNA76510-2504 的完整编码序列包含在飞哥。 41(序列号:41)。克隆 DNA76510-2504 包含单个开放阅读框,在 SEQ ID NO: 41 的核苷酸位置 163-165 处具有明显的翻译起始位点,在核苷酸位置 970-972 处具有明显的终止密码子。信号肽、跨膜结构域的大致位置, N-糖基化位点、N-豆蔻酰化位点和激酶磷酸化位点如图所示飞哥。 42(序列号:42)。预测的多肽前体长度为 269 个氨基酸。克隆 DNA76510-2504 于 1998 年 11 月 17 日保藏在 ATCC 并指定了 ATCC 登录号。 203477. 全长 PRO1787 蛋白飞哥。 42它的估计分子量约为 29,082 道尔顿,pI 约为 9.02。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 42(SEQ ID NO:42)揭示了 PRO1787 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:MYP0_RAT、MYP0_HUMAN、MYP0_BOVIN、GEN12838、HSSCN2B21、AF0077831、HSU907161、P_W42015、XLU43330AF060231 的 1 个1.

例 25

编码人 PRO1868 [UNQ859] 多肽的 cDNA 克隆的分离

如上文实施例1所述,使用Phrap组装相对于其他EST序列的共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 DNA49803。基于观察到的 DNA49803 共有序列与因塞特 EST 克隆 # 中鉴定的 EST 序列之间的同源性。 2994689,Incyte EST 克隆号。获得并测序了 2994689 及其插入片段。该插入片段的序列示于图飞哥。 43在本文中称为 DNA77624-2515。

DNA77624-2515的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 43(序列号:43)。克隆 DNA77624-2515 包含一个单一的开放阅读框,在第 51-53 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 981-983 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 43).预测的多肽前体长度为 310 个氨基酸(飞哥。 44).显示的全长 PRO1868 蛋白飞哥。 44它的估计分子量约为 35,020 道尔顿,pI 约为 7.90。显示的全长 PRO1868 序列分析飞哥。 44(SEQ ID NO:44)显示存在以下内容:从约氨基酸 1 到约氨基酸 30 的信号肽,从约氨基酸 243 到约氨基酸 263 的跨膜结构域,从约氨基酸的潜在 N-糖基化位点氨基酸 104 至约氨基酸 107 和约氨基酸 192 至约氨基酸 195,cAMP 和 cGMP 依赖性蛋白激酶磷酸化位点,约氨基酸 107 至约氨基酸 110,酪蛋白激酶 II 磷酸化位点从约氨基酸106到约氨基酸109和从约氨基酸296到约氨基酸299,从约氨基酸69到约氨基酸77的酪氨酸激酶磷酸化位点,和从约氨基酸26到约氨基酸的潜在N-豆蔻醇化位点大约氨基酸31、氨基酸215到氨基酸220、氨基酸226到氨基酸231、氨基酸243到氨基酸248、氨基酸244到氨基酸249和氨基酸262到大约氨基酸267。克隆DNA77624-2515于 1998 年 12 月 22 日在 ATCC 保藏,并指定 ATCC 登录号。 203553。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 44(SEQ ID NO:44)显示 PRO1868 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在显着同源性:HGS_RC75、P_W61379、A33_HUMAN、P_W14146、P_W14158、AMAL_DROME、P_R77437、I38346、NCM2_HUMAN 和 PTPD_HUMAN。

例 26

编码人 PRO4326 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ1883]

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)。使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996)] 将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。)。 .).

使用 Phrap 组装相对于其他 EST 序列的共有 DNA 序列。该共有序列在本文中称为 DNA85767。基于 DNA85767 的共有序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成 PRO4326 的全长编码序列克隆以进行分离。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议,上面,带有 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5′-CGAGGTGCAGATCGAGGTGTCGC-3′

(序列号:132)

反向PCR引物

5'-GGCACTGCAGGAGAACCTCATGGTC-3'

(SEC-ID-Nr.: 133)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA85767 构建合成寡核苷酸杂交探针

杂交探针

(SEC-ID-Nr.: 134)

5'-CAGCAGTGGAGGAGCTCTTTGGGCTGGAGGATTACTGGTGC-3'

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人骨髓组织中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO4326 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA91779-2571 [胆小。四五, SEQ ID NO:45]; (UNQ1883) 和源自 PRO4326 的蛋白质序列。

UNQ1883 (DNA91779-2571)的完整核苷酸序列如图所示胆小。四五(序列号:45)。克隆 UNQ1883 (DNA91779-2571) 包含一个单一的开放阅读框,在第 398-400 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 3233-3235 位核苷酸处的终止密码子处结束(胆小。四五).预测的多肽前体长度为 945 个氨基酸(飞哥。 46).显示的全长 PRO4326 蛋白飞哥。 46它的估计分子量约为 103,638 道尔顿,pI 约为 5.94。显示的全长 PRO4326 序列分析飞哥。 46(SEQ ID NO:46)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 46.克隆 UNQ1883 (DNA91779-2571) 于 1999 年 3 月 16 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 203844。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 46(SEQ ID NO:46)显示 PRO4326 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在显着同源性:RNU873061、P_W78900、MMU726341、AF0556341, P_W78899, P_W78901, AB0052971、TSP1_CHICK、SSPO_BOVIN 和 CFU559351.

例 27

编码人 PRO4332 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ1887]

编码天然人 PRO4332 多肽的 cDNA 克隆 ​​(DNA100272-2969) 是在人乳腺癌 cDNA 文库中使用酵母选择鉴定的,它优先代表初级 cDNA 克隆的 5' 端。

克隆 DNA100272-2969 包含一个单一的开放阅读框,在第 483-485 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 807-809 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 47;序列号:47)。预测的多肽前体长度为 108 个氨基酸(飞哥。 48岁;序列号:48)。显示的全长 PRO4332 蛋白飞哥。 48岁它的估计分子量约为 12,055 道尔顿,pI 约为 4.69。显示的全长 PRO4332 序列分析飞哥。 48岁(SEQ ID NO:48)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 48岁,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA100272-2969 于 2000 年 7 月 25 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-2299。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 48岁(SEQ ID NO:48)显示 PRO4332 的氨基酸序列与 Dayhoff 数据库中的序列之间没有序列同一性。

例 28

编码人 PRO4346 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ1900]

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)。使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996)] 将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。)。 .).

使用 Phrap 相对于其他 EST 序列组装编码 PRO4346 的共有 DNA 序列。该共有序列在本文中称为“DNA81243”。

基于 DNA81243 的共有序列,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成 PRO4346 的全长编码序列克隆以进行分离。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议,上面,带有 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5'GACATATGCTGCCCGCTCCACTCC3'

(SEC-ID-Nr.: 135)

j

反向PCR引物

5'TCTCTTCTCCGCCTGCTTCCTCAGC3'。

(序列号:136)

此外,从 DNA81243 共有序列构建了合成寡核苷酸杂交探针,其具有以下核苷酸序列:

杂交探针 5' GACAACTTCTCTGGCGAAGCTCTCTGGGAACTGGAGGTAGCAGG3' (SEQ ID NO: 137)。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO4346 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人骨髓中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO4346 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA86594-2587 [飞哥。 49,SEQ ID NO:49];和来自 PRO4346 的蛋白质序列。

PRO4346的完整编码序列如图所示飞哥。 49(序列号:49)。克隆 DNA86594-2587 包含一个单一的开放阅读框,在第 218-220 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,在第 1823-1825 位核苷酸处有一个明显的终止密码子。预测的多肽前体长度为 535 个氨基酸(胆小。五十;序列号:50)。克隆 DNA86594-2587 (UNQ1900),命名为 DNA86594-2587,于 1999 年 3 月 30 日保藏于 ATCC,并指定了 ATCC 登录号。 203894. 全长 PRO4346 蛋白胆小。五十它的估计分子量约为 59,716 道尔顿,pI 约为 6.36。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析胆小。五十(SEQ ID NO:50)公开了 PRO4346 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列(序列和相关文本包括在本文中)之间的同源性:P_W78916、HS45P211、HS45P213、HSU905521、HS45P214、P_W71592、S37583、HSAJ031474、MOG_HUMAN与AF0968701.

例 29

编码人 PRO4400 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ1925]

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)以及 Genentech 专有 EST。使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996)] 将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。)。 .).

使用重复的 Phrap 循环相对于其他 EST 序列组装编码 PRO4400 的共有 DNA 序列。该共有序列在本文中称为“DNA77634”。

基于共有序列 77634,合成寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成 PRO4400 分离物的全长编码序列克隆。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议,上面,带有 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5'GCTGCTGCCGTCCATGCTGATG3'

(序列号:138)

j

反向PCR引物

5'CTCGGGGAATGTGACATCGTCGC3'..

(序列号 139)

此外,从 DNA77634 共有序列构建了合成寡核苷酸杂交探针,其具有以下核苷酸序列:

5'-Hybridisierungssonde GCTGCCGTCCATGCTGATGTTTGCGGTGATCGTGG3' (SEQ ID NO: 140)。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用寡核苷酸探针和 PCR 引物之一使用阳性文库分离编码 PRO4400 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人腺癌细胞系中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了 PRO4400 的全长 DNA 序列(本文称为 DNA87974-2609 [飞哥。 51, SEQ ID NO: 51];和推导的 PRO4400 蛋白质序列。

完整的 PRO4400 编码序列如图所示飞哥。 51(序列号:51)。克隆 DNA87974-2609 包含一个单一的开放阅读框,在第 27-29 位核苷酸处具有明显的翻译起始位点,在第 1026-1028 位核苷酸处具有明显的终止密码子。预测的多肽前体长度为 333 个氨基酸(飞哥。 52;序列号:52)。克隆 DNA87974-2609 (UNQ1925),命名为 DNA87974-2609,于 1999 年 4 月 27 日保藏于 ATCC,并指定了 ATCC 登录号。 203963. 全长 PRO4400 蛋白飞哥。 52它的估计分子量约为 38,618 道尔顿,pI 约为 9.27。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 52(SEQ ID NO:52)显示 PRO4400 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间存在同源性:AF0338271、AF0705941、AF0227291、CEC​​34F64、SYFB_THETH、G70405、SD_DROME、S64023、ALKI1YEAST 和 VG04_HSVII。

例 30

编码人 PRO6003 [UNQ2514] 多肽的 cDNA 克隆的分离

编码天然人 PRO6003 多肽的 cDNA 克隆 ​​(DNA83568-2692) 通过酵母筛选在人胎肾 cDNA 文库中鉴定,该文库优先代表初级 cDNA 克隆的 5' 端。

克隆 DNA83568-2692 包含一个单一的开放阅读框,在第 638-640 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 2225-2227 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 53;序列号:53)。预测的多肽前体长度为 529 个氨基酸(飞哥。 54;序列号:54)。显示的全长 PRO6003 蛋白飞哥。 54它的估计分子量约为 59,583 道尔顿,pI 约为 6.36。显示的全长 PRO6003 序列分析飞哥。 54(SEQ ID NO:54)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 54,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA83568-2692 于 1999 年 7 月 20 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号 PTA-386。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 54(SEQ ID NO:54),证明了 PRO6003 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:P_W58986、PTND71、YKZ3_HEFE、CEK04B121、AB0144641、PCU070591、S31213、CELF25E22、AF0364081 年 AB0079321.

例 31

编码人 PRO6094 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ2542]

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括专有的 EST 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)。使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996)] 将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。)。 .).

如上所述,使用 Phrap 相对于其他 EST 序列组装了共有 DNA 序列。该共有序列在本文中称为 DNA94621。在某些情况下,DNA94621 共有序列源自中间共有 DNA 序列,该序列已使用 BLAST 和 Phrap 的重复循环进行了扩展,以使用上述 EST 序列来源尽可能地扩展该中间共有序列。

基于 DNA94621 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成 PRO6094 的全长编码序列克隆以进行分离。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,Current Protocols in Molecular Biology,supra,使用 PCR 引物对,通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

直接PCR引物

5'GGAGAGGTGGATCACTCGACCCG'

(SEC-ID-Nr.: 141)

j

反向PCR引物

5'ACATGCCAGGGACTCCTCCGAAAC3'..

(SEC-ID-Nr.: 142)

此外,从具有以下核苷酸序列的共有序列 DNA94621 构建合成寡核苷酸杂交探针:

5'-Hybridisierungssonde GTGGATCACTCGACCCGCTTAATTTTCGGATCCTGTGCTGCTG' (SEQ ID NO: 143)。

为了筛选多个文库以获得全长克隆的来源,使用上述 PCR 引物对通过 PCR 扩增分析文库中的 DNA。然后使用探针寡核苷酸和 PCR 引物之一,使用阳性文库分离编码 PRO6094 基因的克隆。

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人肾上腺组织中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序提供了全长 PRO6094 多肽的全长 DNA 序列(本文称为 DNA96995-2709 (飞哥。 55; SEQ ID NO:55)和推导的该 PRO6094 多肽的蛋白质序列。

先前鉴定的全长克隆包含一个单一的开放阅读框,在第 197-199 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,在第 3266-3268 位核苷酸处有一个终止信号(飞哥。 55,序列号:55)。预测的多肽前体长度为 1,023 个氨基酸,计算分子量约为 111,682 道尔顿,估计​​ pI 约为 4.72。显示的全长 PRO6094 序列分析飞哥。 56(SEQ ID NO:56)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 56,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA96995-2709 于 1999 年 8 月 3 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号 PTA-475。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 56(SEQ ID NO:56),证明了 PRO6094 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:AB0231441、152657、XLXOLL1、P_W40224、DAF_CAVPO、HSBMP161、P_P80618、GEN10655、P_P94774 和 P_R66683。

例 32

编码人 PRO6244 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ2564]

编码天然人类 PRO6244 多肽的 cDNA 克隆 ​​(DNA108743-2722) 是通过酵母筛选在人类 cDNA 文库中鉴定出来的,它优先代表初级 cDNA 克隆的 5' 端。

克隆 DNA108743-2722 包含一个单一的开放阅读框,在第 18-20 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 1218-1220 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 57;序列号:57)。预测的多肽前体长度为 400 个氨基酸(飞哥。 58;序列号:58)。显示的全长 PRO6244 蛋白飞哥。 58它的估计分子量约为 44,876 道尔顿,pI 约为 8.32。显示的全长 PRO6244 序列分析飞哥。 58(SEQ ID NO:58)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 58,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA108743-2722 于 1999 年 8 月 10 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号 PTA-508。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 58(SEQ ID NO:58),验证了 PRO6244 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:P_W29676; 145887; YN99_HEFE; S63403; S75481; RS2_SPICI; HGS_RK142; A44811;和 CTRLTFYES1.

例 33

编码人 PRO9820 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ3022]

DNA108769-2765 是通过将基因泰克公司(加利福尼亚州南旧金山)开发的专有信号序列搜索算法应用于 EST 并汇集和组装来自公共来源(例如 GenBank)和/或的 EST 片段来识别的。或私下(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Inc., Palo Alto, California)。信号序列算法根据所考虑的序列或序列片段 5' 端第一个和任选第二个甲硫氨酸 (ATG) 密码子周围的 DNA 核苷酸的特征计算分泌信号值。第一个 ATG 之后的核苷酸必须编码至少 35 个没有终止密码子的独特氨基酸。如果第一个 ATG 具有所需的氨基酸,则不检查第二个。如果都不符合要求,则不评估候选序列。为了确定 EST 序列是否包含真实的信号序列,使用已知与分泌信号相关联的一组七个传感器(评分参数)对 ATG 密码子周围的 DNA 和相应的氨基酸序列进行评分。

使用上述信号序列算法能够从 Incyte 数据库中识别 EST 序列,在本文中称为 DNA20895,在本文中也称为 DNA85061。

基于 DNA85061 序列,克隆号。 3110062H1 购自 Incyte,cDNA 插入片段获自人外分泌腺组织并测序。此处发现 cDNA 插入片段编码全长蛋白质。该 cDNA 插入片段的序列在本文中称为 DNA108769-2765。

克隆 DNA108769-2765 包含一个单一的开放阅读框,在第 133-135 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并终止于第 1834-1836 位核苷酸处的终止密码子(飞哥。 59;序列号:59)。预测的多肽前体长度为 567 个氨基酸(飞哥。 60;序列号:60)。显示的全长 PRO9820 蛋白飞哥。 60它的估计分子量约为 65,118 道尔顿,pI 约为 8.33。显示的全长 PRO9820 序列分析飞哥。 60(SEQ ID NO:60)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 60,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA108769-2765 于 1999 年 10 月 19 日保藏于 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-861。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 60(SEQ ID NO:60),验证了 PRO9820 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:S43720; CLP_HUMAN; P_W93002; AB010089S31; AB009666S21; JC5925; PSU260251; S50756; P_W56024;和 P_W53469。

例 34

编码人 PRO9828 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ3027]

如上文实施例1所述,使用Phrap组装相对于其他核酸序列的共有DNA序列。该共有序列在本文中称为 DNA139814。基于 DNA139814 的共有序列,合成了寡核苷酸:1) 通过 PCR 鉴定包含感兴趣序列的 cDNA 文库和 2) 用作探针以生成用于分离 PRO9828 的全长编码序列的克隆。正向和反向 PCR 引物的长度通常为 20 到 30 个核苷酸,通常设计为提供长度约为 100 到 1000 bp 的 PCR 产物。探针序列的长度通常为 40-55 bp。在某些情况下,当共有序列大于约 1-1.5 kbp 时,会合成额外的寡核苷酸。为了筛选全长克隆的多个文库,根据 Ausubel 等人,通过 PCR 扩增文库中的 DNA。分析,分子生物学的当前协议,上面,带有 PCR 引物对。然后使用探针寡核苷酸和引物对之一,使用阳性文库分离编码目的基因的克隆。

合成 PCR 引物(正向和反向):

5'-AATCTCAGCACCAGCCACTCAGAGCA-3'

(SEC-ID-Nr.: 144)

5'-GTTAAAGAGGGTGCCCTTCCAGCGA-3'

(SEC-ID-Nr.: 145)

5'-TATCCCAATGCCTCCCCACTGCTC-3'

(序列号:146)

5'-GATGAACTTGGCGAAGGGGCGGCA-3'

(SEC-ID-Nr.: 147)

用于构建 cDNA 文库的 RNA 是从人胎肝组织中分离出来的。用于分离 cDNA 克隆的 cDNA 文库是使用市售试剂(例如来自 Invitrogen, San Diego, California 的试剂)通过标准方法构建的。与 NotI,通过凝胶电泳适当确定大小并以确定的方向克隆到适当的克隆载体(例如 pRKB 或 pRKD;pRK5B 是缺少 SfiI 位点的 pRK5D 的前体;参见 Holmes 等人,科学,253:1278-1280 (1991))在独特的 XhoI 和 NotI 位点。

如上所述分离的克隆的 DNA 测序揭示了全长 PRO9828 多肽的全长 DNA 序列(本文称为 DNA142238-2768 [飞哥。 61,SEQ ID NO:61])和该 PRO9828 多肽的推导蛋白质序列。

先前鉴定的全长克隆包含一个单一的开放阅读框,在第 232-234 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,在第 985-987 位核苷酸处有一个终止信号(飞哥。 61,序列号:61)。预测的多肽前体长度为 251 个氨基酸,计算分子量约为 27,954 道尔顿,估计​​ pI 约为 9.22。显示的全长 PRO9828 序列分析飞哥。 62(SEQ ID NO:62)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 62,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。染色体图谱表明编码 PRO9828 的核酸映射到人类染色体 12p13。克隆 DNA142238-2768 于 1999 年 10 月 5 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-819。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 62(SEQ ID NO:62),证明了 PRO9828 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:P_Y08581、AB0181221、FGF3_HUMANO、P_R70824、S54407、P_R80780、P_Y23761、P_W92312、OMFGF61 和 P_R80871。

例 35

分离编码人 PRO10274 多肽的 cDNA 克隆 ​​[UNQ3122]

来自公共 Swiss-Prot 数据库的大约 950 种已知分泌蛋白的细胞外域 (ECD) 序列(包括分泌信号序列,如果存在)用于搜索 EST 数据库。 EST 数据库包括 (1) 公共 EST 数据库(例如,GenBank 和默克/华盛顿大学),(2) 专有 EST 数据库(LIFESEQ®,Incyte Pharmaceuticals,Palo Alto,California),以及 (3) Genentech 专有 EST 数据库].使用软件 BLAST 或 BLAST2 [Altschul 等人,酶学方法,266:460-480 (1996)] 将 ECD 蛋白质序列与 EST 序列的 6 帧翻译进行比较。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇集并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析成共有 DNA 序列。)。 .).

如上所述,使用 Phrap 相对于其他 EST 序列组装了共有 DNA 序列。该共有序列在本文中称为 DNA 120444 所讨论的 EST 序列的来源。多于。

EST 克隆#4522347 接下来购自 LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California,获得来自该克隆的 cDNA 插入片段并完全测序。

从上述克隆获得的插入片段的 DNA 测序提供了全长 PRO10274 多肽的全长 DNA 序列(本文称为 DNA139686-2823 [飞哥。 63, SEQ ID NO: 63]) 和推导的该 PRO10274 多肽的蛋白质序列。

先前鉴定的全长克隆包含一个单一的开放阅读框,在核苷酸位置 2-4 处有一个明显的翻译起始位点,在核苷酸位置 1412-1414 处有一个终止信号(飞哥。 63,序列号:63)。预测的多肽前体长度为 470 个氨基酸,计算分子量约为 52,118 道尔顿,估计​​ pI 约为 5.06。显示的全长 PRO10274 序列分析飞哥。 64(SEQ ID NO:64)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 64,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA139686-2823 于 2000 年 2 月 2 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-1264。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 64(SEQ ID NO:64),证明了 PRO10274 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:af1518481、cec27h64、ceb04912、auto36h122、cet05g510、ynp7_caeel、celc16c817、p_w61533、rdaxx1 焦耳 hsf08111.

例 36

编码人 PRO16090 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ5783]

DNA144844-2843 是通过将基因泰克公司(加利福尼亚州南旧金山)开发的专有信号序列搜索算法应用于 EST 并汇集和组装来自公共来源(例如 GenBank)和/或的 EST 片段来识别的。或私下(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Inc., Palo Alto, California)。信号序列算法根据所考虑的序列或序列片段 5' 端第一个和任选第二个甲硫氨酸 (ATG) 密码子周围的 DNA 核苷酸的特征计算分泌信号值。第一个 ATG 之后的核苷酸必须编码至少 35 个没有终止密码子的独特氨基酸。如果第一个 ATG 具有所需的氨基酸,则不检查第二个。如果都不符合要求,则不评估候选序列。为了确定 EST 序列是否包含真实的信号序列,使用已知与分泌信号相关联的一组七个传感器(评分参数)对 ATG 密码子周围的 DNA 和相应的氨基酸序列进行评分。

使用上述信号序列算法能够从 Incyte 数据库中识别 EST 簇序列,在本文中称为 1607358。然后将该 EST 簇序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, California)以识别现有的同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。所得共有序列在本文中称为 DNA87966。

鉴于观察到的 DNA87966 序列与克隆号中包含的 EST 序列之间的序列同源性。来自 Incyte 数据库的 1607358,克隆号。 1607358 和 cDNA 插入片段已获得并测序。该 cDNA 插入片段被发现用于编码全长蛋白质。该 cDNA 插入片段的序列示于图胆小。六十五在本文中称为 DNA144844-2843。

克隆 DNA144844-2843 包含一个单一的开放阅读框,在第 88-90 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 523-525 位核苷酸处的终止密码子处结束(胆小。六十五;序列号:65)。预测的多肽前体长度为 145 个氨基酸(飞哥。 66;序列号:66)。显示的全长 PRO16090 蛋白飞哥。 66它的估计分子量约为 16,618 道尔顿,pI 约为 5.26。显示的全长 PRO16090 序列分析飞哥。 66(SEQ ID NO:66)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 66,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA144844-2843 于 2000 年 3 月 21 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-1536。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 66(SEQ ID NO:66),证明了 PRO16090 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:P_W62772、AF1610801、T04798、D841311、D883581, GUNA_MICBI, T16251, AF0016281、AF1767841 年 T26081。

例 37

编码人 PRO19644 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ5825]

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别 EST pool 序列。然后将该汇集的 EST 序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)以识别同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。由此产生的共有序列在此处称为 DNA60765。根据 DNA60765,鉴定出 DNA139592-2866。

显示的全长克隆(此处指定为 DNA139592-2866)。飞哥。 67包含一个单一的开放阅读框,在第 192-194 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并以在第 1122-1124 位核苷酸处发现的终止密码子结束(飞哥。 67;序列号:67)。预测的 PRO19644 多肽前体 (飞哥。 68, SEQ ID NO: 68) 的长度为 882 个氨基酸。 PRO19644 的计算分子量约为 98428 道尔顿,估计​​ pI 约为 8.89。

使用显示的全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 68(SEQ ID NO:68)揭示了 PRO19644 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列(序列和相关文本并入本文)之间的同源性:P_W56538。

克隆 DNA139592-2866 于 2000 年 3 月 28 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-1587。

例 38

编码人 PRO21340 多肽的 cDNA 克隆的分离 [UNQ5982]

编码天然人 PRO21340 多肽的 cDNA 克隆(DNA 176775-2957)通过酵母筛选在 cDNA 文库中鉴定,cDNA 文库源自优先含有初级 cDNA 代表克隆的 5' 端的人体组织混合物。

克隆 DNA176775-2957 包含一个单一的开放阅读框,在第 128-130 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 2489-2491 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 69;序列号:69)。预测的多肽前体长度为 787 个氨基酸(飞哥。 70;序列号:70)。显示的全长 PRO21340 蛋白飞哥。 70它的估计分子量约为 87934 道尔顿,pI 约为 5.49。显示的全长 PRO21340 序列分析飞哥。 70(SEQ ID NO:70)证明存在多种重要的多肽结构域,如图所示飞哥。 70,其中为这些重要的多肽结构域提供的位置大致对应于上述那些。克隆 DNA176775-2957 于 2000 年 7 月 25 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 PTA-2303。

使用图 1 所示完整序列的 ALIGN-2 序列比对分析对 Dayhoff 数据库(版本 35.45 SwissProt 35)进行分析飞哥。 70(SEQ ID NO:70),证明了 PRO21340 的氨基酸序列与以下 Dayhoff 序列之间的序列同一性:MFTMDCIII1、HSA1330051、ADO2_HUMANO、P_R87036、S18968、P_W44120、AF1674031、AF1719311、AF0298991 年 AF0299001.

例 39

编码人 PRO1026 [UNQ511] 多肽的 cDNA 克隆的分离

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别 EST pool 序列。然后将该合并的 EST 序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有的 EST DNA 数据库(Lifeseq®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)以识别同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。所得共有序列在本文中称为 DNA56434。

鉴于在 DNA56434 序列和因塞特 EST 克隆号编码的 EST 序列之间观察到的序列同源性。 1227491,克隆 1227491 购自 Incyte EST,获得 cDNA 插入片段并测序。发现该插入片段编码全长蛋白质。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 77在本文中称为 DNA59613-1417。

DNA59613-1417的完整核苷酸序列如图所示飞哥。 77(SEQ ID NO:77)。克隆 DNA59613-1417 包含一个单一的开放阅读框,在第 233-235 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并在第 944-946 位核苷酸处的终止密码子处结束(飞哥。 77).预测的多肽前体长度为 237 个氨基酸(飞哥。 78).显示的全长 PRO1026 蛋白飞哥。 78它的估计分子量约为 25,284 道尔顿,pI 约为 5.74。克隆 DNA59613-1417 已保藏在 ATCC。关于序列,可以理解保藏的克隆包含正确的序列并且本文提供的序列基于已知的测序技术。

根据对 SEQ ID NO: 78 的氨基酸序列的分析,推定的信号肽位于 SEQ ID NO: 78 的大约氨基酸 1-25 处。N-糖基化位点位于大约氨基酸 45-48、73 处SEQ ID NO: 78 的 -76、107-110、118-121、132-135、172-175、175-178 和 185-188。节肢动物防御素的保守区大约位于 SEQ ID NO: 78 的氨基酸 176-182 ID NO:78。kringle 结构域开始于 SEQ ID NO:78 的大约氨基酸 128,ly-6/u-PAR 结构域开始于 SEQ ID NO:78 的大约氨基酸 6。这些和其他的相应核苷酸给定本文提供的序列,可以常规确定氨基酸序列。

Dayhoff 数据库中出现的与 PRO1026 共享某些序列同一性的名称如下:SSC20F101; SF041083; P_W26579; S44208; JC2394; PSTA_DICDI; A27020; S59310; RAGI1_RABIT; y MUBALBC11.

例 40

编码人 PRO1124 (UNQ18919) 多肽的 cDNA 克隆的分离

使用上面实施例 3 中描述的信号序列算法允许从 Incyte 数据库中识别单个 EST 库序列。然后将该汇集的 EST 序列与各种表达序列标签 (EST) 数据库进行比较,包括公共 EST 数据库(例如 GenBank)和专有 EST DNA 数据库(LIFESEQ®, Incyte Pharmaceuticals, Palo Alto, CA)以识别同源性。使用 BLAST 或 BLAST2 软件(Altshul 等人,酶学方法266:460-480(1996))。那些导致 BLAST 得分为 70(或在某些情况下为 90)或更高但未编码任何已知蛋白质的比较被汇总并使用“phrap”程序(Phil Green,华盛顿大学,西雅图,华盛顿)进行分析进入共识 DNA 序列,美国)。由此产生的共有序列在此处称为 DNA56035。

鉴于在 DNA56035 共有序列和因塞特 EST 克隆 # 中编码的 EST 序列之间观察到的序列同源性。 2767646,克隆 2767646 购自 Incyte EST,获得 cDNA 插入片段并测序。发现该插入片段编码全长蛋白质。该 cDNA 插入片段的序列示于图飞哥。 75在本文中称为 DNA60629-1481。

全长显示的克隆飞哥。 75包含一个单一的开放阅读框,在第 25-27 位核苷酸处有一个明显的翻译起始位点,并以第 2782-2784 位核苷酸处的终止密码子结束(飞哥。 75;序列号:75)。预测的多肽前体(飞哥。 76, SEQ ID NO: 76) 的长度为 919 个氨基酸。 PRO1124 的计算分子量约为 101,282 道尔顿,估计​​ pI 约为 5.37。克隆 DNA60629-1481 于 1998 年 6 月 16 日保藏在 ATCC,并已指定 ATCC 登录号。 209979.保藏的克隆被认为具有实际序列,此处仅提供基于当前测序技术的表示,可能包含正常和轻微错误。

基于全长序列的 WU-BLAST2 序列比对分析,PRO1124 显示出与氯离子通道蛋白和 ECAM-1 显着的氨基酸序列同一性。特别是,确定了以下与 PRO1124 具有序列同一性的 Dayhoff 名称:ECLC_BOVIN、AF0012611、P_WO6548、SSC6A101、AF0043551、S76691、AF017642、BYU068662、CSA_DICDI和SAU471392.

例 41

表达 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO18.87 PRO432 的小鼠的生成和分析, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 基因修饰

探究 PRO194、PRO220、PRO241、PRO284、PRO331、PRO354、PRO355、PRO533、PRO541、PRO725、PRO937、PRO1014、PRO1120、PRO1182、PRO1325、PRO1382、PRO1410、PRO1555、PRO1556、PRO1760、PRO1787、PRO433468 的作用PRO4400、PRO6003、PRO6094、PRO6244、PRO9820、PRO9828、PRO10274、PRO16090、PRO19644、PRO21340、PRO92165、PRO85143、PRO1124、PRO1026 或 PRO23370 多肽,PRO194、PRO3、PRO3、PRO35、PRO5、PRO3、25、PRO5413 中的中断, PRO937, PRO1014, PRO1120, PRO1182, PRO1325, PRO1382, PRO1410, PRO1555, PRO1556, PRO1760, PRO1787, PRO1868, PRO4326 PRO10274, PRO19094, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1327,逆转录病毒插入技术。具体而言,转基因小鼠包含以下变化, PRO4332, PRO4346, PRO4400, PRO6003, PRO6094, PRO6244, PRO9820, PRO9828, PRO10274, PRO16090, PRO19644, PRO21340, PRO92165, PRO85143, PRO1124, PRO1026 或 PRO23370 由基因工程敲除小鼠或敲除小鼠产生。通过 Southern 印迹分析确认突变,以确认 5' 和 3' 端的正确方向。还通过基因组 PCR 进行了基因特异性基因分型,以确认内源性天然转录物的丢失,正如 RT-PCR 使用与插入位点侧翼的外显子杂交的引物所证明的那样。将靶向载体电穿孔到菌株 129 ES 细胞中并鉴定靶向克隆。将选定的克隆显微注射到宿主囊胚中以产生嵌合体。嵌合体与 C57 动物杂交产生 F1 杂合子。杂合子被杂交以产生用于表型分析的野生型、杂合子和纯合子 F2 队列。当产生的 F1 杂合子不足时,很少将 F1 hets 与野生型 C57 小鼠交配以产生足够的杂合子来繁殖队列以测试表型。所有表型分析均在出生后 12 至 16 周之间进行。

结果总结

41.1.包含 DNA26844-1394 (UNQ168) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO194 多肽的基因(命名为 DNA26844-1394)(UNQ168)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM025693 或加入:NM025693 NID:gi 21313375 ref NM025693.1小鼠肌肉RIKEN-Gen cDNA 5730578N08 (5730578N08Rik);蛋白质参考:Q9D8U2 或加入:Q9D8U2 NID:小鼠肌肉(老鼠)。 5730578N08Rik 蛋白(RIKEN cDNA 基因 5730578N08)。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM080652 或访问:NM080652 NID:gi 18087812 ref NM080652.1一个聪明人类似于 RIKEN 基因 cDNA 5730578N08 (MGC15397);人类蛋白质序列对应参考:Q96HV5 或 ACCESSION:Q96HV5 NID:一个聪明人(人类)。假设的蛋白质。人类 SPTRNRDB。

(Video) 新药的故事

感兴趣的小鼠基因是 RIKEN cDNA 5730578N08 基因,它是人类 MGC15397 的同源基因(类似于 RIKEN cDNA 5730578N08 基因)。别名包括 2900010K02Rik。 MGC15397 是一种假设的质膜蛋白,由一个信号肽和六个跨膜片段组成。

重量

总共

观察到的

17

37

十六

70

预期的

17.5

35

17.5

70

卡方。 = 0.26

显着性 = 0.87935

(他/她)= 0.23

平均产仔数 = 7

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 1 和 2 之间的内含子中(访问 NCBI NM025693.1)。

野生型表达组:除骨骼肌、骨骼和脂肪组织外,通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本均检测到目标基因表达。该基因在正常小肠中升高。

RT-PCR 分析表明,在测试的 (-/-) 小鼠 (F-97) 中不存在转录物。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

41.1.1。表型分析(针对改变的基因:DNA26844-1394 (UNQ168)

(a) 一般表型总结:

编码假设的人类膜蛋白直向同源基因的突变导致免疫学异常,其特征是平均血清 TNF-α、MCP-1 和 IL-6 对 LPS 攻击的反应升高。此外,被击倒的男性甘油三酯水平显着增加,体内脂肪总量也增加。纯合子 (-/-) 和杂合子 (+/-) 雄性小鼠均显示骨矿物质密度测量值增加。雌性小鼠 (-/-) 也表现出增加的骨相关测量值。 RT-PCR 不存在转录本。

(b) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

急性期反应:

测试描述:细菌脂多糖 (LPS) 是一种内毒素,因此是急性期反应和全身炎症的有效诱导剂。使用 26 号针头在 200 µl 无菌盐水中对 LPS 水平 I 的小鼠进行腹膜内 (i.p.) 注射亚致死剂量的 LPS。剂量基于注射后 3 小时以 1 µg/g 体重测试的小鼠的平均体重注射;然后抽取 100 µl 血样并在 FACS Calibur 仪器上分析 TNFa、MCP-1 和 IL-6 的存在。

结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 表现出对 LPS 攻击的平均血清 IL-6、MCP-1 和 TNF-α 反应更大。

分析 wt/had/him: 6/4/8

总之,LPS-内毒素攻击表明,与野生型同窝小鼠相比,缺乏编码 PRO194 多肽的基因的基因敲除小鼠具有免疫学异常。特别是,突变小鼠在受到 LPS-内毒素攻击时表现出增强的免疫反应能力(产生 TNF-α、MCP-1 和 IL-6),表明存在明显的促炎反应。 IL-6 有助于 B 细胞活化的晚期阶段。此外,IL-6 在诱导急性期反应和全身炎症中起着至关重要的作用。这表明 PRO194 多肽的拮抗剂(抑制剂)可刺激免疫系统,并将在这种作用对个体有益的情况下发挥作用,例如白血病和其他癌症,以及免疫功能低下的患者。比如艾滋病患者。因此,PRO194 多肽或其激动剂可用于抑制免疫反应,并可作为抑制有害免疫反应的候选物,例如免疫反应。在移植排斥或移植物抗宿主病中。

(c) 表型分析:心脏病学

在心血管生物学领域,已经确定了治疗高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠状动脉疾病、血脂异常如高胆固醇(hypercholesterolemia)和升高的血清甘油三酯(hypertriglyceridemia)、糖尿病和/或肥胖。 .表型测试包括测量血清胆固醇和甘油三酯。

血脂

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。升高的胆固醇水平和升高的血液甘油三酯水平是公认的心血管疾病和/或糖尿病发展的危险因素。测量血脂有助于寻找调节血脂水平的生物开关。增加血脂水平的抑制因素可能有助于降低心血管疾病的风险。在这些血液化学测试中,使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)记录测量值。

结果:

与其野生型对照同窝小鼠相比,雄性基因敲除小鼠 (-/-) 的甘油三酯水平显着增加。

如上所述,与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性小鼠的甘油三酯水平 (-/-) 显着升高。然而,胰岛素水平和葡萄糖耐量试验均未显示异常。由于甘油三酯水平显着升高,具有 PRO194 敲除突变的小鼠可以作为心血管疾病的模型。 PRO194多肽或其编码基因可用于调节血脂如甘油三酯。因此,PRO194多肽或其激动剂可用于治疗心血管疾病,例如高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠心病或高甘油三酯血症和/或肥胖症。

(d) 放射学和骨代谢的表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

结果:

DEXA:与同性别的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性小鼠 (-/-) 的总体脂肪平均百分比更高。此外,在纯合子 (-/-) 和杂合子 (+/-) 雄性小鼠中发现了更高的平均骨矿物质密度。与 (+/+) 相比,雌性小鼠 (-/-) 显示平均骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、全身骨矿物质密度 (BMD)、股骨矿物质密度和脊椎骨矿物质密度增加。 ) 同窝仔和历史媒体。

分析 wt/had/him: 4/4/8

概括:

小鼠 (-/-) 与同性同窝小鼠 (+/-) 相比,平均总体脂肪百分比、骨矿物质密度、骨矿物质含量、BMC/LBM 以及全身和股骨骨矿物质密度增加。这些结果表明,敲除突变体表型与骨骼异常(如骨硬化症)有关。骨硬化症是一种以骨骼异常增厚和硬化以及骨骼异常脆性为特征的病症。因此,PRO194 多肽或其激动剂将有益于骨硬化病的治疗。与增加的骨矿物质含量和全身和股骨矿物质密度相关的表型表明模拟这些作用的药物(例如,PRO194 多肽拮抗剂)将可用于骨愈合。

(e) 表达式配置文件

表达谱分析表明 UNQ168 在正常小肠中升高。因此,该基因很可能与肠道的先天免疫有关。

41.2。包含 DNA32298-1132 (UNQ194) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO220 多肽的基因(命名为 DNA32298-1132)(UNQ194)被破坏。这些研究的基因具体信息如下: 突变小鼠基因对应于参考核苷酸:D49802 或 ACCESSION:D49802 NID:1369905小家鼠富含亮氨酸重复蛋白的 mRNA;蛋白质参考:P97860 或 ACCESSION:P97860 NID:小鼠肌肉(老鼠)。富含亮氨酸的重复蛋白质前体(片段)。 SPTRNRDB 鼠标;人类基因序列参考:NM 018334 或一个聪明人富含亮氨酸的神经元重复序列 3 (LRRN3);人类蛋白质序列对应参考:Q9H3W5 或 ACCESSION:Q9H3W5 NID:一个聪明人(人类)。 79.4 KDA 的假设蛋白质(富含亮氨酸 3 的神经元重复蛋白质)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Lrrn3(神经元富含亮氨酸重复蛋白 3),人类 LRRN3(神经元富含亮氨酸重复蛋白 3)的直系同源物。别名包括 NLRR-3; NLRR3; FLJ1129;和富含亮氨酸的重复蛋白,神经元 3。

LRRN3 是一种 I 型质膜蛋白,由胞外区段、跨膜区段和短胞质 C 末端组成。细胞外片段由一个信号肽、几个富含亮氨酸的重复序列、一个免疫球蛋白样结构域和一个纤连蛋白 III 型结构域组成;细胞质结构域包含网格蛋白介导的内吞作用的基序。由于免疫球蛋白样结构域和纤连蛋白 III 型结构域通常参与蛋白质-蛋白质相互作用,因此 LRRN3 可以作为信号转导或细胞粘附分子发挥作用(Taniguchi 等人,2008 年)。脑资源 Mol 脑资源;36(1):45-52 (1996);J.生物学。化学。277(46):43549-52 (2002)。在用 LRRN3 表达质粒转染的成纤维细胞中,LRRN3 可能促进 EGF 内化到网格蛋白包被的囊泡中并增强 Ras-MAPK 信号传导(Fukamachi 等人,2008 年)。J.生物学。化学。277(46):43549-52 (2002)。 LRRN3 表达在发育中的大脑中最高,在受伤的大脑中升高,表明该蛋白质可能在神经系统的发育和维持中发挥作用(Taniguchi 等人,脑资源 Mol 脑资源;36(1):45-52 (1996);伊希特等人。脑资源 Mol 脑资源;40(1): 148-52 (1996), Fukamachi 等人。J.生物学。化学。277(46):43549-52 (2002)。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

18

31

23

72

预期的

18

36

18

72

卡方。 = 2.08

显着性 = 0.35287

(他/她)= 0.32

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 D49802.1)。

野生型表达组:在大脑、脊髓、眼睛、脾脏、肝脏和脂肪组织中通过 RT-PCR 分析的 13 个成人组织样本中检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.2.1。表型分析(针对改变的基因:DNA32298-1132 (UNQ194)

(a) 一般表型总结:

与其野生型同性同窝小鼠和历史平均值相比,纯合子突变小鼠显示出平均体脂百分比增加和脂肪量增加,以及骨骼相关测量值异常。此外,与它们的同性野生型同窝小鼠相比,纯合子突变小鼠表现出葡萄糖耐量增加和胰岛素敏感性增加。突变小鼠在现场测试中也表现出活动减少,这表明它们患有抑郁症。热板结果表明伤害性反应或敏感性增加。目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

(b) 骨代谢和放射学的表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性和雌性小鼠 (-/-) 的总体脂肪平均百分比更高。雌性小鼠 (-/-) 的平均总脂肪量也有所增加。

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,显示平均皮质厚度和股骨干横截面积减少。

分析 wt/had/him: 4/4/8

概括:

通过 DEXA 分析的小鼠 (-/-) 显示与其同窝小鼠 (+/+) 相比骨骼评分降低,表明骨骼疾病异常。此外,雄性和雌性 (-/-) 突变小鼠也表现出增加的平均体脂百分比,表明存在肥胖表型。这些观察结果表明,缺乏编码 PRO220 多肽的基因的突变小鼠会导致与脂肪堆积相关的代谢紊乱,但也会导致骨骼读数异常,这反映了可能与肥胖相关的一般代谢紊乱。这与血液化学分析(显示葡萄糖耐量增加)相结合,表明突变小鼠表现出复杂的代谢效应,包括异常的葡萄糖代谢。此外,突变小鼠表现出胰岛素敏感性增加,胰岛素水平没有变化,但葡萄糖耐量增加。因此,PRO220 多肽或其激动剂可用于治疗或预防疾病,如肥胖或其他代谢疾病。

(c) 表型分析:代谢血液化学/葡萄糖耐量

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括葡萄糖耐量试验,以测量胰岛素敏感性和葡萄糖代谢的变化。葡萄糖耐量试验结果异常可能表明但不限于以下疾病或病症:1 型和 2 型糖尿病、X 综合征、各种心血管疾病和/或肥胖症。

方法:在该测定中使用一组 2 只野生型和 4 只纯合小鼠。葡萄糖耐量试验是确定哺乳动物体内葡萄糖稳态受损的标准。使用 Lifescan 血糖仪进行葡萄糖耐量测试。给动物腹腔注射 2 g/kg D-葡萄糖(20% 溶液),并在注射后 0、30、60 和 90 分钟测量血糖水平。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

葡萄糖耐量测试:与同性别的同窝小鼠 (+/+) 相比,经过测试的 (-/-) 突变小鼠表现出更高的葡萄糖耐量。

分析 wt/had/him: 4/4/8

概括:

在这些研究中,突变小鼠 (-/-) 在所有 3 个测试时间间隔内表现出在空腹血糖正常的情况下与它们的同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比葡萄糖耐量增加。此外,在 (-/-) 小鼠中没有明显的高胰岛素血症。因此,基因敲除小鼠表现出胰岛素敏感性增加或葡萄糖稳态受损的相反表型模式,因此 PRO220 多肽或其编码基因的拮抗剂(抑制剂)可用于治疗葡萄糖稳态受损。

(d) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。分析 wt/het/hom:5/4/8

结果:

在露天活动测试期间观察到明显的差异。与同性同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性小鼠 (-/-) 在中央区域显示出增加的中位总和时间,表明突变体对恐惧的反应同样减少。因此,敲除小鼠表现出与重度抑郁症、精神分裂症和/或双相情感障碍一致的表型。因此,PRO220 多肽及其激动剂可用于治疗或改善与抑郁症相关的症状。

热板测试

测试描述:通过将每只小鼠放在 55°C 的小型封闭热板上进行伤害感受的热板测试。记录后爪反应(舔、摇或跳)的潜伏期,在热板上的最长时间为 30 秒。每只动物测试一次。

结果:

与同性别的对照同窝小鼠 (+/+) 相比,突变小鼠 (-/-) 表现出更短的反应潜伏期(例如,敏感性差异更大)。这些结果表明伤害性反应增加。

41.3。包含 DNA34392-1170 (UNQ215) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO241 多肽的基因(命名为 DNA34392-1170)(UNQ215)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM025711 或加入:NM025711 NID:gi 13385169 ref NM025711.1小鼠肌肉天冬氨酸 (Aspn);蛋白质参考:Q99MQ4 或 ACCESSION:Q99MQ4 NID:小鼠肌肉(老鼠)。孢子素前体。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM017680 或访问:NM017680 NID:gi 16596677 ref NM017680.2一个聪明人阿斯波林(1 类 LRR)(ASPN);人类蛋白质序列对应参考:Q9BXN1 或 ACCESSION:Q9BXN1 NID:一个聪明人(人类)。孢子素前体。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Aspn (asporin),它是人类 ASPN(asporin [LRR 类 1])的直向同源基因。别名包括 PLAP1、SLRR1C、4631401G09Rik、FLJ20129、富含亮氨酸的小蛋白 1C 和牙周膜相关蛋白 1。

ASPN 是一种分泌型富含亮氨酸的蛋白质,含有与胶原蛋白结合并连接到细胞外基质的重复序列。 ASPN 由信号肽、推定的前肽、4 个氨基末端半胱氨酸、10 个富含亮氨酸的重复序列和 2 个 C 末端半胱氨酸组成。 N 端还包含一个独特的富含天冬氨酸的区域。 ASPN主要表达于骨骼发育、软骨和结缔组织。在骨关节炎的关节软骨、主动脉、子宫、心脏和肝脏中发现了相对高水平的 ASPN。 ASPN 可能在调节胶原纤维的组织或稳定以及牙周韧带组织中矿化基质的形成中发挥作用(Lorenzo 等人,2016 年)。J.生物学。化学。276(15):12201-11 (2001);恩里克等。J.生物学。化学。276(15):12212-21 (2001);山田等人。将军;275(2):279-86 (2001))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

19

37

17

73

预期的

18.25

36.5

18.25

73

卡方。 = 0.12

显着性 = 0.94022

(他/她)= 0.23

平均产仔数 = 7

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 AF316825.1)。

野生型表达组:在通过 RT-PCR 分析的所有 13 个成人组织样本中检测到靶基因表达,肝脏和骨骼除外。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.3.1。表型分析(针对改变的基因:DNA34392-1170 (UNQ215)

(a) 一般表型总结:

编码人阿斯波林直系同源物(LRR 类 1)(ASPN) 的基因突变导致葡萄糖耐量增加,(-/-) 突变小鼠的胰岛素敏感性可能增加。雄性和雌性 (-/-) 小鼠均显示骨骼相关测量值降低。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 表型分析:代谢-血液化学/葡萄糖耐量

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括葡萄糖耐量试验,以测量胰岛素敏感性和葡萄糖代谢的变化。葡萄糖耐量试验结果异常可能表明但不限于以下疾病或病症:1 型和 2 型糖尿病、X 综合征、各种心血管疾病和/或肥胖症。

方法:在该测定中使用一组 2 只野生型和 4 只纯合小鼠。葡萄糖耐量试验是确定哺乳动物体内葡萄糖稳态受损的标准。使用 Lifescan 血糖仪进行葡萄糖耐量测试。给动物腹腔注射 2 g/kg D-葡萄糖(20% 溶液),并在注射后 0、30、60 和 90 分钟测量血糖水平。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

葡萄糖耐量测试:与同性 (+/+) 同窝小鼠相比,所测试的雄性 (-/-) 突变小鼠表现出更高的葡萄糖耐量。

分析 wt/had/him: 4/4/8

概括:

在这些研究中,与它们的同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性突变小鼠 (-/-) 在所有 3 个测试时间间隔内表现出在正常空腹血糖存在的情况下增加或改善的葡萄糖耐量。此外,在 (-/-) 小鼠中没有明显的高胰岛素血症。因此,基因敲除小鼠表现出相反的葡萄糖稳态受损表型模式,因此 PRO241 多肽或其编码基因的拮抗剂(抑制剂)可用于治疗葡萄糖稳态受损和/或各种心血管疾病。

(c) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

DEXA 用于股骨和椎骨中的骨矿物质密度测量 MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

与对应物相比,雌性小鼠 (-/-) 显示出较低的总体体积骨密度(vBMD > 1 个标准差)、总体骨密度(1 个标准差)和股骨骨密度(1 个标准差)。 .同窝仔的匹配对照。与野生型同窝小鼠相比,雄性 (-/-) 小鼠的骨小梁连接体积、数量和密度以及股骨中轴总面积均有所减少。

这些结果表明,敲除突变小鼠具有异常的骨代谢,具有显着的骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,并且可能导致骨折的脆性。因此,PRO241 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO241多肽或其编码基因在骨愈合或关节炎或骨质疏松症的治疗中具有重要意义;而PRO241多肽或其编码基因的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。

41.4。包含 DNA23318-1211 (UNQ247) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO284 多肽的基因(命名为 DNA23318-1211)(UNQ247)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM024273 或加入:NM024273 NID:gi 13357215 ref NM024273.1小鼠肌肉RIKEN 基因 cDNA 4930455C21 (4930455C21Rik);蛋白质参考:Q99LS9 或附件:Q99LS9 NID:小鼠肌肉(老鼠)。类似于 M5-14 蛋白。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM016589 或访问:NM016589 NID:gi 7706124 ref NM016589.1一个聪明人3 号染色体开放阅读框 1 (C3orf1);人类蛋白质序列对应参考:Q9NPL8 或 ACCESSION:Q9NPL8 NID:一个聪明人(人类)。假设的蛋白质 C3orf1。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 RIKEN cDNA 4930455C21 基因,人类 C3orf1(染色体 3 开放阅读框 1)的同源基因。别名包括 2810021C21Rik 和 M5-14 蛋白。

C3orf1 是一种假设的蛋白质转位酶亚基,由 Tim17/Tim22/Tim23 家族的一个结构域组成。该结构域存在于内部线粒体蛋白 Tim17、Tim22 和 Tim23 中。这些蛋白质与线粒体外膜前蛋白转位酶 (Tom) 一起形成转位酶通道,蛋白质通过该通道从细胞质进入线粒体基质。线粒体基质蛋白提供与该复合物相关的 ATP 酶(Pfam 登录号 PF02466)。 C3orf1 表达广泛,但在骨骼肌和心肌中尤其高(Escarceller 等人,DNA序列;11(3-4):335-8 (2000))。

重量

总共

观察到的

22

40

62

预期的

15.5

31

15.5

62

卡方。 = 20.84

显着性 = 0.00003

(他/她)= 0.00

平均产仔数 = 6

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在外显子 5 和 6 编码之间的内含子中(访问 NCBI NM024273.1)。

野生型表达组:通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本中均检测到目标基因表达,骨骼除外。

由于致死率,未进行转录表达分析。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

UNQ247 在早期发育过程中普遍表达。

41.4.1。表型分析(针对改变的基因:DNA23318-1211 (UNQ247)

(a) 一般表型总结:

编码人类 3 号染色体开放阅读框 1 直向同源基因 (C3orf1) 的突变导致突变体 (-/-) 的致死率。小鼠 (+/-) 显示骨骼相关测量值下降。

胚胎发育异常致死率的相关讨论:

敲除小鼠的胚胎致死率通常由几种严重的发育问题引起,包括但不限于神经退行性疾病、血管生成疾病、炎症性疾病,或者当基因/蛋白质在许多细胞类型的基本细胞信号传导过程中发挥重要作用时。此外,致死胚胎可用作潜在的癌症模型。同样,当相应的杂合 (+/-) 突变动物表现出高度指示敲除基因功能的表型和/或病理记录时,它们特别有用。例如,缺乏 EPO 的动物在胚胎方面是致命的,但胚胎的病理报告显示严重的红细胞缺乏症。

(b) 病理学

显微镜观察:由于胚胎致死性,未进行测试。在第 12.5 天,观察到 54 个胚胎:30 个 (+/-) 胚胎、13 个 (+/+) 胚胎、10 个吸收痣和 1 个不确定。致死率发生在胚胎第 12.5 天之前。

基因表达:通过免疫组织化学分析在组织组中未检测到 LacZ 活性。

分析 wt/had/him: 1/2/0

(c) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中分析了一组 4 个野生型和 4 个杂合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只杂合小鼠中取出一根椎骨和一根股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

与野生型同窝小鼠相比,杂合子 (+/-) 雄性小鼠的骨矿物质含量(1 个标准差)和骨矿物质密度(1 个标准差)测量值降低。杂合子 (+/-) 女性的骨矿物质含量、BMC/LBM、全身骨矿物质密度(1 个标准偏差)、股骨骨矿物质密度(1 个标准偏差)和椎骨骨矿物质密度(1 个标准偏差)也有所降低。标准偏差)与野生型同窝仔相比。与同性别的同窝仔 (+/+) 相比,雄性杂合子 (+/-) 显示小梁骨连接的体积、数量、厚度和密度减少。与野生型同窝小鼠相比,股骨中段的皮质厚度也有所减少。因此,编码 PRO284 多肽的基因对于正常的骨骼发育必须是必需的。

41.5。包含 DNA40981-1234 (UNQ292) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO331 多肽的基因(命名为 DNA40981-1234)(UNQ292)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM178725 哦小鼠肌肉RIKEN 基因 cDNA 6430556C10 (6430556C10Rik);蛋白质参考:Q8BGH8 或 ACCESSION:Q8BGH8 NID:小鼠肌肉(老鼠)。与脑肿瘤相关蛋白NAG14弱相似;人类基因序列参考:XM045271 o一个聪明人KIAA1580 蛋白 (KIAA1580);人类蛋白质序列对应参考:Q9HCJ2 或 ACCESSION:Q9HCJ2 NID:一个聪明人(人类)。 KIAA1580 蛋白质(片段)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 RIKEN cDNA 6430556C10 基因,它是人类 NGL-1(netrin G1 配体)的同源基因。别名包括 NGL-1、mKIAA1580、Netrin G1 配体和 KIAA1580。

NGL-1 是一种在纹状体和皮层神经元中表达的 I 型质膜蛋白,可作为轴突引导共受体 netrin-G1 的配体,netrin-G1 是一种在丘脑皮质轴突中表达的脂质锚定蛋白。 NGL-1 由信号肽、富含亮氨酸的重复序列、免疫球蛋白样结构域、跨膜片段和短胞质 C 末端组成。 NGL-1 通过其富含亮氨酸的重复序列与 netrin-G1 相互作用。此外,C 端胞质区段可与细胞内信号转导蛋白相互作用。 NGL-1 在发育过程中起到促进纹状体和大脑皮层丘脑皮质轴突生长的作用 (Lin et al.自然神经科学;6(12): 1270-6 (2003))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

24

43

26

93

预期的

23.25

46.5

23.25

93

卡方。 = 0.61

显着性 = 0.73605

(他/她)= 0.28

平均产仔数 = 9

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 AK048322.1)。

野生型表达组:除了肺、骨骼肌和骨骼外,RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本均检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.5.1。表型分析(针对改变的基因:DNA40981-1234 (UNQ292)

(a) 一般表型总结:

编码人 netrin G1 配体 (NGL-1) 同源基因的突变导致平均血清 IL-6 和 TNF-α 对 LPS 挑战的反应增加。此外,(-/-) 突变小鼠表现出习得性无助的减少。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

急性期反应:

测试描述:细菌脂多糖 (LPS) 是一种内毒素,因此是急性期反应和全身炎症的有效诱导剂。使用 26 号针头在 200 µl 无菌盐水中对 LPS 水平 I 的小鼠进行腹膜内 (i.p.) 注射亚致死剂量的 LPS。剂量基于注射后 3 小时以 1 µg/g 体重测试的小鼠的平均体重注射;然后抽取 100 µl 血样并在 FACSCalibur 仪器上分析 TNFa、MCP-1 和 IL-6 的存在。

结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 显示出对 LPS 攻击的平均血清 IL-6 和 TNF-α 反应更大。

分析 wt/had/him: 6/4/8

总之,LPS-内毒素攻击表明,与它们的野生型同窝小鼠相比,缺乏编码 PRO331 多肽的基因的敲除小鼠具有免疫学异常。特别是,突变小鼠在受到 LPS-内毒素攻击时表现出增强的免疫反应能力(TNF-α 和 IL-6 的产生),表明存在明显的促炎反应。 IL-6 有助于 B 细胞活化的晚期阶段。此外,IL-6 在诱导急性期反应和全身炎症中起着至关重要的作用。这表明 PRO331 多肽的拮抗剂(抑制剂)可刺激免疫系统,并将在这种作用对个体有益的情况下发挥作用,例如在白血病和其他癌症以及免疫功能低下的患者中。比如艾滋病患者。因此,PRO331 多肽或其激动剂可用于抑制免疫反应,并可作为抑制有害免疫反应的候选物,例如免疫反应。在移植排斥或移植物抗宿主病中。

(c) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。

后悬架测试:

尾挂测试是作为啮齿动物抑郁行为模型开发的程序。在这个特定的设置中,一只老鼠被它的尾巴悬吊 6 分钟,作为回应,老鼠挣扎着逃离这个位置。一段时间后,老鼠的挣扎平息,这被解释为一种习得性无助范式。具有无效数据的动物(即,它们在测试期间爬上了尾巴)被排除在分析之外。

结果:

老鼠 (-/-) 在后悬挂测试中表现出更长的反应时间。这些结果表明习得性无助有所减少。因此,突变小鼠表现出与抑郁症相关的表型。

41.6。包含 DNA44192-1246 (UNQ311) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO354 多肽的基因(命名为 DNA44192-1246)(UNQ311)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM172471 哦小鼠肌肉Inter-Alpha(球蛋白)H5 抑制剂 (Itih5); Proteinreferenz: Q80VG0 order ACCESSION: Q80VG0 NID:小鼠肌肉(老鼠)。间-α-胰蛋白酶抑制剂重链 5;人类基因序列参考:NM030569 哦一个聪明人α间(球蛋白)H5 抑制剂 (H5ITI);人类蛋白质序列对应参考:Q86UX2 或 ACCESSION:Q86UX2 NID:一个聪明人(人类)。胰蛋白酶抑制剂 Inter-Alpha-5 重链。

感兴趣的小鼠基因是 Itih5(α 间(球蛋白)H5 抑制剂),人类 ITIH5 的同源基因。别名包括 E130106B02、5430408M01Rik 和 inter-alpha 胰蛋白酶抑制剂重链前体 5。

ITIH5 是α-胰蛋白酶抑制剂 (ITI) 家族分泌型蛋白酶抑制剂的重链亚基。 ITI 全蛋白通常由一条轻链和一组可变的重链组成。 ITIH5 由一个信号肽、一个 von Willebrand 因子 A 型结构域和一个 ITI 重链的 C 端组成。 von Willebrand 因子 A 型结构域通常存在于细胞外蛋白中,并通过金属依赖性粘附位点介导与细胞外基质的粘附(SMART 访问 SM00327)。 ITI 重链 C 端结构域存在于 ITI 重链亚基中。重链亚基本身没有胰蛋白酶抑制活性。相反,它们与透明质酸相互作用并促进细胞外基质的稳定性(Salier 等人,生物化学杂志;315(第 1 部分):1-9(1996 年)。 ITIH5 的缺失可能在乳腺癌的发展中发挥作用(Himmelfarb 等人,癌症拉脱维亚;204(1):69-77 (2004))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

22

32

22

76

预期的

19

38

19

76

卡方。 = 1.89

显着性 = 0.38776

(他/她)= 0.29

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

目的是编码外显子 1(访问 NCBI NM172471.1)。

野生型表达组:通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本中均检测到目标基因表达,骨骼除外。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.6.1。表型分析(针对改变的基因:DNA44192-1246 (UNQ311)

(a) 一般表型总结:

编码人 inter-alpha(球蛋白)抑制剂 H5 (ITIH5) 直系同源基因的突变导致 (-/-) 小鼠外周血中 CD4 细胞的平均百分比增加。雄性小鼠(-/-)也表现出睾丸退化,但没有男性不育的证据。雌性小鼠 (-/-) 的尿酸水平显着升高。敲除小鼠的脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素水平也升高。从通过微阵列分析确定的浸润性乳腺导管癌中表达持续降低的观点来看,该基因很有趣(数据未显示)。睾丸退化表明在肿瘤发展中的作用。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 病理学

显微镜观察: 3 只雄性小鼠 (-/-) 显示出睾丸退化的轻度局灶性病变特征。在可用于分析的 6 只 (-/-) 小鼠中,2 只 (-/-) 小鼠(M-109 和 F-134)显示脾脏和骨髓中的含铁血黄素色素水平升高,另外 2 只 (-/-) . ) 小鼠(F-74 和 F-111)仅在脾脏中显示含铁血黄素增加。敲除小鼠 (M-113) 显示多灶性急性肉芽肿性炎症。

基因表达:通过免疫组织化学分析在组织组中未检测到 LacZ 活性。解析 wt/het/hom:0/1/6

(c) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

荧光激活细胞分选分析 (FACS)。

程序:

进行了外周血免疫细胞组成的 FACS 分析,包括 CD4、CD8 和 T 细胞受体以评估 T 淋巴细胞,CD19 用于 B 淋巴细胞,CD45 作为白细胞标记物和 NK pan 用于自然杀伤细胞。对 2 只野生型小鼠和 6 只纯合小鼠进行了 FACS 分析,包括来自胸腺、脾脏、骨髓和淋巴结的细胞。在这些研究中,测试的细胞是从胸腺、外周血、脾脏、骨髓和淋巴结中分离出来的。开发流式细胞术以确定单核细胞群中 T 细胞、B 细胞、NK 细胞以及 CD4 和 CD8 阳性单核细胞的相对比例。 Becton-Dickinson FACS Calibur 3 激光 FACS 装置用于评估免疫状态。对于表型分析和筛选,该设备记录 CD4+/CD8-、CD8+/CD4-、NK、B 细胞和单核细胞的数量以及 CD4+/CD8+ 比率。

单核细胞概况是通过用一组六种谱系特异性抗体对每只小鼠的单个裂解外周血样本进行染色获得的:CD45 PerCP、抗 TCRbAPC、CD4 PE、CD8 FITC、pan-NK PE 和 CD19、FITC。 FITC 和 PE 标记的抗体染色相互排斥的细胞类型。使用带有 CellQuest 软件的 Becton Dickinson FACS Calibur 流式细胞仪分析样品。

结果:

FACS:与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 的 CD4 细胞平均百分比增加。因此,编码 PRO354 多肽的基因的敲低导致 T 细胞群的增加。根据这些观察,PRO354 多肽或编码 PRO354 的基因似乎充当 T 细胞增殖的负调节剂。PRO354 多肽或其激动剂有利地作为负调节剂在 T 细胞广泛增殖的情况下,T 细胞增殖的影响,如发生在自身免疫性疾病(例如类风湿性关节炎患者中)。此外,PRO354 多肽在预防皮肤移植物排斥方面特别有用。

(d) 血腥

测试描述:Lexicon Genetics 在其临床环境中使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)对小鼠进行血液化学测试。

结果:

与野生型同窝小鼠相比,雌性小鼠 (-/-) 的尿酸水平显着降低。没有观察到肾功能不全的其他迹象。

41.7。包含 DNA39518-1247 (UNQ312) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO355 多肽的基因(命名为 DNA39518-1247)(UNQ312)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM018770 或访问:NM018770 NID:gi 9055173 ref NM018770.1小鼠肌肉免疫球蛋白超家族成员 4 (Igsf4);蛋白质参考:Q9CRY3 或 ACCESSION:Q9CRY3 NID:小鼠肌肉(老鼠)。 3100001108 RIK 蛋白(片段)。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM014333 或加入:NM014333 NID:gi 22095346 ref NM014333.2一个聪明人免疫球蛋白超家族成员 4 (IGSF4);人类蛋白质序列对应参考:Q9BY67 或 ACCESSION:Q9BY67 NID:一个聪明人(人类)。连接蛋白样蛋白 2. HUMANSPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Igsf4(免疫球蛋白超家族,成员 4),它是人类 IGSF4 的同源基因。别名包括 RA175A、RA175B、RA175C、RA175N、SgIGSF、SynCam、BL2、ST17、NECL2、TSLC1、SYNCAM、nectin 样蛋白 2、2900073G06Rik; 3100001108Rik, B12 蛋白免疫超家族和肺癌中的肿瘤抑制因子 1.

IGSF4 是属于免疫球蛋白超家族的一种膜糖蛋白,位于肺上皮细胞的细胞-细胞连接处 (Ito et al.克雷布斯水库;63(19):6320-6 (2003))。 IGSF4 参与细胞粘附,并在非小细胞肺癌和食管鳞状细胞癌中充当肿瘤抑制因子(Fukuhara 等人,2016 年)。致癌基因;22(40):6160-5 (2003);渡边等人,组织学;18(4):1321-9 (2003))。 IGSF4 的细胞质区域包含被认为对其肿瘤抑制活性至关重要的蛋白质基序 (Mao et al.克雷布斯水库;63(22):7979-85 (2003))。 IGSF4 与 MPP3 相关联,MPP3 是果蝇大肿瘤抑制盘 (Dlg),可能是 IGSF4 和 MMP3,参与相同的细胞间相互作用,其破坏可导致恶性肿瘤(Fukuhara 等人,致癌基因;23(2):629 (2004), Fukuhara 等人。致癌基因;22(40):6160-5 (2003))。

重量

总共

观察到的

22

41

15

78

预期的

19.5

39

19.5

78

卡方。 = 1.46

显着性 = 0.48154

(他/她)= 0.19

平均产仔数 = 8

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 1 和 2 之间(登录号:AF434663)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到目标基因表达。

RT-PCR 分析表明,在测试的 (-/-) 小鼠 (M-179) 中,转录本在心脏中不存在,在大脑中减少。

41.7.1。表型分析(针对改变的基因:DNA39518-1247 (UNQ312)

(a) 一般表型总结:

编码人免疫球蛋白超家族成员 4 (IGSF4) 直向同源基因的基因突变导致 (-/-) 小鼠出现更大的探索性反应。小鼠 (-/-) 也表现出对 LPS 攻击的 TNF-α 反应增强。突变小鼠 (-/-) 也表现出生长迟缓和骨骼测量异常的迹象。雄性小鼠 (-/-) 显示平均血清甘油三酯水平升高。如通过 RT-PCR 确定的那样,转录物在心脏中不存在并且在脑中减少。

(b) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan, 1994, John Wiley & Sons, Inc. 许多与免疫系统相关的疾病是已知的,并且已被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

急性期反应:

测试描述:细菌脂多糖 (LPS) 是一种内毒素,因此是急性期反应和全身炎症的有效诱导剂。使用 26 号针头在 200 µl 无菌盐水中对 LPS 水平 I 的小鼠进行腹膜内 (i.p.) 注射亚致死剂量的 LPS。剂量基于注射后 3 小时以 1 µg/g 体重测试的小鼠的平均体重注射;然后抽取 100 µl 血样并在 FACS Calibur 仪器上分析 TNFα、MCP-1 和 IL-6 的存在。

结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 显示出对 LPS 攻击的平均血清 TNF-α 反应更大。

分析 wt/had/him: 8/4/8

总之,LPS-内毒素攻击表明,与野生型同窝小鼠相比,缺乏编码 PRO355 多肽的基因的基因敲除小鼠具有免疫学异常。特别是,突变小鼠在受到 LPS-内毒素攻击时表现出增强的引发免疫反应(TNF-α 产生)的能力,表明明显的促炎反应。这表明 PRO355 多肽的拮抗剂(抑制剂)可刺激免疫系统,并将在这种作用对个体有益的情况下发挥作用,例如白血病和其他癌症,以及免疫功能低下的患者。比如艾滋病患者。因此,PRO355 多肽或其激动剂可用于抑制免疫反应,并可作为抑制有害免疫反应的候选物,例如免疫反应。在移植排斥或移植物抗宿主病中。

(c) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。分析 wt/het/hom:5/4/8

结果:

在露天活动测试期间观察到明显的差异。与同性同窝小鼠 (+/+) 相比,小鼠 (-/-) 的总行走距离和育儿活动更多,这表明突变小鼠对新环境的探索性反应更强。因此,敲除小鼠表现出与多动症一致的表型。因此,PRO355 多肽及其激动剂可用于治疗或减轻与多动症相关的症状。

倒屏测试:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

倒屏测试数据:

倒置屏幕用于测量运动强度/协调性。未经训练的小鼠被单独放置在水平安装在金属杆上的方形金属丝网(7.5 厘米 x 7.5 厘米)上。然后将条旋转 180 度,使老鼠位于屏幕底部。在 1 分钟的测试期间记录了以下行为反应:跌倒、未攀爬和攀爬。

基因型

比例下降 %

比率增加 %

+/+(n = 4)

0/4

3/4

75

+/- (n = 4)

0/4

2/4

50

-/- (n = 8)

8/8

100

0/8

* 编码表示明显的差异。

当 (-/-) 或 (+/-) 小鼠和 (+/+) 小鼠之间的跌倒反应存在 50% 点差异时,电机力缺陷就很明显。 0/8 或 1/8 (-/-) 或 (+/-) 非攀爬小鼠表明运动协调受损。 7/8 或 8/8(-/-) 或 (+/-) 小鼠爬表明运动协调得到改善。

结果:

倒置屏幕测试用于测量基本运动和感官观察:在倒置屏幕测试中,当所有 8 (-/-) 只小鼠从屏幕上掉落时观察到明显差异,而 0/4 (+/+) 只小鼠掉落离开。然而,在解释运动协调结果时,必须考虑在这些突变体中观察到的多动症。

(d) 骨代谢和身体诊断

(1) 组织质量和去脂体重测量:Dexa

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

身体测量(身高和体重):

身体测量值:在大约 16 周龄时测量身长和体重。

结果:

与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 的平均体重和体长有所下降。器官重量也减少了,这与平均体重和长度测量值的减少一致。分析 wt/het/hom:17/38/14

(2) 骨代谢:放射表型分析在骨代谢领域,这里确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,以及促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性别和历史上的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性和雌性小鼠 (-/-) 均显示全身和四肢的平均去脂体重下降、骨矿物质含量下降以及骨矿物质密度下降意思是漩涡。突变体的骨矿物质含量指数 (BMC/LBM) 也有所下降,男性的差异更为明显。

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 与同窝小鼠 (+/+) 相比,显示平均椎骨小梁骨体积、连接数量和密度减少,股骨干平均横截面积减少性和历史。分析 wt/het/hom:4/4/7

概括

这些结果表明敲除突变小鼠具有异常的骨代谢,具有显着的骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低和可能的脆性,导致骨折或成骨相关疾病。因此,PRO355 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO355多肽或其编码基因在骨愈合或关节炎或骨质疏松症的治疗中具有重要意义;而PRO355多肽的拮抗剂(抑制剂)会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。此外,与 (+/+) 同窝小鼠相比,DEXA 测试的 (-/-) 小鼠的瘦体重显着降低,表明这些突变体的生长迟缓。这与观察到的体重和身长减少(以及器官重量减少)一起表明组织消耗的情况,例如B. 恶病质或其他生长障碍。因此,PRO355 多肽或其激动剂可用于治疗或预防生长障碍,例如恶病质和/或其他组织消耗性疾病。

(e) 表型分析:心脏病学

在心血管生物学领域,已经确定了治疗高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠状动脉疾病、血脂异常如高胆固醇(hypercholesterolemia)和升高的血清甘油三酯(hypertriglyceridemia)、糖尿病和/或肥胖。 .表型测试包括测量血清胆固醇和甘油三酯。

血脂

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。升高的胆固醇水平和升高的血液甘油三酯水平是公认的心血管疾病和/或糖尿病发展的危险因素。测量血脂有助于寻找调节血脂水平的生物开关。增加血脂水平的抑制因素可能有助于降低心血管疾病的风险。在这些血液化学测试中,使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)记录胆固醇测量值。

结果:如上所述,小鼠 (-/-) 的甘油三酯水平与其同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比显着升高。因此,缺乏PRO355基因的突变小鼠可以作为心血管疾病的模型。 PRO355多肽或其编码基因可用于调节血脂如甘油三酯。因此,PRO355多肽或其激动剂可用于治疗心血管疾病,例如高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠心病、高胆固醇血症、高甘油三酯血症、糖尿病和/或肥胖症。

41.8。包含 DNA49435-1219 (UNQ334) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO533 多肽的基因(命名为 DNA49435-1219)(UNQ334)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM008003 或访问:NM008003 编号:6679776小家鼠成纤维细胞生长因子 15 (Fgf15);蛋白质参考:035622 或加入:O35622 NID:小鼠肌肉(老鼠)。成纤维细胞生长因子 15 (FGF-15) 前体。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM005117 或访问:NM005117 天然橡胶:15011922智者智者成纤维细胞生长因子 19 (FGF19);人类蛋白质的序列对应参考:095750 或 ACCESSION:O95750 NID:一个聪明人(人类)。成纤维细胞生长因子 19 (FGF-19) 的前体。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Fgf15(成纤维细胞生长因子 15),人类 FGF19(成纤维细胞生长因子 19)的同源基因。

FGF19 是成纤维细胞生长因子家族的一员,是一种分泌蛋白,可作为成纤维细胞生长因子受体 4 (FGFR4) 的配体 (Xie et al.细胞因子;11(10):729-35 (1999); Harmeret 等人,生物化学;43(3):629-40 (2004))。 FGF19 在胎儿大脑中高度表达,可能参与大脑和内耳发育(Nishimura 等人,生物化学生物物理学报;1444(1):148-51 (1999); Ladheret 等人,科学;290 (5498): 1965-7 (2000))。 FGF19 抑制肝胆固醇 7-α-羟化酶 (CYP7A1) 的表达,胆汁酸生物合成的第一步和限速步骤,从而调节肝胆固醇降解和分解(Holt 等人,基因发育;17(13):1581-91 (2003))。

表达 FGF19 的转基因小鼠显示能量消耗和棕色脂肪量增加,但总脂肪量、肝脏甘油三酯和肝脏乙酰辅酶 A 羧化酶 2 减少,表明 FGF19 在能量代谢中发挥作用(Tomlinson 等人,内分泌科;143(5): 1741-7 (2002))。然而,FGF19 在转基因小鼠中的异位表达导致肝脏肿瘤的发展,表明 FGF19 可能在肝细胞癌中发挥作用(Nicholes 等人,2008 年)。大豆 J. Pathol;160(6):2295-307 (2002))。

赖特 ua (生物发育;269(1):264-75 (2004)) 使用 Fgf15 缺陷小鼠研究小鼠 Fgf15 在内耳发育中的作用。他们发现,尽管小鼠 Fgf15 或人 FGF19 足以在鸡外植体试验中诱导耳标记物表达,但缺乏 Fgf15 的小鼠胚胎不会出现耳部异常。他们得出结论,小鼠 Fgf15 是人类 FGF19 的直向同源物,但不仅是小鼠耳部诱导或模式化所必需的。

傅等。 (Endocrinology 145(6):2594-603 (2004) 报道 FGF19 提高代谢率并逆转瘦素缺乏症和营养性糖尿病。

重量

总共

观察到的

23

44

10

77

预期的

19.25

38.5

19.25

77

卡方。 = 5.96

显着性 = 0.05077

(他/她)= 0.13

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

选择了编码外显子 1 和 2(访问 NCBI NM008003.1)。

野生型表达panel:检测到目的基因在脑内的表达;脊髓;眼睛;百里香;肾; RT-PCR 分析的 13 个成人组织样本中的胃、小肠和结肠。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.8.1。表型分析(针对改变的基因:DNA49435-1219 (UNQ334)

(a) 一般表型总结:

编码人成纤维细胞生长因子 19 (FGF19) 直向同源基因的突变导致生长迟缓并降低 (-/-) 小鼠的骨读数。小鼠 (-/-) 也显示出对卵清蛋白攻击的血清 IgG2a 反应降低。此外,(-/-) 突变小鼠显示平均血清胰岛素水平降低。纯合 (-/-) 小鼠中也存在生存力降低(预期为 19.25 时观察到 10 只)。在基因分型时(在出生后第 10-12 天),一半的纯合子死亡。通过 Southern 杂交分析证实了靶基因的破坏。

(b) 骨代谢与身体诊断

(1) 组织质量和去脂体重测量:Dexa

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中分析了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 4 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

身体测量(身高和体重):

身体测量值:在大约 16 周龄时测量身长和体重。

结果:

与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性和雌性小鼠 (-/-) 的平均体重和体长均有所下降,差异更为显着。老鼠。

(2) 骨代谢:放射学表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中分析了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 4 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型和 4 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性小鼠 (-/-) 的平均总组织质量和瘦体重有所降低。然而,野生型的总组织质量和瘦体重高于历史对照。雄性突变小鼠还表现出平均骨矿物质含量和相关骨矿物质密度测量值降低。此外,敲除雌性 (-/-) 显示出较低的股骨骨矿物质密度,尽管野生型高于历史对照。

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 与性别匹配的 (+ /+) 同窝仔和历史手段。这些变化可能是由于雄性 (-/-) 小鼠体型缩小所致。

概括

这些结果表明,基因敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,可能变得脆弱,导致骨折,表明存在成骨相关疾病。因此,PRO533 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO533多肽或其编码基因在骨愈合或关节炎或骨质疏松症的治疗中具有重要意义;而PRO533多肽的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。此外,与 (+/+) 同窝小鼠相比,用 DEXA 测试的 (-/-) 小鼠显示总组织质量和瘦体重显着减少,表明这些突变体的生长迟缓。这与体重和长度减少的观察结果一起表明组织消耗的情况,例如B. 恶病质或其他生长障碍。

因此,PRO533多肽或其激动剂可用于治疗或预防生长障碍,例如恶病质和/或其他组织消耗性疾病。表型分析还显示纯合子的生存能力降低。在基因分型时(产后第 10-12 天),一半的纯合子已经死亡。

(c) 血腥

使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)在其临床配置中进行血液化学分析,用于在小鼠中进行血液化学测试。

胰岛素数据:

测试描述:Lexicon Genetics 在其临床环境中使用 Cobra II 系列自动伽马计数系统对小鼠进行定量胰岛素测定。

结果:

与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性小鼠 (-/-) 显示平均血清胰岛素水平降低。

概括

缺乏编码 PRO533 多肽的基因的突变 (-/-) 小鼠表现出与生长迟缓、活力降低和组织消耗性疾病一致的表型。胰岛素水平异常低,这可能表明患有糖尿病。因此,PRO533 多肽或其编码基因的拮抗剂或抑制剂将模拟这些生长相关和代谢作用。此外,PRO533 多肽或其激动剂可用于预防和/或治疗代谢紊乱,例如糖尿病或其他组织消耗性疾病。

(d) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

卵清蛋白挑战

方法:该测定是在野生型和纯合子上进行的。鸡卵清蛋白 (OVA) 是一种 T 细胞依赖性抗原,广泛用作研究小鼠抗原特异性免疫反应的模型蛋白。 OVA 是无毒和惰性的,因此即使没有诱导免疫反应也不会伤害动物。小鼠对 OVA 的免疫反应已得到充分表征,因为已鉴定出用于引发 T 细胞反应的免疫显性肽。抗 OVA 抗体可在免疫后 8 至 10 天通过联合免疫吸附测定法检测到。关于酶 (ELIZA) 以及不同抗体同种型的测定提供了有关可能导致转基因小鼠弱反应的复杂过程的更多信息。

如上所述,该协议评估小鼠产生抗原特异性免疫反应的能力。给动物腹腔注射在弗氏完全佐剂中乳化的 50 mg 鸡卵清蛋白,14 天后测量抗卵清蛋白抗体(IgM、IgG1 和 IgG2 亚类)的血清滴度。血清样品中 OVA 特异性抗体的量与仪器扫描 96 孔样品板产生的光密度 (OD) 值成正比。为每个血清样品的一组系列稀释收集数据。

本次挑战的结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 显示对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG2a 反应降低。因此,这些基因敲除小鼠显示出对 OVA 依赖性 T 细胞抗原引起 OVA 特异性抗体反应的能力降低。

总之,卵清蛋白攻击研究表明,与它们的野生型同窝小鼠相比,缺乏编码 PRO533 多肽的基因的基因敲除小鼠表现出免疫学异常。特别是,当用 T 细胞依赖性 OVA 抗原攻击时,突变小鼠表现出降低的引发免疫反应的能力。因此,PRO533 多肽或其激动剂可用于刺激免疫系统(例如 T 细胞增殖) ) 并且会在这种效果对个人有益的情况下找到应用,例如B. 白血病和其他类型。癌症,以及免疫功能低下的患者,如艾滋病患者。因此,PRO533 多肽的抑制剂(拮抗剂)可用于抑制免疫反应,因此可用作抑制有害免疫反应的候选物,例如免疫反应。在移植排斥或移植物抗宿主病中。

41.9。包含 DNA45417-1432 (UNQ342) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO541 多肽的基因(命名为 DNA45417-1432)(UNQ342)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM031402 或加入:NM031402 天然橡胶:13878236小家鼠Cocoacrisp(Cocoacrisp 待定);蛋白质参考:Q99MM6 或 ACCESSION:Q99MM6 NID:小鼠肌肉(老鼠)。咔嚓咔嚓。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM031461 或加入:NM031461 天然橡胶:21314740智者智者可可酥 (LOC83690);人类蛋白质序列对应参考:Q9H33 或 ACCESSION:Q9H336 NID:一个聪明人(人类)。秘书蛋白 (COCOACRISP) 的推定前体。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Cocoacrisp(Cocoacrisp 蛋白),人类 CocoaCrisp 的直系同源物。

CocoaCrisp 是一种假想的分泌蛋白,由一个信号肽、一个 SCP 样细胞外蛋白结构域和一个 LCCL 结构域组成。类 SCP 胞外蛋白结构域存在于多种真核细胞胞外蛋白中,例如被认为参与精子成熟的精子包被糖蛋白,以及昆虫毒液过敏原(访问 Pfam PF00188)。 LCCL 结构域可能参与脂多糖结合以及其他功能,例如B. 细胞信号(Pfam 保藏号 PF03815)。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。

嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

12

41

15

68

预期的

17

34

17

68

卡方。 = 3.15

显着性 = 0.20731

(他/她)= 0.22

平均产仔数 = 7

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 BC040768.1)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.9.1。表型分析(针对改变的基因:DNA45417-1432 (UNQ342)

(a) 一般表型总结:

编码人类 CocoaCrisp 直向同源基因的突变导致突变 (-/-) 小鼠的生长延迟和骨骼测量异常。此外,(-/-) 小鼠显示真皮成纤维细胞增殖增加。微阵列分析显示 UNQ342 在乳腺癌和前列腺癌中上调。 UNQ342 具有与蛋白酶抑制剂 15(人 P115)高度相似的区域,后者是一种胰蛋白酶抑制剂,可通过促进肿瘤侵袭来帮助调节细胞外蛋白水解。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 骨代谢与身体诊断

(1) 组织质量和去脂体重测量:Dexa

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

身体测量(身高和体重):

身体测量值:在大约 16 周龄时测量身长和体重。

结果:

与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 的平均体重和体长有所下降。分析 wt/het/hom:15/39/21

(2) 骨代谢:放射学表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

结果:

DEXA:小鼠 (-/-) 与它们的同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,平均总组织质量和瘦体重有所降低。与同性同窝小鼠和历史平均值相比,这些突变小鼠的平均骨矿物质含量也有所降低。分析 wt/het/hom:4/4/8

概括

这些结果表明,基因敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,可能变得脆弱,导致骨折或成骨相关疾病。因此,PRO541 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO541多肽或其编码基因在骨愈合或关节炎或骨质疏松症的治疗中具有重要意义;而PRO544多肽的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。此外,通过 DEXA (-/-) 分析的小鼠与其同窝小鼠 (+/+) 相比显示总组织质量和瘦体重减少,表明这些突变体存在生长迟缓。这与体重和长度减少的观察结果一起表明组织消耗的情况,例如B. 恶病质或其他生长障碍。因此,PRO541 多肽或其激动剂可用于治疗或预防生长障碍,例如恶病质和/或其他组织消耗性疾病。

(c) 成人皮肤细胞的增殖:

程序:皮肤细胞分离自 16 周大的动物(2 只野生型和 4 只纯合子)。这些在原代成纤维细胞培养物中生长,并在严格控制的方案中测量成纤维细胞增殖率。用 p53 和 Ku80 证明了该测定法检测过度增殖和低增殖表型的能力。使用 Brdu 掺入测量增殖。

特别是,在这些研究中使用了皮肤成纤维细胞增殖试验。标准化培养物中细胞数量的增加被用作相对增殖能力的量度。原代成纤维细胞是从野生型和突变小鼠的皮肤活组织检查中建立的。接种 0.05 万个细胞的一式两份或一式三份培养物并生长六天。在培养期结束时,使用电子粒子计数器确定培养物中存在的细胞数。

结果:小鼠 (-/-) 与同性别的同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,皮肤成纤维细胞的增殖率更高。 [分析 wt/het/hom:2/0/4]

因此,纯合突变小鼠表现出过度增殖的表型。正如这些观察所表明的那样,PRO541 多肽或其激动剂可作为肿瘤抑制剂发挥作用,并可用于减少异常细胞增殖。

41.10。包含 DNA52758-1399 (UNQ390) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO725 多肽的基因(命名为 DNA52758-1399)(UNQ390)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM009136 或访问:NM009136 NID:gi 6677876 ref NM009136.1小鼠肌肉痒病敏感基因 1 (Scrg1);蛋白质参考:088745 或加入:088745 NID:小鼠肌肉(老鼠)。负责瘙痒病的蛋白质 1 的前体 (SCRG-1)。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM007281 或访问:NM007281 NID:gi 6005869 ref NM007281.1一个聪明人痒病敏感蛋白 1 (SCRG1);人类蛋白质序列对应参考:O75711 或 ACCESSION:O75711 NID:一个聪明人(人类)。负责瘙痒病的蛋白质 1 的前体 (SCRG-1)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Scrg1(刮擦敏感基因 1),它是人类 SCRG1 的同源基因。别名包括 SCRG-1。

SCRG1 是一种假定的分泌蛋白,主要在中枢神经系统中表达。 98个氨基酸长的蛋白质由一个信号肽、一个特征性的半胱氨酸分布模式和一个在小鼠、大鼠和人类中高度保守的35个氨基酸片段组成。 SCRG1 表达发生在神经胶质细胞和神经元中(Dandoy-Dron 等人,J.生物学。化学。273(13):7691-7 (1998);无人机等,J.生物学。化学。273(29):18015-8 (1998);无人机等,基因组学;70(1): 140-9 (2000))。此外,SCRG1 似乎与体外和体内的致密核心囊泡相关,表明 SCRG1 与神经元细胞的分泌途径相关(Dandoy-Dron 等人,2008 年)。欧洲神经科学杂志;18(9):2449-59 (2003))。

SCRG1 可能在响应脑损伤或感染因子的神经胶质细胞激活中发挥作用。此外,已提出 SCRG1 参与神经胶质细胞的持续和广泛激活,以响应进行性传染性神经退行性疾病,如克雅氏病、German-Straussler-Scheinker 综合征、库鲁病、瘙痒病和脑病。由于神经胶质细胞的长期和广泛激活可能对大脑功能有害,因此 SCRG1 可能在神经退行性过程中发挥作用(Dandoy-Dron 等人,2016 年)。J.生物学。化学。273(13):7691-7 (1998);无人机等,J.生物学。化学。273(29):18015-8 (1998))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

21

38

23

82

预期的

20.5

41

20.5

82

卡方。 = 0.54

显着性 = 0.76468

(他/她)= 0.28

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

目的是编码外显子 1(访问 NCBI NM009136.2)。

野生型表达组:除肝脏、骨骼肌、心脏和脂肪组织外,通过 RT-PCR 分析的所有 13 个成人组织样本均检测到靶基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.10.1。表型分析(针对改变的基因:DNA52758-1399 (UNQ390)

(a) 一般表型总结:

编码人类瘙痒病敏感蛋白 1 (SCRG1) 同源基因的突变导致全身脂肪和总脂肪量的平均百分比增加。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 骨代谢与身体诊断:骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

DEXA 结果:雌性突变小鼠 (-/-) 与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,总体脂肪和总脂肪量的平均百分比更高。这种表型与肥胖或以血脂异常为特征的代谢紊乱有关。因此,预计 PRO725 多肽或其编码基因的拮抗剂(或抑制剂)会模拟这种阴性表型。另一方面,PRO725多肽或其激动剂可用于预防和/或治疗这些代谢紊乱。

41.11.包含 DNA56436-1448 (UNQ474) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO937 多肽的基因(命名为 DNA56436-1448)(UNQ474)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM008150 或访问:NM008150 不是:我们的小家鼠磷脂酰肌醇蛋白聚糖 4 (Gpc4);蛋白质参考:P51655 或 GPC4_MOUSE P51655 GLYPICAN-4 PRECURSOR K-GLYPICAN;人类基因序列参考:NM001448 或访问:NM001448 不是:我们的智者智者字形聚糖 4 (GPC4);人类蛋白质的序列对应于参考:075487 或 GPC4_HUMAN 075487 GLYPICAN-4 PRECURSOR K-GLYPICAN。

感兴趣的小鼠基因是 Gpc4 (Glypican 4),它是人类 GPC4 的同源基因。别名包括 K-Glypican。

GPC4 是一种糖基磷脂酰肌醇 (GPI) 锚定的细胞外硫酸乙酰肝素蛋白多糖,可结合和调节聚阳离子激素,如成纤维细胞生长因子和内皮抑素(Fransson,国际生化细胞生物学杂志;35(2):125-9 (2003);加利埃等人。发展;130(20):4919-29 (2003);痣细胞;7(4):811-22 (2001))。 GPC4 可能参与大脑发育、肾脏发育和骨骼重塑(Watanabe 等人,细胞生物学杂志;130(5): 1207-18 (1995);痣细胞;7(4):811-22 (2001);加利埃等人。发展;130(20):4919-29 (2003); Sheu 等人。J Bone Miner 研究;17(5):915-22 (2002)。

X 染色体上 Glypican 3 (GPC3) 和 GPC4 基因的缺失可能解释了 Simpson-Golabi-Behmel 综合征表型的变异性,其特征是产前和产后过度生长、内脏和骨骼异常以及发育中的胚胎肿瘤。 Veugelers 等人。基因组学;53(1): 1-11 (1998);胡伯你。将军;225(1-2):9-16 (1998))。

该项目链接到 X:

按性别和基因型与 X 染色体连锁的基因分布总结

(仅包括雄性嵌合体的刺豚鼠幼犬。)

按基因型划分的性别 X 连锁基因分布总结

后代

Agouti F1(M-嵌合体×体重)

后代

F1a (Fit × Peso)

性别

重量

性别

重量

坏的

麦德龙

4个

麦德龙

20

不适用

19

F

19

F

22

22

不适用

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。

嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

22

20

41

83

预期的

20.75

41.5

20.75

83

卡方。 = 30.98

显着性 = 0.00000

(他/她)= 0.49

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

目的是编码外显子 3(访问 NCBI NM008150.1)。

野生型表达panel:在眼中检测到目的基因的表达;脾;肾;肝;胃、小肠和大肠;心; RT-PCR 分析的 13 个成人组织样本中的脂肪和脂肪。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.11.1。表型分析(针对改变的基因:DNA56436-1448 (UNQ474)

(a) 一般表型总结:

编码人类磷脂酰肌醇蛋白聚糖同源基因 4 (GPC4) 的基因突变导致雄性 (-/-) 小鼠贫血。该突变位于一个X连锁基因中,对野生型雄性和雌性小鼠进行了测试,而仅对雄性半合子突变小鼠进行了测试。半合子(野生型)和雄性半合子突变小鼠分别指定为 (0/+) 和 (0/-)。

与野生型同性同窝小鼠和历史平均值相比,雄性半合子突变小鼠表现出贫血迹象。此外,(-/-) 小鼠显示出对卵清蛋白攻击的 IgG2a 反应降低。 UNQ474 仅在 T7 单核细胞中被特异性上调(数据未显示)。小鼠 (-/-) 显示平均血糖水平降低;然而,生长正常,葡萄糖和胰岛素耐量试验正常。此外,半合子 (0/-) 突变小鼠的总体脂肪平均百分比降低,骨骼相关测量值异常。目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

(b) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

血液学分析:

测试说明:血液测试使用 Abbott 的 Cell-Dyn 3500R 自动血液分析仪进行。它的一些功能包括 WBC 五件式分类。 “患者”报告总共可以涵盖超过 22 个参数。

结果:

与相同性别和历史平均值的野生型同窝小鼠 (0/+) 相比,雄性小鼠 (0/-) 显示平均红细胞计数减少,平均血红蛋白和血细胞比容水平降低。

分析 wt/had/him: 6/4/12

这些结果涉及与贫血相关的表型。因此,PRO937 多肽、它们的激动剂或编码 PRO937 多肽的基因应该是正常红细胞产生所必需的,因此可用于治疗与贫血或低血细胞比容相关的血液病症。

卵清蛋白挑战

方法:该测定是在 7 个野生型和 8 个纯合子上进行的。鸡卵清蛋白 (OVA) 是一种 T 细胞依赖性抗原,广泛用作研究小鼠抗原特异性免疫反应的模型蛋白。 OVA 是无毒和惰性的,因此即使没有诱导免疫反应也不会伤害动物。小鼠对 OVA 的免疫反应已得到充分表征,因为已鉴定出用于引发 T 细胞反应的免疫显性肽。抗 OVA 抗体可在免疫后 8 至 10 天通过联合免疫吸附测定法检测到。关于酶 (ELIZA) 以及不同抗体同种型的测定提供了有关可能导致转基因小鼠弱反应的复杂过程的更多信息。

如上所述,该协议评估小鼠产生抗原特异性免疫反应的能力。给动物腹腔注射在弗氏完全佐剂中乳化的 50 mg 鸡卵清蛋白,14 天后测量抗卵清蛋白抗体(IgM、IgG1 和 IgG2 亚类)的血清滴度。血清样品中 OVA 特异性抗体的量与仪器扫描 96 孔样品板产生的光密度 (OD) 值成正比。为每个血清样品的一组系列稀释收集数据。

该挑战的结果:与其同窝小鼠 (+/+) 相比,小鼠 (-/-) 显示出对卵清蛋白挑战的平均血清 IgG2a 反应降低。因此,这些基因敲除小鼠显示出对 OVA 依赖性 T 细胞抗原引起 OVA 特异性抗体反应的能力降低。

总之,卵清蛋白攻击研究表明,与它们的野生型同窝小鼠相比,缺乏编码 PRO937 多肽的基因的基因敲除小鼠表现出免疫学异常。当用 T 细胞依赖性 OVA 抗原攻击时,突变小鼠表现出降低的引发免疫反应的能力。这表明 PRO937 多肽或其激动剂将是可以刺激免疫系统(例如 B. T 细胞增殖)的重要试剂) 并将在这种效应对个体有益的情况下得到应用,如白血病和其他癌症的情况,以及免疫功能低下的患者,如 AIDS 患者。因此,PRO937 多肽的抑制剂(拮抗剂)将可用于抑制免疫反应,并且将是抑制有害免疫反应的有用候选物,例如在移植排斥或移植物抗宿主病中。

(c) 骨代谢与身体诊断:骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性同窝小鼠 (0/+) 和历史平均值相比,雄性小鼠 (0/-) 的总体脂肪平均百分比降低。

显微 CT:雄性小鼠 (0/-) 与同性同窝小鼠 (0/+) 和历史平均值相比,中股骨干的平均皮质厚度增加,中股骨干的平均横截面积减少。分析 wt/het/hom:4/4/8

这些结果表明,半合子表现出与骨测量异常或成骨相关疾病相关的阴性表型。全身脂肪减少表明组织消耗的状况或表型。

(d) 表型分析:代谢血液化学

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。

结果:

与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,小鼠 (-/-) 的平均血糖有所降低。然而,突变小鼠 (-/-) 表现出正常的体重增加、生长、胰岛素和葡萄糖耐量。

41.12。包含 DNA56409-1377 (UNQ497) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1014 多肽的基因(命名为 DNA56409-1377)(UNQ497)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM198030 哦小鼠肌肉表达序列 A1047820 (AI047820);参考蛋白:Q8VCR2 或 ACCESSION:Q8VCR2 NID:小鼠肌肉(老鼠)。类似于羟基类固醇 17-β-脱氢酶 11;人类基因序列参考:NM178135 哦一个聪明人短链脱氢酶/还原酶 9 (SCDR9);人类蛋白质序列对应参考:Q7Z5P4 或 ACCESSION:Q7Z5P4 NID:一个聪明人(人类)。短链脱氢酶/还原酶 9.

感兴趣的小鼠基因是 A1047820(表达序列 A1047820),人类 SCDR9(短链脱氢酶/还原酶 9)的同源基因。别名包括 PAN1B 样和乙醇脱氢酶 PAN1B 样。 SCDR9 是一种假设的氧化还原酶,可催化短链醇的 NAD(P)H 依赖性还原。该蛋白质包含一个信号肽和一个由 NAD(P)H 结合片段和一个醇共底物结合片段组成的短链脱氢酶结构域(Pfam 登录号 PF00106)。 SCDR9的细胞位置不明确;生物信息学分析表明 SCDR9 位于内质网或质膜中。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

15

48岁

12

75

预期的

18.75

37.5

18.75

75

卡方。 = 6.12

显着性 = 0.04689

(他/她)= 0.16

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

靶向编码外显子 1 和 2(NCBI 登录号 BC019427.1)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到靶基因表达,骨骼肌和骨骼除外。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.12.1。表型分析(针对改变的基因:DNA56409-1377 (UNQ497)

(a) 一般表型总结:

编码人短链脱氢酶/还原酶直系同源物 9 (SCDR9) 的基因突变导致观察到雄性突变 (-/-) 小鼠的小梁数量和连接密度增加,而股骨干中段的小梁密度降低。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 骨代谢与身体诊断:骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

与野生型同窝小鼠相比,雄性突变 (-/-) 小鼠的小梁数量和连接密度增加。此外,与野生型同窝小鼠相比,中位股骨干的总面积似乎有所减少。这些结果表明,敲除突变体表型可能与骨骼异常如骨硬化症有关。骨硬化症是一种以骨骼异常增厚和硬化以及骨骼异常脆性为特征的病症。因此,PRO1014 多肽或其激动剂将有益于骨硬化症的治疗。与小梁数量和连接密度增加相关的表型表明模拟这些作用的药物(例如 PRO1014 多肽拮抗剂)可能在骨愈合中发挥作用。

41.13。包含 DNA48606-1479 (UNQ559) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1120 多肽的基因(命名为 DNA48606-1479)(UNQ559)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:BC062900 或小鼠肌肉RIKEN 基因 cDNA 2010004N24,mRNA(cDNA 克隆 ​​MGC:86096 IMAGE:6810085);蛋白质参考:Q8CFG0 或附件:Q8CFG0 NID:小鼠肌肉(老鼠)。细胞外硫酸酯酶 Sulf-2 (EC 3.1.6.-) (MSulf-2) 的前体。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM 018837 或 glucosamine-6-sulfatase-like (SULF2)-like;人类蛋白质序列对应参考:Q81WU5 或 ACCESSION:Q81WU5 NID:一个聪明人(人类)。细胞外 sulf-2-sulfatase 前体 (EC 3.1.6.-) (HSulf-2)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Sulf2(硫酸酯酶 2),它是人类 SULF2 的同源基因。别名包括 mKIAA1247、2010004N24Rik、HSULF-2、KIAA1247 和 SULF-2 细胞外硫酸酯酶。

SULF2 是一种细胞外内硫酸酯酶,在肝素内的适当环境中对氨基葡萄糖-6-硫酸盐具有高选择性(Morimoto-Tomita 等人,J.生物学。化学。277(51):49175-85 (2002))。酶前体被预测为大约 890 个氨基酸的蛋白质,由重叠的信号肽和跨膜片段以及硫酸酯酶结构域组成(Pfam 登录号 PF00884)。 SULF2 经过内切蛋白水解处理和分泌。 SULF2 可以在细胞粘附、基底膜和细胞外基质屏障功能、细胞生长和细胞分化等过程中调节硫酸乙酰肝素-蛋白多糖相互作用(Morimoto-Tomita 等人,J.生物学。化学。277(51):49175-85 (2002)。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

17

36

十六

69

预期的

17.25

34.5

17.25

69

卡方。 = 0.16

显着性 = 0.92338

(他/她)= 0.23

平均产仔数 = 7

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 2 和 3 之间的内含子中(NCBI 登录号 AK034712.1)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到靶基因表达,骨骼肌和骨骼除外。

RT-PCR 分析表明,在测试的 (-/-) 小鼠 (M-166) 中不存在转录物。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

41.13.1。表型分析(针对改变的基因:DNA48606-1479 (UNQ559)

(a) 一般表型总结:

编码人类硫酸酯酶 2 (SULF2) 同源基因的基因突变导致雄性 (-/-) 小鼠的焦虑相关反应增强。此外,(-/-) 突变小鼠表现出组织质量和体重下降,以及与骨骼相关的测量值下降。基因敲除雌性 (-/-) 甘油三酯水平显着下降,但胆固醇水平呈上升趋势。 RT-PCR 不存在转录本。

(b) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雌性小鼠 (-/-) 的平均总组织质量和瘦体重有所降低,骨矿物质含量也有所降低。雄性突变小鼠 (-/-) 与它们的同性同窝小鼠和历史平均值相比,也显示出减少的瘦体重。

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,股骨干内侧的平均横截面积减小。

这些结果表明,敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,可能变得脆弱,导致骨折或其他骨相关疾病。因此,PRO1120 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO1120多肽或其编码基因可用于骨愈合或治疗关节炎或骨质疏松症;而PRO1120多肽的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。此外,与 (+/+) 同窝小鼠相比,用 DEXA 测试的 (-/-) 小鼠显示总组织质量和瘦体重显着减少,表明这些突变体的生长迟缓。与历史平均值相比,雄性小鼠 (-/-) 的体重也有所减轻。这表明组织损失情况,例如B. 恶病质或其他生长障碍。因此,PRO1120 多肽或其激动剂可用于治疗或预防生长障碍,例如恶病质和/或其他组织消耗性疾病。

(c) 表型分析:心脏病学

在心血管生物学领域,已经确定了治疗高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠状动脉疾病、血脂异常如高胆固醇(高胆固醇血症)和血清甘油三酯升高(高甘油三酯血症)、癌症和 u / 或肥胖。 .

表型测试包括测量血清胆固醇和甘油三酯。此外,还进行了炎症测定以确定动脉粥样硬化炎症成分的潜在靶点。

血脂

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。升高的胆固醇水平和升高的血液甘油三酯水平是公认的心血管疾病和/或糖尿病发展的危险因素。测量血脂有助于寻找调节血脂水平的生物开关。增加血脂水平的抑制因素可能有助于降低心血管疾病的风险。在这些血液化学测试中,使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)记录胆固醇测量值。

结果:如上所述,与它们的性别配对 (+/+) 相比,雌性小鼠 (-/-) 的甘油三酯水平显着降低 (p=0.04488) 并且胆固醇水平有升高的趋势 (p=0.05857)。同窝仔和历史媒体。因此,缺乏 PRO1120 基因的突变小鼠可以作为研究代谢紊乱的模型。 PRO1120多肽或其编码基因可用于调节血脂。

(d) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。分析 wt/het/hom:5/4/8

结果:

在露天活动测试期间观察到明显的差异。与同性同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性突变小鼠 (-/-) 在中心区域的平均添加时间减少。这种类型的行为与增加的类似恐惧的反应是一致的。敲除小鼠表现出与轻度至中度焦虑相关的焦虑相关疾病、与一般医学状况相关的焦虑和/或双相情感障碍一致的表型;多动症;感觉障碍;强迫症、精神分裂症或偏执型人格。因此,PRO1120 多肽或其激动剂可用于治疗此类神经障碍或减轻与焦虑症相关的症状。

41.14。包含 DNA59848-1512 (UNQ596) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1182 多肽的基因(命名为 DNA59848-1512)(UNQ596)被破坏。这些研究的基因具体信息如下: 突变小鼠基因对应参考核苷酸:AK003121 或 ACCESSION:AK003121 NID:12833583小家鼠成年男性心脏 cDNA,丰富的全长 RIKEN 文库,克隆:1010001H16:COLLECTIN 34 同系物,全长插入序列;蛋白质参考:Q9DC75 或 ACCESSION:Q9DC75 NID:小鼠肌肉(老鼠)。 1010001H16RIK 蛋白。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM024027 哦一个聪明人Collectin 亚家族成员 11 (COLEC11),转录变体 1;人类蛋白质序列对应参考:Q9BWP8 或 ACCESSION:Q9BWP8 NID:一个聪明人(人类)。假设的蛋白质。

感兴趣的小鼠基因是 Colec11(collectin 亚家族成员 11),它是人类 COLEC11 的同源基因。别名包括 1010001H16Rik 和 MGC3279。

COLEC11 是一种推定的分泌型聚集素家族蛋白,可能起结合蛋白的作用。 COLEC11 由信号肽、胶原蛋白三螺旋重复序列(Pfam 登录号 PF01391)和凝集素 C 型结构域(Pfam 登录号 PF00059)组成。显示 COLEC11 的一般结构域组织的集合在先天免疫中起着重要作用。它们识别并结合微生物,并通过凝集和调理作用增强微生物的粘附和吞噬作用。收集物还充当肺表面活性物质的成分或防止呼吸道感染(Hickling 等人,白细胞生物学杂志;75(1):27-33 (2004))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

24

31

24

79

预期的

19.75

39.5

19.75

79

卡方。 = 3.66

显着性 = 0.16056

(他/她)= 0.30

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 AK003121.1)。

野生型表达组:在通过 RT-PCR 分析的 13 个成人组织样本中,在大脑、脾脏、肾脏、肝脏、心脏和脂肪组织中检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.14.1。表型分析(针对改变的基因:DNA59848-1512 (UNQ596)

(a) 一般表型总结:

编码人类收集素亚家族成员 11 (COLEC11) 直系同源物的基因突变导致突变 (-/-) 小鼠生长迟缓。小鼠 (-/-) 也显示异常的骨骼相关测量值。小鼠 (-/-) 也显示血清甘油三酯降低和血清葡萄糖升高与生长/体重增加减少相关。与历史平均值相比,雄性和雌性 (-/-) 小鼠的心率均降低(<2 标准差)。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 骨代谢与身体诊断

(1) 组织质量和去脂体重测量:Dexa

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

身体测量(身高和体重):

身体测量值:在大约 16 周龄时测量身长和体重。

结果:

与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性小鼠 (-/-) 的平均体重、身长和生长均有所下降。

心律:

与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,雄性和雌性突变小鼠 (-/-) 的平均心率显着降低(<2 个标准差)。

(2) 骨代谢:放射学表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与相同年龄、性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性小鼠 (-/-) 显示平均总组织质量、瘦体重、脂肪 (%) 和脂肪(克)减少。然而,小鼠 (+/+) 的体重高于历史平均水平。除了这些观察到的变化外,雄性 (-/-) 突变小鼠还表现出骨矿物质密度和相关测量值降低。分析 wt/het/hom:4/4/8

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 与同性别和历史平均值的同窝小鼠 (+/+) 相比,股骨干内侧的平均横截面积减小。

这些结果表明,敲除突变小鼠具有异常的骨代谢,具有显着的骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,并且可能导致骨折的脆性。因此,PRO1182 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO1182多肽或其编码基因可用于骨愈合或治疗关节炎或骨质疏松症;而PRO1182多肽或其编码基因的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。

总之,用 DEXA 测试的 (-/-) 小鼠体重显着下降,总组织质量下降,瘦体重下降,骨矿物质含量和骨密度下降,表明这些突变体生长迟缓。因此,PRO1182多肽或其激动剂必须是正常生长和/或生长代谢所必需的,因此可用于治疗或预防生长障碍、恶病质或其他组织消耗性疾病。

(c) 表型分析:心脏病学

在心血管生物学领域,已经确定了治疗高血压、动脉粥样硬化、心力衰竭、中风、各种冠状动脉疾病、血脂异常如高胆固醇(hypercholesterolemia)和升高的血清甘油三酯(hypertriglyceridemia)、糖尿病和/或肥胖。 .表型测试包括测量血清胆固醇和甘油三酯。

血脂

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。升高的胆固醇水平和升高的血液甘油三酯水平是公认的心血管疾病和/或糖尿病发展的危险因素。测量血脂有助于寻找调节血脂水平的生物开关。增加血脂水平的抑制因素可能有助于降低心血管疾病的风险。在这些血液化学测试中,使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)记录测量值。

结果:

与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性 (-/-) 突变小鼠的平均血清甘油三酯水平降低,平均血糖水平升高(尽管胰岛素水平和葡萄糖耐量测试正常)。总之,这些敲除突变小鼠表现出与观察到的体重、生长和长度测量值下降一致的脂质相关表型。

41.15。包含 DNA66659-1593 (UNQ685) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1325 多肽的基因(命名为 DNA66659-1593)(UNQ685)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM172257 或加入:NM172257 NID:gi 26986550 ref NM172257.1小鼠肌肉假设蛋白 LOC214597 (LOC214597);蛋白质参考号:Q922R2 或加入号:Q922R2NID:小鼠肌肉(老鼠)。类似于假设的蛋白质 FLJ20174(片段)。

鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM 015996 或 ACCESSION:NM015996 NID:gi 7705756 ref NM015996.1一个聪明人CGI-40蛋白(CGI-40);人类蛋白质序列对应参考:Q9Y357 或 ACCESSION:Q9Y357 NID:一个聪明人(人类)。 CGI-40 蛋白。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 BC023957(cDNA 序列 BC023957),人类 CGI-40(CGI-40 蛋白)的直系同源物。别名包括 MGC36407、MGC58967、B930096019。

CGI-40 是一种假设的多跨度跨膜蛋白,位于质膜中。它由一个信号肽、一个相对较大的细胞外结构域和九个跨膜结构域组成。 CGI-40 的分子功能未知;然而,它在结构上是相似的秀丽隐杆线虫sid-1(SID-1 系统性 RNA 干扰缺陷,推定的跨膜蛋白,系统性 RNAi 激活 [87.9 kD] [sid-1])(Lai 等人,基因组中没有任何内容;10(5):703-13 (2000))。 Sid-1 将双链 RNA 转运到细胞中并实现系统性 RNA 干扰介导的基因沉默秀丽隐杆线虫(温斯顿等人,科学;295(5564):2456-9 (2002);范伯格和亨特,科学;301 (5639): 1545-7 (2003))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

24

35

26

85

预期的

21.25

42.5

21.25

85

卡方。 = 2.74

显着性 = 0.25396

(他/她)= 0.31

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

选择了编码外显子 1 和 2(访问 NCBI NM172257.1)。

野生型表达组:通过RT-PCR检测的13个成人组织样本中,仅在脊髓和眼睛中检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.15.1。表型分析(针对改变的基因:DNA66659-1593 (UNQ685)

(a) 一般表型总结:

编码人类 CGI-40 蛋白直系同源物 (CGI-40) 的基因突变导致多灶性退行性肌病和 (-/-) 小鼠胰腺腺泡细胞的变化。突变 (-/-) 小鼠还显示平均总组织质量、瘦体重和脂肪质量 (%&g) 减少,以及骨相关指标减少。小鼠 (-/-) 也表现出对卵清蛋白攻击的血清 IgG1 反应降低和平均血小板计数增加。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 免疫表型分析

(Video) Conversations on COVID-19: Leaked Emails of Dr. Fauci, Lab Origin, and Politicization of Science,

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

卵清蛋白挑战

方法:该测定是在 7 个野生型和 8 个纯合子上进行的。鸡卵清蛋白 (OVA) 是一种 T 细胞依赖性抗原,广泛用作研究小鼠抗原特异性免疫反应的模型蛋白。 OVA 是无毒和惰性的,因此即使没有诱导免疫反应也不会伤害动物。小鼠对 OVA 的免疫反应已得到充分表征,因为已鉴定出用于引发 T 细胞反应的免疫显性肽。抗 OVA 抗体可在免疫后 8 至 10 天通过联合免疫吸附测定法检测到。关于酶 (ELIZA) 以及不同抗体同种型的测定提供了有关可能导致转基因小鼠弱反应的复杂过程的更多信息。

如上所述,该协议评估小鼠产生抗原特异性免疫反应的能力。给动物腹腔注射在弗氏完全佐剂中乳化的 50 mg 鸡卵清蛋白,14 天后测量抗卵清蛋白抗体(IgM、IgG1 和 IgG2 亚类)的血清滴度。血清样品中 OVA 特异性抗体的量与仪器扫描 96 孔样品板产生的光密度 (OD) 值成正比。为每个血清样品的一组系列稀释收集数据。分析 wt/het/hom:7/4/8

本次挑战的结果:

与其同窝小鼠 (+/+) 相比,突变小鼠 (-/-) 显示对卵清蛋白攻击的平均血清 IgG1 反应降低。因此,这些基因敲除小鼠显示出针对 T 细胞依赖性 OVA 抗原引发 OVA 特异性抗体反应的能力降低。总之,卵清蛋白攻击研究表明,与野生小鼠相比,缺乏编码 PRO1325 多肽基因的基因敲除小鼠免疫异常类型同窝。当用 T 细胞依赖性 OVA 抗原攻击时,突变小鼠表现出降低的引发免疫反应的能力。这表明 PRO1325 多肽或其激动剂将是可以刺激免疫系统(例如 B. T 细胞增殖)的有用试剂) 并将在这种效应对个体有益的情况下得到应用,如白血病和其他癌症的情况,以及免疫功能低下的患者,如 AIDS 患者。因此,PRO1325 多肽的抑制剂(拮抗剂)可用于抑制免疫反应,并且可用于抑制有害免疫反应,例如免疫反应。在移植排斥或移植物抗宿主病中。

血液学分析:

测试说明:血液测试使用 Abbott 的 Cell-Dyn 3500R 自动血液分析仪进行。它的一些功能包括 WBC 五件式分类。 “患者”报告总共可以涵盖超过 22 个参数。

结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 显示平均血小板计数增加。分析 wt/het/hom:8/4/9

例如,缺乏 DNA66659-1593 基因的突变小鼠会导致与凝血障碍相关的表型。在这方面,PRO1325 多肽的抑制剂或拮抗剂可用于治疗与血液凝固异常相关的病症,例如血友病。

(c) 病理学

显微镜观察:可用于分析的 6 只 (-/-) 小鼠患有轻度至中度多灶性退行性肌病,其特征是骨骼肌嗜酸性粒细胞增多、皮纹缺失、空泡形成、纤维萎缩和细胞核集中(嗜碱性粒细胞增多和核增大)。) . ).这些变化存在于单根纤维中,并广泛分布在肌肉中。在某些区域,存在炎症成分,伴有粒细胞和巨噬细胞浸润,并伴有个别肌纤维凝固性坏死。这些发现证实了炎症和退行性肌病的诊断。此外,3/3 的雌性小鼠 (-/-) 显示胰腺腺泡细胞的细胞质发生变化,反映出这些细胞基底区域粗面内质网的减少。已观察到胰腺腺泡细胞的变化。

基因表达:通过免疫组织化学分析在组织组中未检测到 LacZ 活性。解析 wt/het/hom:2/1/6

(d) 放射学和骨代谢的表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性同窝小鼠和历史平均值相比,雄性和雌性 (-/-) 小鼠的平均总组织质量和平均瘦组织质量均有所降低(雄性为 1 个标准差)。与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性和雌性小鼠 (-/-) 的脂肪 (%) 和脂肪(克)均有所减少。雌性小鼠 (-/-) 也显示 BMC/LBM 比率增加。

显微 CT:雄性小鼠 (-/-) 的体积、数量、厚度和椎间小梁骨的连接密度与其同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比显着减少。在解释这些结果时,必须考虑到突变小鼠体型缩小的情况。分析 wt/het/hom:4/4/8

概括:

这些结果表明,基因敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨测量值显着下降,类似于骨质疏松症,其特征是骨量减少,密度降低,可能导致骨折。因此,PRO1325 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO1325多肽或其编码基因可用于骨愈合或治疗关节炎或骨质疏松症;而PRO1325多肽或其基因编码的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。

总之,通过 DEXA 测试的 (-/-) 小鼠体重显着下降,总组织减少,瘦体重减少,脂肪含量减少,脂肪含量和骨矿物质密度减少,表明这些突变体的生长迟缓.因此,PRO1325 多肽或其激动剂必须是正常生长和/或生长代谢所必需的,因此可用于治疗或预防生长障碍、恶病质或其他组织消耗性疾病。病理结果(如上所示)证实了这些 (-/-) 突变小鼠表现出肌肉萎缩(特别是多灶性退行性肌病)这一事实。

41.16.包含 DNA66526-1616 (UNQ718) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1382 多肽的基因(命名为 DNA66526-1616)(UNQ718)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM175631 或加入:NM175631 NID:gi 28274689 ref NM175631.1小鼠肌肉小脑蛋白前体蛋白 4 (Cbln4);蛋白质参考:Q8BME9 或 ACCESSION:Q8BME9 NID:小鼠肌肉(老鼠)。小脑蛋白样糖蛋白 1(小脑蛋白 4)的前体;人类基因序列参考:NM080617 或加入:NM080617 编号:21313626智者智者小脑祖细胞 1 (CBLNL1);人类蛋白质序列对应参考:Q9NTU7 或 ACCESSION:Q9NTU7 NID:一个聪明人(人类)。类似于 CEREBELLIN (DJ885A10.1) 的糖蛋白前体。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 Cbln4(小脑前体蛋白 4),人类 CBLNL1(小脑蛋白前体蛋白 1 样)的同源基因。别名包括小脑蛋白样糖蛋白 1 和 dJ885A10.1。

CBLNL1 可能是一种分泌蛋白,由信号肽和补体成分的 C1q 结构域组成。 C1q 折叠类似于肿瘤坏死因子 (SMART access SM00110)。尽管 CBLNL1 的功能目前未知,但它在结构上类似于一个家族成员,前小脑蛋白 (CBLN1),后者在大脑和肾上腺中都起着神经调节剂的作用(Mazzocchi 等人,临床内分泌代谢杂志;84(2):632-5 (1999); Panget 等人,J.神经科学;20(17):6333-9 (2000))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

18

42

13

73

预期的

18.25

36.5

18.25

73

卡方。 = 2.34

显着性 = 0.30998

(他/她)= 0.18

平均产仔数 = 7

Mutationstyp:同源重组(标准)

目的是编码外显子 1(访问 NCBI NM175631.1)。

野生型表达panel:检测到目的基因在脑内的表达;脊髓;眼睛;百里香; RT-PCR 分析的 13 个成人组织样本中的胃、小肠和结肠。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.16.1。表型分析(针对改变的基因:DNA66526-1616 (UNQ718)

(a) 一般表型总结:

编码人类小脑蛋白前体同源基因 1 (CBLNL1) 的基因突变导致观察到突变体 (-/-) 雌性小鼠在笼子活动测试中表现出行走能力下降。然而,雄性小鼠 (-/-) 在现场测试期间表现出更多的焦虑。男女皆宜

小鼠 (-/-) 显示尿酸水平显着增加。此外,雄性小鼠 (-/-) 显示骨骼相关测量值下降。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。

昼夜节律测试说明:

在测试的第一天下午 4:00,将雌性小鼠单独圈养在 19" x 10" 的笼中,并随意喂食和饮水。动物接受 12 小时光照/黑暗循环,光照在上午 7:00 点亮,晚上 7:00 点熄灭。系统软件跟踪由动物运动引起的断条数,断条自动分解为迁移。在整个三天的试验中,以 60 个一小时的间隔记录活动。生成的数据显示为每小时记录的平均活动水平(昼夜节律)和三天测试期间每个明暗周期(运动活动)的平均总活动。解析 wt/het/hom:8/0/8

结果:

与它们的同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雌性小鼠 (-/-) 在笼中的活动测试中表现出轻度活动减退。

如上所述,在笼子活动测试期间观察到差异。在观察到的时间段内,与同窝小鼠 (+/+) 相比,小鼠 (-/-) 的行走能力下降,表明突变体的昼夜节律反应异常。这些结果与凝固一致。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

在露天活动测试期间观察到差异。与同性别的同窝小鼠 (+/+) 相比,雄性小鼠 (-/-) 在中心区域的平均添加时间减少。这种类型的行为与增加的类似恐惧的反应是一致的。敲除小鼠表现出与轻度至中度焦虑相关的焦虑相关疾病、与一般医学状况相关的焦虑和/或双相情感障碍一致的表型;多动症;感觉障碍;强迫症、精神分裂症或偏执型人格。因此,PRO1382 多肽或其激动剂可用于治疗此类神经障碍或减轻与焦虑症相关的症状。

(c) 血腥

测试描述:Lexicon Genetics 在其临床环境中使用 COBAS Integra 400(制造商:Roche)对小鼠进行血液化学测试。

结果:

与野生型同窝小鼠相比,小鼠 (-/-) 的尿酸水平显着增加(雌性 p=0.04156;雄性 p=0.01383)。没有观察到肾功能不全的其他迹象。

(d) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:男性基因敲除 (-/-) 表明骨矿物​​质含量和骨矿物质密度测量值降低。与野生型同窝仔畜相比,杂合子 (+/-) 和纯合子 (-/-) 雌性显示出增加的总组织质量、瘦体重和骨矿物质含量。

显微 CT:男性基因敲除显示骨小梁体积(1 个标准差)和厚度(1 个标准差)与历史平均值相比有所减少。男性击倒者的中段股骨总面积也有所减少。然而,野生型测量值高于历史平均值。

这些结果表明敲除突变小鼠具有异常的骨代谢。因此,PRO1382 多肽可用于维持骨稳态和治疗与成骨相关的病症,而 PRO1382 多肽或其编码 DNA 的拮抗剂或抑制剂会导致异常或病理性骨病症。

41.17.包含 DNA68874-1622 (UNQ728) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1410 多肽的基因(命名为 DNA68874-1622)(UNQ728)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:AK087615 或小鼠肌肉怀孕2天成年女性输卵管cDNA,RIKEN富集全文库,克隆:E230025L24 产品:假设蛋白,全长插入序列;蛋白质参考:Q8C2Z8 或 ACCESSION:Q8C2Z8NID:小鼠肌肉(老鼠)。假设的蛋白质;人类基因序列参考:NM203422 欧一个聪明人类似于假设的蛋白质 (LOC221091);人类蛋白质的序列对应参考:Q8ND94 或 ACCESSION:Q8ND94 NID:一个聪明人(人类)。假设的蛋白质。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因和人类直向同源基因编码一种假设的蛋白质。别名包括 MGC61707。

假设的蛋白质可能是一种 I 型质膜蛋白,包含一个信号肽、一个 3 型纤连蛋白结构域和一个 C 末端跨膜片段。 3 型纤连蛋白结构域存在于多种细胞内和细胞外蛋白质中,并参与蛋白质-蛋白质相互作用(SMART 访问 SM00060)。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。

嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

22

46

24

92

预期的

23

46

23

92

卡方。 = 0.09

显着性 = 0.95745

(他/她)= 0.26

平均产仔数 = 9

Mutationstyp:同源重组(标准)

外显子 1 的编码被靶向(NCBI 登录号 AK087615.1)。

野生型表达组:通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本中均检测到目标基因表达,骨骼除外。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.17.1。表型分析(针对改变的基因:DNA68874-1622 (UNQ728)

(a) 一般表型总结:

编码假设的人类膜蛋白直向同源基因的突变导致观察到突变 (-/-) 雌性小鼠的血糖水平升高,胰​​岛素水平降低。此外,KO 男性表现出总组织质量和骨矿物质密度测量值下降。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 表型分析:代谢血液化学/血清葡萄糖水平

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。葡萄糖测试结果异常可能表明但不限于以下疾病或病症:1 型和 2 型糖尿病、X 综合征、各种心血管疾病和/或肥胖症。

方法:在该测定中使用一组 4 只野生型和 8 只纯合小鼠。

结果:

血液化学:与同性别的同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雌性小鼠 (-/-) 的平均血糖水平升高。此外,(-/-) 小鼠的胰岛素水平降低。因此,敲除小鼠表现出葡萄糖稳态受损的表型模式,胰岛素水平异常(低)和空腹血糖水平升高,表明糖尿病或糖尿病前期。基于这些结果,PRO1410 多肽(或其激动剂)可用于治疗受损的葡萄糖代谢和/或糖尿病。

(c) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

DEXA:与同性别和历史均值相同的同窝仔畜 (+/+) 相比,基因敲除雄性 (-/-) 的总组织质量和骨矿物质密度测量值有所下降。

显微 CT:男性基因敲除显示骨小梁体积和厚度减少,股骨干总面积中位数减少。

这些结果表明,雄性基因敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,并且可能导致骨折。因此,PRO1410 多肽可用于维持骨稳态并可用于骨愈合或用于治疗关节炎或骨质疏松症,而 PRO1410 多肽或其 DNA 编码的拮抗剂或抑制剂将导致异常骨病或类似于骨质疏松症的病状。

41.18。包含 DNA73744-1665 (UNQ763) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1555 多肽的基因(命名为 DNA73744-1665)(UNQ763)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM022418 或加入:NM022418 天:ein小家鼠假设蛋白,克隆 1-2 (AB030183);蛋白质参考:Q9JMG3 或 Q9JMG3 Q9JMG3 mRNA,CDS COMPLETE,克隆:1-22010004020R1;人类基因序列参考:NM031434 或加入:NM031434 天:ein智者智者假设蛋白 MGC5442 (MGC5442);人类蛋白质序列对应于参考:Q9BVT8 或 Q9BVT8 Q9BVT8 SIMILAR TO HYPOTHETICAL PROTEIN, CLONE 1-2。

感兴趣的小鼠基因是 RIKEN cDNA 2010004020 基因,人类 C7orf21(染色体 7 开放阅读框 21)的同源基因。别名包括 SB144 和 MGC5442。

C7orf21 是一种假设蛋白,由信号肽、泛素家族结构域(Pfam 登录号 PF00240)和两个 C 端跨膜片段组成。该蛋白的细胞定位尚不清楚;然而,生物信息学分析表明 C7orf21 可以被分泌。泛素家族结构域存在于泛素样蛋白中,例如 SUMO、NEDD8 和 Apg12。泛素样蛋白与靶蛋白结合,从而介导蛋白酶体降解、细胞周期进程、细胞信号传导和免疫识别等生物学过程(Yeh 等人,将军;248(1-2):1-14 (2000);霍赫施特拉瑟天然细胞生物学;2(8): E153-7 (2000);霍赫施特拉瑟细胞;107(1):5-8 (2001))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

26

37

22

85

预期的

21.25

42.5

21.25

85

卡方。 = 1.80

显着性 = 0.40657

(他/她)= 0.26

平均产仔数 = 9

Mutationstyp:同源重组(标准)

选择了编码外显子 1 和 2(访问 NCBI NM022418.1)。

野生型表达组:除了肺、骨骼肌和骨骼外,RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本均检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.18.1。表型分析(针对改变的基因:DNA73744-1665 (UNQ763)

(a) 一般表型总结:

编码人类 7 号染色体开放阅读框 21 (C7orf21) 直向同源基因的基因突变导致 (-/-) 小鼠的平均绝对单核细胞计数增加。小鼠 (-/-) 显示全身脂肪减少,骨骼测量异常。此外,(-/-) 小鼠在昼夜节律测试期间也显示运动活动增加。雄性小鼠 (-/-) 表现出葡萄糖耐受不良,尽管胰岛素水平正常。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。

昼夜节律测试说明:

在测试的第一天下午 4:00,将雌性小鼠单独圈养在 19" x 10" 的笼中,并随意喂食和饮水。动物接受 12 小时光照/黑暗循环,光照在上午 7:00 点亮,晚上 7:00 点熄灭。系统软件跟踪由动物运动引起的断条数,断条自动分解为迁移。在整个三天的试验中,以 60 个一小时的间隔记录活动。生成的数据显示为每小时记录的平均活动水平(昼夜节律)和三天测试期间每个明暗周期(运动活动)的平均总活动。因此,(-/-) 突变小鼠表现出严重的活动减退。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 在习惯期的两个黑暗阶段显示平均走动计数增加。

分析 wt/had/him: 8/0/8

如上所述,在笼子活动测试期间观察到显着差异。这些结果与黑暗时期运动活动增加一致。这些发现表明 (-/-) 突变小鼠过度活跃,表明与异常昼夜节律模式相关的神经系统疾病。预计 PRO1555 多肽的拮抗剂或抑制剂会模拟这种神经学表型。而 PRO1555 多肽或其激动剂可用于治疗此类神经障碍。

(c) 骨代谢与身体诊断:骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只杂合小鼠中取出一根椎骨和一根股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

CAT 扫描协议:

给小鼠腹膜内注射 CT 造影剂 Omnipaque 300(Nycomed Amershan,每毫升 300 毫克碘,每只动物 0.25 毫升或 2.50-3.75 克碘/千克体重)。在笼子中休息 10 分钟后,通过腹腔注射阿佛汀(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 毫升/千克体重)使小鼠镇静。使用 MicroCAT 扫描仪 (ImTek, Inc.) 进行 CT 扫描,麻醉动物面朝下躺在扫描仪上。使用 ImTek 3D RECON 软件在一组工作站中通过 Feldkamp 算法重建三维图像。

结果:

DEXA:与同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,雄性和雌性小鼠 (-/-) 的平均总体脂肪百分比和平均总脂肪量均有所降低。雄性突变体还表现出更高的瘦体重和平均股骨骨矿物质密度。与野生型同性同窝小鼠相比,雌性小鼠 (-/-) 显示总组织质量减少,尽管野生型小鼠比历史对照大。

显微 CT:雄性突变小鼠 (-/-) 与它们的同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,显示股骨中轴的平均皮质厚度增加,尽管野生型高于历史平均值。此外,雄性 (-/-) 小鼠的骨小梁体积、数量和连接密度增加,尽管野生型测量值低于历史平均值。

CAT 扫描:测试的所有 2 只 (-/-) 小鼠均显示腹内脂肪减少,肾脏可能增大。

总之,与同性 (+/+) 同窝小鼠相比,(-/-) 小鼠的平均总体脂肪和脂肪量减少。这些观察结果表明与血脂异常或脂肪储存耗竭或其他代谢紊乱相关的组织消耗性疾病。 CT扫描结果显示肾脏也肿大了。此外,(-/-) 突变小鼠显示骨骼发育异常。因此,预计 PRO1555 多肽或编码 PRO1555 的基因的拮抗剂或抑制剂会模拟这种负代谢表型。同样,PRO1555 多肽或其激动剂对于正常生长和/或代谢发育是必需的,并且可用于治疗与这种观察到的阴性表型相关的相关生长或代谢障碍。

(d) 免疫表型分析

炎症和免疫相关疾病是相当复杂的、通常是多重的、相互关联的生物通路的表现或结果,这些通路在正常生理学中对损伤或损伤做出反应、启动损伤或损伤修复以及建立先天和后天的防御机制是必不可少的外来生物。当这些正常的生理通路导致进一步的损害或损伤时,疾病或病理就会发生,这些损害或损伤要么与反应强度直接相关,要么是异常调节或过度刺激的结果,要么是内在反应,要么是它们的组合。

尽管这些疾病的病因通常涉及多步通路,并且通常涉及多个不同的生物系统/通路,但在这些通路中的一个或多个热点处进行干预可以起到缓解或治疗的作用。可以通过拮抗有害过程/途径或通过刺激有益过程/途径来进行治疗干预。

T淋巴细胞(T细胞)是哺乳动物免疫反应的重要组成部分。 T 细胞识别与主要组织相容性复合体 (MHC) 内的基因编码的自身分子相关的抗原。抗原可与MHC分子一起呈递在抗原呈递细胞、病毒感染细胞、癌细胞、移植物等表面。 T 细胞系统消除了这些对宿主哺乳动物健康构成威胁的变异细胞。 T细胞包括辅助性T细胞和细胞毒性T细胞。辅助性 T 细胞在识别抗原呈递细胞上的抗原-MHC 复合物后广泛增殖。辅助性 T 细胞还分泌多种细胞因子,即淋巴因子,它们在激活 B 细胞、细胞毒性 T 细胞和参与免疫反应的多种其他细胞中发挥重要作用。

在许多免疫反应中,炎症细胞会渗入受伤或感染部位。迁移细胞可以是中性粒细胞、嗜酸性粒细胞、单核细胞或淋巴细胞,这可以通过受影响组织的组织学检查来确定。当前的免疫学协议,编辑。 John E. Coligan,1994 年,John Wiley & Sons, Inc.

许多与免疫系统相关的疾病是已知的并且已经被广泛研究。这些疾病包括免疫介导的炎症性疾病(如类风湿性关节炎、免疫介导的肾脏疾病、肝胆疾病、炎症性肠病(IBD)、牛皮癣和哮喘)、非免疫介导的炎症性疾病、传染病、免疫缺陷疾病、肿瘤、移植排斥等。在免疫学领域,已经确定了治疗炎症和炎性疾病的靶点。

在免疫学领域,这里确定了治疗炎症和炎症性疾病的靶点。在一种情况下,与免疫系统相关的疾病可以通过抑制免疫反应来治疗。使用抑制具有免疫刺激活性的分子的中和抗体将有利于治疗炎症和免疫介导的疾病。抑制免疫反应的分子(直接或通过使用抗体激动剂的蛋白质)可用于抑制免疫反应,从而减轻免疫相关疾病。

进行了以下测试:

(1) 血液学分析:

测试说明:血液测试使用 Abbott 的 Cell-Dyn 3500R 自动血液分析仪进行。它的一些功能包括 WBC 五件式分类。 “患者”报告总共可以涵盖超过 22 个参数。

结果:

与同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 显示平均绝对单核细胞计数增加。分析 wt/het/hom:7/4/8

总之,血液学结果表明,与对照同窝小鼠相比,纯合子突变小鼠的单核细胞计数增加,表明巨噬细胞祖细胞水平增加。这些结果表明纯合子 (-/-) 基因敲除小鼠具有阳性免疫表型。这些免疫学发现表明 PRO1555 多肽的抑制剂(拮抗剂)将是可以刺激免疫系统(如 T 细胞增殖)的重要药物,并将在这种作用对个体有益的情况下得到应用,如白血病和其他癌症和免疫功能低下的患者,如艾滋病患者。因此,PRO1555 多肽或其激动剂将在抑制免疫反应中发挥作用,并将成为抑制有害免疫反应的有用候选物,例如在移植排斥或移植物抗宿主病中。

(e) 表型分析:代谢-血液化学/葡萄糖耐量

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括葡萄糖耐量试验,以测量胰岛素敏感性和葡萄糖代谢的变化。葡萄糖耐量试验结果异常可能表明但不限于以下疾病或病症:1 型和 2 型糖尿病、X 综合征、各种心血管疾病和/或肥胖症。

方法:在该测定中使用一组 4 只野生型和 8 只纯合小鼠。葡萄糖耐量试验是确定哺乳动物体内葡萄糖稳态受损的标准。使用 Lifescan 血糖仪进行葡萄糖耐量测试。给动物腹腔注射 2 g/kg D-葡萄糖(20% 溶液),并在注射后 0、30、60 和 90 分钟测量血糖水平。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

这些研究表明,在空腹血糖正常的情况下,雄性小鼠 (-/-) 在所有 3 个测试间隔中与其同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比葡萄糖耐量受损。此外,在 (-/-) 小鼠中没有明显的高胰岛素血症。在剩余的临床化学数据中未观察到异常。因此,基因敲除小鼠表现出葡萄糖稳态受损的表型模式,因此,PRO1555 多肽的拮抗剂有望模拟这些代谢效应。同样,PRO1555 多肽或其激动剂可用于治疗受损的葡萄糖稳态。

41.19。包含 DNA76529-1666 (UNQ764) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1556 多肽的基因(命名为 DNA76529-1666)(UNQ764)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM197991 o小鼠肌肉RIKEN 基因 cDNA 2310044H10 (2310044H10Rik);蛋白质参考:Q8VCD8 或 ACCESSION:Q8VCD8 NID:小鼠肌肉(老鼠)。 27.0 kDa 的假设蛋白质。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM206538 欧一个聪明人假设蛋白 LOC284361 (LOC284361),转录变体 2;人类蛋白质序列对应参考:Q8N541 或 ACCESSION:Q8N541 NID:一个聪明人(人类)。 LOC126122(假设的蛋白质)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是 RIKEN cDNA 2310044H10 基因,它是假设的人类蛋白质 LOC284361 的直系同源物。别名包括 INM02、AAAS764、MGC33203 和 2310044H10Rik。

假设的蛋白质由信号肽和 C 末端跨膜片段组成,表明该蛋白质是 I 型质膜蛋白。同源人类基因编码由信号肽和末端(跨膜片段)组成的第二个变体。预计该变体会被分泌。

重量

总共

观察到的

12

43

19

74

预期的

18.5

37

18.5

74

卡方。 = 3.27

显着性 = 0.19493

(他/她)= 0.26

平均产仔数 = 7

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 1 和 2 之间的内含子中(访问 NCBI NM197991.1)。

野生型表达组:除骨骼肌、骨骼和脂肪组织外,通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本均检测到目标基因表达。

RT-PCR 分析表明,在测试的 (-/-) 小鼠 (M-184) 中不存在转录物。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

41.19.1。表型分析(针对改变的基因:DNA76529-1666 (UNQ764)

(a) 一般表型总结:

编码假设的人类膜蛋白直系同源基因的突变导致雄性 (-/-) 小鼠的葡萄糖耐量增加和生育能力降低。雌性基因敲除显示胆红素水平显着升高,磷酸盐水平降低。雄性基因敲除显示骨小梁测量值下降。雌性小鼠 (-/-) 表现出更强的恐惧相关反应。 RT-PCR 不存在转录本。

(b) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

在露天活动测试期间观察到明显的差异。与同性别的同窝小鼠 (+/+) 相比,雌性小鼠 (-/-) 在中央区域的平均添加时间减少。这种类型的行为与增加的类似恐惧的反应是一致的。敲除小鼠表现出与轻度至中度焦虑相关的焦虑相关疾病、与一般医学状况相关的焦虑和/或双相情感障碍一致的表型;多动症;感觉障碍;强迫症、精神分裂症或偏执型人格。因此,PRO1556 多肽或其激动剂可用于治疗此类神经障碍或减轻与焦虑症相关的症状。

(c) 表型分析:血液代谢化学

(1) 耐葡萄糖

在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括血糖测量。 COBAS Integra 400(制造商:Roche)用于对小鼠进行血液化学测试。在代谢领域,可以确定治疗糖尿病的攻击点。血液化学的表型分析包括葡萄糖耐量试验,以测量胰岛素敏感性和葡萄糖代谢的变化。葡萄糖耐量试验结果异常可能表明但不限于以下疾病或病症:1 型和 2 型糖尿病、X 综合征、各种心血管疾病和/或肥胖症。

方法:在该测定中使用一组 4 只野生型和 8 只纯合小鼠。葡萄糖耐量试验是确定哺乳动物体内葡萄糖稳态受损的标准。使用 Lifescan 血糖仪进行葡萄糖耐量测试。给动物腹腔注射 2 g/kg D-葡萄糖(20% 溶液),并在注射后 0、30、60 和 90 分钟测量血糖水平。分析 wt/het/hom:4/4/8

结果:

这些研究表明,在空腹血糖正常的情况下,雄性小鼠 (-/-) 在所有 3 个测试时间间隔内与其同性同窝小鼠 (+/+) 和历史平均值相比葡萄糖耐量增加。雄性小鼠 (-/-) 也表现出降低的血清葡萄糖水平。此外,在 (-/-) 小鼠中没有明显的高胰岛素血症。在剩余的临床化学数据中未观察到异常。因此,基因敲除小鼠表现出相反的葡萄糖稳态受损表型模式,因此 PRO1556 多肽或其编码基因的拮抗剂可用于治疗葡萄糖稳态受损。

(2) 胆红素/磷

雌性敲除小鼠 (-/-) 显示血清胆红素水平显着升高 (p=0.04399)。雄性小鼠的磷水平显着降低 (p=0.046203)。

(d) 身体诊断

生育力

结果:

唯一可用于分析的雄性小鼠 (-/-) 是不育的。经过60天的配种和4次交配,没有产下幼犬。变异的雄性看起来很健康,腹部压力可以诱导阴茎勃起,并且在雌性中观察到阴道塞,这表明不育可能是由于精子缺陷造成的。

(c) 骨代谢与身体诊断:骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只杂合小鼠中取出一根椎骨和一根股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

显微 CT:与野生型同窝小鼠相比,雄性基因敲除 (-/-) 显示小梁连接密度和股骨中轴厚度和总面积降低。这些结果表明,敲除突变小鼠的骨代谢异常,骨质疏松样骨质流失,其特征是骨量减少,密度降低,并且可能导致骨折。因此,PRO1556 多肽或其激动剂似乎可用于维持骨稳态。此外,PRO1556多肽或其编码基因在骨愈合或关节炎或骨质疏松症的治疗中具有重要意义;而PRO1556多肽或其编码基因的拮抗剂会导致异常或病理性骨病,包括与骨代谢异常相关的炎症性疾病,包括关节炎、骨质疏松症和骨质减少。

41.20。包含 DNA76532-1702 (UNQ833) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1760 多肽的基因(命名为 DNA76532-1702)(UNQ833)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:AK006658 或 ACCESSION:AK006658 NID:na小鼠肌肉来自成年男性睾丸的 cDNA,产品:假设的蛋白酶相关 (PA) 结构域蛋白,全长插入序列;蛋白质参考:BAB24693 或未命名的蛋白质产品 [小鼠肌肉];人类基因序列参考:NM032319 哦一个聪明人染色体 2 开放阅读框 7 (C2orf7);人类蛋白质的序列对应参考:NP115695 或 2 号染色体开放阅读框 7。

感兴趣的小鼠基因是一种假设的蛋白质,与人类 C2orf7(2 号染色体的开放阅读框 7)同源。

预计 C2orf7 具有信号肽、蛋白酶相关 (PA) 结构域或 N 末端跨膜区。已在植物液泡分选受体和 RING 样锌指和蛋白酶 (InterPro IPR003137) 的几个家族中观察到 PA 结构域。虽然它包含一个类似 PA 的区域,但没有其他迹象表明 C2orf7 是一种蛋白酶。

重量

总共

观察到的

26

34

17

77

预期的

19.25

38.5

19.25

77

卡方。 = 3.16

显着性 = 0.20640

(他/她)= 0.22

平均产仔数 = 8

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入位于编码外显子 1 和 2 之间的内含子中(NCBI 登录号 AK006658)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到目标基因表达,骨骼肌和胃、小肠和结肠除外。

RT-PCR 分析表明,在所测试的 (-/-) 小鼠 (F-70) 中,肾脏中的转录减少,而脾脏中的转录不存在。

41.20.1。表型分析(针对改变的基因:DNA76523-1702 (UNQ833)

(a) 一般表型总结:

编码人类 2 号染色体开放阅读框 7 (C2orf7) 直向同源基因的基因突变导致 (-/-) 小鼠腰椎读数增加。如通过 RT-PCR 所确定的,转录物在脾脏中不存在并且在肾脏中减少。

(b) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

基因敲除 (-/-) 小鼠与其野生型同窝小鼠相比,所有 5 个腰椎的测量值均有所增加。因此,敲除编码 PRO1760 多肽的基因会导致指示成骨相关疾病的表型。因此,PRO1760 多肽或其激动剂可用于治疗与骨发育异常相关的病症,例如骨硬化症。

41.21。包含 DNA76510-2504 (UNQ849) 遗传改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1787 多肽的基因(命名为 DNA76510-2504)(UNQ849)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:AK090278 或小鼠肌肉16日龄雄性延髓cDNA,RIKEN富集全文库,克隆:G630033K19 产品:PROTEIN ZERO RELATED PROTEIN-like (MYELIN PROTEIN ZERO-LIKE 1) [一个聪明人],完整的插入序列;蛋白质基准:XP129565 或 ADNc de RIKEN 1110007A10 [小鼠肌肉];人类基因序列参考:NM003953 哦一个聪明人髓鞘蛋白零样 1 (MPZL1);人类蛋白质的序列对应参考:NP003944 o Cero 1 样髓磷脂蛋白;相关蜡蛋白 [一个聪明人]。

感兴趣的小鼠基因是 Mpzl1(髓鞘零样蛋白 1, 1110007A10Rik),它是人类 MPZL1 的同源基因。别名包括 PZR 和相关蛋白 Null。

MPZL1 是一种 I 型膜蛋白,可能充当细胞外基质蛋白纤连蛋白的受体(Zannettino 等人,生物化学杂志;370(第 2 部分):537-49(2003 年))。 MPZL1 包含一个信号肽、一个免疫球蛋白 V 型结构域、一个跨膜结构域和两个串联免疫受体酪氨酸抑制基序 (ITIM)。在 MPZL1 激​​活后,ITIM 被酪氨酸磷酸化,导致 SHP-2(Src 同源磷酸酶 2 型)的募集和激活(Zhao 等人。J.生物学。化学。277(10):7882-8 (2002); Zhao y Zhao,J.生物学。化学。275(8):5453-9 (2000))。 MPZL1 广泛表达,但在心脏、胎盘、肾脏和胰腺中含量特别丰富(Zhao 和 Zhao,J.生物学。化学。273(45):29367-72 (1998))。除了 MPZL1 之外,另外两种无 ITIM 的亚型是通过选择性剪接产生的。 MPZL1 可能参与细胞运动和发育(Zannettino 等人。生物化学杂志;370(第 2 部分):537-49(2003 年))。

重量

总共

观察到的

12

49

21

82

预期的

20.5

41

20.5

82

卡方。 = 5.10

显着性 = 0.07818

(他/她)= 0.26

平均产仔数 = 8

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 1 和 2 之间(登记号 AK090278)。

野生型表达组:在胚胎干 (ES) 细胞和通过 RT-PCR 测试的所有 13 个成人组织样本中检测到目标基因表达。

RT-PCR 分析表明,在所分析的 (-/-) 小鼠 (M-126) 中,在 30 个 PCR 循环时,脾脏中没有转录本,心脏中的转录本大大减少。

41.21.1。表型分析(针对改变的基因:DNA76510-2504 (UNQ849)

(a) 一般表型总结:

编码人髓鞘无效蛋白 ortholog 1 (MPZL1) 的基因突变导致观察到 (-/-) 突变小鼠的腰椎测量值增加。如通过 RT-PCR 确定的,转录物在脾脏中不存在并且在心脏中大大减少。

(b) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

骨显微 CT 分析:

方法:显微 CT 也用于获得高度灵敏的 BMD 测量值。从一组 4 只野生型小鼠和 8 只纯合小鼠中取出椎骨和股骨。测量了5个腰椎的骨小梁体积、骨小梁厚度、连接密度、股骨中段总骨面积和皮质厚度。 μCT40 扫描提供了有关骨量和结构的详细信息。各种骨头被放置在样品架上并自动扫描。仪器软件用于选择感兴趣的区域进行分析。在第 5 腰椎 (LV5) 以 16 微米的分辨率分析骨小梁参数,在股骨的中轴以 20 微米的分辨率分析皮质骨参数。

结果:

与其野生型同窝小鼠相比,敲除 (-/-) 小鼠显示所有 5 个腰椎的读数增加,小梁增加。因此,编码 PRO1787 多肽的基因的敲除导致指示成骨相关病症的表型。因此,PRO1787 多肽或其激动剂可用于治疗与骨发育异常相关的病症。

41.22。包含 DNA77624-2515 (UNQ859) 基因改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO1868 多肽的基因(命名为 DNA77624-2515)(UNQ859)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM023277 或加入:NM023277 天然橡胶:12963612小家鼠连接细胞粘附分子 3 (Jcam3);参考蛋白:Q9EPK4 或类似的

访问:Q9EPK4 NID:小鼠肌肉(老鼠)。关节粘附分子 2,JAM-2(蛋白质 1110002N23RIK)。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM032801 或加入:NM032801 编号:21704285智者智者结粘附分子 3 (JAM3);人类蛋白质序列对应参考文献:Q8WWL8 或 ACCESSION:Q8WWL8 NID:一个聪明人(人类)。结合粘附分子 3.

感兴趣的小鼠基因是 Jam3(连接粘附分子 3),它是人类 JAM3 的同源基因。别名包括 JAM-3、Jcam3、1110002N23Rik、FLJ14529 和连接细胞粘附分子 3。

JAM3 是一种 I 型质膜蛋白,作为细胞粘附分子和在白细胞上表达的 beta2 整合素 Mac-I 和在上皮组织上表达的连接粘附分子 JAM2 的反受体。和内皮细胞。该蛋白质由一个信号肽、两个免疫球蛋白样折叠、一个跨膜片段和一个由 46 个氨基酸组成的胞质片段组成(Arrate 等人,J.生物学。化学。276(49):45826-32 (2001);桑托索等人。实验医学杂志;196(5):679-91 (2002);坎宁哈等人。J.生物学。化学。277(31):27589-92 (2002);棕榈等。J.生物学。化学。275(25):19139-45 (2000))。已在血小板、T 细胞、自然杀伤细胞和树突细胞中检测到 JAM3 表达(Liang 等人,J 免疫学;168(4):1618-26 (2002))。

JAM3 可能通过表达 JAM2 的内皮细胞的紧密连接介导免疫细胞向次级淋巴器官和炎症部位的迁移(Arrate 等人,2018 年)。J.生物学。化学。276(49):45826-32 (2001);梁等人,J 免疫学;168(4):1618-26 (2002))。此外,JAM3 可能通过沉积的表达 JAM3 的血小板促进表达 Mac-1 的免疫细胞通过没有内皮细胞的受损血管迁移(Santoso 等人,2018 年)。实验医学杂志;196(5):679-91 (2002))。这些生物学作用表明,JAM3 可能成为炎症性疾病(包括动脉粥样硬化血栓形成)治疗干预的新靶点(Chavakis 等人,2017 年)。Thromb-Hämost;89(1): 13-7 (2003))。 JAM3 也可能参与心脏发育和左心发育不全的主要人类先天性心脏病(Phillips 等人,基因组学;79(4):475-8 (2002))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

18

42

12

72

预期的

18

36

18

72

卡方。 = 3.00

显着性 = 0.22313

(他/她)= 0.17

平均产仔数 = 8

Mutationstyp:同源重组(标准)

目的是编码外显子 1(访问 NCBI NM023277.1)。

野生型表达组:通过RT-PCR检测的13个成人组织样本中,仅在大脑、脊髓和眼睛中检测到目标基因表达。

目标基因破坏通过 Southern 杂交分析得到证实。

41.22.1。表型分析(针对改变的基因:DNA77624-2515 (UNQ859)

(a) 一般表型总结:

编码人连接粘附分子 ortholog 3 (JAM3) 的基因突变导致小鼠成熟的先天性核晶状体白内障 (-/-)。小鼠 (-/-) 也显示运动活动增加(现场测试中的多动症)。 (-/-) 突变小鼠表现出明显的生长迟缓,因为它们更小,体重减轻,平均总组织量、瘦体重和总脂肪量减少。雄性小鼠 (-/-) 不育并表现出性腺机能减退和精子发生缺陷。此外,在 Genentech 繁殖群中,基因敲除动物不具有孟德尔频率:大约 50% 的 UNQ859 (-/-) 小鼠在出生后死亡。通过Southern印迹证实了基因变化。

(b) 骨代谢与身体诊断

(1) 组织质量和去脂体重测量:Dexa

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:成功地使用双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 来识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

一般说明:

4 只分析的白化小鼠 (-/-) 显示白内障。仔细检查后,在黑色和刺豚鼠 (-/-) 小鼠中也观察到白内障,白化突变体的表型更为明显。

身体测量(身高和体重):

身体测量值:在大约 16 周龄时测量身长和体重。

结果:

与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,小鼠 (-/-) 的平均体重和体长有所下降。

生育能力:

可用于分析的雄性小鼠 (-/-) 在 4 次交配和 40 天的繁殖后没有产下幼崽。

(2) 骨代谢:放射学表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于股骨和椎骨中的骨矿物质密度测量 MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

CAT 扫描协议:

给小鼠腹膜内注射 CT 造影剂 Omnipaque 300(Nycomed Amershan,每毫升 300 毫克碘,每只动物 0.25 毫升或 2.50-3.75 克碘/千克体重)。在笼子中休息 10 分钟后,通过腹腔注射阿佛汀(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 毫升/千克体重)使小鼠镇静。使用 MicroCAT 扫描仪 (ImTek, Inc.) 进行 CT 扫描,麻醉动物面朝下躺在扫描仪上。使用 ImTek 3D RECON 软件在一组工作站中通过 Feldkamp 算法重建三维图像。

结果:

DEXA:与同性 (+/+) 同窝小鼠和历史平均值相比,雄性小鼠 (-/-) 的平均总组织质量、瘦体重和总脂肪质量有所降低。此外,与野生型同窝小鼠相比,雄性敲除小鼠 (-/-) 显示 BMC/LBM 比率增加。

CAT 扫描:可用于分析的两只雄性 (-/-) 小鼠(M-147 和 M-186)显示出适度较小的睾丸,表明性腺机能减退。与野生型同胞 (0.214 g) 和历史数据(0.216 g,标准差为 0.058 g)相比,雄性小鼠 (-/-) 显示睾丸重量减少(平均 0.137 g)。一只雄性小鼠 (+/-) 显示左睾丸 (M-148) 明显增大,表明后天性病变,例如B. 炎症可能是由于。分析 wt/het/hom:4/5/9

病理

大体观察在所有小鼠中观察到白内障(-/-)。

显微镜观察:(-/-) 小鼠表现出先天性晶状体核性白内障,这是在这些突变小鼠中观察到的唯一主要眼部病变。此外,可用于分析的雄性小鼠 (-/-) 的睾丸和附睾较小。在所有曲细精管中观察到精子发生有缺陷或停滞,生殖细胞的数量和比例发生深刻变化;一些小管完全衬有支持细胞。附睾和曲细精管中有大量的巨细胞和凋亡的生殖细胞,但成熟的精子细胞很少。

基因表达:通过免疫组织化学分析在组织组中未检测到 LacZ 活性。解析 wt/het/hom:2/1/10

概括:

诊断/放射学和病理学研究表明,(-/-) 突变小鼠表现出明显的生长迟缓,其特征是体重低,平均总组织质量、瘦体重和全身脂肪减少。雄性小鼠还表现出严重的生殖障碍,包括精子发生受损、不育和性腺机能减退。杂合子 (+/-) 雄性小鼠也表现出与炎症相关的生殖功能障碍迹象。此外,病理报告表明(-/-)突变小鼠患有严重的先天性晶状体核性白内障。因此,编码 PRO1868 多肽的基因失活会导致严重的生长、生殖和眼科疾病。 PRO1868 多肽或编码 PRO1868 多肽的基因的拮抗剂或抑制剂将预期模拟这些阴性表型条件。因此,编码 PRO1868 多肽的基因似乎对正常生长和生殖发育至关重要,尤其是在雄性中。

(c) 心血管表型分析:

在心血管生物学领域,已经进行了表型测试以确定治疗心血管、内皮或血管生成疾病的潜在靶点。其中一项表型测试包括眼底照相和血管造影,以确定视网膜动静脉 (A/V) 比率,以指示各种眼部异常。异常的 A/V 比表示那些可能与高血压血管疾病(以及任何引起高血压的疾病,例如动脉粥样硬化)、糖尿病或与眼部疾病相对应的其他眼部疾病相关的全身性疾病或病症。此类眼部异常可能包括但不限于:视网膜异常是视网膜发育不良、各种视网膜病、视网膜动脉再狭窄、阻塞或闭塞;视网膜变性导致视网膜血管继发性萎缩、色素性视网膜炎、黄斑营养不良、Stargardt病、先天性住院夜盲症、无脉络膜血症、脑回萎缩、先天性肝黑蒙、视网膜劈裂症、Wagner综合征、Usher综合征、Zellweger、Saldino-Mainzer综合征、高级-Loken 综合征、Bardet-Biedl 综合征、Alport 综合征、Alstom 综合征、Cockayne 综合征、先天性椎间盘突出症、Flynn-Aird 综合征、Friedreich 共济失调、Hallgren 综合征、Marshall 综合征、Albers' Schnoberg 病、Refsum 病、Keams-Sayre 综合征、Waardenburg综合征、Alagile 综合征、强直性肌营养不良、橄榄桥脑小脑萎缩、Pierre-Marie-Dunsdrome 综合征、Stickler 综合征、胡萝卜素血症、胱氨酸增多症、Wolfram 综合征、Bassen 粒支综合征、无β脂蛋白血症、色素性尿失禁、Batten 病、粘多糖贮积症、高胱氨酸尿症或甘露糖苷贮积症。

方法:在该测定中测试了一组 4 个野生型、4 个杂合子和 8 个纯合子。使用根据 Hawes 和合著者修改的 Kowa Genesis 小型动物眼底照相机(Hawes 等人,1999 年,Molecular Vision 1999;5:22)在清醒的动物身上进行光学眼底照相。腹膜内注射荧光素使每项研究都能获得直射光眼底图像和荧光血管造影照片。除了直接的眼科变化外,该测试还可以检测与全身性疾病(如糖尿病和动脉粥样硬化)或其他视网膜异常相关的视网膜变化。提供正常光线下的眼底图像。血管造影图像允许检查眼睛的动脉和静脉。此外,还确定了眼睛的动脉与静脉 (A/V) 比率。

使用上述协议对野生型、杂合子和纯合子 F2 突变后代进行眼科分析。具体而言,使用Kowa COMIT+软件根据眼底图像测量和计算A/V比。该测试通过放大的瞳孔拍摄彩色照片:这些图像有助于识别和分类许多疾病。动脉与静脉比率 (A/V) 是动脉直径与静脉直径之间的比率(在血管分叉之前测量)。许多疾病都会影响该比率,例如B. 糖尿病、心血管疾病、视乳头水肿、视神经萎缩或其他眼部异常,如视网膜变性(称为色素性视网膜炎)或视网膜发育不良、视力障碍或失明。因此,与野生型 (+/+) 同窝仔相比,导致纯合子 (-/-) 和杂合子 (+/-) 突变后代的动脉与静脉比率增加的表型观察表明这种病理状况。

结果:

8 (-/-) 小鼠表现出不同程度的成熟白内障。由于白内障阻塞,无法在 (-/-) 小鼠中测量视网膜动脉与静脉 (A/V) 比率。分析 wt/het/hom:4/5/8

总之,通过敲除编码鉴定为 DNA77624-2515 (UNQ859) 的 PRO1868 多肽的基因,纯合突变后代表现出与白内障形成和/或其他眼部疾病相关的表型。这种检测到的眼科变化通常与全身性心血管疾病有关。特别是,白内障形成可能表明与血液凝固级联紊乱相关的心血管并发症。白内障还与全身性疾病有关,例如B.:人类唐氏综合症、Hallerman-Streiff 综合症、Lowe 综合症、半乳糖血症、Marfan 综合症、Trismoy 13-15 病症、Alport 综合症、强直性肌营养不良、Fabry 病、甲状腺功能减退症、Conradi 综合症。因此,编码 PRO1868 的基因的拮抗剂会导致类似的病理变化,而激动剂可用作预防白内障形成和/或潜在的心血管疾病或眼科疾病的治疗剂。

(d) 表型分析:CNS/神经病学

在神经病学领域,分析的重点是确定用于治疗神经和精神疾病的体内验证靶点,包括抑郁症、广泛性焦虑症、注意力缺陷多动障碍、强迫症、精神分裂症、认知障碍、痛觉过敏和感觉障碍。神经系统疾病包括定义为“焦虑症”的类别,包括但不限于:轻度至中度焦虑、一般医学状况引起的焦虑症、未另行说明的焦虑症、广泛性焦虑症、惊恐发作、恐慌症伴广场恐惧症,无广场恐惧症的恐慌症,创伤后应激障碍,社交恐惧症,特定恐惧症,物质引起的焦虑症,急性酒精戒断,强迫症,广场恐惧症,双相 I 或 II 型障碍,未明确的双相障碍,循环性精神障碍,抑郁症,重度抑郁症,情绪障碍,物质引起的情绪障碍。此外,焦虑症可应用于人格障碍,包括但不限于以下类型:偏执型、反社会型、回避型、边缘型、依赖型、组态型、自恋型、强迫型、分裂样型和分裂型人格障碍。

程序:

对一组 4 只野生型突变小鼠(4 只杂合子和 8 只纯合子)进行了行为筛选。所有行为测试都在 12 至 16 周龄之间进行,除非生存能力受损需要更早的测试。这些测试包括一个开放的领域来测量焦虑、活动水平和探索。

开场测试:

几个已知的药物靶标已在现场测试中显示出表型。这些包括血清素转运蛋白、多巴胺转运蛋白(Giros 等人,Nature 1996 年 2 月 15 日;379(6566):606-12)和 GABA 受体(Homanics 等人,Proc Natl Acad Sci USA。1997 年 4 月 15 日)的失活, 94(8):4143-8)。调整了一个自动开放场实验,以解释与情感状态和与学习相关的探索模式相关的变化。首先,为小鼠选择相对较大的区域 (40 × 40 cm),因此它被设计为检测与扫描相关的运动活动的变化。此外,地板上还有 4 个孔,可以挖鼻子,这是一项与探索特别相关的活动。还开发了几个因素来增加与此测试相关的情感状态。开场测试是测试小鼠的第一个实验程序,所进行的测量是受试者对相机的第一次体验。此外,空旷的场地上灯火通明。所有这些因素都增加了与新的和开放空间相关的自然焦虑。探索活动的模式和范围,尤其是中心和总行进距离之间的关系,可以潜在地检测与焦虑或抑郁易感性相关的变化。使用在三个不同水平具有红外线的大型场地(40 厘米 x 40 厘米,AccuScan Instruments VersaMax 动物活动监测系统)来记录运动和饲养活动。将动物放在中心并测量其活动 20 分钟。以 5 个 4 分钟的间隔分析来自该测试的数据。记录覆盖的总距离 (cm)、垂直运动的数量(幼崽)、穿孔的数量以及中心与总距离之间的比率。

小鼠对新环境表现出正常习惯反应的倾向是通过确定其水平运动活动在 5 个时间间隔内的总体变化来评估的。这种计算出的活动随时间变化的斜率是使用归一化的总行进距离而不是绝对距离来确定的。斜率是根据 5 个时间间隔中每个时间间隔的归一化活动的回归线确定的。正常习惯由负斜率值表示。

结果:

在露天活动测试期间观察到明显的差异。与同性同窝小鼠 (+/+) 相比,小鼠 (-/-) 的总行走距离和育儿活动更多,这表明突变小鼠对新环境的探索性反应更强。因此,敲除小鼠表现出与多动症一致的表型。鉴于这些观察结果,PRO1868 多肽及其激动剂可用于治疗或减轻与多动症相关的症状。

41.23。包含 DNA91779-2571 (UNQ1883) 遗传改变的小鼠的产生和分析

在这些敲除实验中,编码 PRO4326 多肽的基因(命名为 DNA91779-2571)(UNQ1883)被破坏。这些研究的基因特定信息如下:突变的小鼠基因对应于参考核苷酸:NM029770 哦小鼠肌肉unc-5 同系物 B (秀丽隐杆线虫) (Unc5b);蛋白质参考:Q8K1S3 或附件:Q8K1S3 NID:小鼠肌肉(老鼠)。 Unc5h2 netrin 受体。鼠标 TRNRDB;人类基因序列参考:NM170744 或加入:NM170744 NID:gi 25014104 ref NM170744.1一个聪明人Unc5H2 跨膜受体 (UNC5H2);人类蛋白质序列对应参考:Q81ZJ1 或 ACCESSION:Q81ZJ1 NID:一个聪明人(人类)。 UNC5H2 跨膜受体。

感兴趣的小鼠基因是 Unc5b(unc-5 同系物 B [秀丽隐杆线虫]), 人类 UNC5B 的直系同源物。别名包括 Unc5h2、6330415E02Rik、unc5-match (秀丽隐杆线虫)2、p53RDL1、Unc5H2跨膜受体和p53调节生死受体。

UNC5B 是一种 I 型质膜蛋白和化学脉冲轴突传导配体 netrin-1 的受体(Leonardo 等人。自然;386 (6627):833-8 (1997))。该蛋白质由一个信号肽、两个免疫球蛋白结构域、两个血小板反应蛋白 1 型基序、一个跨膜片段、一个 ZU-5 结构域、一个 DCC 结合结构域和一个 C 端死亡结构域组成。 UNC5B 可以通过与 G 蛋白亚基 G1-alpha2 以其活性 GTP 结合形式相互作用并从 G1-alpha2 抑制中释放腺苷酸环化酶来刺激 cAMP 合成。 UNC5B 在轴突导向中发挥作用,并可能参与免疫细胞趋化性(Komatsuzaki 等人,Biochem Biophys Res Comunes;297(4):898-905 (2002))。在没有 netrin-1 的情况下,UNC5B 可以通过诱导细胞凋亡充当肿瘤抑制因子(Thiebault 等人,2017 年)。Proc Natl Acad Sci 美国;100(7):4173-8 (2003);兰比等人。恩宝;20(11):2715-22 (2001); Tanikawaet 等人,天然细胞生物学;5(3):216-23 (2003))。

在 129SvEv 菌株中产生定向或陷阱基因突变Brd- 衍生胚胎干细胞 (ES)。嵌合小鼠与白化 C57BL/6J 小鼠杂交产生杂合 F1 动物。这些后代杂交产生杂合子和纯合子野生型 F2 突变后代。在极少数情况下,例如当从嵌合体中获得的 F1 小鼠很少时,杂合 F1 小鼠会与 129SvEv 杂交。Brd/C57 杂交小鼠产生额外的杂合动物用于交配产生 F2 小鼠。对这一代小鼠进行了 I 级表型分析。

重量

总共

观察到的

22

44

66

预期的

16.5

33

16.5

66

卡方。 = 22.00

显着性 = 0.00002

(他/她)= 0.00

平均产仔数 = 7

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入发生在编码外显子 1 和 2 之间的内含子中(访问 NCBI NM029770.1)。

野生型表达组:除胸腺、骨骼肌、骨骼和脂肪组织外,通过 RT-PCR 检测的所有 13 个成人组织样本均检测到目标基因表达。

由于致死率,未进行转录表达分析。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

41.23.1。表型分析(针对改变的基因:DNA91779-2571 (UNQ1883)

(a) 一般表型总结:

编码人类 unc-5 的 B 同系物的直系同源物的基因突变(秀丽隐杆线虫) (UNC5B) 导致 (-/-) 突变体的致死率。在小鼠中,观察到尿尿 (+/-)。此外,雌性小鼠 (+/-) 显示出较高的总体脂肪含量。

胚胎发育异常致死率的相关讨论:

敲除小鼠的胚胎致死率通常由几种严重的发育问题引起,包括但不限于神经退行性疾病、血管生成疾病、炎症性疾病,或者当基因/蛋白质在许多细胞类型的基本细胞信号传导过程中发挥重要作用时。此外,致死胚胎可用作潜在的癌症模型。同样,当相应的杂合 (+/-) 突变动物表现出高度指示敲除基因功能的表型和/或病理记录时,它们特别有用。例如,缺乏 EPO 的动物在胚胎方面是致命的,但胚胎的病理报告显示严重的红细胞缺乏症。

(b) 病理学

一般观察:12.5 天 (-/-) 的胚胎表现出中度发育迟缓。

显微镜观察:12.5 天后,观察到 63 个胚胎:14 个 (-/-) 个胚胎、28 个 (+/-) 个胚胎、12 个 (+/+) 个胚胎和 9 个吸收痣。在 12.5 天 (-/-) 胚胎中观察到正常的器官发生,尽管除大脑和脊髓外所有器官的大小普遍减少。

基因表达:在通过免疫组织化学分析的组织中的脑中检测到LacZ活性。

(c) Blutchemie:尿液分析

在测试的八 (8) 只杂合 (+/-) 小鼠中,七只表现出尿尿症。

(d) 骨代谢:放射表型分析

在骨代谢领域,已经确定了治疗关节炎、骨质疏松症、骨质减少和骨硬化症的靶点,并确定了促进骨愈合的靶点。包含的考试:

    • DEXA 用于测量股骨和椎骨中的骨矿物质密度
    • MicroCT 用于骨矿物质密度测量,对小梁骨和皮质骨具有非常高分辨率和非常高的灵敏度。

Dexa 分析 - 测试说明:

方法:在该测定中分析了一组 4 个野生型和 4 个杂合子。双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 已成功用于识别骨骼变化。检查麻醉动物并测量骨矿物质含量 (BMC)、BMC/LBM 比率、骨矿物质体积密度 (vBMD)、全身 BMD、股骨 BMD 和椎骨 BMD。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,在感兴趣区域 (ROI) [即H。整个身体,椎骨和两个股骨]。

结果:

与同性同窝仔和历史平均值相比,杂合子 (+/-) 雌性的总体脂肪含量更高;然而,血液甘油三酯没有变化,表明脂质代谢异常。

41.24。包含 DNA100272-2969 (UNQ1887) 遗传改变的小鼠的产生和分析。

在这些敲除实验中,编码 PRO4332 多肽的基因(命名为 DNA100272-2969)(UNQ1887)被破坏。这些研究的基因具体信息如下:突变小鼠基因对应于参考核苷酸:AK014709 或 ACCESSION:AK014709 NID:12852724小家鼠Day 0 新生儿头部 cDNA,富集全长 RIKEN 文库,克隆:4833416109:与 PROTEIN CG5901 相关,全长插入序列;参考蛋白:Q9CUS9或肽酶样信号肽3(SPP样蛋白3)(膜内蛋白酶2)(IMP2)(早老素样蛋白4);人类基因序列参考:NM139015 欧一个聪明人信号肽肽酶 3 (SPPL3);人类蛋白质序列对应参考:Q8TCT6 或 ACCESSION:Q8TCT6 NID:一个聪明人(人)。早老素样蛋白 4 (EC 3.4.99.-)(蛋白 SPPL3)。人类 SPTRNRDB。

感兴趣的小鼠基因是早老素样蛋白 4,与人类 SPPL3(信号肽肽酶 3)同源。别名包括 4833416109Rik、IMP2、PSL4、DKFZP586C1324、膜内蛋白酶和早老素样蛋白 4。

SPPL3 是一种推定的早老素样天冬氨酸蛋白酶,存在于内质网膜中并催化从前体蛋白切割的信号肽的膜内蛋白水解。 SPPL3 等信号蛋白肽酶参与细胞信号传导、细胞调节和蛋白质加工(Weihofen 等人,科学;296 (5576): 2215-8 (2002);格里戈连科等。生物化学(麝香); 67(7):826-35 (2002); Xia y Wolfe,细胞科学;116(Teil 14):2839-44(2003); Urney 等人。基因表达模式;3(5):685-91 (2003))。

重量

总共

观察到的

14

40

14

68

预期的

17

34

17

68

卡方。 = 2.12

显着性 = 0.34686

(他/她)= 0.21

平均产仔数 = 7

突变类型:逆转录病毒插入(OST)

逆转录病毒插入位于外显子 6 和 7 的编码之间(NCBI 登录号 AK014709.1)。

野生型表达组:通过RT-PCR检测的13个成人组织样本中,在大脑、脊髓、肾脏和心脏中检测到目标基因表达。

RT-PCR 分析表明,在测试的 (-/-) 小鼠 (M-185) 中不存在转录本。由于通过核苷酸序列分析确定逆转录病毒载体片段剪接到目标转录物中,因此在小鼠 (-/-) 的两个组织中也检测到了较大的转录物。然而,预计逆转录病毒载体序列中的框内终止密码子会破坏该转录本的翻译。通过反向 PCR 确认靶基因破坏。

41.24.1。表型分析(针对改变的基因:DNA100272-2969 (UNQ1887)

(a) 一般表型总结:

编码人类信号肽肽酶 3 (SPPL3) 直系同源物的基因突变导致 (-/-) 小鼠生长迟缓和生育能力降低。小鼠 (-/-) 也表现出许多神经系统异常。此外,突变小鼠 (-/-) 显示空腹血糖和甘油三酯水平下降。已在包括精子在内的生精小管中观察到 LacZ 表达。 RT-PCR 不存在转录本。

(b) 身体诊断:组织质量和身体质量测量 Leas:Dexa

(1) Dexa分析-测试说明:

方法:成功地使用双能 X 射线吸收测定法 (DEXA) 来识别总组织质量 (TMT) 的变化。

小鼠腹腔注射阿佛丁(1.25% 2,2,2-三溴乙醇,20 ml/kg体重)麻醉,测量体长和体重,然后将小鼠俯卧在平台上用于 DEXA 扫描的 PIXImus™ 密度计(Lunar Inc.)。使用 Lunar PIXImus 软件,确定感兴趣区域(ROI,即全身、椎骨和双股骨)的骨矿物质密度 (BMD) 和脂肪成分(% 脂肪)和总组织质量 (TMT)。

一般说明:

小鼠 (-/-) 比它们的同窝小鼠 (+/+) 小,并且表现出不安分的行为。

身体测量(身高